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21. 发明申请

WO2011006165A2 DETECTING MULTINUCLEOTIDE REPEATS 审中-公开
标题翻译：检测多发性重复
公开(公告)号：WO2011006165A2
公开(公告)日：2011-01-13
申请号：PCT/US2010041731
申请日：2010-07-12
申请人： PERKINELMER HEALTH SCI INC , ADLER KARL EDWIN JR
发明人： ADLER KARL EDWIN JR
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/686 , C12Q2565/519 , C12Q2525/204 , C12Q2525/151
摘要： Methods of determining the length of a multinucleotide repeat region in a target nucleic acid are provided herein which include labeling amplified target nucleic acids with a target detection label independent of the number of multinucleotide repeats and a repeat-detection label proportional to the number of multinucleotide repeats, wherein the two types of labels are each independently incorporated in the amplified target nucleic acids during the amplifying or after the amplifying; binding the amplified target nucleic acids to a capture probe specific for the amplified target nucleic acids; detecting the target detection label associated with the capture probe to produce a first signal; detecting the repeat-detection label associated with the capture probe to produce a second signal; and determining a ratio of the first signal and the second signal, wherein the ratio is indicative of the length of the multinucleotide repeat region in the target nucleic acid.
摘要翻译：本文提供确定靶核酸中多核苷酸重复区长度的方法，其包括用与多核苷酸重复数目无关的靶标检测标记物标记扩增的靶核酸，以及与多核苷酸重复数目成比例的重复检测标记其中两种类型的标记在放大期间或扩增后各自独立地并入扩增的靶核酸中; 将扩增的靶核酸与扩增的靶核酸特异的捕获探针结合; 检测与捕获探针相关联的目标检测标签以产生第一信号; 检测与捕获探针相关联的重复检测标签以产生第二信号; 以及确定第一信号和第二信号的比率，其中该比率指示靶核酸中的多核苷酸重复区的长度。

22. 发明申请

WO2010130877A2 METHOD FOR DETECTING NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：检测核酸的方法
公开(公告)号：WO2010130877A2
公开(公告)日：2010-11-18
申请号：PCT/FI2010050380
申请日：2010-05-11
申请人： ABACUS DIAGNOSTICA OY , VON LODE PIIA , SYRJAELAE ANNIINA , LOEVGREN TIMO , SOUKKA TERO
发明人： VON LODE PIIA , SYRJAELAE ANNIINA , LOEVGREN TIMO , SOUKKA TERO
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6818 , C12Q1/689 , C12Q2537/161 , C12Q2527/107 , C12Q2525/204 , C12Q2565/107
摘要： This invention relates to detecting nucleic acids. It employs a double-stranded oligonucleotide probe comprising i)a first probe comprising a first label moiety capable of emitting a measurable signal, and ii) a second probe being partially complementary with the first probe and comprising a second label moiety capable of interacting with the first moiety when brought in close proximity with each other, the second moiety being a quencher or acceptor of emission of the first moiety. The first or second probe comprises a sequence being complementary to that of a target nucleotide, and the second or first probe, respectively, comprises a sequence being complementary to a complement of the target nucleotide sequence of the nucleic acid to be detected. The first and the second moieties are attached to the first and second probes respectively in a manner wherein the distance between the first and second moieties is not more than 7 base pairs apart. The complementary sequences of the double-stranded probe is shorter than the full sequence of both the first and second single-stranded probes. The first and second probes have a higher Tm when hybridized with the target nucleotide sequence compared to the Tm of the double-stranded probe. The intensity of the signal of the first label when the first probe is not hybridized to the second probe is higher or lower than the intensity of the signal of the first label when the first probe is hybridized to the second probe. This invention also relates to oligonucleotides for determining Chlamydia trachomatis.
摘要翻译：本发明涉及检测核酸。其采用双链寡核苷酸探针，其包含i）第一探针，其包含能够发射可测量信号的第一标记部分，和ii）与第一探针部分互补的第二探针，并且包含能够与当第一部分彼此靠近时，第二部分是第一部分的发射的猝灭剂或受体。第一或第二探针包含与靶核苷酸互补的序列，第二或第一探针分别包含与被检测核酸的靶核苷酸序列的互补序列互补的序列。第一和第二部分分别以第一和第二部分之间的距离不超过7个碱基对的方式连接到第一和第二探针。双链探针的互补序列比第一和第二单链探针的全序列短。当与靶核苷酸序列杂交时，与双链探针的Tm相比，第一和第二探针具有更高的Tm。当第一探针不与第二探针杂交时，第一标记的信号的强度比第一标记与第二探针杂交时的第一标记的信号的强度高或低。本发明还涉及确定沙眼衣原体的寡核苷酸。

