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    • 2. 发明申请
      WO2006096931A1 RENAL REPAIR AND REGENERATION 审中-公开
    • RENAL REPAIR AND REGENERATION
    • 肾脏修复和再生
    • WO2006096931A1
    • 2006-09-21
    • PCT/AU2006/000357
    • 2006-03-17
    • THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND , MONASH UNIVERSITY , LITTLE, Melissa , HUME, David
    • LITTLE, Melissa , HUME, David
    • A61P13/12 , A61K38/18 , C12N5/08 , A61K35/23 , C12N5/06
    • C12N5/0686 , A61K38/00 , A61K48/00 , C07K14/53 , C12N2501/22
    • Methods and compositions comprising CSF-1 are provided for regenerating, repairing or otherwise treating renal cells, tissues and/or organs, and more particularly, in prophylactic or therapeutic treatment of diseases or conditions associated with renal damage and/or dysfunction. In particular, CSF-1 may be particularly efficacious in treating acute renal failure. CSF-1 protein or an encoding nucleic acid may be administered to suppress, ameliorate or otherwise treat an existing renal disease or condition or to prevent, inhibit, suppress or otherwise protect against subsequent renal damage and/or renal failure. CSF-1 may also be used to regenerate or repair renal cells, tissue and/or organs ex vivo, the treated cells, tissue and/or organs then being suitable for subsequent transplantation to an animal, such as a human.
    • 提供包含CSF-1的方法和组合物用于再生，修复或以其他方式治疗肾细胞，组织和/或器官，更具体地，用于与肾损伤和/或功能障碍相关的疾病或病症的预防或治疗性治疗。 特别地，CSF-1可能特别有效治疗急性肾功能衰竭。 可以施用CSF-1蛋白或编码核酸以抑制，改善或以其他方式治疗现有的肾脏疾病或病症，或者预防，抑制，抑制或以其它方式防止随后的肾损伤和/或肾衰竭。 CSF-1也可用于离体再生或修复肾细胞，组织和/或器官，然后治疗的细胞，组织和/或器官适合于随后的移植到动物如人中。
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    • 6. 发明申请
      WO02072614A8 ALGORITHMIC DESIGN OF PEPTIDES FOR BINDING AND/OR MODULATION OF THE FUNCTIONS OF RECEPTORS AND/OR OTHER PROTEINS 审中-公开
    • ALGORITHMIC DESIGN OF PEPTIDES FOR BINDING AND/OR MODULATION OF THE FUNCTIONS OF RECEPTORS AND/OR OTHER PROTEINS
    • 用于结合和/或调节受体和/或其他蛋白质功能的肽的算法设计
    • WO02072614A8
    • 2004-02-19
    • PCT/US0203914
    • 2002-01-23
    • CIELO INST , MANDELL ARNOLD J , SELZ KAREN A , SHLESINGER MICHAEL F
    • MANDELL ARNOLD J , SELZ KAREN A , SHLESINGER MICHAEL F
    • C07K1/00 , C07K1/04 , C07K7/08 , C07K14/53 , C07K14/585 , G06F19/16 , G06F19/22 , G06F19/00
    • G06F19/22 , C07K1/00 , C07K1/047 , C07K7/08 , C07K7/083 , C07K14/53 , C07K14/585 , G06F19/16
    • Method of designing protein-targeted peptides or peptide analogues whose sequences are derived from the target protein sequences, using target protein sequence, analytically derived templates, and relevant distributions of amino acids for weighted random assignments to those templates. The templates are derived from eigenvectors of the autocovariance matrices of the physicochemically-transformed amino acid sequence of the target proteins; wavelet subsequence templates derived from wavelet transformations of the physicochemically-transformed amino acid sequence of the target proteins; and/or non-overlapping redundant subsequent templates computed from the physicochemically-transformed target protein amino acid sequence. The protein targets include cell receptors; transporters; enzymes; chaperonins; antibodies; surface proteins of infectious agents; and any protein involved in protein-protein interactions. The peptides are designed to bind to and/or otherwise modulate the function of the target protein. Partitioned amino acid distributions for weighted random assignments to the similarly partitioned templates are derived from a variety of physiologically relevant amino acid pools or regions in the target protein sequence relevant to the construction of the templates. Sequential pattern ("mode") matches between candidate peptides and their target proteins are designed such that when examined by maximum entropy, all poles power spectral transformations and/or wavelet transformations, they yield peaks of wavenumbers that differ by
