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1. 发明申请

WO2017041084A3 MULTIVALENT PROBES HAVING SINGLE NUCLEOTIDE RESOLUTION 审中-公开
标题翻译：多核探针具有单核苷酸分辨率
公开(公告)号：WO2017041084A3
公开(公告)日：2017-04-27
申请号：PCT/US2016050376
申请日：2016-09-06
申请人： NANOSTRING TECH INC
发明人： KIM DAE , ROSS PAUL MARTIN , MEREDITH GAVIN , MANRAO ELIZABETH A
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q2525/161 , C12Q2525/313 , C12Q2563/179 , C12Q2565/514 , C12Q2565/519
摘要： The present invention relates to, among other things, polymer strands, probes, compositions, methods, and kits for enabling accurate and robust enzyme- and amplification-free detection of DNA and RNA with single base resolution (e.g., detection of a single nucleotide polymorphism (SNP), an insertion, and a deletion). The compositions, methods, and kits may further provide simultaneous detection of DNA and/or RNA and protein targets.
摘要翻译：本发明尤其涉及聚合物链，探针，组合物，方法和试剂盒，用于实现具有单碱基分辨率的DNA和RNA的准确和强大的无酶和无扩增检测（例如，检测单核苷酸多态性（SNP），插入和删除）。组合物，方法和试剂盒可进一步提供DNA和/或RNA和蛋白质靶标的同时检测。

2. 发明申请

WO2017015513A1 LOCKED NUCLEIC ACIDS FOR CAPTURING FUSION GENES 审中-公开
标题翻译：用于捕获融合基因的闭锁核酸
公开(公告)号：WO2017015513A1
公开(公告)日：2017-01-26
申请号：PCT/US2016/043430
申请日：2016-07-21
申请人： GUARDANT HEALTH, INC.
发明人： MORTIMER, Stefanie Ann, Ward
IPC分类号： C12Q1/68 , C40B40/06 , C40B30/04 , C12P19/34
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6827 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , C12Q2525/113 , C12Q2535/122 , C12Q2565/519
摘要： Provided herein is a method for enriching a sample for polynucleotides comprising a breakpoint of a fusion gene, comprising: a) contacting a probe set comprising a plurality of polynucleotide probes, each probe configured to specifically hybridize to a fusion gene, wherein the set comprises one or more high affinity polynucleotide probes (e.g., a polynucleotide comprising one or more locked nucleic acid nucleotides), with a mixture of polynucleotides under hybridization conditions to produce probe-captured polynucleotides; and b) isolating the probe-captured polynucleotides from the mixture, to produce a sample enriched with polynucleotides comprising breakpoint fragments of the fusion gene.
摘要翻译：本文提供了用于富集包含融合基因断点的多核苷酸的样品的方法，其包括：a）使包含多个多核苷酸探针的探针组接触，每个探针被配置为与融合基因特异性杂交，其中该组包含一个或更高亲和力的多核苷酸探针（例如，包含一个或多个锁定的核酸核苷酸的多核苷酸）与多核苷酸的混合物在杂交条件下产生探针捕获的多核苷酸; 和b）从混合物中分离探针捕获的多核苷酸，以产生富含融合基因的断点片段的多核苷酸的样品。

3. 发明申请

WO2016170181A1 METHOD FOR HYBRIDIZING A NUCLEIC ACID MOLECULE 审中-公开
标题翻译：用于杂交核酸分子的方法
公开(公告)号：WO2016170181A1
公开(公告)日：2016-10-27
申请号：PCT/EP2016/059167
申请日：2016-04-25
申请人： QIAGEN GMBH
发明人： KORFHAGE, Christian , FRICKE, Evelyn
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12Q1/6832 , C12Q2525/301 , C12Q2525/307 , C12Q2537/162 , C12Q2565/519
摘要： The present invention is directed to a method for hybridizing a nucleic acid molecule to another nucleic acid molecule and to a use of a nucleic acid molecule to reduce and/or avoid the formation of hairpin structures of a nucleic acid target molecule.
摘要翻译：本发明涉及用于将核酸分子与另一核酸分子杂交的方法以及核酸分子用于减少和/或避免形成核酸靶分子的发夹结构的方法。

