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1. 发明申请

WO0055353A9 IN VITRO MACROMOLECULE BIOSYNTHESIS METHODS USING EXOGENOUS AMINO ACIDS AND A NOVEL ATP REGENERATION SYSTEM 审中-公开
标题翻译：在体外大分子生物化学方法中使用异构氨基酸和新型ATP再生系统
公开(公告)号：WO0055353A9
公开(公告)日：2002-03-14
申请号：PCT/US0007095
申请日：2000-03-15
申请人： UNIV LELAND STANFORD JUNIOR , SWARTZ JAMES R , KIM DONG MYUNG
发明人： SWARTZ JAMES R , KIM DONG-MYUNG
IPC分类号： C12N15/09 , C07K1/02 , C07K14/525 , C12N9/10 , C12P21/00 , C12P21/02 , C12P21/06
CPC分类号： C12N9/1033 , C07K14/5255 , C12P21/00
摘要： Compositions and methods are provided for the enhanced in vitro synthesis of polypeptides. In order to improve the performance of in vitro protein synthesis reactions, metabolic inhibitors, or manipulation of a source organism, is used to diminish or avoid the action of enzymes responsible for undesirable amino acids production or depletion. A homeostatic system may be used for production of ATP, where the required high energy phosphate bonds are generated in situ, e.g. through coupling with an oxidation reaction. The homeostatic energy source will typically lack high energy phosphate bonds itself, and will therefore utilize free phosphate in the reaction mix during generation of ATP. The homeostatic energy source is provided in combination with an enzyme that catalyzes the creation of high energy phosphate bonds and with an enzyme that can use that high energy phosphate bond to regenerate ATP.
摘要翻译：提供组合物和方法用于增强多肽的体外合成。为了改善体外蛋白质合成反应的性能，使用代谢抑制剂或来源生物体的操作来减少或避免负责不良氨基酸产生或消耗的酶的作用。可以使用稳态系统来生产ATP，其中所需的高能磷酸键是原位产生的。通过与氧化反应的偶联。稳态能源本身通常缺乏高能量磷酸键，因此在产生ATP期间将在反应混合物中利用游离磷酸盐。稳态能量源与催化高能磷酸键的酶的结合，以及能够使用高能磷酸键重新生成ATP的酶组合提供。

2. 发明申请

WO2011140516A3 METHODS FOR CONTROL OF FLUX IN METABOLIC PATHWAYS THROUGH ENZYME RELOCATION 审中-公开
标题翻译：通过酶转移控制代谢途径中的通量的方法
公开(公告)号：WO2011140516A3
公开(公告)日：2012-01-05
申请号：PCT/US2011035639
申请日：2011-05-06
申请人： GREENLIGHT BIOSCIENCES INC , UNIV LELAND STANFORD JUNIOR , SWARTZ JAMES R
发明人： SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12N1/00 , C12N1/06 , C12N15/52
CPC分类号： C12P7/42 , C07K2319/034 , C12N9/1029 , C12N9/88 , C12N15/625 , C12N15/70 , C12P5/007 , C12P7/16 , C12P7/625 , C12P23/00 , Y02E50/10
摘要： Genetically manipulated cells, lysates of such cells, systems, and methods of use thereof are provided, where one or more enzymes in a pathway of interest are genetically modified to incorporate a peptide sequence that provides for relocation of the protein, e.g., to the periplasm, so as to sequester the enzyme, and where the enzyme controls flux in the pathway of interest.
摘要翻译：提供了遗传操纵的细胞，这种细胞的裂解物，系统及其使用方法，其中感兴趣途径中的一种或多种酶被遗传修饰以掺入提供蛋白重新定位的肽序列，例如提供给周质，以便螯合酶，以及酶控制感兴趣途径中的通量。

3. 发明申请

WO2005010155A3 METHODS OF DECOUPLING REACTION SCALE AND PROTEIN SYNTHESIS YIELD IN BATCH MODE 审中-公开
标题翻译：分批模式下反应规模和蛋白质合成产量的解耦方法
公开(公告)号：WO2005010155A3
公开(公告)日：2005-04-28
申请号：PCT/US2004022632
申请日：2004-07-12
申请人： UNIV LELAND STANFORD JUNIOR , VOLOSHIN ALEXEI M , SWARTZ JAMES R
发明人： VOLOSHIN ALEXEI M , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12N20060101 , C12N15/70 , C12P21/02 , C12P21/06
CPC分类号： C12P21/02
摘要： Biological macromolecules are synthesized in vitro in a thin film that provides for high surface area/volume ratio, allowing improved yield in scaled up reactions.
摘要翻译：生物大分子在体外以薄膜形式合成，提供高表面积/体积比，允许在放大的反应中提高产量。

