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1. 发明申请

WO2016012870A1 SYSTEM FOR THE CHARACTERIZATION OF NUCLEIC ACID AND DETECTION OF DNA AMPLIFICATION USING ELECTRICAL METHOD 审中-公开
标题翻译：用于表征核酸的系统和使用电气方法检测DNA放大
公开(公告)号：WO2016012870A1
公开(公告)日：2016-01-28
申请号：PCT/IB2015/050983
申请日：2015-02-10
申请人： BHAT, Shama
发明人： CHANDRESHEKAR, Arun , DODDAMANI, Shashanka , RAJENDRAN, Sureshkumar , NANJE GOWDA, Raghu , MEKHILERI, Naveen Vijayan , SRIDHAR, Preetham , SHETTY, Prathap Babu , BELEYUR, Ravindra Kirana , ABBOY, Raghav
IPC分类号： C12M1/00 , G01N27/00 , C12Q1/00 , C12Q1/68
CPC分类号： G01N27/226 , B01L7/52 , B01L2200/143 , B01L2300/046 , B01L2300/0645 , B01L2300/0829 , C12Q1/686 , C12Q1/6865 , C12Q2565/607
摘要： A system (100) and method (700) for extracting electrical signals from one or more samples and testing the sample for one or more amplicons are provided. The system includes a plurality of vials (102) for receiving samples, a plurality of cover members (106) and electrodes (108) and an electronic circuit (104). Each vial is configured to receive one cover member (106) and a pair of electrodes (108), such that, the pair of electrodes (108) makes contact with the sample. The electronic circuit (104) is connected to the electrodes (108) and is configured to measure electrical properties of the samples present in the vials (102) through the electrodes. The change in the electrical properties of the sample can be used in determining the presence or absence of the amplicons and also in determining which of the amplicons is present in the sample.
摘要翻译：提供一种用于从一个或多个样本提取电信号并测试一个或多个扩增子的样本的系统（100）和方法（700）。该系统包括用于接收样品的多个小瓶（102），多个盖构件（106）和电极（108）和电子电路（104）。每个小瓶配置成接收一个盖构件（106）和一对电极（108），使得该对电极（108）与样品接触。电子电路（104）连接到电极（108）并且被配置为通过电极测量存在于小瓶（102）中的样品的电特性。样品的电学性质的变化可用于确定扩增子的存在或不存在，并且还用于确定样品中存在哪些扩增子。

2. 发明申请

WO2014059260A2 COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTING HUMAN PAPILLOMAVIRUS NUCLEIC ACID 审中-公开
标题翻译：用于检测人类斑马鱼核酸的组合物和方法
公开(公告)号：WO2014059260A2
公开(公告)日：2014-04-17
申请号：PCT/US2013/064519
申请日：2013-10-11
申请人： GEN-PROBE INCORPORATED
发明人： SCHRODER, Astrid R.W.
IPC分类号： C12Q1/70
CPC分类号： C12Q1/708 , C12Q1/6865 , C12Q2600/158
摘要： Disclosed are nucleic acid oligomers, including amplification oligomers, capture probes, and detection probes, for detection of a human papillomavirus (HPV) nucleic acid. Also disclosed are methods of specific nucleic acid amplification and detection using the disclosed oligomers, as well as corresponding reaction mixtures and kits.
摘要翻译：公开了用于检测人乳头瘤病毒（HPV）核酸的核酸寡聚体，包括扩增寡聚体，捕获探针和检测探针。还公开了使用所公开的寡聚体以及相应的反应混合物和试剂盒进行特异性核酸扩增和检测的方法。

3. 发明申请

WO2012150317A1 LINEAR DNA AMPLIFICATION 审中-公开
标题翻译：线性DNA扩增
公开(公告)号：WO2012150317A1
公开(公告)日：2012-11-08
申请号：PCT/EP2012/058194
申请日：2012-05-04
申请人： INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM) , STICHTING DIENST LANDBOUWKUNDIG ONDERZOEK , CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE (C.N.R.S) , UNIVERSITÉ DE STRASBOURG , VERDELHO TRINDADE VAN, Gerven, Luisa Miguel , GRONEMEYER, Hinrich , PATTABHIRAMAN, Shankara Narayanan
发明人： VERDELHO TRINDADE VAN, Gerven, Luisa Miguel , GRONEMEYER, Hinrich , PATTABHIRAMAN, Shankara Narayanan
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6865 , C12Q2522/101 , C12Q2525/143 , C12Q2535/122 , C12Q2521/131 , C12Q2525/173 , C12Q2531/101
摘要： The present invention provides materials and methods for DNA amplification, in particular linear amplification methods using RNA polymerase. These methods permit high- throughput sequencing of pictogram amounts of DNA and are of use in a range of applications including genome-wide profiling of transcription factors and epigenetic DNA and histone modifications, global transcript profiling, mapping of chromatin conformations, as well as for forensic use and archaeological studies.
摘要翻译：本发明提供用于DNA扩增的材料和方法，特别是使用RNA聚合酶的线性扩增方法。这些方法允许图形量的DNA的高通量测序，并且在一系列应用中使用，包括转录因子和表观遗传学DNA的全基因组谱和组蛋白修饰，全局转录谱分析，染色质构象的映射以及法医学使用和考古研究。

