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1. 发明申请

WO2019116234A1 METHODS FOR DETERMINING MICROBIOME RIBOSOMAL RNA COMPOSITION CHANGES 审中-公开
公开(公告)号：WO2019116234A1
公开(公告)日：2019-06-20
申请号：PCT/IB2018/059889
申请日：2018-12-11
申请人： NESTEC S.A.
发明人： MIMMS, Larry , STACHELSKI, Jordan
IPC分类号： C12Q1/6813 , C12Q1/6883
CPC分类号： C12Q1/6813 , C12Q1/6883 , C12Q2600/158 , C12Q2545/113
摘要： Provided herein are methods for analyzing ribosomal RNA populations in a biological sample. Methods for detecting human and microbiome ribosomal RNA changes associated with gastrointestinal-related or liver-related conditions are also provided.

2. 发明申请

WO2017053683A1 FORMALIN FIXED PARAFFIN EMBEDDED (FFPE) CONTROL REAGENTS 审中-公开
标题翻译： FORMALIN FIXED PARAFFIN嵌入式（FFPE）控制试剂
公开(公告)号：WO2017053683A1
公开(公告)日：2017-03-30
申请号：PCT/US2016/053280
申请日：2016-09-23
申请人： MICROGENICS CORPORATION
发明人： SHAHBAZIAN, Mona , NORMAN, Kara , LAU, Aron , NATARAJ, Nakul
IPC分类号： G01N1/06 , G01N1/30 , G01N1/36 , G01N33/574 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6876 , C12Q1/6827 , C12Q1/6841 , C12Q2600/156 , C12Q2600/166 , G01N1/36 , G01N2001/2893 , G01N2001/364 , C12Q2543/10 , C12Q2545/113
摘要： The disclosure provides a plurality of nucleic acid sequences comprising multiple variants of a reference sequence. The disclosure further provides plasmids, cells, methods and kits comprising the same.
摘要翻译：本公开提供了包含参考序列的多个变体的多个核酸序列。本公开进一步提供了质粒，细胞，方法和包含其的试剂盒。

3. 发明申请

WO2015196141A1 NUCLEIC ACID SAMPLE PREPARATION 审中-公开
标题翻译：核酸样品制备
公开(公告)号：WO2015196141A1
公开(公告)日：2015-12-23
申请号：PCT/US2015036789
申请日：2015-06-19
申请人： BIOLOG DYNAMICS INC
发明人： KRISHNAN RAJARAM , CHARLOT DAVID J , TU EUGENE , MCCANA JAMES , KUMOSA LUCAS , SWANSON PAUL D , TURNER ROBERT , YANG KAI , DOBROVOLSKAYA IRINA , LIU DAVID , HINESTROSA SALAZAR JUAN PABLO , MENEZES JUSCILENE
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q2545/113 , C12Q2563/116 , C12Q2565/607 , C12Q2545/114
摘要： The present invention includes methods, devices and systems for isolating a nucleic acid from a fluid comprising cells. In various aspects, the methods, devices and systems may allow for a rapid procedure that requires a minimal amount of material and/or results in high purity nucleic acid isolated from complex fluids such as blood or environmental samples.
摘要翻译：本发明包括用于从包含细胞的流体分离核酸的方法，装置和系统。在各个方面，方法，装置和系统可以允许需要最少量的材料和/或产生从诸如血液或环境样品的复杂流体分离的高纯度核酸的快速程序。

4. 发明申请

WO2015155723A1 UNIVERSAL CONTROLS FOR SEQUENCING ASSAYS 审中-公开
标题翻译：通用测序的通用控制
公开(公告)号：WO2015155723A1
公开(公告)日：2015-10-15
申请号：PCT/IB2015/052578
申请日：2015-04-09
申请人： VELA OPERATIONS PTE. LTD.
发明人： LEE, Charlie Wah Heng , ARIYARATNE, Pramila Nuwantha
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12Q1/686 , C12Q1/6886 , C12Q1/707 , C12Q2600/158 , C12Q2600/166 , C12Q2545/107 , C12Q2545/113
摘要： The present invention relates to a positive and negative control and an extraction control, respectively, for sequencing assays. The present application discloses plasmids, kits, their uses and a method of detecting a specific nucleic acid, wherein the controls according to the present invention are used.
摘要翻译：本发明分别涉及用于测序测定的阳性和阴性对照和提取对照。本申请公开了质粒，试剂盒，其用途和检测特定核酸的方法，其中使用根据本发明的对照。

