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1. 发明申请

WO2016037394A1 一种核酸单链环状文库的构建方法和试剂审中-公开
公开(公告)号：WO2016037394A1
公开(公告)日：2016-03-17
申请号：PCT/CN2014/088543
申请日：2014-10-14
申请人：深圳华大基因科技有限公司
发明人：耿春雨 , 郭荣荣 , 陈若莹 , 贺玲瑜 , 章文蔚 , 蒋慧
IPC分类号： C40B50/06 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6853 , B01J19/0046 , B01J2219/00529 , C12N9/22 , C12N9/93 , C12N11/06 , C12N15/10 , C12N15/1065 , C12N15/1082 , C12N15/1093 , C12N15/66 , C12Q1/6806 , C12Q1/6811 , C12Q1/6837 , C12Q1/6855 , C12Q1/686 , C12Q1/6874 , C12Q2525/191 , C12Q2565/537 , C40B40/06 , C40B40/08 , C40B50/06 , C40B50/14 , C40B60/14 , C12Q2521/525 , C12Q2535/122 , C12N15/1089 , C12Q2525/186 , C12Q2521/101
摘要：本发明提供了一种核酸单链环状文库的构建方法和试剂。所述方法包括：使用转座酶包埋复合体随机打断核酸并连接第一接头；在缺口处连接第二接头；进行第一PCR反应，其中一条引物5'端具有第一亲和标记，得到两端连接不同接头序列的产物；将产物与具有第二亲和标记的固相载体结合；变性，分离无亲和标记的单链；对单链进行环化。

2. 发明申请

WO2013154999A2 METHOD OF PREPARATION OF NANOPORE AND USES THEREOF 审中-公开
标题翻译：制备纳米材料的方法及其用途
公开(公告)号：WO2013154999A2
公开(公告)日：2013-10-17
申请号：PCT/US2013/035635
申请日：2013-04-08
申请人： THE TRUSTEES OF COLUMBIA UNIVERSITY IN THE CITY OF NEW YORK , GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, AS REPRESENTED BY THE SECRETARY OF COMMERCE , JU, Jingyue , KUMAR, Shiv , TAO, Chuanjuan , CHIEN, Minchen , RUSSO, James, J. , KASIANOWICZ, John, J. , ROBERTSON, Joseph, W.F.
发明人： JU, Jingyue , KUMAR, Shiv , TAO, Chuanjuan , CHIEN, Minchen , RUSSO, James, J. , KASIANOWICZ, John, J. , ROBERTSON, Joseph, W.F.
IPC分类号： C12Q1/42
CPC分类号： C12Q1/6883 , B82Y5/00 , C07H19/06 , C07H19/16 , C12Q1/42 , C12Q1/48 , C12Q1/6869 , C12Q2600/158 , G01N33/48721 , G01N2333/9125 , C12Q2521/525 , C12Q2521/543 , C12Q2535/107 , C12Q2565/631
摘要： This disclosure provides systems and methods for sequencing nucleic acids using nucleotide analogues and translocation of tags from incorporated nucleotide analogues through a nanopore. In aspects, this disclosure is related to composition, method, and system for sequencing a nucleic acid using tag molecules and detection of translocation through a nanopore of tags released from incorporation of the molecule.
摘要翻译：本公开提供了使用核苷酸类似物对核酸进行测序的系统和方法，以及通过纳米孔从掺入的核苷酸类似物转移标签。在一些方面，本公开涉及使用标签分子对核酸进行测序的组合物，方法和系统，以及通过从分子掺入释放的标记的纳米孔的易位检测。

