专利快速检索-快速检索全球专利，免费商用专利数据库-IPRDB

21. 发明申请

WO0029621A3 METHOD FOR MEASURING TARGET POLYNUCLEOTIDES AND NOVEL ASTHMA BIOMOLECULES 审中-公开
标题翻译：测量目标多核苷酸和新型哮喘生物分子的方法
公开(公告)号：WO0029621A3
公开(公告)日：2000-11-09
申请号：PCT/US9926931
申请日：1999-11-12
申请人： GENELABS TECH INC
发明人： DOLGANOV GREGORY , NOVIKOV ALEXANDER
IPC分类号： C07K14/52 , C12Q1/68 , C12N15/63 , C07K16/24
CPC分类号： C12Q1/6883 , C07K14/521 , C12Q1/6809 , C12Q1/683 , C12Q2600/158 , C12Q2539/103
摘要： The present invention provides a method for simultaneously determining the levels of selected target polynucleotide sequences in a sample. In the method, selected target sequences are amplified using sequence-selective primer pairs to form double-stranded copies. The copies are cleaved with one or more endonucleases, and first and second aliquots of the cleaved fragment mixture are ligated to first and second adaptors, respectively, to form mixtures of first and second adaptor-fragment conjugates. The aliquots are combined and ligated to form conjugate dimers containing a conjugate from each of the first and second conjugate mixtures. After optional amplification, the conjugates are treated to release the adaptor segments, yielding target-identifier dimers. The dimers are polymerized to form target-identifier dimer multimers, and the relative abundances of the target-identifiers in one or more dimer multimers to provide an estimate of the levels of the selected target sequences in the sample. The present invention is particularly useful for determining expression levels of mRNA gene sequences in a sample, and for evaluating changes in mRNA expression levels among different samples or in response to changes in sample conditions. Also disclosed are certain polynucleotides and polypeptides that are useful for a variety of applications, particularly relating to asthma.
摘要翻译：本发明提供了用于同时测定样品中选定的靶多核苷酸序列水平的方法。在该方法中，使用序列选择性引物对扩增选定的靶序列以形成双链拷贝。用一种或多种内切核酸酶切割拷贝，并将切割的片段混合物的第一和第二等分试样分别连接到第一和第二衔接子上以形成第一和第二衔接子 - 片段缀合物的混合物。将等分试样组合并连接以形成含有来自第一和第二缀合物混合物中的每一种的缀合物的缀合物二聚体。在任选扩增后，处理缀合物以释放衔接子片段，产生目标 - 识别二聚体。二聚体聚合形成靶标识物二聚体多聚体，并且靶标识别物在一个或多个二聚体多聚体中的相对丰度提供样品中所选靶序列水平的估计。本发明对确定样品中mRNA基因序列的表达水平和评估不同样品中mRNA表达水平的变化或响应样品条件的变化特别有用。还公开了可用于多种应用，特别是与哮喘有关的某些多核苷酸和多肽。

