专利快速检索-快速检索全球专利，免费商用专利数据库-IPRDB

1. 发明申请

WO2012124965A2 다중 타겟 위치의 단일 핵산서열로의 어셈블리 방법 审中-公开
标题翻译：用于将多个目标位置组装成单个核酸序列的方法
公开(公告)号：WO2012124965A2
公开(公告)日：2012-09-20
申请号：PCT/KR2012/001808
申请日：2012-03-13
申请人： 연세대학교 산학협력단 , 방두희 , 한효준
发明人： 방두희 , 한효준
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11
CPC分类号： C12Q1/686 , C12P19/34 , C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12Q2531/113 , C12Q2537/143 , C12Q2537/149
摘要： 본 발명은 다중 타겟 위치(multiple target loci)를 하나의 어셈블된 핵산서열로의 어셈블리하는 방법 및 이를 이용한 동시 검출방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법은 두 번의 PCR, 즉 제1차 PCR(polymerase chain reaction) 및 제2차 PCR 반응을 통해 다중 타겟 위치를 하나의 어셈블된 핵산서열로 어셈블리시킨다. 보다 상세하게는, 본 발명에서 이용되는 제1차 증폭용 프라이머쌍(정방향 프라이머 및 역방향 프라이머)은 타겟-특이적 서열(타겟 혼성화 뉴클레오타이드 서열) 및 5'-플랭킹 어셈블리 스페이서 서열(오버래핑 서열)로 이루어져 있다. 또한, 상기 제1차 증폭용 프라이머쌍을 이용하여 증폭된 제1차 증폭결과물을 제2차 증폭용 프라이머 세트를 통해 간편하고 용이하게 하나의 단축된 핵산서열로 어셈블리시켜 다중 타겟 위치를 동시에 검출할 수 있다. 따라서, 본 발명의 방법 및 키트는 시료(바람직하게는, 인간의 혈액)의 DNA 서열 상의 다중 변이성(예컨대, SNPs)을 동시에 검출 및 분석함으로써, 변이 검출을 위한 시퀀싱 비용을 현저하게 감소시킬 수 있을 뿐 아니라 맞춤형 의약의 개념을 실현하기 위한 중요한 접근방법 및 수단을 제공한다.
摘要翻译：本发明涉及用于将多个目标基因座组装成单个组装的核酸序列的方法，以及使用所述组装方法同时检测多个靶基因座的方法。本发明的方法包括通过两个聚合酶链反应（PCR）将多个目标基因座组装成单个组装的核酸序列，即初级PCR和二级PCR。更具体地，用于初次扩增的一对引物（正向引物和反向引物）由靶特异性序列（靶杂交核苷酸序列）和5'-侧翼组装间隔物序列（重叠序列）组成。此外，通过用于初级扩增的一对引物扩增的初级扩增产物通过用于二次扩增的一组引物以方便和容易的方式组装成单个缩短的核酸序列，从而能够同时检测多个目标基因座。因此，本发明的方法和试剂盒可以同时检测和分析样品（优选人血液）的DNA序列中的多种变异性，因此不仅显着降低了检测变异性的测序成本，而且提供了关键方法和手段实现定制医学的概念。

2. 发明申请

WO2013019075A9 핵산분자의 제조방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2013019075A9
公开(公告)日：2013-02-07
申请号：PCT/KR2012/006147
申请日：2012-08-01
申请人： 연세대학교산학협력단 , 방두희 , 김황범 , 한효준
发明人： 방두희 , 김황범 , 한효준
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11 , G06F19/22 , C12N15/10
摘要： (a) 목적 핵산분자의 전체 서열의 적어도 일부를 구성하는 핵산 단편들을 제공하는 단계; (b) 상기 핵산 단편들을 바코드 서열들(barcode sequences)로 태깅(tagging)하는 단계; (c) 상기 바코드 서열들로 태깅된 핵산 단편들의 서열을 확인하는 단계; 및 (d) 상기 서열 확인된 핵산 단편들 중 소망하는 핵산 단편들을 상기 바코드 서열들을 이용하여 회수하는 단계를 포함하는 핵산분자의 제조방법이 제공된다.

