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1. 发明申请

WO2013042821A1 단백질의 재설계를 위한 허용 위치 선별 및 이를 이용한 변형된 단백질의 제조 방법 审中-公开
标题翻译：选择蛋白质重新定义的现场，以及使用其生产改性蛋白质的方法
公开(公告)号：WO2013042821A1
公开(公告)日：2013-03-28
申请号：PCT/KR2011/007683
申请日：2011-10-14
申请人： 한국생명공학연구원 , 이승구 , 이상준 , 김은미 , 김수진 , 손정훈 , 나유진 , 박순호
发明人： 이승구 , 이상준 , 김은미 , 김수진 , 손정훈 , 나유진 , 박순호
IPC分类号： G01N33/68 , C12N15/81 , G01N33/52 , A61K38/27
CPC分类号： A61K38/27
摘要： 본 발명은 표적 단백질의 효능 개선을 위한 단백질 공학 기술에 관한 것이다. 보다 구체적으로 폴딩 리포터 단백질이 표적 단백질의 다양한 내부 위치에 삽입된 융합 단백질을 갖는 표적 단백질 라이브러리에서 유전적 변형, 화학적 수식, 또는 이종 단백질 융합이 가능한 허용 위치를 선별하는 방법, 상기 방법으로 선별된 허용 위치에 돌연변이, 화학적 수식 또는 이종 단백질 융합을 수행하여 변형된 표적 단백질을 제조하는 방법, 상기 방법에 의해 제조된 표적 단백질 및 신규한 변형된 표적 단백질에 관한 것이다.
摘要翻译：本发明涉及一种用于改善靶蛋白的作用的蛋白质工程技术。更具体地说，本发明涉及在具有融合蛋白的靶蛋白文库中选择能够进行遗传修饰，化学修饰或外来蛋白融合的允许位点的方法，其中折叠报道蛋白插入到靶的各种内部位置蛋白质，还涉及通过在所选择的允许位点进行突变，化学修饰或外来蛋白质融合来制备修饰的靶蛋白的方法，并且还涉及通过该方法产生的靶蛋白和新的修饰的靶蛋白。

2. 发明申请

WO2010143871A9 재설계 유전자 회로를 이용한 다양한 효소 활성의 탐색 및 정량 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2010143871A9
公开(公告)日：2010-12-16
申请号：PCT/KR2010/003674
申请日：2010-06-08
申请人： 한국생명공학연구원 , 이승구 , 나유진 , 최수림 , 송재준 , 최종현 , 김희식
发明人： 이승구 , 나유진 , 최수림 , 송재준 , 최종현 , 김희식
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： 본 발명은 목적 효소 활성의 감지 및 정량 방법과 이를 기반으로 하는 메타게놈 라이브러리 유래 목적 효소활성의 탐색 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자회로 GESS(genetic enzyme screening system)를 제작하고 이를 이용하여 다양한 효소의 활성을 감지 및 정량하는 방법과 재설계 유전자회로를 이용하여 메타게놈 유래 목적 효소의 미량 활성을 탐색하여, 목적효소 유전자를 확보하는 방법에 관한 것이다. 또한, 본 발명에 따른 목적 효소 활성의 탐색 및 정량 방법을 이용하면, 환경이나 메타게놈 라이브러리를 비롯한 다양한 유전자 집단에서 유용 유전자를 단일세포 수준에서 초고속(million/day)으로 감지할 수 있고, 페놀 유도체에 대한 민감도와 발현조절을 이용하여 다양한 효소 활성을 고감도로 빠르게 감지 및 정량할 수 있어, 효소개량을 위한 단백질 공학기술에도 유용하게 사용할 수 있으며, 특히, 효소 활성을 정량적으로 탐색할 수 있어 분자진화기술에 적용할 수 있다.