22. 发明申请

WO00044936A1 MICROASSAY FOR SERIAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION AND APPLICATIONS THEREOF 审中-公开
标题翻译：用于串联分析基因表达及其应用的微阵列
公开(公告)号：WO00044936A1
公开(公告)日：2000-08-03
申请号：PCT/IB2000/000111
申请日：2000-01-25
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q2539/103
摘要： Method of obtaining a library of tags able to define a specific state of a biological sample, comprising the following successive steps: (1) extracting in a single-step mRNA from a small amount of a biological sample using oligo(dT)25 covalently bound to paramagnetic beads, (2) generating a double strand cDNA library, from said mRNA, (3) cleaving the obtained cDNAs using Sau3A I, (4) separating the cleaved cDNAs in two aliquots, (5) ligating the cDNA contained in each of said two aliquots via said Sau3A I restriction site to a linker consisting of one double-strand cDNA molecule having one of the following formulas: GATCGTCCC-X1 or GATCGTCCC-X2, wherein X1 and X2, which comprise 30-37 nucleotides and are different, include a 20-25 bp PCR priming site with a Tm of 55 DEG C-65 DEG C, (6) digesting the products obtained in step (5) with the tagging enzyme BsmF I, (7) blunt-ending said BsmF I tags with a DNA polymerase and mixing the tags ligated with the different linkers, (8) ligating the tags obtained in step (7) to form ditags with a DNA ligase, (9) amplifying the ditags obtained in step (8) with primers comprising 20-25 bp and having a Tm of 55 DEG -65 DEG C, (10) isolating the ditags having between 20 and 28 bp from the amplification products obtained in step (9) by digesting said amplification products with Sau3A I and separating the digested products, (11) ligating the ditags obtained in step (10) to form concatemers, purifiying said concatemers and separating the concatemers having more than 300 bp, (12) cloning and sequencing said concatemers and (13) analysing the different obtained tags.
摘要翻译：获得能够定义生物样品的特定状态的标签库的方法，包括以下连续步骤：（1）使用共价结合的寡聚（dT）25从少量生物样品中提取单步mRNA （2）从所述mRNA产生双链cDNA文库，（3）使用Sau3AⅠ切割获得的cDNA，（4）以两个等分试样分离切割的cDNA，（5）连接包含在每个将所述两个等分试样通过所述Sau3AⅠ限制性位点连接到由具有下式之一的一条双链cDNA分子组成的接头：GATCGTCCC-X1或GATCGTCCC-X2，其中X1和X2包含30-37个核苷酸并且不同，包括Tm为55℃-65℃的20-25bp PCR引发位点，（6）用标记酶BsmF I消化步骤（5）中获得的产物，（7）将所述BsmF I标签平端化用DNA聚合酶混合与不同接头连接的标签，（8）连接（7）中获得的e标签以用DNA连接酶形成二价，（9）用包含20-25bp，Tm为55-65℃，（10）的引物扩增步骤（8）中获得的ditag，通过用Sau3AI消化所述扩增产物并分离消化产物，分离步骤（9）中获得的扩增产物具有20至28bp的二价残基，（11）连接步骤（10）中获得的ditag以形成并发物所述并列物质并且分离具有超过300bp的（2）克隆和测序所述并列物质的并列物质，（13）分析不同获得的标签。

23. 发明申请

WO99014356A2 P53-INDUCED APOPTOSIS 审中-公开
标题翻译： P53诱导的细胞凋亡
公开(公告)号：WO99014356A2
公开(公告)日：1999-03-25
申请号：PCT/US1998/019300
申请日：1998-09-17
IPC分类号： C12N15/09 , C07K16/32 , C12P21/08 , C12Q1/68 , C12Q
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q1/6886 , C12Q1/6897 , C12Q2539/103 , C12Q2600/136 , C12Q2600/142
摘要： The most well-documented biochemical property of p53 is its ability to transcriptionally activate genes. Many of the genes which are activated by p53 expression prior to the onset of apoptosis are predicted to encode proteins which could generate or respond to oxidative stress, including one that is implicated in apoptosis within plant meristems. p53 may result in apoptosis through a three-step process: (i) the transcriptional induction of specific redox-related genes; (ii) the formation of reactive oxygen species (ROS); and (iii) the oxidative degradation of mitochondrial components, rapidly leading to cell death. Transcription of other genes is decreased by p53. Examination of the level of transcription of p53-induced or -repressed genes can be used to determine p53 status, to diagnose cancer, and to evaluate cytotoxicity or carcinogenicity of a test agent.
摘要翻译： p53的最佳记录性质是其转录激活基因的能力。据预测，编码的细胞凋亡蛋白，可能产生氧化应激和反应，因此，包括在分生组织参与细胞凋亡的蛋白质的开始之前通过p53的表达被激活的许多基因植物。 P53可以通过包括以下三个步骤的方法导致凋亡：（i）与氧化还原有关的特定基因的转录诱导; （ii）形成活性氧物质（ROS）; 和（iii）氧化降解线粒体成分，迅速导致细胞死亡。其他基因的转录被p53降低。检测p53诱导的或p53抑制的基因转录水平可用于诊断癌症并评估测试药剂的细胞毒性和致癌性。