3. 发明申请

WO2015115768A1 염기서열 확인 과정에서 분리된 핵산 단편들을 회수하는 방법 审中-公开
标题翻译：用于回收在序列中分离的核酸片段的方法
公开(公告)号：WO2015115768A1
公开(公告)日：2015-08-06
申请号：PCT/KR2015/000828
申请日：2015-01-27
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 박상언 , 임현섭 , 한효준
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/68
CPC分类号： C12N15/1072 , C12N15/1093 , C12Q1/6806 , C12Q2531/113 , C12Q2535/122 , C12Q2537/159
摘要： 본 발명은 서열 확인 과정에서 분리된 핵산 단편들을 증폭하여 회수하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 방법을 이용할 경우 증폭할 DNA 라이브러리를 효과적으로 축소하여 소망하는 핵산 단편들의 회수 효율을 높일 수 있는 장점이 있다.
摘要翻译：本发明涉及通过扩增在测序期间分离的核酸片段进行回收的方法。如果利用，根据本发明的方法具有通过有效减少要扩增的DNA文库来增加所需核酸片段的回收率的益处。

4. 发明申请

WO2022114732A1 PCR 과정 동안 생성되는 가닥들의 정보를 연결하여 하나의 클러스터를 만들고, 생성된 가닥들의 생성 순서를 추적할 수 있는 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2022114732A1
公开(公告)日：2022-06-02
申请号：PCT/KR2021/017283
申请日：2021-11-23
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 임현섭 , 전소영
IPC分类号： C12Q1/686 , C12Q1/6895
摘要： 본 발명은 PCR 과정 동안 생성되는 가닥들의 정보를 연결하여 하나의 클러스터를 만들고, 생성된 가닥들의 생성 순서를 추적할 수 있는 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 본 발명은 UID 함유 프라이머를 사용하여 PCR 과정 후 모든 부모 가닥과 딸 가닥(daughter strand)이 하나의 UID를 공유하고, 이러한 공유 UID를 사용하여 두 가닥(부모 가닥과 딸 가닥)을 연결하며, 더 나아가서 손녀 가닥까지 확장해서 연결하여 첫 번째로 복사된 가닥에서 파생된 모든 자손 가닥에 연결될 수 있게 함으로써, 하나의 네트워크(클러스터)를 만드는 것 외에도 증폭 과정동안 생성된 가닥들의 생성 순서를 알 수 있으며, 증폭 계통(lineage of amplification) 을 구성하고, 오류 패턴을 관찰할 수 있다.

5. 发明申请

WO2022086185A1 단일 세포 분석법을 이용한 TCR-항원의 특이성을 확인하는 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2022086185A1
公开(公告)日：2022-04-28
申请号：PCT/KR2021/014747
申请日：2021-10-20
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 하상준 , 이승현 , 신동주 , 박동진
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12N5/0784 , C12N5/0783 , C07K14/74 , C12N15/86
摘要： 본 발명은 단일 세포 분석을 이용한 TCR-항원 특이성을 검출하는 방법에 대한 것으로, 항원을 표면에 제시하는 항원 제시 세포 및 TCR을 표면 발현하는 T-세포의 공동 배양을 통해 형성된 항원 제시 세포-T세포 복합체의 단일 세포 유전체 분석을 통하여 TCR-항원을 동시에 시퀀싱 함으로써 식별하는 것을 특징으로 한다. 본 발명의 방법을 이용하는 경우, 기존 TCR-항원 특이성을 검출기술 대비 비용 경제적이며, 고 처리량으로 TCR-항원 쌍 식별이 가능하다.