3. 发明申请

WO2011078448A1 메타게놈 유래 알칼린 포스파타아제 审中-公开
标题翻译： METAGENOME衍生的碱性磷酸酶
公开(公告)号：WO2011078448A1
公开(公告)日：2011-06-30
申请号：PCT/KR2010/003675
申请日：2010-06-08
申请人： 한국생명공학연구원 , 이승구 , 최수림 , 나유진 , 송재준
发明人： 이승구 , 최수림 , 나유진 , 송재준
IPC分类号： C12N9/16 , C12N15/55 , C12N1/21
CPC分类号： C12N9/16
摘要： 본 발명은 메타게놈 유래 알칼린 포스파타아제에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 페놀계 화합물을 감지하는 재설계 유전자회로를 이용하여 스크리닝된 메타게놈 유래 신규 알칼린 포스파타아제 및 그 제조방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 신규 알칼린 포스파타아제는 높은 DNA 탈인산화 활성을 지니고 있으며, 간단한 열처리조작에 의하여 활성을 신속하게 제거할 수 있는 특징이 있어서, 유전자 클로닝을 비롯한 유전자 조작의 효율화를 위한 탈인산화 반응에 사용될 수 있다. 또한, 재조합 미생물에서 활성형 발현이 가능하므로, 효소면역법(enzyme immuno-assay) 등 다양한 분석목적의 활용이 가능하다.
摘要翻译：本发明涉及来源于碱金属蛋白酶的碱性磷酸酶，更具体地说涉及一种新的碱性磷酸酶，该碱性磷酸酶是使用检测酚类化合物的重新设计的基因电路进行筛选的巨噬细胞。根据本发明，新型碱性磷酸酶具有高的DNA去磷酸化活性，具有通过简单的热处理快速除去活化的特征，因此可以用于脱磷酸化，以用于基因操作的效率，包括基因克隆。此外，由于活性碱性磷酸酶可以在重组微生物中表达，碱性磷酸酶可以用于各种分析的目的，例如酶免疫测定等。

4. 发明申请

WO2015072776A1 재설계 유전자 회로를 이용한 ε카프로락탐의 감지 및 정량 방법 审中-公开
标题翻译：通过使用重新定义的基因电路感测和定量-卡波米特的方法
公开(公告)号：WO2015072776A1
公开(公告)日：2015-05-21
申请号：PCT/KR2014/010951
申请日：2014-11-14
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이승구 , 염수진 , 김하성 , 이대희 , 권길광 , 나유진 , 정흥채
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/68 , C12N15/63
CPC分类号： C12Q1/6897
摘要： 본 발명은 재설계 유전자 회로를 이용한 ε-카프로락탐의 감지 및 정량 방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 나일론 6의 전구체로 활용되는 ε-카프로락탐을 감지할 수 있는 유전자 회로를 이용한 ε-카프로락탐의 분석 및 정량방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 ε-카프로락탐을 인지하는 재설계 유전자회로는 ε-카프로락탐의 양에 비례하여 ε-카프로락탐 조절유전자가 형광단백질의 발현을 유도하도록 함으로써, ε-카프로락탐을 빠르게 감지 및 정량화할 수 있어, ε-카프로락탐의 정량적 분석 및 ε-카프로락탐 생합성 효소의 활성 분석 등의 목적에 이용할 수 있는 효과가 있다. 본 발명을 통해 0.1 μM 정도의 극미량의 ε-카프로락탐도 고감도로 감지 가능하며, 기존에는 불가능하였던 세포 단위의 분석이 가능하므로, 고속 탐색을 통해 미생물 메타게놈 라이브러리로부터 신규 ε-카프로락탐 생산 균주 및 유전자를 탐색하는 과정에도 본 발명의 효율적 이용이 가능하다.
摘要翻译：本发明涉及一种通过使用重新设计的基因电路来检测和定量ε-己内酰胺的方法，更具体地说，涉及使用能够感测ε-己内酰胺的基因电路来分析和定量ε-己内酰胺的方法，该基因电路用作尼龙-6的前体。根据本发明的识别ε-己内酰胺的重新设计的基因回路允许ε-己内酰胺的调节基因与ε-己内酰胺的量成比例地诱导荧光蛋白的表达。因此，可以快速地检测和定量ε-己内酰胺。因此，重新设计的基因回路可以用于定量分析ε-己内酰胺并分析酶的活性以生物合成ε-己内酰胺。通过本发明，可以通过高灵敏度感测痕量（即约0.1μm的ε-己内酰胺），并且可以在现有技术中不可能的单元单元中进行分析。因此，本发明可以有效地用于通过使用高通量筛选从微生物宏基因组文库产生ε-己内酰胺的新基因和菌株的筛选过程。