24. 发明申请

WO1997010363A1 METHOD FOR SERIAL ANALYSIS OF GENE EXPRESSION 审中-公开
标题翻译：基因表达序列分析方法
公开(公告)号：WO1997010363A1
公开(公告)日：1997-03-20
申请号：PCT/US1996014638
申请日：1996-09-12
申请人： THE JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE
发明人： THE JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE , KINZLER, Kenneth, W. , VOGELSTEIN, Bert , VELVULESCU, Victor, E. , ZHANG, Lin
IPC分类号： C12Q01/68
CPC分类号： C12N15/1096 , C12Q1/6809 , C12Q1/6869 , C12Q2539/103
摘要： Serial analysis of gene expression, SAGE, a method for the rapid quantitative and qualitative analysis of transcripts is provided. Short defined sequence tags corresponding to expressed genes are isolated and analysed. Sequencing of over 1,000 defined tags in a short period of time (e.g., hours) reveals a gene expression pattern characteristic of the function of a cell or tissue. Moreover, SAGE is useful as a gene discovery tool for the identification and isolation of novel sequence tags corresponding to novel transcripts and genes.
摘要翻译：提供基因表达的串行分析，SAGE，一种用于快速定量和定性分析转录本的方法。分离并分析与表达基因相对应的短定义序列标签。在短时间（例如，小时）内测定超过1,000个定义的标签显示了细胞或组织功能特征的基因表达模式。此外，SAGE可用作用于鉴定和分离对应于新转录物和基因的新序列标签的基因发现工具。

25. 发明申请

WO2008070352A2 EFFICIENT ARRAYS OF AMPLIFIED POLYNUCLEOTIDES 审中-公开
标题翻译：放大多核苷酸的有效阵列
公开(公告)号：WO2008070352A2
公开(公告)日：2008-06-12
申请号：PCT/US2007/082896
申请日：2007-10-29
申请人： COMPLETE GENOMICS, INC. , DRMANAC, Radoje , CALLOW, Matthew
发明人： DRMANAC, Radoje , CALLOW, Matthew
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/686 , C12Q1/6809 , C12Q1/6874 , C12Q2565/501 , C12Q2539/103 , C12Q2531/119
摘要： The present invention is related generally to analysis of polynucleotides, particularly polynucleotides derived from genomic DNA. The invention provides methods, compositions and systems for such analysis. Encompassed by the invention are arrays of polynucleotides in which the polynucleotides have undergone multiple rounds of amplification in order to increase the strength of signals associated with single polynucleotide molecules.
摘要翻译：本发明一般涉及多核苷酸的分析，特别是源自基因组DNA的多核苷酸。本发明提供了用于这种分析的方法，组合物和系统。本发明包括多核苷酸阵列，其中多核苷酸经历多轮扩增以提高与单个多核苷酸分子相关的信号强度。