6. 发明申请

WO2022050654A1 씨에프디엔에이의 저빈도 변이 검출을 위해 엔지에스 분석에 사용되는 고유 단편의 비율을 증가시키는 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2022050654A1
公开(公告)日：2022-03-10
申请号：PCT/KR2021/011654
申请日：2021-08-31
申请人： 주식회사 아이엠비디엑스 , 연세대학교 산학협력단
发明人： 허성훈 , 이동인 , 방두희 , 노한성 , 김황필 , 문성태
IPC分类号： G16B20/20 , G16B30/10 , G16B40/20 , G16B35/10
摘要： 본원은 NGS (Next Generation Sequencing) 분석을 이용한 cfDNA (cell free DNA)의 저빈도 변이 검출에 있어서, 상기 NGS 분석에 사용되는 고유 단편의 비율을 향상시키는 방법을 개시한다. 본원에 따른 방법은 우연히 서열이 동일한 사건 의 비가 일정 이하가 되도록 시료를 2개 이상의 알리쿼트로 분할하여 알리쿼트 당 DNA 농도를 낮춰서 NGS 라이브러리를 만들고, 각 알리쿼트에서 생성된 NGS 데이터는 분석 단계에서 합쳐서 분석함으로써 대부분의 고유한 DNA 단편을 구분할 수 있어 일반적인 NGS 보다 예를 들면 cfDNA에 매우 적은 양으로 존재하는 ctDNA의 저빈도 유전자 변이의 검출이 가능하다.

7. 发明申请

WO2014204246A1 서열 확인된 핵산 단편들을 회수하는 방법 및 서열 확인된 핵산 단편들을 증폭시키기 위한 장치 审中-公开
标题翻译：检测序列验证的核酸片段的方法和放大序列核酸核酸片段的装置
公开(公告)号：WO2014204246A1
公开(公告)日：2014-12-24
申请号：PCT/KR2014/005439
申请日：2014-06-19
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 김황범 , 조남진 , 임현섭
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/68 , C12M1/38
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12N15/1034 , C12N15/1093 , C12Q1/6848 , C12Q2535/122
摘要： (a) DNA 라이브러리를 구비한 시퀀싱 플레이트를 준비하는 단계; (b) 상기 DNA 라이브러리에 대한 초병렬적 시퀀싱을 통하여 서열 확인된 축소된 핵산 단편 라이브러리를 제공하는 단계; (c) 상기 서열 확인된 핵산 단편들 전체를 구비한 상기 시퀀싱 플레이트를 증폭기에 위치시키는 단계; (d) 상기 증폭기에 위치된 핵산 단편들 전체를 증폭하는 단계; 및 (e)상기 증폭된 핵산 단편들을 회수하는 단계를 포함하는 핵산 단편의 회수방법이 제공된다.
摘要翻译：提供了一种检索核酸片段的方法，所述方法包括以下步骤：（a）制备包含DNA文库的测序板; （b）通过相对于DNA文库的高平行测序提供经序列验证的核酸片段的简化文库; （c）将包含整个序列验证的核酸片段的测序板定位在放大机中; （d）扩增位于放大机中的整个核酸片段; 和（e）检索扩增的核酸片段。