23. 发明申请

WO2010016937A3 METHODS FOR SEQUENCING INDIVIDUAL NUCLEIC ACIDS UNDER TENSION 审中-公开
标题翻译：用于在张力下测定个体核酸的方法
公开(公告)号：WO2010016937A3
公开(公告)日：2010-07-08
申请号：PCT/US2009004546
申请日：2009-08-07
申请人： ION TORRENT SYSTEMS INC , ROTHBERG JONATHAN M , LEAMON JOHN H , DAVIDSON JOHN F , VAN OIJEN ANTOINE M , HINZ WOLFGANG , DAVEY MELVILLE , HANN BRADLEY , SCHULTZ JONATHAN
发明人： ROTHBERG JONATHAN M , LEAMON JOHN H , DAVIDSON JOHN F , VAN OIJEN ANTOINE M , HINZ WOLFGANG , DAVEY MELVILLE , HANN BRADLEY , SCHULTZ JONATHAN
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6874 , C12Q2523/303 , C12Q2565/131 , C12Q2525/204 , C12Q2521/101 , C12Q2535/122
摘要： The invention provides apparatuses and methods of use thereof for sequencing nucleic acids subjected to a force, and thus considered under tension. The methods may employ but are not dependent upon incorporation of extrinsically detectably labeled nucleotides.
摘要翻译：本发明提供了用于测序经受力的核酸的装置及其使用方法，并因此在张力下考虑。所述方法可以采用但不依赖于外源可检测标记的核苷酸的引入。

24. 发明申请

WO2009102632A3 METHOD FOR ISOLATING CELL FREE APOPTOTIC OR FETAL NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：用于分离细胞免疫球蛋白或天然核酸的方法
公开(公告)号：WO2009102632A3
公开(公告)日：2009-11-26
申请号：PCT/US2009033375
申请日：2009-02-06
申请人： BIOCEPT INC , BHATT RAM , FAN WEN-HUA
发明人： BHATT RAM , FAN WEN-HUA
IPC分类号： C12Q1/68 , C07H21/00 , G01N33/53
CPC分类号： C12Q1/6804 , C12Q1/6806 , G01N33/5308 , G01N33/54326 , C12Q2525/204 , C12Q2522/101
摘要： The present invention provides methods for isolating cell free nucleic acid, e.g., apoptotic or fetal nucleic acids and methods of detecting neoplastic cells or identifying the genetic composition of a fetus. The invention also provides magnetic particles comprising an anti-DNA antibody, and kits comprising the magnetic particles.
摘要翻译：本发明提供了分离无细胞核酸的方法，例如凋亡或胎儿核酸以及检测肿瘤细胞或鉴定胎儿遗传组成的方法。本发明还提供包含抗DNA抗体的磁性颗粒和包含磁性颗粒的试剂盒。

25. 发明申请

WO2009102632A2 METHOD FOR ISOLATING CELL FREE APOPTOTIC OR FETAL NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：分离无细胞凋亡或胎儿核酸的方法
公开(公告)号：WO2009102632A2
公开(公告)日：2009-08-20
申请号：PCT/US2009/033375
申请日：2009-02-06
申请人： BIOCEPT, INC. , BHATT, Ram , FAN, Wen-hua
发明人： BHATT, Ram , FAN, Wen-hua
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/53 , C07H21/00
CPC分类号： C12Q1/6804 , C12Q1/6806 , G01N33/5308 , G01N33/54326 , C12Q2525/204 , C12Q2522/101
摘要： The present invention provides methods for isolating cell free nucleic acid, e.g., apoptotic or fetal nucleic acids and methods of detecting neoplastic cells or identifying the genetic composition of a fetus. The invention also provides magnetic particles comprising an anti-DNA antibody, and kits comprising the magnetic particles.
摘要翻译：本发明提供了分离无细胞核酸（例如凋亡或胎儿核酸）的方法以及检测赘生性细胞或鉴定胎儿遗传组合物的方法。本发明还提供了包含抗DNA抗体的磁性颗粒和包含磁性颗粒的试剂盒。

26. 发明申请

WO2008001054A8 PCR SCREENING METHOD 审中-公开
标题翻译： PCR筛选方法
公开(公告)号：WO2008001054A8
公开(公告)日：2009-07-16
申请号：PCT/GB2007002352
申请日：2007-06-25
申请人： SYNGENTA LTD , KAUNDUN SHIV SHANKHAR
发明人： KAUNDUN SHIV SHANKHAR
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6858 , C12Q2531/113 , C12Q2525/204 , C12Q2521/301
摘要： The present invention relates, inter alia, to a method for detecting a point mutation in a gene of interest using a PCR and restriction digest based approach.
摘要翻译：本发明尤其涉及使用PCR和基于限制性消化的方法检测感兴趣基因中的点突变的方法。