4. 发明申请

WO2016074910A1 THERMOZYKLER UND VERFAHREN ZUM BETRIEB EINES THERMOZYKLERS 审中-公开
标题翻译：热循环仪及其操作方法使用热循环仪
公开(公告)号：WO2016074910A1
公开(公告)日：2016-05-19
申请号：PCT/EP2015/074643
申请日：2015-10-23
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： GUMBRECHT, Walter , HUANG, Yiwei , PAULICKA, Peter
IPC分类号： B01J19/00 , B01L7/00 , C12Q1/68
CPC分类号： B01L7/525 , B01L3/50273 , B01L2200/04 , B01L2300/123 , B01L2300/1822 , B01L2400/0481 , C12Q1/6834 , C12Q1/686 , C12Q2565/519 , C12Q2565/537 , C12Q2531/113
摘要： Die Erfindung betrifft einen Thermozykler und ein Verfahren zum Betrieb eines Thermozyklers. Das Verfahren zum Betrieb des Thermozyklers umfasst die Schritte: - Einstellen einer ersten Temperatur in einem ersten Temperaturbereich des Probenraums mittels eines ersten Mittels zum Denaturieren der Nukleinsäurestränge, - Einstellen einer zweiten Temperatur in einem zweiten Temperaturbereich des Probenraums mittels eines zweiten Mittels zum Hybridisieren eines Primers an die Nukleinsäuren, - Zugeben einer nukleinsäurehaltigen Probe in den ersten Temperaturbereich des Probenraums des Thermozyklers, - Denaturieren der Nukleinsäuren, - Bewegen eines beweglichen Abschnitts der ersten Außenwand derart, dass der Abschnitt auf die gegenüberliegende zweite Außenwand zu bewegt wird und sich die Probe von dem ersten zum zweiten Temperaturbereich bewegt, - Hybridisieren der Primer-Nukleinsäuremoleküle an die Nukleinsäurestränge, - Bewegen des beweglichen Abschnitts der ersten Außenwand derart, dass der Abschnitt von der gegenüberliegenden zweiten Außenwand weg bewegt wird und sich die Probe vom zweiten zum ersten Temperaturbereich bewegt, - Elongieren der Nukleinsäurestränge.
摘要翻译：本发明涉及一种热循环仪和用于操作的热循环仪的方法。热循环仪的操作方法包括以下步骤： - 通过的第1装置设置在一第一温度范围内的样品腔室的第一温度用于变性的核酸链， - 用于引物杂交到设置在第二温度范围内的样品腔室的第二温度通过的第二装置的装置的核酸， - 将热循环仪的样本空间的第一温度区域中的含核酸样本， - 变性核酸， - 移动所述第一外壁的可动部，使得该部分被朝向相对的第二外壁并从所述第一样品移动移动到第二温度范围内， - 杂交引物的核酸分子与核酸链， - 移动，使得该部分被从相对的第二外壁和s移开所述第一外壁的可动部余移动离开所述第二样品到第一温度范围， - 所述核酸链的伸长率。

5. 发明申请

WO2016018986A1 DETECTION OF TARGET NUCLEIC ACIDS USING HYBRIDIZATION 审中-公开
标题翻译：使用杂交检测目标核酸
公开(公告)号：WO2016018986A1
公开(公告)日：2016-02-04
申请号：PCT/US2015/042604
申请日：2015-07-29
申请人： ARIOSA DIAGNOSTICS, INC.
发明人： OLIPHANT, Arnold , ZAHN, Jacob , JUNEAU, Kara , BOGARD, Patrick , HUANG, Stephanie
IPC分类号： G01N33/48
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/6837 , C12Q1/6862 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2535/131 , C12Q2537/16 , C12Q2565/519
摘要： The present invention provides detection systems and methods for detection of loci and genomic regions in a sample, including mixed samples, using hybridization to an array.
摘要翻译：本发明提供用于使用与阵列的杂交来检测样品中的基因座和基因组区域的检测系统和方法，包括混合样品。