4. 发明申请

WO2011091393A1 SELF-FOLDING AMPLIFICATION OF TARGET NUCLEIC ACID 审中-公开
标题翻译：目标核酸的自折叠放大
公开(公告)号：WO2011091393A1
公开(公告)日：2011-07-28
申请号：PCT/US2011/022326
申请日：2011-01-25
申请人： RD BIOSCIENCES, INC. , JU, Jingliang
发明人： JU, Jingliang
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/70
CPC分类号： C12Q1/6853 , C12N15/1096 , C12Q1/6844 , C12Q1/6865 , C12Q1/707 , C12Q2531/143 , C12Q2525/301 , C12Q2525/161 , C12Q2525/143
摘要： The application relates generally to methods useful for the selective amplification of one or more target nucleic acid or fragments thereof, as well as compositions and kits comprising said amplification reaction mixtures. More specifically, the application relates to a composite primer that comprises a 5 ' promoter portion and a 3 ' target-recognition portion which is complementary to the 3 ' end portion of a target polynucleotide sequence; and optionally, a means for identifying the 5' end portion of the target polynucleotide sequence. The amplification reaction mixture comprises at least one handle-stem-loop structure which comprises a 5 ' single-stranded handle comprising the promoter portion and a double-stranded stem comprising at least one pair of self- folding segments hybridized to each other, and optionally, a single-stranded loop comprising the sequence between the pair of self- folding segments.
摘要翻译：本申请一般涉及可用于选择性扩增一种或多种靶核酸或其片段的方法，以及包含所述扩增反应混合物的组合物和试剂盒。更具体地，本申请涉及复合引物，其包含与靶多核苷酸序列的3'端部分互补的5'启动子部分和3'靶标识别部分; 以及任选的用于鉴定靶多核苷酸序列的5'端部分的方法。扩增反应混合物包括至少一个手柄 - 茎 - 环 - 结构，其包括包含促进剂部分的5'单链手柄和包含彼此杂交的至少一对自折叠片段的双链茎，以及任选地，包括在一对折叠片段之间的序列的单链环。

5. 发明申请

WO2010126913A1 METHODS AND KITS FOR USE IN THE SELECTIVE AMPLIFICATION OF TARGET SEQUENCES 审中-公开
标题翻译：用于选择性扩增目标序列的方法和工具
公开(公告)号：WO2010126913A1
公开(公告)日：2010-11-04
申请号：PCT/US2010/032631
申请日：2010-04-27
申请人： GEN-PROBE INCORPORATED , BECKER, Michael, M. , LIVEZEY, Kristin, W.
发明人： BECKER, Michael, M. , LIVEZEY, Kristin, W.
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6848 , C12Q1/6865 , C12Q2531/143 , C12Q2525/301
摘要： The present invention provides nucleic acid amplification methods that desirably reduce or eliminate false positive amplification signals resulting from contaminating biological material, e.g., nucleic acid, that may be present in one or more reagents used in an amplification reaction and/or that may be present in the environment in which an amplification reaction is performed. The invention offers the further advantage of requiring less stringent purification and/or sterility efforts than conventionally needed in order to ensure that enzymes and other reagents used in amplification reactions, and the environment in which an amplification reaction is performed, are free of bacterial or other nucleic acid contamination that may yield false positive results.
摘要翻译：本发明提供了核酸扩增方法，其期望地减少或消除由污染生物材料（例如核酸）产生的假阳性扩增信号，所述核酸可以存在于用于扩增反应的一种或多种试剂中和/或可存在于进行扩增反应的环境。本发明提供了进一步的优点，其需要比常规所需的更少的纯化和/或不育努力，以确保用于扩增反应的酶和其它试剂以及进行扩增反应的环境不含细菌或其它可能产生假阳性结果的核酸污染物。