5. 发明申请

WO2015066695A1 MULTIPLE-CONTROL CALIBRATORS FOR DNA QUANTITATION 审中-公开
标题翻译：用于DNA量化的多控制校准器
公开(公告)号：WO2015066695A1
公开(公告)日：2015-05-07
申请号：PCT/US2014/063875
申请日：2014-11-04
申请人： EXACT SCIENCES CORPORATION
发明人： DOMANICO, Michael , TYLER, Ilse A. , AIZENSTEIN, Brian , ALLAWI, Hatim , LIDGARD, Graham P.
IPC分类号： C12Q1/68 , C07H21/04
CPC分类号： C12Q1/6851 , C12Q1/6846 , C12Q2521/301 , C12Q2525/204 , C12Q2545/113
摘要： The present invention provides DNA plasmids that find use as calibrators or reference standards for calculating DNA quantities in a sample. In particular, provided herein are DNA plasmids that contain multiple control fragments, and methods of their use in DNA quantitation.
摘要翻译：本发明提供DNA质粒，其可用作校准物或用于计算样品中DNA量的参考标准。特别地，本文提供了含有多个对照片段的DNA质粒及其在DNA定量中的用途。

6. 发明申请

WO2014033268A1 OPTICAL CHARACTERISATION OF DNA AND/OR RNA 审中-公开
标题翻译： DNA和/或RNA的光学特征
公开(公告)号：WO2014033268A1
公开(公告)日：2014-03-06
申请号：PCT/EP2013/068011
申请日：2013-08-30
申请人： TRINEAN NV
发明人： BOONEFAES, Tom
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N21/33
CPC分类号： G01N21/33 , C12Q1/68 , G01N2201/12 , Y10T436/143333 , C12Q2527/119 , C12Q2537/165 , C12Q2545/113
摘要： A method is described for characterising a sample comprising at least DNA and/or RNA. The method comprises obtaining a UV-VIS spectroscopic measurement of the sample comprising at least DNA and/or RNA, deriving an absorption parameter based on the UV-VIS spectroscopic measurement, and determining a DNA and/or RNA quantification present in the sample. Determining a DNA and/or RNA quantification thereby comprises taking into account a buffer and/or salt effect on the UV-VIS spectroscopic measurement irrespective of the actual buffer and salt content of the sample, based on said derived absorption parameter and reference spectral data including spectral information for buffer and/or salt effects.
摘要翻译：描述了用于表征包含至少DNA和/或RNA的样品的方法。该方法包括获得包含至少DNA和/或RNA的样品的UV-VIS光谱测量，基于UV-VIS光谱测量导出吸收参数，以及测定样品中存在的DNA和/或RNA定量。基于所述衍生的吸收参数和参考光谱数据，确定DNA和/或RNA定量因此包括考虑对UV-VIS光谱测量的缓冲液和/或盐影响，而不考虑样品的实际缓冲液和盐含量，包括用于缓冲和/或盐效应的光谱信息。