6. 发明申请

WO2015124779A1 METHODS FOR DETECTING MULTIPLE NUCLEIC ACIDS IN A SAMPLE 审中-公开
标题翻译：在样品中检测多种核酸的方法
公开(公告)号：WO2015124779A1
公开(公告)日：2015-08-27
申请号：PCT/EP2015/053759
申请日：2015-02-23
申请人： ALERE TECHNOLOGIES GMBH
发明人： ULLRICH, Thomas
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6818 , B01L3/502715 , B01L2300/0819 , B01L2400/0481 , C12Q1/6844 , C12Q2537/101 , C12Q2545/107 , C12Q2565/102 , C12Q2565/107 , C12Q2565/519
摘要： The present invention relates to methods for determining the presence and/or amount of multiple nucleic acids in a sample.
摘要翻译：本发明涉及用于确定样品中多种核酸的存在和/或量的方法。

7. 发明申请

WO2015070173A1 COMPOUNDS AND METHODS FOR DETECTING OLIGONUCLEOTIDES 审中-公开
标题翻译：用于检测寡核苷酸的化合物和方法
公开(公告)号：WO2015070173A1
公开(公告)日：2015-05-14
申请号：PCT/US2014/064874
申请日：2014-11-10
申请人： ISIS PHARMACEUTICALS, INC.
发明人： GREENLEE, Sarah , YU, Zhengrong , PRAKASH, Thazha, P. , MATSON, John E.
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/36 , C07H21/04 , C07H21/02
CPC分类号： C12Q1/6834 , C12Q1/6816 , C12Q1/6825 , C12Q1/6837 , C12Q2545/114 , C12Q2565/519 , C12Q2521/537 , C12Q2525/113 , C12Q2525/204 , C12Q2563/113
摘要： The present invention provides methods of detecting and/or quantitating a target oligonucleotide in a biological sample.
摘要翻译：本发明提供了在生物样品中检测和/或定量靶寡核苷酸的方法。

8. 发明申请

WO2015069787A1 METHODS FOR DETECTING NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：检测核酸的方法
公开(公告)号：WO2015069787A1
公开(公告)日：2015-05-14
申请号：PCT/US2014/064157
申请日：2014-11-05
申请人： HTG MOLECULAR DIAGNOSTICS, INC.
发明人： ROUNSEVILLE, Matt , MODUR, Vijay
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6834 , C12Q2521/327 , C12Q2521/501 , C12Q2521/514 , C12Q2525/161 , C12Q2533/107 , C12Q2537/125 , C12Q2561/125 , C12Q2565/519 , C12Q2521/319
摘要： Disclosed herein are methods for detecting a target nucleic acid molecule in a sample. The methods can include contacting a sample with a detectably labeled probe (detection probe) that specifically binds to a first target sequence in the target nucleic acid molecule, a bifunctional oligonucleotide including a portion that specifically binds to a second target sequence in the target nucleic acid molecule and a portion that specifically binds to an anchor, and a surface comprising the anchor. Specifically bound detection probe and bifunctional oligonucleotide are ligated and a reagent that specifically removes substantially all of the target nucleic acid is added. Unligated detection probe is removed and presence of the detectable label is detected. In other embodiments, the ligation and/or removal of target nucleic acid are omitted and the detection probe specifically bound to the target nucleic acid is detected.
摘要翻译：本文公开了用于检测样品中靶核酸分子的方法。所述方法可以包括将样品与特异性结合靶核酸分子中的第一靶序列的可检测标记的探针（检测探针）接触，双功能寡核苷酸，包括特异性结合靶核酸中的第二靶序列的部分分子和特异性结合锚的部分，以及包含锚的表面。连接特异性结合的检测探针和双功能寡核苷酸，并添加特异性去除基本上所有靶核酸的试剂。去除未螯合的检测探针，检测到可检测标记的存在。在其它实施方案中，省略靶核酸的连接和/或去除，并检测特异性结合靶核酸的检测探针。