5. 发明申请

WO2015183052A1 재설계 유전자회로를 이용한 아미노카프론산의 감지 및 정량 방법 审中-公开
标题翻译：使用重新定义的基因回路定量检测氨基酸的方法
公开(公告)号：WO2015183052A1
公开(公告)日：2015-12-03
申请号：PCT/KR2015/005446
申请日：2015-05-29
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이승구 , 염수진 , 권길광 , 김문정 , 김하성 , 나유진 , 이대희 , 정흥채
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/63 , C12N1/19 , G01N33/50
CPC分类号： C12N15/63 , C12Q1/68 , G01N33/50
摘要： 본 발명은 재설계 유전자회로를 이용한 아미노카프론산의 감지 및 정량 방법에 관한 것으로, 본 발명에 따른 아미노카프론산을 인지하는 재설계 유전자회로는 아미노카프론산의 양에 비례하여 형광단백질의 발현을 유도하여 아미노카프론산을 빠르게 감지 및 정량화 할 수 있으므로, 아미노카프론산의 정량 분석이 필요한 분야에서 유용하게 쓰일 수 있다.
摘要翻译：本发明涉及使用重新设计的基因电路定量和检测氨基己酸的方法。由于根据本发明的识别氨基己酸的重新设计的基因电路诱导与氨基己酸的量成比例的荧光蛋白的表达，因此可以快速检测和定量氨基己酸。因此，重新设计的基因电路可以有用地应用于需要氨基己酸定量分析的领域。

6. 发明申请

WO2015099456A1 재설계 유전자회로를 이용한 섬유소분해효소의 신규 탐색 및 정량방법 审中-公开
标题翻译：使用重新定义的遗传电路搜索和定量细胞因子的新方法
公开(公告)号：WO2015099456A1
公开(公告)日：2015-07-02
申请号：PCT/KR2014/012826
申请日：2014-12-24
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이승구 , 권길광 , 나유진 , 최수림 , 김하성 , 이대희
IPC分类号： C12N15/65 , C12N1/21 , C12Q1/34
CPC分类号： C12Q1/34 , G01N2333/942 , G01N2400/26
摘要： 본 발명은 재설계 유전자 회로를 이용한 섬유소분해활성 효소의 신규 탐색방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 재설계 유전자 회로를 이용한 섬유소분해활성 효소의 신규 탐색방법 및 상기 섬유소분해활성 효소에 의해 분해되는 셀로비오스의 정량방법에 관한 것이다. 본 발명의 재설계 유전자회로를 이용하면, 셀로비오스의 양에 비례하는 셀로비오스 인지 전사조절 단백질(CelR)이 리포터 단백질의 발현을 유도하도록 함으로써, 셀로비오스를 고감도로 빠르게 감지하고 정량화 함으로서 셀로비오스의 감지 및 정량적 분석에 활용할 수 있고, 셀로비오스를 유리하는 exo형 섬유소분해효소의 활성을 측정하거나 새로운 exo형 섬유소분해효소 탐색할 수 있다.
摘要翻译：本发明涉及一种使用重新设计的遗传回路来检索纤维素酶的新方法，更具体地说，涉及一种使用重新设计的遗传回路来检测纤维素酶的新方法和一种定量由纤维素酶降解的纤维二糖的方法。当使用本发明的重新设计的遗传回路时，与纤维二糖的量成比例的纤维二糖识别转录调节蛋白（CelR）诱导报告蛋白的表达，从而以高灵敏度迅速感测和定量纤维二糖，并且因此本发明可用于纤维二糖感测和定量分析，并且能够测量外切型纤维素酶的活性，其释放纤维二糖并搜索新的外切型纤维素酶。

7. 发明申请

WO2021080277A1 신규 D-트레오닌 생산 효소 및 이를 이용한 D-트레오닌의 입체특이적 생산 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2021080277A1
公开(公告)日：2021-04-29
申请号：PCT/KR2020/014292
申请日：2020-10-20
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이승구 , 염수진 , 김하성 , 박성현 , 이대희 , 나유진 , 이혜원 , 권길광 , 안정웅
IPC分类号： C12N9/88 , C12N15/70 , C12P13/08
摘要： 본 발명은 D-트레오닌을 생산할 수 있는 신규한 효소에 관한 것으로, 본 발명의 효소를 이용하여 반응을 진행시킬 경우 D-트레오닌와 함께 생산될 수 있는 부분입체 이성질체인 D-알로트레오닌의 비율을 낮추고, 더 높은 순도의 D-트레오닌을 수득할 수 있는 장점이 있다.

