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1. 发明申请

WO2006104979A2 METHOD FOR DETECTING A TARGET ANALYTE 审中-公开
标题翻译：检测目标分析仪的方法
公开(公告)号：WO2006104979A2
公开(公告)日：2006-10-05
申请号：PCT/US2006/011033
申请日：2006-03-28
申请人： NANOSPHERE, INC. , MÜLLER, Uwe, R. , STORHOFF, James, J. , LUCAS, Adam
发明人： MÜLLER, Uwe, R. , STORHOFF, James, J. , LUCAS, Adam
CPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q2565/30 , C12Q2565/518 , C12Q2537/125
摘要： The present invention relates to methods, reagents, and kits for detecting for the presence or absence of one or more target analytes in a sample. In particular, the present invention relates to detection methods with high sensitivity by ways of reducing background and/or improving the sensitivity of detection by using barcodes. The present invention also relates to methods and kits for detaching a surface-bound oligonucleotide or barcodes from a substrate surface.
摘要翻译：本发明涉及用于检测样品中一种或多种目标分析物的存在或不存在的方法，试剂和试剂盒。特别地，本发明涉及通过减少背景和/或通过使用条形码提高检测灵敏度的高灵敏度的检测方法。本发明还涉及用于从基底表面分离表面结合的寡核苷酸或条形码的方法和试剂盒。

2. 发明申请

WO2010141391A3 MUTANT DNA POLYMERASES 审中-公开
标题翻译：突变DNA聚合酶
公开(公告)号：WO2010141391A3
公开(公告)日：2011-04-21
申请号：PCT/US2010036760
申请日：2010-05-28
申请人： LIFE TECHNOLOGIES CORP , PERIS MARIAN , PHELAN MICHAEL , ROSENBLUM BARNETT B , HENDRICKS STEPHEN P
发明人： PERIS MARIAN , PHELAN MICHAEL , ROSENBLUM BARNETT B , HENDRICKS STEPHEN P
IPC分类号： C12N9/10 , C12N15/54 , C12N15/63
CPC分类号： C12N9/1252 , C12Q1/68 , C12Q1/6804 , C12Q1/6818 , C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C12Q1/6872 , C12Y207/07007 , G01N2500/00 , C12Q2565/632 , C12Q2563/137 , C12Q2563/107 , C12Q2565/30 , C12Q2537/157
摘要： Provided herein are mutant DNA-dependent polymerases which are derived from, or otherwise related to, wild type RB69 DNA polymerase. These mutant polymerases are capable of selectively binding labeled nucleotides. These mutant polymerases are also capable of incorporating a variety of naturally occurring and modified nucleotides, including, for example, terminator nucleotides.
摘要翻译：本文提供了衍生自野生型RB69 DNA聚合酶或与野生型RB69 DNA聚合酶相关的突变型DNA依赖性聚合酶。这些突变型聚合酶能够选择性地结合标记的核苷酸。这些突变型聚合酶还能够掺入多种天然存在和修饰的核苷酸，包括例如终止子核苷酸。

3. 发明申请

WO2009151150A1 ＤＮＡを定量又は検出する方法审中-公开
标题翻译：定量或检测DNA的方法
公开(公告)号：WO2009151150A1
公开(公告)日：2009-12-17
申请号：PCT/JP2009/061068
申请日：2009-06-11
申请人：住友化学株式会社 , 冨ヶ原祥隆 , 佐藤日出夫 , 樽井弘和
发明人：冨ヶ原祥隆 , 佐藤日出夫 , 樽井弘和
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/25 , C12Q1/68 , G01N33/53
CPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q1/6804 , C12Q1/6827 , C12Q1/6834 , C12Q1/6886 , C12Q2563/107 , C12Q2537/164 , C12Q2521/125 , C12Q2565/30 , C12Q2523/125 , C12Q2521/531
摘要：本発明は、検体中に含まれる目的とするＤＮＡ領域を有するＤＮＡを定量又は検出する方法等に関する。
摘要翻译：本发明涉及用于定量或检测具有包含在样本中的目标DNA区域的DNA的方法。