    • 设计蛋白质靶向肽或肽类似物的方法，其序列来源于目标蛋白质序列，使用靶蛋白质序列，分析衍生的模板以及相关氨基酸分布进行加权随机分配给这些模板。 模板衍生自目标蛋白的物理化学转化氨基酸序列的自协方差矩阵的特征向量; 衍生自靶蛋白的物理化学转化氨基酸序列的小波变换的小波子序列模板; 和/或从物理化学转化的靶蛋白氨基酸序列计算的非重叠冗余后续模板。 蛋白质靶标包括细胞受体; 运输; 酶; 分子伴侣; 抗体; 感染因子的表面蛋白; 和涉及蛋白质 - 蛋白质相互作用的任何蛋白质。 肽被设计为结合和/或以其他方式调节靶蛋白的功能。 对类似分配的模板的加权随机分配的分割氨基酸分布来自与模板构建相关的目标蛋白质序列中的多种生理相关氨基酸池或区域。 候选肽之间的顺序模式（“模式”）匹配，并且它们的靶蛋白被设计成使得当通过最大熵检查时，所有极功率谱变换和/或小波变换，它们产生的波峰的峰值相差<10％ 波数值。 还提供了这种模式匹配肽的实例，以及它们用于阐明用于药物设计和测试的蛋白质上的位点，疾病状况或污染物的检测以及疾病治疗中用于蛋白质功能调节的治疗剂的方法。
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    • 9. 发明申请
      WO2002072614A2 ALGORITHMIC DESIGN OF PEPTIDES FOR BINDING AND/OR MODULATION OF THE FUNCTIONS OF RECEPTORS AND/OR OTHER PROTEINS 审中-公开
    • ALGORITHMIC DESIGN OF PEPTIDES FOR BINDING AND/OR MODULATION OF THE FUNCTIONS OF RECEPTORS AND/OR OTHER PROTEINS
    • 用于结合和/或调节受体和/或其他蛋白质功能的肽的算法设计
    • WO2002072614A2
    • 2002-09-19
    • PCT/US2002/003914
    • 2002-01-23
    • CIELO INSTITUTE , MANDELL, Arnold, J. , SELZ, Karen, A. , SHLESINGER, Michael, F.
    • MANDELL, Arnold, J. , SELZ, Karen, A. , SHLESINGER, Michael, F.
    • C07K1/00
    • G06F19/22 , C07K1/00 , C07K1/047 , C07K7/08 , C07K7/083 , C07K14/53 , C07K14/585 , G06F19/16
    • Method of designing protein-targeted peptides or peptide analogues whose sequences are derived from the target protein sequences, using target protein sequence, analytically derived templates, and relevant distributions of amino acids for weighted random assignments to those templates. The templates are derived from eigenvectors of the autocovariance matrices of the physicochemically-transformed amino acid sequence of the target proteins; wavelet subsequence templates derived from wavelet transformations of the physicochemically-transformed amino acid sequence of the target proteins; and/or non-overlapping redundant subsequent templates computed from the physicochemically-transformed target protein amino acid sequence. The protein targets include cell receptors; transporters; enzymes; chaperonins; antibodies; surface proteins of infectious agents; and any protein involved in protein-protein interactions. The peptides are designed to bind to and/or otherwise modulate the function of the target protein. Partitioned amino acid distributions for weighted random assignments to the similarly partitioned templates are derived from a variety of physiologically relevant amino acid pools or regions in the target protein sequence relevant to the construction of the templates. Sequential pattern ("mode") matches between candidate peptides and their target proteins are designed such that when examined by maximum entropy, all poles power spectral transformations and/or wavelet transformations, they yield peaks of wavenumbers that differ by 10% of the larger wavenumber value. Also provided are examples of such mode-matched peptides, as well as methods for their use in elucidating sites on proteins for drug design and testing, detection of disease conditions or contaminants, and as therapeutics for protein function modulation in disease treatment.
    • 设计蛋白质靶向肽或肽类似物的方法，其序列来源于目标蛋白质序列，使用靶蛋白质序列，分析衍生的模板以及相关氨基酸分布进行加权随机分配给这些模板。 模板衍生自目标蛋白的物理化学转化氨基酸序列的自协方差矩阵的特征向量; 衍生自靶蛋白的物理化学转化氨基酸序列的小波变换的小波子序列模板; 和/或从物理化学转化的靶蛋白氨基酸序列计算的非重叠冗余后续模板。 蛋白质靶标包括细胞受体; 运输; 酶; 分子伴侣; 抗体; 感染因子的表面蛋白; 和涉及蛋白质 - 蛋白质相互作用的任何蛋白质。 肽被设计为结合和/或以其他方式调节靶蛋白的功能。 对类似分配的模板的加权随机分配的分割氨基酸分布来自与模板构建相关的目标蛋白质序列中的多种生理相关氨基酸池或区域。 候选肽之间的序列模式（“模式”）匹配，并且它们的靶蛋白被设计成使得当通过最大熵检测时，所有极功率谱变换和/或小波变换，它们产生由 << / u> 10％的较大波数值。 还提供了这种模式匹配肽的实例，以及它们用于阐明用于药物设计和测试的蛋白质上的位点，疾病状况或污染物的检测以及疾病治疗中用于蛋白质功能调节的治疗剂的方法。
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