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11. 发明申请

WO2015049356A1 A METHOD OF IDENTIFYING OR PRODUCING AN APTAMER 审中-公开
标题翻译：鉴定或生产APTAMER的方法
公开(公告)号：WO2015049356A1
公开(公告)日：2015-04-09
申请号：PCT/EP2014/071205
申请日：2014-10-02
申请人： TOLLE, Fabian , FRIEDRICH, Felix , HECKEL, Alexander , MAYER, Günter
发明人： TOLLE, Fabian , FRIEDRICH, Felix , HECKEL, Alexander , MAYER, Günter
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/10 , C12N15/115
CPC分类号： C12Q1/6811 , C12N15/115 , C12N2310/16 , C12N2320/13 , C12Q2525/117 , C12Q2525/205 , C12Q2541/101
摘要： The invention relates to amethod of identifying or producing an aptamer,and a reagent comprising a nucleic acid ligand capable of binding a target sample, wherein the nucleic acid ligand comprises at least one nucleobase modified to contain an azide-alkyne chemical group.
摘要翻译：本发明涉及鉴定或产生适体的方法，以及包含能够结合目标样品的核酸配体的试剂，其中所述核酸配体包含至少一个经修饰以含有叠氮化物基团的核碱基。

12. 发明申请

WO2015026845A2 NUCLEOTIDE ANALOGS 审中-公开
标题翻译：核苷酸类似物
公开(公告)号：WO2015026845A2
公开(公告)日：2015-02-26
申请号：PCT/US2014051726
申请日：2014-08-19
申请人： ABBOTT MOLECULAR INC
发明人： KIM DAE HYUN
IPC分类号： C12N15/10 , C07H19/10 , C07H19/20
CPC分类号： C12Q1/6806 , C07H19/10 , C07H19/20 , C07H21/04 , C12N15/1065 , C12N15/1093 , C12Q2525/117 , C12Q2525/191
摘要： Provided herein is technology relating to the manipulation and detection of nucleic acids, including but not limited to compositions, methods, and kits related to nucleotides comprising a chemically reactive linking moiety.
摘要翻译：本文提供与核酸的操作和检测有关的技术，包括但不限于涉及包含化学反应性连接部分的核苷酸的组合物，方法和试剂盒。

13. 发明申请

WO2015009844A2 MIRROR BISULFITE ANALYSIS 审中-公开
标题翻译：镜像二硫分析
公开(公告)号：WO2015009844A2
公开(公告)日：2015-01-22
申请号：PCT/US2014046876
申请日：2014-07-16
申请人： ZYMO RES CORP
发明人： JIA XI-YU , SUN XUEGUANG
IPC分类号： G01N33/53
CPC分类号： C12Q1/6858 , C12Q2521/531 , C12Q2523/125 , C12Q2525/117
摘要： Reagents and methods for detection and quantitation of DNA hydroxymethylcytosine (5hmC) are provided. Specifically, genome-wide and loci analysis methods are provided that utilizes methylated primers coupled with bisulfite-sequencing for detecting and quantitating 5hmC levels in the genome. This methodology also allows quantitation of 5hmC levels at a single CpG. This method, was used to map and quantitate 5hmC sites of neurons from the human brain. This novel method can determine the exact location and abundance of 5hmC, which with bioinformatic analysis utilizing software and computers can facilitate our understanding of how modified cytosines such as hydroxymethylcytosine play a role in regulating gene expression in the brain.
摘要翻译：提供了检测和定量DNA羟甲基胞嘧啶（5hmC）的试剂和方法。具体而言，提供了使用与亚硫酸氢盐测序偶联的甲基化引物来检测和定量基因组中5hmC水平的全基因组和基因座分析方法。该方法还可以在单个CpG上定量5hmC的水平。该方法用于绘制和定量人脑中5hmC的神经元位点。这种新方法可以确定5hmC的确切位置和丰度，利用软件和计算机进行生物信息学分析可以帮助我们理解修饰的胞嘧啶（如羟甲基胞嘧啶）如何在调节大脑基因表达中发挥作用。