7. 发明申请

WO2013095137A3 METHODS, MEANS AND KITS FOR DETECTING SCARCE ANALYTES 审中-公开
标题翻译：用于检测分析分析的方法，手段和试剂盒
公开(公告)号：WO2013095137A3
公开(公告)日：2013-11-07
申请号：PCT/NL2012050910
申请日：2012-12-21
申请人： UNIV GRONINGEN
发明人： HERRMANN ANDREAS , PRUSTY DEEPAK KUMAR
IPC分类号： G01N33/542 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6816 , G01N33/542 , C12Q2545/113 , C12Q2545/114 , C12Q2563/125 , C12Q2563/131 , C12Q2565/101 , C12Q2565/601 , C12Q2565/627
摘要： The invention relates methods, means and kits for detecting and quantitation of chemical and biological analytes using catalytic signal amplification. Provided are methods, kits, and reagents for detecting a target molecule or interacting target molecules in a sample based on catalytic signal amplification, comprising the steps of (i) providing at least a first non-fluorescent and a second non-fluorescent probe capable of binding to distinct binding sites on the target molecule(s), the first probe being provided with a first ligand and the second probe being provided with a second ligand, wherein the first and second ligand can form a catalytic complex in the presence of a catalytic compound and wherein the catalytic complex can catalyze a chromogenic reaction; (ii) contacting a sample known or suspected to contain the target molecule(s) with said at least a first and second non-fluorescent probe under conditions that allow for binding of the probes to the target molecule(s) such that, upon binding of the probes to the target molecule(s), the first and second ligand are brought in close proximity of each other and together with the catalytic compound form a catalytic complex immobilized on the target molecule(s); and (iii) detecting the formation of the catalytic complex based on a non-enzymatic conversion of a water- soluble precursor dye into a chromophoric reporter dye.
摘要翻译：本发明涉及使用催化信号放大来检测和定量化学和生物分析物的方法，手段和试剂盒。本发明提供了方法，试剂盒，以及用于检测的目标分子或基于催化信号扩增样品中的相互作用的目标分子，包括（i）的步骤：提供至少第一非荧光和第二非荧光探针能够试剂结合靶的分子（或多个）上独特的结合位点，所述第一探针被设置有第一配体和所述第二探针被设置有第二配体，其中第一和第二配体可以形成在催化的存在下，催化络合物化合物，并且其中催化复合物可以催化显色反应; （ⅱ）接触已知或怀疑的样品以包含与所述靶标分子（S）的至少第一和第二非荧光探针，其允许对靶标分子（多个）的探针的结合的条件下，使得在结合探针与目标分子的相互作用，第一和第二配体彼此靠近并与催化化合物一起形成固定在靶分子上的催化复合物; 和（iii）基于水溶性前体染料的非酶促转化为发色报道染料来检测催化复合物的形成。

8. 发明申请

WO2013003849A4 PROCESS AND APPARATUS FOR QUANTIFYING NUCLEIC ACID IN A SAMPLE 审中-公开
标题翻译：在样品中定量核酸的方法和装置
公开(公告)号：WO2013003849A4
公开(公告)日：2013-06-27
申请号：PCT/US2012045271
申请日：2012-07-02
申请人： BIOQUANTA SA , BIOQUANTA CORP , ASSIST PUBL HOPITAUX DE PARIS , CONTI MARC , LORIC SYLVAIN , MANIVET PHILIPPE , DELACOTTE NICOLAS , KEUMEUGNI KWEMO CARLOSSE , SALIOU BAH MAMADOU
发明人： CONTI MARC , LORIC SYLVAIN , MANIVET PHILIPPE , DELACOTTE NICOLAS , KEUMEUGNI KWEMO CARLOSSE , SALIOU BAH MAMADOU
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/53
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/68 , C12Q2537/125 , C12Q2545/113 , C12Q2563/173 , C12Q2522/101 , C12Q2537/161 , C12Q2545/114
摘要： In one aspect, the present invention concerns methods and kits for quantifying a target nucleic acid in a sample. In embodiments, a method comprises sequestrating the target nucleic acid by one or more interactors to form a sequestered conjugate that will be further labeled to form a labeled conjugate. The signal produced by the labeled conjugate is measured and correlated to the amount of the target nucleic acid. In another aspect, the present invention concerns a method for quantifying a target nucleic acid in a sample by a reaction of the nucleic acids in the sample with a nucleic acid interactor or set of interactors to form a conjugate. The conjugate is then sequestered from the rest of the sample with a molecule bound to a support, to form a sequestered conjugate. The sequestered conjugate is labeled to form a labeled conjugate. The signal produced by the labeled conjugate is measured and correlated to the amount of the target nucleic acid. In some embodiments, the target nucleic acid is cell free nucleic acids. In embodiments, the interactor binds to nucleic acids in the sample in a nonsequence specific manner.
摘要翻译：一方面，本发明涉及用于定量样品中靶核酸的方法和试剂盒。在实施方案中，方法包括通过一种或多种相互作用体螯合靶核酸以形成将被进一步标记以形成标记的缀合物的螯合缀合物。测量由标记的缀合物产生的信号并与靶核酸的量相关。在另一方面，本发明涉及通过样品中的核酸与核酸相互作用体或一组相互作用体的反应来定量样品中的靶核酸以形成缀合物的方法。然后将缀合物与其余的样品以分子结合到载体上螯合形成螯合偶联物。被隔离的缀合物被标记以形成标记的缀合物。测量由标记的缀合物产生的信号并与靶核酸的量相关。在一些实施方案中，靶核酸是无细胞核酸。在实施方案中，相互作用者以非序列特异性方式结合样品中的核酸。