4. 发明申请

WO2013177444A3 INFLUENZA VACCINE CONSTRUCTS 审中-公开
标题翻译：流感疫苗结构
公开(公告)号：WO2013177444A3
公开(公告)日：2014-04-10
申请号：PCT/US2013042498
申请日：2013-05-23
申请人： UNIV LELAND STANFORD JUNIOR
发明人： LU YUAN , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： A61K38/14
CPC分类号： C07K14/005 , A61K39/00 , A61K39/12 , A61K2039/5258 , A61K2039/6075 , A61K2039/64 , C07K14/00 , C07K2319/00 , C07K2319/42 , C07K2319/50 , C07K2319/70 , C12N7/00 , C12N2760/16134
摘要： Vaccine compositions and methods of producing and using the same are provided, which compositions comprise a modified HA stem domain in a trimeric configuration.
摘要翻译：提供了疫苗组合物及其生产和使用方法，该组合物包含三聚体构型的经修饰的HA茎结构域。

5. 发明申请

WO2013177440A3 ORDERED FLAGELLIN ARRAY AS AN IMMUNOSTIMULANT 审中-公开
标题翻译：订购的FLAGELLIN ARRAY作为免疫组织
公开(公告)号：WO2013177440A3
公开(公告)日：2014-03-06
申请号：PCT/US2013042493
申请日：2013-05-23
申请人： UNIV LELAND STANFORD JUNIOR
发明人： LU YUAN , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： A61K39/00 , A61K39/395
CPC分类号： C07K14/255 , A61K39/12 , A61K39/145 , A61K39/39 , A61K2039/5258 , A61K2039/55516 , A61K2039/6068 , C07K2319/00 , C12N2730/10134
摘要： Bacterial flagellin protein is modified to improve adjuvant activity.
摘要翻译：细菌鞭毛蛋白被修饰以改善佐剂活性。

6. 发明申请

WO2013177283A2 DISULFIDE STABILIZED FOLDON POLYPEPTIDES 审中-公开
标题翻译：不饱和脂肪醇的稳定性
公开(公告)号：WO2013177283A2
公开(公告)日：2013-11-28
申请号：PCT/US2013042229
申请日：2013-05-22
申请人： UNIV LELAND STANFORD JUNIOR
发明人： LU YUAN , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12P21/02 , C07K14/47
CPC分类号： C07K14/005 , C07K2319/22 , C07K2319/35 , C07K2319/40 , C07K2319/42 , C07K2319/50 , C07K2319/735 , C12N7/00 , C12N2760/16022 , C12N2760/16034 , C12N2795/10122 , C12P21/02
摘要： Intermolecular disulfide stabilized foldon polypeptides are provided.
摘要翻译：提供了分子间二硫键稳定的折叠多肽。

7. 发明申请

WO2014197655A1 CONTROL OF METABOLIC FLUX IN CELL-FREE BIOSYNTHETIC SYSTEMS 审中-公开
标题翻译：无细胞生物体系中代谢通量的控制
公开(公告)号：WO2014197655A1
公开(公告)日：2014-12-11
申请号：PCT/US2014041009
申请日：2014-06-05
申请人： GREENLIGHT BIOSCIENCES INC , UNIV LELAND STANFORD JUNIOR
发明人： SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12N9/00
CPC分类号： C12Q3/00 , C12N9/00
摘要： Methods are provided for controlling metabolic flux rate in a cell-free system comprising a complex set of enzymes, to produce a desired product of a pathway of interest. In the methods of the invention, measurements of metabolic performance parameters are taken by continuous monitoring or intermittent monitoring. Based on the metabolic performance parameters, the system is modified by one or more steps comprising: (i) altering enzyme levels in the cell-free system; (ii) altering feed rate of a substrate that controls redox flux or carbon flux to the cell-free system; (iii) altering 02 addition to the cell-free system; (iv) controlling efficiency of electron transport system by altering leakage across a membrane; wherein enzymes present in the pathway of interest catalyze production of a desired product.
摘要翻译：提供了用于控制包含复杂的酶组的无细胞系统中的代谢通过速率的方法，以产生感兴趣的途径的所需产物。在本发明的方法中，通过连续监测或间歇监测进行代谢性能参数的测量。基于代谢性能参数，系统通过一个或多个步骤修饰，包括：（i）改变无细胞系统中的酶水平; （ii）将控制氧化还原通量或碳通量的底物的进料速率改变为无细胞系统; （iii）将02添加到无细胞系统中; （iv）通过改变膜上的渗漏来控制电子传输系统的效率; 其中存在于感兴趣途径中的酶催化产生所需产物。