26. 发明申请

WO2007011016A1 転写開始部位を含む1本鎖遺伝子タグ群の製造方法审中-公开
标题翻译：用于生产具有转录启动位点的单链基因标签的方法
公开(公告)号：WO2007011016A1
公开(公告)日：2007-01-25
申请号：PCT/JP2006/314459
申请日：2006-07-21
申请人：株式会社ポストゲノム研究所 , 国立大学法人東京大学 , 橋本真一 , 松島綱治 , 飴谷章夫 , 鮫島由紀恵 , 志水加代
发明人：橋本真一 , 松島綱治 , 飴谷章夫 , 鮫島由紀恵 , 志水加代
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/68 , G06F19/00
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q2565/501 , C12Q2539/103 , C12Q2525/143
摘要：　本発明者らは、5’SAGE法において開示されている方法に、2本鎖DNAを1本鎖にするための手法を組み合わせることにより、mRNAの5’末端の塩基配列の種類と量比を反映する1本鎖遺伝子タグ群を作製した。そして、これを試料としてDNAチップへのハイブリダイゼーションを行ったところ、1本鎖遺伝子タグ群が、発現開始部位を標的とした遺伝子の発現確認に有効であることを見出した。本発明の1本鎖遺伝子タグ群を利用することにより、様々な転写開始部位を標的とした遺伝子の網羅的発現解析を行うことが可能である。
摘要翻译：可以通过使用将双链DNA转化为单链的方法来生成能够反映各自位于mRNA的5'端的核苷酸序列的种类和比例的单链基因标签与5-SAGE中公开的方法组合。当使用单链基因标签组作为样品在DNA芯片上进行杂交时，发现单链基因标签组可用于确认其中表达起始的基因的表达现场作为目标。通过使用该组单链基因标签，可以对其中使用各种转录起始位点的基因的表达进行综合分析。

27. 发明申请

WO2006069346A2 METHYLATION-SENSITIVE RESTRICTION ENZYME ENDONUCLEASE METHOD OF WHOLE GENOME METHYLATION ANALYSIS 审中-公开
标题翻译：甲基化敏感限酶法核酸内切酶全基因组甲基化分析
公开(公告)号：WO2006069346A2
公开(公告)日：2006-06-29
申请号：PCT/US2005/046896
申请日：2005-12-20
申请人： ILLUMINA, INC. , GUNDERSON, Kevin
发明人： GUNDERSON, Kevin
IPC分类号： C12Q1/68 , C12P19/34
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q2521/331 , C12Q2521/101 , C12Q2539/103
摘要： The invention provides methods of identifying a plurality of reactive recognition sites for a restriction endonuclease in genomic DNA. In particular embodiments, the methods can be used to identify methylation state of a plurality of CpG target sites in genomic DNA. The method can include steps of treating genomic DNA with a restriction endonuclease, thereby producing genomic DNA fragments; ligating the fragments, thereby forming a concatenated DNA; and identifying sequence portions of the concatenated DNA that are re-ordered compared to the genomic DNA.
摘要翻译：本发明提供了鉴定基因组DNA中限制性内切核酸酶的多个反应性识别位点的方法。在特定的实施方案中，该方法可用于鉴定基因组DNA中多个CpG靶位点的甲基化状态。该方法可以包括用限制性内切核酸酶处理基因组DNA的步骤，由此产生基因组DNA片段; 连接片段，从而形成连接的DNA; 并鉴定与基因组DNA相比重新排序的级联DNA的序列部分。

28. 发明申请

WO2005071112A3 MOLECULAR ANALYSIS 审中-公开
标题翻译：分子分析
公开(公告)号：WO2005071112A3
公开(公告)日：2005-12-08
申请号：PCT/GB2005000244
申请日：2005-01-26
申请人： ISIS INNOVATION , VAUX DAVID
发明人： VAUX DAVID
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6811 , C12Q2539/103 , C12Q2531/113 , C12Q2525/151
摘要： The present invention relates to a method of determining the sequence and/or occurrence frequency of a number of variable gene inserts from a gene library, which inserts exhibit a desired specific characteristic, wherein each variable gene insert is flanked (5') and (3') by known sequences, the method comprising; selecting the number of inserts by their ability to exhibit the desired specific characteristic, conducting polymerase chain reaction to amplify the selected number of variable gene inserts to produce components of a mixed PCR product, ligating the components of the mixed PCR product to produce a concatenated sequence and sequencing or determining the occurrence of the gene inserts in the concatenated sequence.
摘要翻译：本发明涉及确定来自基因文库的许多可变基因插入片段的序列和/或出现频率的方法，该插入片段表现出所需的特异性特征，其中每个可变基因插入片段（5'）和（3' '），该方法包括：通过它们显示所需特异性特征的能力来选择插入物的数目，进行聚合酶链式反应以扩增选定数目的可变基因插入物以产生混合PCR产物的组分，连接混合PCR产物的组分以产生连接序列并测序或确定连锁序列中基因插入的出现。