3. 发明申请

WO2012166715A2 COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION OF DNA CLEAVAGE COMPLEXES 审中-公开
标题翻译：用于检测DNA CLEAVAGE复合物的组合物和方法
公开(公告)号：WO2012166715A2
公开(公告)日：2012-12-06
申请号：PCT/US2012/039834
申请日：2012-05-29
申请人： THE CHILDREN'S HOSPITAL OF PHILADELPHIA , TRUSTEES OF THE UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA , FELIX, Carolyn, A. , GREGORY, Brian , WANG, Li-san , CARILLO, Marie, L.
发明人： FELIX, Carolyn, A. , GREGORY, Brian , WANG, Li-san , CARILLO, Marie, L.
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16 , G01N33/5308 , C12Q2521/519 , C12Q2521/525 , C12Q2525/191 , C12Q2527/127 , C12Q2543/10
摘要： Compositions, methods, and kits for identifying protein-nucleic acid complexes, particularly DNA topoisomerase II-DNA complexes, are disclosed.
摘要翻译：公开了用于鉴定蛋白质 - 核酸复合物，特别是DNA拓扑异构酶II-DNA复合物的组合物，方法和试剂盒。

4. 发明申请

WO2009006584A2 METHODS AND COMPOSITIONS FOR IDENTIFYING CELLULAR RNA TRANSCRIPTS 审中-公开
标题翻译：用于鉴定细胞RNA转录物的方法和组合物
公开(公告)号：WO2009006584A2
公开(公告)日：2009-01-08
申请号：PCT/US2008/069178
申请日：2008-07-03
申请人： THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF COLORADO , VAN DYK, Linda F. , DIEBEL, Kevin W.
发明人： VAN DYK, Linda F. , DIEBEL, Kevin W.
IPC分类号： C12N15/09 , C07H21/04 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q1/6855 , C12Q1/705 , C12Q2525/207 , C12Q2525/191 , C12Q2521/107 , C12Q2527/149 , C12Q2521/525
摘要： Provided herein are methods to determine modifications of cellular RNA transcripts and/or map the 5' and 3' ends of RNA transcripts.
摘要翻译：本文提供了确定细胞RNA转录物修饰和/或绘制RNA转录物的5'和3'末端的方法。

5. 发明申请

WO2004020603A3 ANALYTE DETECTION 审中-公开
标题翻译：分析检测
公开(公告)号：WO2004020603A3
公开(公告)日：2004-04-22
申请号：PCT/US0327285
申请日：2003-08-29
申请人： AMERSHAM BIOSCIENCES CORP
发明人： SOOD ANUP , KUMAR SHIV , FULLER CARL , NELSON JOHN
IPC分类号： C12N15/09 , C12P19/34 , C12Q1/02 , C12Q1/42 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/6823 , C12Q1/6844 , C12Q2565/301 , C12Q2563/179 , C12Q2525/301 , C12Q2521/525 , C12Q2521/101
摘要： A method of characterizing an analyte sample is provided that includes the steps of: (a) anchoring the analyte to a nucleic acid template of known sequence; (b) conducting a DNA polymerase reaction that includes the reaction of a template, a non-hydrolyzable primer, at least one terminal phosphate-labeled nucleotide, DNA polymerase, and an enzyme having 3' 5' exonuclease activity which reaction results in the production of labeled polyphosphate; (c) permitting the labeled polyphosphate to react with a phosphatase to produce a detectable species characteristic of the sample; (d) detecting the detectable species. The method may include the step of characterizing the nucleic acid sample based on the detection. Also provided are methods of analyzing multiple analytes in a sample, and kits for characterizing analyte samples.
摘要翻译：提供表征分析物样品的方法，其包括以下步骤：（a）将分析物锚定到已知序列的核酸模板; （b）进行DNA聚合酶反应，其包括模板，不可水解的引物，至少一个末端磷酸酯标记的核苷酸，DNA聚合酶和具有3'5'核酸外切酶活性的酶的反应，该反应导致生产的标记多磷酸盐; （c）允许标记的多磷酸酯与磷酸酶反应以产生样品的可检测物种特征; （d）检测可检测物种。该方法可以包括基于检测来表征核酸样品的步骤。还提供了分析样品中多种分析物的方法，以及用于表征分析物样品的试剂盒。