9. 发明申请

WO2013064789A1 PROCÉDÉ DE CLASSIFICATION D'ÉCHANTILLONS DE TISSUS FIXES ET INCLUS EN PARAFFINE 审中-公开
标题翻译：用于分类固定和嵌入在配子中的组织样品的方法
公开(公告)号：WO2013064789A1
公开(公告)日：2013-05-10
申请号：PCT/FR2012/052547
申请日：2012-11-05
申请人： ASSISTANCE PUBLIQUE - HÔPITAUX DE PARIS
发明人： MOURAH, Samia , LEBBE, Céleste , JANIN, Anne , CALVO, Fabien , GUEDJ, Mickael
IPC分类号： C12Q1/58
CPC分类号： C12Q1/6876 , C12Q1/6806 , C12Q1/6851 , C12Q2600/158 , C12Q2600/166 , C12Q2537/165 , C12Q2545/113
摘要： L'invention concerne un procédé de classification d'un échantillon de tissu fixé et inclus en paraffine, dans lequel on détermine si ledit échantillon à tester, désigné échantillon « j », est d'une qualité suffisante pour une étude de l'expression génique par quantification de son ARN, ledit procédé comprenant la comparaison du niveau d'expression de n gènes de référence dans ledit échantillon « j » par rapport au niveau d'expression contrôle desdits n gènes de référence.
摘要翻译：本发明涉及一种用于对固定和包埋在石蜡中的组织样品进行分类的方法，其包括以下步骤：确定所述待测样品（称为样品“j”）是否具有足够高的质量以使得能够进行研究的基因表达，所述方法包括比较所述样品“j”中n个参考基因在所述n个参照基因的对照表达水平上的表达水平的步骤。

10. 发明申请

WO2012171949A2 THROMBOEMBOLIC DISEASE 审中-公开
标题翻译：血栓性疾病
公开(公告)号：WO2012171949A2
公开(公告)日：2012-12-20
申请号：PCT/EP2012/061185
申请日：2012-06-13
申请人： GENDIAG.EXE, S.L. , SALAS, Eduardo , SORIA, José, Manuel , OGORELKOVA, Miroslava , ELOSUA, Roberto , VILA, Joan, S. , CASTILLO, Sergio
发明人： SALAS, Eduardo , SORIA, José, Manuel , OGORELKOVA, Miroslava , ELOSUA, Roberto , VILA, Joan, S. , CASTILLO, Sergio
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/6827 , C12Q1/6837 , C12Q2600/106 , C12Q2600/112 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2565/501 , C12Q2565/102 , C12Q2545/113 , C12Q2537/113 , C12Q2521/319 , C12Q2521/307
摘要： The invention relates to a method for a more appropriate thromboembolic event risk assessment based on the presence of different genetic variant. The invention also relates to a method for determining the risk of suffering a thromboembolism disease by combining the absence or presence of one or more polymorphic markers in a sample from the subject with conventional risk factors for thromboembolism as well as computer-implemented means for carrying out said method.
摘要翻译：本发明涉及一种基于不同遗传变体存在的更合适的血栓栓塞事件风险评估方法。本发明还涉及通过将来自受试者的样品中的一种或多种多态性标记物的不存在或存在与血栓栓塞的常规危险因素结合来确定患有血栓栓塞性疾病的风险的方法以及用于进行血栓栓塞的计算机实施的手段说的方法。

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