14. 发明申请

WO2014150851A1 NUCLEOTIDE ANALOGS FOR SEQUENCING 审中-公开
标题翻译：用于测序的核苷酸模拟物
公开(公告)号：WO2014150851A1
公开(公告)日：2014-09-25
申请号：PCT/US2014/024391
申请日：2014-03-12
申请人： IBIS BIOSCIENCES, INC. , HAYDEN, Mark A. , HUFF, Jeffrey , ESHOO, Mark W. , PICURI, John
发明人： HAYDEN, Mark A. , HUFF, Jeffrey , ESHOO, Mark W. , PICURI, John
IPC分类号： C07H21/04 , C07H19/00 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C07H19/10 , C07H21/04 , C12Q2523/319 , C12Q2525/117 , C12Q2563/107 , C12Q2563/113 , C12Q2563/116 , C12Q2563/137
摘要： Provided herein is technology relating to sequencing nucleic acids, but not exclusively, to compositions, methods, systems, and kits related to nucleotides comprising an electrochemically detectable moiety and one or more photolabile synthesis-inhibiting moieties.
摘要翻译：本文提供了与核酸测序相关的技术，但不排他地涉及与包含电化学可检测部分和一个或多个光不稳定合成抑制部分的核苷酸相关的组合物，方法，系统和试剂盒。

15. 发明申请

WO2014051076A1 BNA CLAMP METHOD 审中-公开
标题翻译： BNA钳法
公开(公告)号：WO2014051076A1
公开(公告)日：2014-04-03
申请号：PCT/JP2013076329
申请日：2013-09-27
申请人： BNA INC
发明人： IMANISHI TAKESHI , ORITA AYAKO , BAN IKUYA
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09
CPC分类号： C12Q1/6858 , C07H19/06 , C07H19/16 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q2525/117 , C12Q2535/131 , C12Q2549/126
摘要： Provided is an examination method allowing highly sensitive and highly accurate detection of a target nucleic acid (for example a mutant gene), while being simple and low cost. More specifically, in a nucleic acid amplification reaction, an oligonucleotide analog containing 1 or 2 or more of at least one kind of unit structure of each kind of nucleotide analogs represented by the general formula (I) (symbols in the formula are as defined in the description) or similar, or a salt thereof, is used as clamp nucleic acid, the amplification of a non target nucleic acid (for example a wild-type gene) in a sample is inhibited, and thus a target nucleic acid is selectively amplified and the amplified nucleic acid is detected.
摘要翻译：本发明提供了一种检测方法，其能够简单且成本低，能够高精度地检测靶核酸（例如突变型基因）。更具体地说，在核酸扩增反应中，含有1或2以上的通式（I）表示的各种核苷酸类似物的至少一种单元结构的寡核苷酸类似物（式中的符号如描述）或类似物或其盐用作钳位核酸，样品中非靶核酸（例如野生型基因）的扩增被抑制，因此靶核酸被选择性扩增并检测扩增的核酸。

16. 发明申请

WO2011150852A1 COMPOSITIONS AND METHODS FOR SEQUENCING NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：用于测序核酸的组合物和方法
公开(公告)号：WO2011150852A1
公开(公告)日：2011-12-08
申请号：PCT/CN2011/075106
申请日：2011-06-01
申请人： INDUSTRIAL TECHNOLOGY RESEARCH INSTITUTE , CHIOU, Chung-Fan , PAN, Chao-Chi , FANN, Jenn-Yeh , CHANG, Shang-Chia , FU, Tsu-Ju
发明人： CHIOU, Chung-Fan , PAN, Chao-Chi , FANN, Jenn-Yeh , CHANG, Shang-Chia , FU, Tsu-Ju
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C07H21/00 , C07H21/04 , C12Q1/6869 , C12Q2525/117 , C12Q2525/119 , C12Q2565/101
摘要： The present invention provides a method for sequencing nucleic acids, comprising the use of nucleotide analogs and a nucleic acid polymerase enzyme or enzyme complex with proofreading activity. The nucleotide analogs may be incorporated into a replicating strand and induce the proofreading activity of the polymerase enzyme, thereby prolonging the duration of a signal associated with nucleotide incorporation.
摘要翻译：本发明提供了一种核酸测序方法，其包括使用核苷酸类似物和具有校对活性的核酸聚合酶或酶复合物。核苷酸类似物可以并入复制链中并诱导聚合酶的校对活性，从而延长与核苷酸掺入相关信号的持续时间。