4. 发明申请

WO2006061994A1 遺伝子配列検査法审中-公开
标题翻译：检测基因序列的方法
公开(公告)号：WO2006061994A1
公开(公告)日：2006-06-15
申请号：PCT/JP2005/021554
申请日：2005-11-24
申请人：山本健
发明人：山本健
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q2561/101 , C12Q2565/30 , C12Q2521/319
摘要：　簡便、迅速、高精度且つ安価に特定の核酸配列の定量的検出及び遺伝子多型または変異の検出を均一系にて行う方法及びそれに用いられるオリゴヌクレオチドプローブを提供する。　標的核酸にハイブリダイズさせた１個または２個の標識物質を含むプローブＤＮＡを、エキソヌクレアーゼの作用によって５´または３´末端より分解させ、プローブの標識物質のひとつを遊離させた結果発せられるシグナルを検出することにより、特定配列を有する核酸の定量的検出、遺伝子多型または変異の検出がなされる。
摘要翻译：旨在提供一种方法，其可以方便，快速，高度准确和经济地定量检测特异性核酸序列，并且检测基因多态性或突变在均相系统和寡核苷酸中进行可用的探针。特异性核酸序列的定量检测和基因多态性或突变的检测可以通过将包含一个或两个标记并已经与靶核酸杂交的探针DNA从其5'-r 3'结束使用外切核酸酶，从而释放探针中的一个标记物，然后检测由此产生的信号。

5. 发明申请

WO2010107946A2 USE OF THERMOSTABLE ENDONUCLEASES FOR GENERATING REPORTER MOLECULES 审中-公开
标题翻译：使用可测量的内切酶用于产生报告分子
公开(公告)号：WO2010107946A2
公开(公告)日：2010-09-23
申请号：PCT/US2010/027706
申请日：2010-03-17
申请人： SEQUENOM, INC. , ROY, Margaret, Ann , OETH, Paul, Andrew
发明人： ROY, Margaret, Ann , OETH, Paul, Andrew
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/52 , C12N15/11 , C12N9/22
CPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/686 , C12Q2525/131 , C12Q2525/186 , C12Q2565/30
摘要： Provided are compositions and methods for amplifying, capturing and/or detecting target nucleic acids using cleavable oligonucleotides.
摘要翻译：提供了使用可切割寡核苷酸扩增，捕获和/或检测靶核酸的组合物和方法。

6. 发明申请

WO2008066730A2 PNA-DNA OLIGOMERS AND METHODS OF USE THEREOF 审中-公开
标题翻译： PNA-DNA寡聚体及其使用方法
公开(公告)号：WO2008066730A2
公开(公告)日：2008-06-05
申请号：PCT/US2007024180
申请日：2007-11-19
申请人： MASSACHUSETTS INST TECHNOLOGY , BORTOLIN LAURA T , RUDZINSKI CHRISTINA M , STEPHENS AMANDA L
发明人： BORTOLIN LAURA T , RUDZINSKI CHRISTINA M , STEPHENS AMANDA L
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6823 , C12Q2525/107 , C12Q2525/197 , C12Q2565/30 , C12Q2521/319
摘要： Peptide nucleic acid (PNA)-deoxyribonucleic acid (DNA) oligomers and methods of using the PNA-DNA oligomers to detect and/or amplify a target nucleic acid in a sample are provided. The PNA-DNA oligomers of the invention are relatively insensitive to ionic concentration and many inhibitory proteins and, consequently, are particularly advantageous for direct use in environmental or challenging samples to detect nucleic acid, especially that of microorganisms, including food and water pathogens and/or bioterrorism agents. Methods are also provided for use of the PNA-DNA oligomers in applications including polymerase chain reaction, nucleic acid sequencing, mutation detection and as nucleic acid probes.
摘要翻译：提供肽核酸（PNA） - 脱氧核糖核酸（DNA）寡聚体和使用PNA-DNA寡聚体检测和/或扩增样品中靶核酸的方法。本发明的PNA-DNA寡聚体对离子浓度和许多抑制蛋白质相对不敏感，因此特别有利于直接用于环境或挑战样品中以检测核酸，特别是微生物，包括食物和水病原体和/ 或生物恐怖主义者。还提供了用于在包括聚合酶链反应，核酸测序，突变检测和核酸探针的应用中使用PNA-DNA寡聚体的方法。