29. 发明申请

WO2005079357A2 NUCLEIC ACID REPRESENTATIONS UTILIZING TYPE IIB RESTRICTION ENDONUCLEASE CLEAVAGE PRODUCTS 审中-公开
标题翻译：使用IIB型限制性内切酶产品的核酸代表
公开(公告)号：WO2005079357A2
公开(公告)日：2005-09-01
申请号：PCT/US2005004571
申请日：2005-02-15
申请人： DANA FARBER CANCER INST INC , MEYERSON MATTHEW L , TENGS TORSTEIN
发明人： MEYERSON MATTHEW L , TENGS TORSTEIN
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/1093 , C12N15/66 , C12Q2539/103 , C12Q2521/313
摘要： This invention encompasses nucleic acid libraries comprising Type IIB restriction endonuclease cleavage products, or tags, including concatenated tags, and using concatenated and single Type IIB restriction endonuclease cleavage tags in diverse methods including karyotyping, pathogen discovery, identification of novel genes, subtraction techniques and transcript profiling.
摘要翻译：本发明包括包含IIB限制性内切核酸酶切割产物或包括连接标签的标签的核酸文库，并且使用包括核型分析，病原体发现，新基因鉴定，减法技术和转录物在内的不同方法中的连接和单一IIB型限制性内切酶切割标签剖析。

30. 发明申请

WO2004099445A1 USE OF A TYPE III RESTRICTION ENZYME TO ISOLATE IDENTIFICATION TAGS COMPRISING MORE THAN 25 NUCLEOTIDES 审中-公开
标题翻译：使用III型限制酶分离鉴定标签，包含超过25个核苷酸
公开(公告)号：WO2004099445A1
公开(公告)日：2004-11-18
申请号：PCT/JP2003/005840
申请日：2003-05-09
申请人： IWATE PREFECTURAL GOVERNMENT , KAHL, Guenter , WINTER, Peter , KRUEGER, Detlev , REICH, Stefanie , MATSUMURA, Hideo , TERAUCHI, Ryohei
发明人： KAHL, Guenter , WINTER, Peter , KRUEGER, Detlev , REICH, Stefanie , MATSUMURA, Hideo , TERAUCHI, Ryohei
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q1/6837 , C12Q2539/103 , C12Q2525/204 , C12Q2521/301 , C12Q2545/114
摘要： The type III restriction enzyme EcoP15I is used to isolate from cDNA of an expressed gene a tag comprising more than 25 nucleotides and capable of identifying the expressed gene, wherein the 3' end of the tag is defined by a cleavage site of the type III restriction enzyme and the 5' end of the tag is defined by the cleavage site of another restriction enzyme that is closest to the 3' end of the cDNA of the expressed gene. The tag of the invention allows accurate quantitative gene expression analysis and rapid gene expression profiling in any organism for which no expressed sequence tag (EST) database is available.
摘要翻译： III型限制酶EcoP15I用于从表达基因的cDNA分离包含多于25个核苷酸并且能够鉴定表达基因的标签，其中标签的3'末端由III型限制酶切割位点酶和标签的5'末端由最接近表达基因的cDNA的3'末端的另一限制酶的切割位点定义。本发明的标签允许在没有表达序列标签（EST）数据库的任何生物体中进行精确的定量基因表达分析和快速的基因表达谱。

你已经成功收藏专利！

检索式保存成功!

IPRDB

热门服务

关于我们

友情链接

联系方式