17. 发明申请

WO2011132801A1 消光性ならびに蛍光性の核酸塩基類似体とその応用审中-公开
标题翻译：具有猝灭特性的核酸碱基模拟物及其荧光和应用
公开(公告)号：WO2011132801A1
公开(公告)日：2011-10-27
申请号：PCT/JP2011/060343
申请日：2011-04-21
申请人：独立行政法人理化学研究所 , タグシクス・バイオ株式会社 , 平尾一郎 , 平尾路子 , 横山茂之 , 三井雅雄 , 山重りえ
发明人：平尾　一郎 , 平尾　路子 , 横山　茂之 , 三井　雅雄 , 山重　りえ
IPC分类号： C12N15/09 , C07H19/044 , C07H19/073 , C12Q1/68 , G01N33/53 , G01N33/542
CPC分类号： G01N21/6486 , C07H19/044 , C12Q1/6818 , C12Q2525/117
摘要：　本発明は、消光性ならびに蛍光性の核酸塩基類似体とその応用を提供することを目的とする。本発明の消光剤は、式Ｉ［化１］［式Ｉにおいて、Ｒ１は及びＲ２は　リボース、デオキシリボース、　水素、水酸基、ＳＨ基、ハロゲン、　置換又は未置換の、炭素数２ないし１０のアルキル基、アルケニル基又はアルキニル基、　窒素原子または硫黄原子を含む、１又は複数の５員ヘテロ環、１又は複数の６員ヘテロ環、１又は複数の複素環ヘテロ環、1又は複数の芳香族環、　糖、糖鎖、アミノ酸、ペプチド、　リンカーを介して結合した蛍光性分子からなる群から独立に選択される基である］。で示す２－ニトロピロール構造を有することを特徴とする。
摘要翻译：公开了具有淬灭特性和荧光及其应用的核酸碱基类似物。具体公开的是猝灭剂，其特征在于具有式（I）所示的2-硝基吡咯结构。 [式（I）中，R 1和R 2分别独立地选自由核糖和脱氧核糖组成的基团; 氢，羟基，SH基团和卤素; 任选取代的C 2-10烷基，烯基和炔基; 一个或多个5-元杂环，一个或多个6-元杂环，一个或多个多环杂环和一个或多个含有氮原子或硫原子的芳环; 糖，糖链，氨基酸和肽; 和通过接头结合的荧光分子。

18. 发明申请

WO2011047329A2 NOVEL HUMAN SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS 审中-公开
标题翻译：新型人类单核多糖多态性
公开(公告)号：WO2011047329A2
公开(公告)日：2011-04-21
申请号：PCT/US2010/052935
申请日：2010-10-15
申请人： LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION , MULERO, Julio , MALICDEM, Michael , LAGACE, Robert
发明人： MULERO, Julio , MALICDEM, Michael , LAGACE, Robert
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12Q2525/117 , C12Q2563/107 , C12Q2600/156

19. 发明申请

WO2010036795A3 SCREENING METHODS FOR IDENTIFYING SPECIFIC STAPHYLOCOCCUS AUREUS INHIBITORS 审中-公开
标题翻译：筛选特异性维生素AureUS抑制剂的筛选方法
公开(公告)号：WO2010036795A3
公开(公告)日：2010-07-01
申请号：PCT/US2009058208
申请日：2009-09-24
申请人： TRANA DISCOVERY INC , GUENTHER RICHARD H , YENNE SAMUEL P
发明人： GUENTHER RICHARD H , YENNE SAMUEL P
IPC分类号： C12N15/11 , C07H21/00 , C12Q1/68 , C12R1/445 , G01N33/15
CPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/18 , C12Q1/6806 , C12Q1/6895 , C12Q2600/136 , C12Q2600/158 , G01N2333/31 , Y10T436/143333 , C12Q2525/117 , C12Q2563/107
摘要： Methods of inhibiting S. aureus propagation, and screening for compounds that inhibit S. aureus propagation, are described. A method of inhibiting S. aureus propagation comprises inhibiting ribosomal binding of a specific S. aureus tRNA in the S. aureus by an amount sufficient to inhibit S. aureus protein expression. A method of screening for compounds useful for inhibiting S. aureus propagation comprises contacting a specific S. aureus tRNA to a ribosome that binds that tRNA in the presence of the test compound, and then determining whether the compound inhibits the binding of that tRNA.
摘要翻译：描述了抑制金黄色葡萄球菌繁殖的方法和筛选抑制金黄色葡萄球菌繁殖的化合物。抑制金黄色葡萄球菌繁殖的方法包括以足以抑制金黄色葡萄球菌蛋白质表达的量抑制金黄色葡萄球菌中特异性金黄色葡萄球菌tRNA的核糖体结合。筛选用于抑制金黄色葡萄球菌繁殖的化合物的方法包括使特异性金黄色葡萄球菌tRNA与在测试化合物存在下结合该tRNA的核糖体接触，然后确定该化合物是否抑制该tRNA的结合。