8. 发明申请

WO2014092458A1 코돈 조합화 및 변이유발을 이용한 유전자 라이브러리의 합성 방법 审中-公开
标题翻译：使用CODON组合和MUTAGENESIS合成基因库的方法
公开(公告)号：WO2014092458A1
公开(公告)日：2014-06-19
申请号：PCT/KR2013/011492
申请日：2013-12-11
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 박상언 , 이준구 , 이지원
IPC分类号： C12Q1/68 , C40B40/08 , C12N15/11
CPC分类号： C12N15/102 , C12N15/1089 , C12N15/1093 , C12N15/67 , C12Q2563/179
摘要： 같은 단백질로 번역되는 3개의 핵산 염기서열(코돈)의 조합을 이용함으로써 유전자 라이브러리 합성 후, 핵산 염기서열의 다양한 라이브러리 서열의 분석 시 쉽게 에러를 찾아낼 수 있는 방식을 제안한다. 이를 이용해 단백질 서열은 같지만 핵산 염기서열은 서로 다른 유전자 라이브러리를 만들 수 있다는 것을 보여준다. 이는 생체 내에서 특정 유전자를 발현시키기 위해 최적화되어 있는 코돈의 사용을 변화시킴으로써 코돈 변화에 따른 유전자 발현의 상관관계를 측정할 수 있는 새로운 실험방법을 제공한다. 또한, 같은 방식으로 단백질 서열 역시 일부 유사단백질 서열로 변환시킨 유전자 라이브러리를 동시에 합성 및 분석할 수 있으며, 이를 통해 발현된 유전자의 일부 단백질 서열의 변화가 해당 유전자의 기능에 어떠한 영향을 미치는지 확인할 수 있는 방법을 제공한다.
摘要翻译：提出了一种能够在通过使用翻译成相同蛋白质的三个核酸碱基序列（密码子）的组合合成基因文库之后在分析核酸碱基序列的各种文库序列期间容易地发现错误的方法。这表明可以产生具有相同蛋白质序列但不同核酸碱基序列的基因文库。本发明提供了一种新的测试方法，其能够通过改变在体内表达特定基因而优化的密码子的使用来测量根据密码子变化的基因表达之间的相关性。同样地，本发明同样地提供能够同时合成和分析其中蛋白质序列被相似蛋白质序列改变的基因文库的方法，因此能够鉴别部分蛋白质序列的变化的影响的表达基因具有相应基因的功能。

9. 发明申请

WO2022086153A1 차세대 염기 서열 분석에서 크리스퍼/카스9 시스템을 이용하여 저빈도 단일 염기 변이 검출 정확도를 향상시키는 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2022086153A1
公开(公告)日：2022-04-28
申请号：PCT/KR2021/014666
申请日：2021-10-20
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 이동인
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12N9/22 , C12N15/113 , C12N15/10
摘要： 본 발명은 크리스퍼/카스9 시스템을 이용하여 단일 염기 변이를 검출하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 차세대 염기 서열 분석(NGS) 과정에서 기술적 오류로 인해 발생하는 위양성 SNV 검출을 배제시킴으로써 보다 정확한 단일 염기 변이를 검출할 수 있으며, 크리스퍼/카스9 시스템을 이용하여 원하는 SNV를 정확히 표적하여 표지함으로써 저빈도 SNV에 대한 정확한 검출이 가능하다.

10. 发明申请

WO2016195382A1 바코드 서열을 포함하는 어댑터를 이용한 차세대 염기서열 분석 방법 审中-公开
标题翻译：使用包含条形码序列的适配器的下一代核苷酸序列
公开(公告)号：WO2016195382A1
公开(公告)日：2016-12-08
申请号：PCT/KR2016/005817
申请日：2016-06-01
申请人： 연세대학교 산학협력단
发明人： 방두희 , 이지현 , 김하영 , 안진우 , 황병진
IPC分类号： C12Q1/68 , G06F19/22 , C12N9/24
CPC分类号： C12N9/24 , C12Q1/68 , G06F19/22
摘要： 본 발명은 바코드 서열을 포함하는 어댑터를 이용한 DNA 라이브러리 제조 방법 및 차세대 염기서열 분석 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 차세대 염기서열 분석에 있어서, 바코드 서열이 도입된 어댑터를 이용함에 따라, 종래의 방법과 비교하여, 리드(reads)수를 현저히 높여, 극히 적은 빈도수로 존재하는 드문 변이까지 감지할 수 있는 이점이 있다.
摘要翻译：本发明涉及使用包含条码序列和下一代核苷酸测序方法的接头的DNA文库构建方法。根据本发明，在下一代核苷酸测序中，使用条形码导入适配器，因此与常规方法相比，引线数量显着增加，从而感测到以极小的方式存在的罕见突变频率。

你已经成功收藏专利！

检索式保存成功!

IPRDB

热门服务

关于我们

友情链接

联系方式