6. 发明申请

WO2010120803A2 METHODS AND COMPOSITIONS FOR DETECTION OF SMALL RNAS 审中-公开
标题翻译：用于检测小RNA的方法和组合物
公开(公告)号：WO2010120803A2
公开(公告)日：2010-10-21
申请号：PCT/US2010/030922
申请日：2010-04-13
申请人： SOMAGENICS INC. , KAZAKOV, Sergei A. , KUMAR, Pavan , JOHNSTON, Brian H.
发明人： KAZAKOV, Sergei A. , KUMAR, Pavan , JOHNSTON, Brian H.
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11 , C12N15/115
CPC分类号： C12Q1/682 , C12Q1/6806 , C12Q1/6844 , C12Q1/6865 , C12Q2525/313 , C12Q2521/501 , C12Q2525/143 , C12Q2525/207 , C12Q2531/125
摘要： Currently, the circularization of small RNAs is broadly regarded as an obstacle in ligation-related assays and explicitly avoided while short lengths of linear RNA targets is broadly recognized as a factor limiting use of conventional primers in PCR-related assays. In contrast, the disclosed invention capitalizes on circularization of small RNA targets or their conjugates with oligonucleotide adapters. The circular RNA templates provide amplification of the target sequences via synthesis of multimer nucleic acids that can be either labeled for direct detection or subjected to PCR amplification and detection. Structure of small circular RNAs and corresponding multimeric nucleic acids provide certain advantages over current methods including flexibility in design of conventional RT and PCR primers as well as use of 5'-overlapping dimer-primers for efficient and sequence-specific amplification of short target sequences. Our invention also reduces number of steps and reagents while increasing sensitivity and accuracy of detection of small RNAs with both 2'OH and 2'-OMe at their 3' ends. Our invention increase sensitivity and specificity of detection of microRNAs and other small RNAs with both 2'OH and 2'-OMe at their 3' ends while allowing us to distinguish these two forms from each other.
摘要翻译：目前，小RNA的循环被广泛地认为是连接相关测定中的障碍，并且明确地避免，而短的长度的线性RNA靶被广泛认为是限制PCR相关测定中常规引物的使用的因素。相比之下，所公开的发明利用小RNA靶标或其与寡核苷酸衔接子的缀合物的环化。循环RNA模板通过多聚核酸的合成提供靶序列的扩增，所述多聚核酸可以被标记用于直接检测或进行PCR扩增和检测。小循环RNA和相应的多聚体核酸的结构提供了比现有方法（包括常规RT和PCR引物的设计灵活性）以及使用5'-重叠的二聚体 - 引物用于短目标序列的有效和序列特异性扩增的一些优点。我们的发明还减少了步骤和试剂的数量，同时提高了在3'端检测2'OH和2'-OMe的小RNA的灵敏度和准确度。我们的发明提高了在其3'末端检测microRNA和2'OH和2'-OMe的其他小RNA的敏感性和特异性，同时允许我们将这两种形式相互区分开。

7. 发明申请

WO2010078374A1 COMPOSITIONS, KITS AND RELATED METHODS FOR THE DETECTION AND/OR MONITORING OF LISTERIA 审中-公开
标题翻译：用于检测和/或监测LISTERIA的组合物，试剂盒和相关方法
公开(公告)号：WO2010078374A1
公开(公告)日：2010-07-08
申请号：PCT/US2009/069746
申请日：2009-12-29
申请人： GEN-PROBE INCORPORATED , RESHATOFF, Michael R. , LIVEZEY, Kristin W. , HOGAN, James J.
发明人： RESHATOFF, Michael R. , LIVEZEY, Kristin W. , HOGAN, James J.
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6816 , C12Q1/6865
摘要： Provided are compositions, kits, and methods for the identification of Listeria . In certain aspects and embodiments, the compositions, kits, and methods may provide improvements in relation to specificity, sensitivity, and speed of detection.
摘要翻译：提供用于鉴定李斯特菌的组合物，试剂盒和方法。在某些方面和实施方案中，组合物，试剂盒和方法可以提供与特异性，灵敏度和检测速度有关的改进。