9. 发明申请

WO2015059025A1 METHOD AND KIT FOR IDENTIFYING AND QUANTIFYING AT LEAST ONE SINGLE-STRANDED TARGET NUCLEIC ACID 审中-公开
标题翻译：用于识别和定量至少一个单一目标核酸的方法和工具包
公开(公告)号：WO2015059025A1
公开(公告)日：2015-04-30
申请号：PCT/EP2014/072219
申请日：2014-10-16
申请人： SIEMENS AKTIENGESELLSCHAFT
发明人： BATTERSBY, Thomas , GUMBRECHT, Walter , HOFMANN, Stefan , HUANG, Yiwei
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/682 , C12Q1/6816 , C12Q2525/207 , C12Q2525/313 , C12Q2563/125 , C12Q2565/519
摘要： The invention concerns a method for identifying and quantifying at least one single-stranded target nucleic acid (13) and a kit for detecting at least one single-stranded target nucleic acid (13) in a sample. The method comprises providing at least one solid support (1) with at least one catcher oligonucleotide (5) immobilized on the support (1), contacting the support (1) with at least one first adapter oligonucleotide (7), at least one second adapter oligonucleotide (9) and at least one single-stranded target nucleic acid (13), the first and/or the second adapter oligonucleotide (7, 9) having a label, and the target nucleic acid (13) is identified by detecting the label of the first and/or the second adapter oligonucleotide (7, 9).
摘要翻译：本发明涉及用于鉴定和定量至少一种单链靶核酸（13）和用于检测样品中至少一种单链靶核酸（13）的试剂盒的方法。所述方法包括提供至少一种固体支持物（1）与固定在载体（1）上的至少一种捕获寡核苷酸（5），使载体（1）与至少一种第一衔接子寡核苷酸（7）接触，至少一个第二接头寡核苷酸（9）和至少一个单链靶核酸（13），具有标记的第一和/或第二接头寡核苷酸（7,9）和靶核酸（13）通过检测标记第一和/或第二接头寡核苷酸（7,9）。

10. 发明申请

WO2015026873A1 ASSAYS FOR SINGLE MOLECULE DETECTION AND USE THEREOF 审中-公开
标题翻译：单分子检测及其用途的测定
公开(公告)号：WO2015026873A1
公开(公告)日：2015-02-26
申请号：PCT/US2014/051763
申请日：2014-08-19
申请人： SINGULAR BIO, INC.
发明人： FEHR, Adrian, Nielsen , COLLINS, Patrick, James , HERSCHLEB, Jill, Lyndon , JONES, Hywel, Bowden
IPC分类号： G01N33/53
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6809 , C12Q1/6825 , C12Q1/6837 , C12Q1/6876 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , C12Q2600/16 , C12Q2521/101 , C12Q2531/137 , C12Q2535/125 , C12Q2545/101 , C12Q2563/107 , C12Q2565/102 , C12Q2565/519 , C12Q2565/601 , C12Q2525/155 , C12Q2525/161 , C12Q2525/185 , C12Q2533/107 , C12Q2535/131 , C12Q2537/143
摘要： The invention relates to methods of detecting a genetic variation in a genetic sample from a subject using labeled probes and counting the number of labels in the probes.
摘要翻译：本发明涉及使用标记的探针检测来自受试者的遗传样品中的遗传变异并计数探针中的标记数目的方法。

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