7. 发明申请

WO0206531A2 NUCLEIC ACID HAIRPIN PROBES AND USES THEREOF 审中-公开
标题翻译：核酸乳头探针及其用途
公开(公告)号：WO0206531A2
公开(公告)日：2002-01-24
申请号：PCT/US0122166
申请日：2001-07-12
申请人： APPLIED GENE TECHNOLOGIES INC
发明人： DATTAGUPTA NANIBHUSHAN
IPC分类号： B01J19/00 , C07H21/00 , C07H21/02 , C07H21/04 , C07K14/00 , C07K14/47 , C12M1/00 , C12M1/34 , C12P19/34 , C12Q1/68 , G01N33/00
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6816 , C12Q1/6837 , Y10T436/143333 , C12Q2565/525 , C12Q2525/301 , C12Q2565/30 , C12Q2521/301
摘要： This invention relates generally to nucleic acid hybridization analysis. More specifically, an oligonucleotide probe for hybridization analysis is provided, which probe comprises a nucleotide sequence that forms a hairpin structure having a double stranded segment and a single stranded loop, wherein said nucleotide sequences are located with the double stranded segment only or at least a portion of said nucleotide sequences are located within said double stranded segment and a portion of said nucleotide sequence located within said single stranded loop collectively form a region that is complementary to a target nucleotide sequence to be hybridized with. Array comprising the hairpin probes immobilized on a solid support and methods for nucleic acid hybridization analysis using the probes or array of immobilized probes are also provided. Methods for transcribing and/or amplifying a probe DNA sequence using a hairpin probe are further provided.
摘要翻译：本发明一般涉及核酸杂交分析。更具体地，提供了用于杂交分析的寡核苷酸探针，该探针包含形成具有双链区段和单链环的发夹结构的核苷酸序列，其中所述核苷酸序列仅位于双链区段或至少一个所述核苷酸序列的部分位于所述双链区段内，并且位于所述单链环内的所述核苷酸序列的一部分共同形成与待杂交的靶核苷酸序列互补的区域。还提供了包含固定在固体支持物上的发夹探针的阵列和使用探针或固定化探针阵列的核酸杂交分析方法。进一步提供使用发夹探针转录和/或扩增探针DNA序列的方法。

8. 发明申请

WO2016141040A1 HOMOGENOUS ENTROPY-DRIVEN BIOMOLECULAR ASSAY (HEBA) 审中-公开
标题翻译：均质生物分子生物学测定（HEBA）
公开(公告)号：WO2016141040A1
公开(公告)日：2016-09-09
申请号：PCT/US2016/020411
申请日：2016-03-02
申请人： THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF CALIFORNIA
发明人： DI CARLO, Dino , KIM, Donghyuk
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/682 , C12Q1/68 , C12Q1/6804 , G01N21/6428 , G01N2021/6432 , G01N2021/6439 , C12Q2563/107 , C12Q2563/125 , C12Q2563/159 , C12Q2565/30 , C12Q2565/619 , C12Q2525/205 , C12Q2563/179 , C12Q2537/137 , C12Q2537/155 , C12Q2537/157
摘要： A method for detecting an analyte in a sample includes the steps of binding a first catalytic precursor to the analyte at a first epitope and binding a second catalytic precursor to the analyte at a second, different epitope to generate a catalytic complex. The catalytic complex is reacted with a multiplex molecular substrate to generate a first target molecule and an intermediate substrate containing the bound catalytic complex. The intermediate substrate is reacted with a dummy reactant to generate a second target molecule, wherein the reaction further generates a waste molecule containing the dummy reactant and a free catalytic complex. An optical signal that is generated by one or more dye(s) specific to the first target molecule and/or the second target molecule is detected to detect the presence of the analyte in the sample. The overall reaction has substantially net zero enthalpy and a positive entropy change.
摘要翻译：用于检测样品中的分析物的方法包括以第一表位将第一催化前体与分析物结合的步骤，并将第二催化前体与第二不同表位的分析物结合以产生催化复合物。催化络合物与多重分子底物反应以产生含有结合的催化络合物的第一靶分子和中间基质。中间底物与虚拟反应物反应以产生第二靶分子，其中反应进一步产生含有虚拟反应物和游离催化络合物的废分子。检测由第一靶分子和/或第二靶分子特异性的一种或多种染料产生的光信号，以检测样品中分析物的存在。总体反应基本上具有净零焓和正熵变。