8. 发明申请

WO2010061981A1 サイトケラチン１９　ｍＲＮＡの測定方法审中-公开
标题翻译：测量细胞因子-19 MRNA的方法
公开(公告)号：WO2010061981A1
公开(公告)日：2010-06-03
申请号：PCT/JP2009/070439
申请日：2009-11-30
申请人：東ソー株式会社 , 尾本大輔 , 斉藤寿一 , 大仲悟 , 林俊典
发明人：尾本大輔 , 斉藤寿一 , 大仲悟 , 林俊典
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09
CPC分类号： C12Q1/6853 , C12Q1/6865 , C12Q2525/143 , C12Q2545/114 , C12Q2561/113 , C12Q2531/143 , C12Q2521/107
摘要：　サイトケラチン１９　ｍＲＮＡ中の一部と相同的な配列を有する第一のプライマー、相補的な配列を有する第二のプライマー(第一または第二のプライマーのいずれか一方はその５'末端にプロモーター配列が付加されている)からなるオリゴヌクレオチドの組み合わせを用い、逆転写酵素により、プロモーター配列を含む２本鎖ＤＮＡを生成し、該２本鎖ＤＮＡを鋳型としてＲＮＡポリメラーゼによりＲＮＡ転写産物を生成し、該ＲＮＡ転写産物が引き続き前記逆転写酵素によるＤＮＡ合成の鋳型となって前記２本鎖ＤＮＡを生成する工程からなるＲＮＡ増幅工程において、増幅されたＲＮＡ産物量を、増幅されたＲＮＡと相補的２本鎖を形成するとシグナル特性が変化するように設計されたオリゴヌクレオチドプローブで経時的に測定することによる、サイトケラチン１９のｍＲＮＡの増幅・検出方法。
摘要翻译：公开了一种在RNA扩增过程中扩增/检测细胞角蛋白-19mRNA的方法。 RNA扩增方法包括以下步骤：使用寡核苷酸组合产生含逆转录酶启动子序列的双链DNA，所述寡核苷酸组合由具有与细胞角蛋白-19mRNA部分序列同源的第一引物和具有序列的第二引物组成与第一引物互补（条件是第一引物或第二引物具有加入其5'末端的启动子序列）; 使用双链DNA作为模板，用RNA聚合酶产生RNA转录物; 并使用RNA转录物作为用逆转录酶进行DNA合成的模板进一步生产双链DNA。该方法包括使用寡核苷酸探针测量随时间的扩增的RNA产物的量，所述寡核苷酸探针被设计为在寡核苷酸探针和扩增的RNA之间形成互补双链时发生信号特性变化。

9. 发明申请

WO2007005645A3 MATERIALS AND METHODS FOR THE GENERATION OF FULLY 2'-MODIFIED NUCLEIC ACID TRANSCRIPTS 审中-公开
标题翻译：生成完整的2'-变性核酸转录物的材料和方法
公开(公告)号：WO2007005645A3
公开(公告)日：2009-04-23
申请号：PCT/US2006025653
申请日：2006-06-30
申请人： ARCHEMIX CORP , CLOAD SHARON T , DIENER JOHN L , KEEFE ANTHONY DOMINIC , THOMPSON KRISTIN , WANG CHUNHUA
发明人： CLOAD SHARON T , DIENER JOHN L , KEEFE ANTHONY DOMINIC , THOMPSON KRISTIN , WANG CHUNHUA
IPC分类号： C07K14/00 , A61K38/00 , C07H21/04 , C12N15/115 , C12P21/06
CPC分类号： C12N15/1048 , C12N9/1247 , C12N15/115 , C12N2310/16 , C12N2310/321 , C12N2330/30 , C12Q1/6846 , C12Q1/6865 , G01N2333/9125 , C12Q2525/117 , C12Q2521/119 , C12N2310/3521
摘要： Materials and methods are provided for producing aptamer therapeutics having fully modified nucleotide triphosphates incorporated into their sequence.
摘要翻译：提供材料和方法用于产生具有并入其序列的完全修饰的三磷酸核苷酸的适体治疗剂。

10. 发明申请

WO2008090340A3 NUCLEIC ACID AMPLIFICATION AND TESTING 审中-公开
标题翻译：核酸扩增和测试
公开(公告)号：WO2008090340A3
公开(公告)日：2009-01-08
申请号：PCT/GB2008000235
申请日：2008-01-23
申请人： DIAGNOSTICS FOR THE REAL WORLD , LEE HELEN HWAI-AN , DINEVA MAGDA ANASTASSOVA , FLETCHER-BROWN FIONA FRANCES S
发明人： LEE HELEN HWAI-AN , DINEVA MAGDA ANASTASSOVA , FLETCHER-BROWN FIONA FRANCES S
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6865
摘要： Methods for amplifying a target nucleic acid by self-sustained amplification methods are described. The methods are designed, in particular, to be carried out without use of specialised lab facilities or instruments. Compositions, lyophilised formulations, and kits for carrying out the methods are also described.
摘要翻译：描述了通过自持扩增方法扩增靶核酸的方法。这些方法特别设计在不使用专门的实验室设备或仪器的情况下进行。还描述了组合物，冻干制剂和用于实施方法的试剂盒。

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