6. 发明申请

WO03020891A3 SINGLE NUCLEOTIDE AMPLIFICATION AND DETECTION BY POLYMERASE 审中-公开
标题翻译：单核扩增和聚合酶检测
公开(公告)号：WO03020891A3
公开(公告)日：2003-05-08
申请号：PCT/US0227564
申请日：2002-08-29
申请人： AMERSHAM BIOSCIENCES CORP
发明人： NELSON JOHN , FULLER CARL , SOOD ANUP , KUMAR SHIV
IPC分类号： G01N33/53 , C07H19/10 , C07H19/20 , C07H21/00 , C12N15/09 , C12Q1/42 , C12Q1/48 , C12Q1/68 , G01N33/566 , C07H19/00 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12P19/34
CPC分类号： C12Q1/6823 , C12Q2545/114 , C12Q2521/525 , C12Q2521/101
摘要： A method of characterizing a nucleic acid sample is provided that includes the steps of: (a) conducting a DNA polymerase reaction that includes the reaction of a template, a non-hydrolyzable primer, at least one terminal phosphate-labeled nucleotide, DNA polymerase, and an enzyme having 3'->5' exonuclease activity which reaction results in the production of labeled polyphosphate; (b) permitting the labeled polyphosphate to react with a phosphatase to produce a detectable species characteristic of the sample; (c) detecting the detectable species; and (d) characterizing the nucleic acid sample based on the detection.
摘要翻译：提供表征核酸样品的方法，其包括以下步骤：（a）进行DNA聚合酶反应，其包括模板，不可水解的引物，至少一个末端磷酸酯标记的核苷酸，DNA聚合酶，和具有3'→5'核酸外切酶活性的酶，该反应导致标记的多磷酸盐的产生; （b）允许标记的多磷酸酯与磷酸酶反应以产生样品的可检测物质特征; （c）检测可检测物种; 和（d）基于检测来表征核酸样品。

7. 发明申请

WO2018231985A1 POLYNUCLEIC ACID MOLECULE ENRICHMENT METHODOLOGIES 审中-公开
公开(公告)号：WO2018231985A1
公开(公告)日：2018-12-20
申请号：PCT/US2018/037337
申请日：2018-06-13
申请人： GENETICS RESEARCH, LLC, D/B/A ZS GENETICS, INC.
发明人： GLOVER, William
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/683 , C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12Q2600/156 , C12Q2521/301 , C12Q2525/125 , C12Q2533/101 , C12Q2537/159 , C12Q2521/501 , C12Q2521/319 , C12Q2521/525 , C12Q2522/101 , C12Q2537/164
摘要： The invention provides methods of isolating a target nucleic acid in a sample. A polynucleotide region flanking a target nucleic acid may be modified by polymerase extension using modified nucleotides resistant to nuclease degradation to create a modified polynucleotide. Alternatively, an oligonucleotide including the modified nucleotides may be ligated to those regions to create the modified polynucleotide. The sample is exposed to a nuclease, thereby isolating the modified polynucleotide and the target nucleic acid. In other alternatives, terminal phosphates may be removed from a desired portion of a polynucleotide with a double-stranded break to create a modified polynucleotide that is resistant to nuclease degradation, or an epigenetic -binding moiety may be bound to a polynucleotide sequence within or flanking target nucleic acids to sterically inhibit nuclease degradation of the target nucleic acids.