8. 发明申请

WO2020180132A1 D-글루타메이트 영양요구성 대장균 및 이를 이용한 목적 물질 생산 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2020180132A1
公开(公告)日：2020-09-10
申请号：PCT/KR2020/003127
申请日：2020-03-05
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이대희 , 이승구 , 김성근 , 우승균 , 나유진
IPC分类号： C12N15/70 , C12N9/88 , C07K14/245 , C12P21/00
摘要： 본 발명은 murI 유전자가 결실된 D-글루타메이트 영양요구성 변이형 대장균, 이의 제조 방법 및 상기 대장균을 이용한 목적 물질 생산 방법에 관한 것이다. 본 발명의 D-글루타메이트 영양요구성 대장균은 복귀돌연변이체가 적고, 플라스미드 안정성 및 단백질 생산성이 높게 유지되어, 항생제 사용 없이도 효과적으로 유용한 산물을 생산할 수 있는 것으로, 단백질을 포함한 유용 산물의 청정 생산에 응용이 가능하다.

9. 发明申请

WO2017010805A1 미생물 프로토타이핑 유전자 회로 기반 신규 미생물자원 탐색 시스템 审中-公开
标题翻译：用于搜索新型微生物资源的MICROORGANISM基因型基于遗传电路的系统
公开(公告)号：WO2017010805A1
公开(公告)日：2017-01-19
申请号：PCT/KR2016/007613
申请日：2016-07-13
申请人： 한국생명공학연구원
发明人： 이승구 , 나유진 , 김하성 , 성원재
IPC分类号： C12N15/63 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12Q1/02 , G01N21/64
CPC分类号： C12N15/63 , C12N15/70 , C12N15/81 , C12Q1/02 , G01N21/64
摘要： 본 발명은 페놀을 감지하여 발현되는 전사조절인자를 암호화하는 유전자 및 상기 전사조절인자에 의해 작동되는 하위 리포터 유전자를 포함하는 유전자 회로, 상기 유전자 회로를 포함하는 센서 세포, 및 상기 센서 세포와 페놀-태그 기질을 이용하여 자연계 시료에서 직접 목적 효소의 활성을 보유하고 있는 신규 미생물 균주 또는 유전자원을 감지 및 탐색하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 유전자 회로 및 이를 포함하는 센서 세포는 리포터 유전자로 형광 단백질과 함께 센서 세포의 생존을 제어하는 영양요구성에 관련 효소를 함께 포함하고 있으므로, 상기 센서 세포와 원하는 목적 효소의 활성을 갖고 있는 미지의 미생물 균주를 함께 배양하여 형광을 측정하는 간단한 방법으로 해당 목적 효소의 활성을 갖고 있는 신규한 미생물 균주 또는 유전자원을 용이하게 동정할 수 있고, 또한 이와 같은 이중 리포터 시스템을 도입함으로써 목적 효소의 활성 유무를 가시적으로 더욱 명확하게 확인할 수 있다. 또한, 자연계에서 직접 유용 자원을 탐색할 때 DNA 분리 및 라이브러리 구축 과정을 거치지 않고 항생제의 사용을 제한함으로써 목표 효소 유전자의 발현 가능성 및 실험의 용이성을 최대화하고 자연계 고활성 미생물을 직접 사용하므로써 재조합미생물에 의한 GMO/LMO 문제를 최소화할 수 있다.
摘要翻译：本发明涉及：包含编码由感受酚表达的转录调节因子的基因的遗传回路和由转录调节因子操作的下游报告基因; 包括遗传电路的传感器单元; 以及通过使用传感器细胞和苯酚标签底物直接从天然标本感测和搜索具有目标酶活性的新型微生物菌株或遗传资源的方法。包含本发明的遗传电路和传感器细胞作为报告基因包含荧光蛋白和营养缺陷型相关酶，用于控制传感器细胞的存活，从而通过简单的方法易于鉴定共培养传感器细胞和具有所需目标酶活性的未知微生物菌株并测定其具有相应靶酶活性的新型微生物菌株或遗传资源的荧光。另外，通过引入双重报道系统，启用目标酶是否被激活的可见和更清楚的确认。而且，从大自然直接寻找有用资源的时候，由于DNA分离和图书馆建设过程不能进行，抗生素的使用有限，因此目标酶基因表达的可能性和实验的简单性可以最大化，转基因/ 可以通过直接使用具有高活性的天然微生物来最小化由重组微生物引起的改性活生物体问题。

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