9. 发明申请

WO2012039529A1 DETECTION OF TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCES BY EXONUCLEOLYTIC ACTIVITY USING SINGLE-LABELED IMMOBILIZED PROBES ON SOLID PHASE 审中-公开
标题翻译：通过使用固体相位上的单标记固定化探针检测非离子表面活性剂的目标核酸序列
公开(公告)号：WO2012039529A1
公开(公告)日：2012-03-29
申请号：PCT/KR2010/009268
申请日：2010-12-23
申请人： SEEGENE, INC. , CHUN, Jong Yoon , LEE, Young Jo
发明人： CHUN, Jong Yoon , LEE, Young Jo
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11 , G01N33/52
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12Q1/6816 , C12Q1/6823 , C12Q1/6876 , C12Q2521/319 , C12Q2563/107 , C12Q2565/30 , C12Q2565/519
摘要： The present invention relates to a novel method for detection of target nucleic acid sequences by cyclic exonucleolytic reactions (CER) or exonucleolytic reactions (ER) using single-labeled immobilized probes on a solid phase. The present invention enables to detect target nucleic acid sequences on a solid phase using single-labeled systems. Comparing with multiple-labeled systems such as dual labeling, the present invention using single-labeled probes has excellent advantages in light of convenience and cost effectiveness in probe design and preparation. Furthermore, the measurement of changes of the signal decrease during reactions is responsible for more accurate qualitative and quantitative analysis of target nucleic acid sequences.
摘要翻译：本发明涉及通过使用固相上的单标记固定化探针的循环外源核解决反应（CER）或核酸外解反应（ER）检测靶核酸序列的新方法。本发明能够使用单标记系统检测固相上的靶核酸序列。与双标记等多标记体系相比，使用单标记探针的本发明在探针设计和制备中的便利性和成本效益方面具有优异的优点。此外，反应期间信号变化的测量的测量负责更准确地定性和定量分析靶核酸序列。

10. 发明申请

WO2010141390A2 NUCLEOTIDE TRANSIENT BINDING FOR SEQUENCING METHODS 审中-公开
标题翻译：用于测序方法的核心瞬态绑定
公开(公告)号：WO2010141390A2
公开(公告)日：2010-12-09
申请号：PCT/US2010036755
申请日：2010-05-28
申请人： LIFE TECHNOLOGIES CORP , VANDER HORN PETER B , CHEN CHENG-YAO , NISHIMURA STEFANIE YUKIKO , ZHOU ZHAOHUI
发明人： VANDER HORN PETER B , CHEN CHENG-YAO , NISHIMURA STEFANIE YUKIKO , ZHOU ZHAOHUI
CPC分类号： C12N9/1252 , C12Q1/68 , C12Q1/6804 , C12Q1/6818 , C12Q1/6827 , C12Q1/6869 , C12Q1/6872 , C12Y207/07007 , G01N2500/00 , C12Q2565/632 , C12Q2563/137 , C12Q2563/107 , C12Q2565/30 , C12Q2537/157
摘要： Provided herein are compositions and systems for use in polymerase-dependent, nucleotide transient-binding methods. The methods are useful for deducing the sequence of a template nucleic acid molecule and single nucleotide polymorphism (SNP) analyses. The methods rely on the fact that the polymerase transient-binding time for a complementary nucleotide is longer compared to that of a non-complementary nucleotide. The labeled nucleotides transiently-binds the polymerase in a template-dependent manner, but does not incorporate. The methods are conducted under any reaction condition that permits transient binding of a complementary or non-complementary nucleotide to a polymerase, and inhibits nucleotide incorporation.
摘要翻译：本文提供了用于聚合酶依赖性核苷酸瞬变结合方法的组合物和系统。该方法可用于推导模板核酸分子和单核苷酸多态性（SNP）分析的序列。该方法依赖于与非互补核苷酸相比，互补核苷酸的聚合酶瞬时结合时间更长的事实。标记的核苷酸以模板依赖的方式瞬时结合聚合酶，但不包括在内。所述方法在允许互补或非互补核苷酸与聚合酶短暂结合并且抑制核苷酸掺入的任何反应条件下进行。

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