20. 发明申请

WO2009154733A2 POLYMERASE INCORPORATION OF NON-STANDARD NUCLEOTIDES 审中-公开
标题翻译：聚合物纳入非标准核素
公开(公告)号：WO2009154733A2
公开(公告)日：2009-12-23
申请号：PCT/US2009/003595
申请日：2009-06-16
申请人： BENNER, Steven, Albert , CHEN, Fei , YANG, Zunyi
发明人： BENNER, Steven, Albert , CHEN, Fei , YANG, Zunyi
IPC分类号： C12Q1/68 , C12P19/40
CPC分类号： C12Q1/6853 , C12P19/34 , C12Q1/686 , C12Q2521/101 , C12Q2525/117 , C12Q2525/191
摘要： The disclosed invention teaches processes to amplify oligonucleotides by contacting templates and primers with DNA polymerases and triphosphates of non-standard nucleotides, which form nucleobase pairs fitting the standard Watson-Crick geometry, but joined by hydrogen bonding patterns different from those that join standard A:T and G:C pairs. Thus, this invention relates to nucleotide analogs and their derivatives that, when incorporated into DNA and RNA, expand the number of replicatable nucleotides beyond the four found in standard DNA and RNA. The invention further relates to polymerases that incorporate those non-standard nucleotide analogs into oligonucleotide products using the corresponding triphosphate derivatives, and more specifically, polymerases and non-standard nucleoside triphosphates that support the polymerase chain reaction (PCR), including PCR where the products contain more than one non-standard nucleotide unit. Examples are provides that show this process using 6-amino-5-nitro-3-(l'-beta- D-2'-deoxyribofuranosyl)-2(lH)-pyridone to implement the non-standard "small" donor-donor- acceptor (pyDDA) hydrogen bonding pattern, and 2-amino-8-(r-beta-D-2'-deoxyribofuranosyl)- imidazo[l,2-α]-l,3,5-triazin-4(8H)-one to implement the "large" acceptor-acceptor-donor (puAAD) pattern.
摘要翻译：所公开的发明教导了通过使模板和引物与DNA聚合酶和非标准核苷酸的三磷酸接触来扩增寡核苷酸的过程，其形成适合标准Watson-Crick几何形状的核碱基对，但是通过与加入标准A： T和G：C对。因此，本发明涉及核苷酸类似物及其衍生物，其在掺入DNA和RNA时扩大超过标准DNA和RNA中发现的四种可重复核苷酸的数量。本发明还涉及使用相应的三磷酸衍生物，更具体地，支持聚合酶链式反应（PCR）的聚合酶和非标准核苷三磷酸（包括产物含有的PCR）的寡核苷酸产物，将这些非标准核苷酸类似物结合到聚合酶中的聚合酶多个非标准核苷酸单位。提供了使用6-氨基-5-硝基-3-（1'-β-2-脱氧三呋喃糖基）-2（1H） - 吡啶酮来实施非标准“小”供体 - 供体的实施例 - 受体（pyDDA）氢键图案和2-氨基-8-（r-β-D-2'-脱氧三呋喃糖基） - 咪唑并[1,2-a] -1,3,5-三嗪-4（8H） - 执行“大”受体 - 受体 - 供体（puAAD）模式。

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