27. 发明申请

WO2008059578A1 マルチプレックスPCR法审中-公开
标题翻译：多重PCR方法
公开(公告)号：WO2008059578A1
公开(公告)日：2008-05-22
申请号：PCT/JP2006/322898
申请日：2006-11-16
申请人：オリンパス株式会社 , 田邊哲也 , 森本伸彦
发明人：田邊哲也 , 森本伸彦
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/686 , C12Q2600/156 , C12Q2537/143 , C12Q2525/204
摘要：　本発明は、マルチプレックスPCR法であって、長さが32塩基以上のプライマーを使用することと、前記プライマーのTm値よりも低い温度でアニーリングさせることと、1分～10分間の長時間伸長反応を行うこととを特徴とするPCR増幅方法を提供する。
摘要翻译：旨在提供一种多重PCR方法的PCR扩增方法，其特征在于包括使用长度为32个碱基以上的引物，在低于上述引物的Tm值的温度下进行退火，并进行延伸反应时间长达1分钟至10分钟。

28. 发明申请

WO2006119439B1 COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE ANALYSIS OF DEGRADED NUCLEIC ACIDS 审中-公开
标题翻译：降解核酸分析的组合物和方法
公开(公告)号：WO2006119439B1
公开(公告)日：2007-04-05
申请号：PCT/US2006017169
申请日：2006-05-03
申请人： ALTHEA TECHNOLOGIES INC , MONFORTE JOSEPH , FERRE FRANCOIS , OADES KAHUKU
发明人： MONFORTE JOSEPH , FERRE FRANCOIS , OADES KAHUKU
IPC分类号： C07H21/04 , C12P19/34 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/686 , C12Q1/6848 , C12Q1/6853 , C12Q2537/143 , C12Q2525/204 , C12Q2525/161 , C12Q2525/155
摘要： The invention relates to compositions and methods for gene expression analysis. In some embodiments, the invention provides compositions and methods for amplifying targets in a degraded nucleic acid sample. In some embodiments, the invention provides methods for determining the quality of nucleic acids (e.g., the degree of degradation) in a nucleic acid sample. The invention also provides methods for producing a gene expression profile from a degraded RNA sample.
摘要翻译：本发明涉及用于基因表达分析的组合物和方法。在一些实施方案中，本发明提供用于扩增降解的核酸样品中靶标的组合物和方法。在一些实施方案中，本发明提供了确定核酸样品中核酸质量（例如降解程度）的方法。本发明还提供了从降解的RNA样品产生基因表达谱的方法。

29. 发明申请

WO2006107317A3 METHODS FOR MONITORING GENOMIC DNA OF ORGANISMS 审中-公开
标题翻译：监测有机体基因组DNA的方法
公开(公告)号：WO2006107317A3
公开(公告)日：2007-03-22
申请号：PCT/US2005026704
申请日：2005-07-28
申请人： CANON US LIFE SCIENCES INC , TAKAHASHI TORU , BOLES DEBORAH JOHN
发明人： TAKAHASHI TORU , BOLES DEBORAH JOHN
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6858 , C12Q1/686 , C12Q2600/156 , C12Q2535/139 , C12Q2527/113 , C12Q2525/204 , C12Q2527/101
摘要： The invention provides novel SGP primers for improved use in waveform-profiling methods of DNA amplification. In one embodiment, use of an SGP primer in a method of DNA amplification results in exponential amplification of several distinct products. In another embodiment, the methods of the invention further comprise a novel half-time elongation step. In another embodiment, the distinct products may be detected via melting temperature analysis. The primers and methods of the invention may be combined to determine an organism in a sample.
摘要翻译：本发明提供了用于改进在DNA扩增波形分析方法中使用的新型SGP引物。在一个实施方案中，在DNA扩增方法中使用SGP引物导致几种不同产物的指数扩增。在另一个实施方案中，本发明的方法还包括新的半时间延伸步骤。在另一个实施方案中，可以通过熔融温度分析来检测不同的产物。本发明的引物和方法可以组合以确定样品中的生物体。

30. 发明申请

WO2006119439A3 COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE ANALYSIS OF DEGRADED NUCLEIC ACIDS 审中-公开
公开(公告)号：WO2006119439A3
公开(公告)日：2007-02-22
申请号：PCT/US2006017169
申请日：2006-05-03
申请人： ALTHEA TECHNOLOGIES INC , MONFORTE JOSEPH , FERRE FRANCOIS , OADES KAHUKU
发明人： MONFORTE JOSEPH , FERRE FRANCOIS , OADES KAHUKU
IPC分类号： C07H21/04 , C12P19/34 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/686 , C12Q1/6848 , C12Q1/6853 , C12Q2537/143 , C12Q2525/204 , C12Q2525/161 , C12Q2525/155
摘要： The invention relates to compositions and methods for gene expression analysis. In some embodiments, the invention provides compositions and methods for amplifying targets in a degraded nucleic acid sample. In some embodiments, the invention provides methods for determining the quality of nucleic acids (e.g., the degree of degradation) in a nucleic acid sample. The invention also provides methods for producing a gene expression profile from a degraded RNA sample.

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