8. 发明申请

WO2014187924A1 PYROPHOSPHOROLYTIC SEQUENCING 审中-公开
标题翻译：磷酸根序列
公开(公告)号：WO2014187924A1
公开(公告)日：2014-11-27
申请号：PCT/EP2014/060588
申请日：2014-05-22
申请人： ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED
发明人： MEULEMAN, Wouter
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2521/319 , C12Q2521/525 , C12Q2565/631
摘要： A method for determining the sequence of a target nucleic acid, including steps of contacting a target nucleic acid with a polymerase to sequentially remove nucleotide triphosphates from the target nucleic acid, wherein the nucleotide triphosphates that are removed have a variety of different base moieties; and distinguishing the different base moieties for the nucleotide triphosphates that are removed. Also provided is a apparatus including a nanopore positioned in a fluid impermeable barrier to form a passage through which a nucleotide triphosphate can pass from a first fluid reservoir to a second fluid reservoir, and a reaction mix in the first fluid reservoir that includes a polymerase, target nucleic acid having two strands, and pyrophosphoro lytic concentration of pyrophosphate.
摘要翻译：一种用于确定靶核酸序列的方法，包括使目标核酸与聚合酶接触以顺序地从靶核酸中除去三磷酸核苷酸的步骤，其中被去除的三磷酸核苷酸具有多种不同的碱基部分; 并区分待除去的三磷酸核苷酸的不同碱基部分。还提供了一种装置，其包括定位在流体不可渗透屏障中的纳米孔，以形成三磷酸核苷从第一流体储存器传递到第二流体储存器的通道，以及包括聚合酶的第一流体储存器中的反应混合物，具有两条链的靶核酸和焦磷酸焦磷酸溶解浓度。

9. 发明申请

WO2014110287A1 SEQUENCING NUCLEIC ACIDS BY ENZYME ACTIVATION 审中-公开
标题翻译：通过酶活性测序核酸
公开(公告)号：WO2014110287A1
公开(公告)日：2014-07-17
申请号：PCT/US2014/010922
申请日：2014-01-09
申请人： CAERUS MOLECULAR DIAGNOSTICS , FARINAS, Javier
发明人： FARINAS, Javier
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/34
CPC分类号： C12Q1/6874 , B01J19/0046 , B01J2219/00585 , B01J2219/00596 , B01J2219/00722 , C07H19/10 , C07H19/207 , C12Q1/34 , C12Q1/682 , C12Q1/6823 , C12Q1/6869 , C12Q2521/525 , C12Q2521/531 , C12Q2521/537 , C12Q2525/101 , C12Q2527/127 , C12Q2563/159
摘要： Provided herein are methods of nucleic acid sequencing using nucleotides with labels attached to the phosphate group so that incorporation of such nucleotides into a primed template results in formation of a phospho-label. Treatment of the phospho-label with a phophatase generates a free label which can be detected in a variety of ways. The labels can include, e.g., chemiluminescent labels, chemiluminescent substrates and enzyme activators. Also provided are reagents such as nucleotides phospholinked to labels such as enzyme activators.
摘要翻译：本文提供使用具有与磷酸基团连接的标记的核苷酸进行核酸测序的方法，以便将这样的核苷酸引入引发的模板中导致形成磷酸标记。用磷酸酶处理磷酸化标记产生可以以各种方式检测的自由标记。标记可以包括例如化学发光标记，化学发光底物和酶活化剂。还提供了诸如磷酸化为诸如酶活化剂的标记的核苷酸的试剂。

10. 发明申请

WO2014048185A1 从RNA样本富集转录本的方法及其用途审中-公开
公开(公告)号：WO2014048185A1
公开(公告)日：2014-04-03
申请号：PCT/CN2013/081581
申请日：2013-08-15
申请人：深圳华大基因科技服务有限公司
发明人：祝珍珍 , 黄文潘 , 章文蔚 , 陈茂山 , 张艳艳
IPC分类号： C12N15/10 , C40B40/08 , C40B50/06 , C40B60/02 , C12Q1/68 , C12M1/36
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/1096 , C12Q2521/525
摘要：本发明提出了从RNA样本富集转录本的方法及其用途。从RNA样本富集转录本的方法，包括：利用富集试剂对RNA样本进行处理，以便富集转录本，其中，所述富集试剂具有5'-单磷酸外切酶活性，所述转录本为在其5'末端具有帽子结构或三磷酸基团的RNA分子。利用该方法能够有效地富集转录本。

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