8. 发明申请

WO2005087802A3 PROCESS FOR PRODUCING POLYPEPTIDES 审中-公开
标题翻译：生产多糖的方法
公开(公告)号：WO2005087802A3
公开(公告)日：2006-03-02
申请号：PCT/US2005007880
申请日：2005-03-10
申请人： GENENTECH INC , WOON-LAM SUSAN LEUNG , SWARTZ JAMES R
发明人： WOON-LAM SUSAN LEUNG , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C07H21/04 , C07K14/47 , C07K14/65 , C07K14/705 , C07K16/00 , C07K16/26 , C12N1/20 , C12N1/21 , C12N1/32 , C12N1/38 , C12N15/70 , C12N15/74 , C12P21/00 , C12P21/02 , C12P21/06
CPC分类号： C12N15/67 , C07K16/26 , C07K2317/22 , C12N1/20 , C12N1/32 , C12N1/38 , C12N15/70 , C12P21/00
摘要： A process is described for producing a polypeptide heterologous to E. coli wherein E. coli cells comprising nucleic acid encoding the polypeptide are cultured in a culture medium while feeding to the culture medium a transportable organophosphate, such that the nucleic acid is expressed. The polypeptide is then recovered from the cells.
摘要翻译：描述了用于产生与大肠杆菌异源的多肽的方法，其中包含编码多肽的核酸的大肠杆菌细胞在培养基中培养，同时向培养基中加入可运输的有机磷酸酯，使得表达核酸。然后从细胞中回收多肽。

9. 发明申请

WO9856930A9 METHODS FOR PRODUCING HETEROLOGOUS DISULFIDE BOND-CONTAINING POLYPEPTIDES IN BACTERIAL CELLS 审中-公开
标题翻译：在细菌细胞中生产含异源二硫键的多肽的方法
公开(公告)号：WO9856930A9
公开(公告)日：1999-05-06
申请号：PCT/US9812004
申请日：1998-06-09
申请人： UNIV TEXAS , GENENTECH INC , GEORGIOU GEORGE , QIU JI , BESSETTE PAUL , SWARTZ JAMES R
发明人： GEORGIOU GEORGE , QIU JI , BESSETTE PAUL , SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12N15/09 , C07K14/47 , C07K14/65 , C07K14/81 , C12N1/21 , C12N9/02 , C12N9/64 , C12N9/72 , C12N15/70 , C12P21/02
CPC分类号： C12N9/0051 , C07K14/4743 , C07K14/8117 , C12N9/6459 , C12N15/70 , C12Y304/21069
摘要： Disclosed are methods and compositions for producing heterologous disulfide bond containing polypeptides in bacterial cells. In preferred embodiments, the methods involve co-expression of a prokaryotic disulfide isomerase, such as DsbC or DsbG and a gene encoding a recombinant eukaryotic polypeptide. Exemplary polypeptides disclosed include tissue plasminogen activator.
摘要翻译：公开了用于在细菌细胞中产生含有异源二硫键的多肽的方法和组合物。在优选的实施方案中，所述方法涉及原核二硫化物异构酶（例如DsbC或DsbG）和编码重组真核生物多肽的基因的共表达。所公开的示例性多肽包括组织纤溶酶原激活物。

10. 发明申请

WO9412630A3 METHOD FOR PRODUCING POLYPEPTIDE VIA BACTERIAL FERMENTATION 审中-公开
标题翻译：通过生物发酵生产多肽的方法
公开(公告)号：WO9412630A3
公开(公告)日：1994-10-13
申请号：PCT/US9311297
申请日：1993-11-19
申请人： GENENTECH INC , SWARTZ JAMES R
发明人： SWARTZ JAMES R
IPC分类号： C12N15/09 , B01F3/04 , B01F15/00 , C07K14/65 , C12M1/00 , C12M1/06 , C12M1/36 , C12M3/02 , C12N1/21 , C12N9/02 , C12N15/01 , C12P21/02 , C12Q1/02
CPC分类号： C12M41/34 , B01F3/04531 , B01F15/00207 , B01F15/0022 , B01F15/00344 , B01F2003/04581 , B01F2003/04673 , B01F2003/04879 , C07K14/65 , C12M27/02 , C12M41/28 , C12N9/0053 , C12N15/01
摘要： A process for producing a polypeptide of interest from fermentation of bacterial host cells comprising nucleic acid encoding the polypeptide is provided. In this method, the host cells employed have an inactivated electron transport chain. Further provided is a method for determining if a particular bacterial cell culture has a propensity for dissolved oxygen instability when fermented on a large scale.

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