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1. 发明申请

WO2019128744A1 一种全基因组sgRNA文库的构建系统及其应用审中-公开
公开(公告)号：WO2019128744A1
公开(公告)日：2019-07-04
申请号：PCT/CN2018/121328
申请日：2018-12-14
申请人：苏州金唯智生物科技有限公司
发明人：徐凤丹 , 金亮 , 许朋阳 , 段广有 , 赵文妍 , 葛毅
IPC分类号： G16B15/00
CPC分类号： G16B15/00 , G16B20/00 , G16B50/00
摘要：本申请提供了一种全基因组sgRNA文库的构建系统及其应用，所述系统包括输入模块、sgRNA设计模块和sgRNA过滤模块，通过构建系统的三大模块，优化模块内细节及流程，采用多种设计标准及筛选原则，最终构建得到全基因组sgRNA文库，所述系统及方法简洁高效，得到的文库质量高，活性好，便于应用在基因编辑研究中。

2. 发明申请

WO2019071195A1 A METHOD OF SEQUENCE TYPING WITH IN SILICO APTAMERS FROM A NEXT GENERATION SEQUENCING PLATFORM 审中-公开
公开(公告)号：WO2019071195A1
公开(公告)日：2019-04-11
申请号：PCT/US2018/054707
申请日：2018-10-05
申请人： AAGEY HOLDING, LLC
发明人： ESPITIA, Hector , CHANDE, Aroon T. , JORDAN, Irving King , RISHISHWAR, Lavanya
IPC分类号： C07H21/02 , C12N15/113 , C12Q1/02 , G06G7/48
CPC分类号： G16B20/00 , G16B15/00 , G16B20/20 , G16B30/10 , G16B50/00
摘要： A method of sequence typing with in silico aptamers from a next generation sequencing (NGS) platform includes a database indexing phase and a sequence variant detection phase. The database indexing phase includes breaking down each of a plurality of input sequences into k-mers, where the k-mers are subsequences of a length k, where the length k is a user defined positive integer, and constructing an enhanced suffix array (ESA) index out of each k-mer from the plurality of input sequences. The sequence variant detection phase includes using an input NGS read file with a plurality of reads. Wherein, the sequence variant detection phase includes using the ESA index constructed out of each k-mer from the plurality of input sequences from the database indexing phase for sequence variant detection.

3. 发明申请

WO2018149405A1 信息存储和读取的方法审中-公开
公开(公告)号：WO2018149405A1
公开(公告)日：2018-08-23
申请号：PCT/CN2018/076721
申请日：2018-02-13
申请人：苏州泓迅生物科技股份有限公司
发明人：杨平 , 蔡晓辉 , 李彦敏 , 齐金才 , 蔡锦雄 , 时逢宽 , 田净净 , 刁文一 , 王彬彬
IPC分类号： G06F19/28
CPC分类号： G16B50/00 , G16B50/50
摘要：一种信息存储和读取的方法，包括读取原始文件信息的二进制信息，将所述二进制信息转换为四进制信息，并将所述四进制信息编码转换成腺嘌呤A、胸腺嘧啶T、胞嘧啶C和鸟嘌呤G四种脱氧核糖核苷酸表示的DNA全序列；将所述DNA全序列打断分成多个DNA片段，并分别将所述多个DNA片段进行构建获得多个输出DNA序列；将所述多个输出DNA序列合成相应的人工DNA序列并进行保存。

4. 发明申请

WO2018094204A1 DETERMINING RELATIONSHIPS BETWEEN RISKS FOR BIOLOGICAL CONDITIONS AND DYNAMIC ANALYTES 审中-公开
公开(公告)号：WO2018094204A1
公开(公告)日：2018-05-24
申请号：PCT/US2017/062290
申请日：2017-11-17
申请人： ARIVALE, INC. , INSTITUTE FOR SYSTEMS BIOLOGY
发明人： MAGIS, Andrew Tyler , EARLS, John Carl , PRICE, Nathan
IPC分类号： G06F19/24
CPC分类号： G16B40/00 , G16B20/00 , G16B20/40 , G16B25/10 , G16B50/00
摘要： The present disclosure describes systems and methods to elucidate unknown relationships and interactions between and among complex biological systems and components thereof. The systems and methods can inform clinical interventions in individuals before phenotypes of an adverse condition emerge.

5. 发明申请

WO2018004044A1 게놈 정보 분석 모듈 및 그를 포함하는 시스템 审中-公开
标题翻译：基因组信息分析模块和包括其的系统
公开(公告)号：WO2018004044A1
公开(公告)日：2018-01-04
申请号：PCT/KR2016/007148
申请日：2016-07-01
申请人： 주식회사 마이지놈박스
发明人： 이민섭 , 신상철 , 박성일
IPC分类号： G06F19/28 , G06F15/16 , G06F21/31 , G06F3/06 , G06F9/54
CPC分类号： G06F3/06 , G06F9/54 , G06F15/16 , G06F21/31 , G16B50/00
摘要： 본 발명은 사용자의 적어도 하나의 게놈 정보를 저장하는 게놈 정보 저장장치, 사용자 단말기로부터 게놈 분석 어플리케이션의 실행 요청이 있는 경우, 상기 사용자 단말기의 사용자 정보와 대응하는 사용자별 게놈 정보의 전송을 상기 게놈 정보 저장장치에 요청하여 수신하고, 상기 사용자별 게놈 정보를 분석하는 게놈 분석 어플리케이션을 클라우드 환경에서 실행하는 게놈 분석 어플리케이션 서버 장치를 포함하는 게놈 정보 분석 모듈에 관한 것이다.
摘要翻译：本发明涉及用于存储用户的至少一个基因组信息的基因组信息存储装置，用于存储用户的基因组信息的基因组信息存储装置，以及基因组分析应用服务器装置，用于向基因组信息存储装置请求基因组信息的传输并执行用于分析云环境中的用户特定基因组信息的基因组分析应用。 / p>

6. 发明申请

WO2017156037A1 METHODS AND SYSTEMS FOR DETERMINING ANTIBIOTIC SUSCEPTIBILITY 审中-公开
标题翻译：确定抗生素敏感性的方法和系统
公开(公告)号：WO2017156037A1
公开(公告)日：2017-09-14
申请号：PCT/US2017/021209
申请日：2017-03-07
申请人： OPGEN, INC.
发明人： WALKER, George Terrance , ROCKWEILER, Tony
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689 , A61K31/407 , A61K31/496 , A61K31/5383 , A61K31/546 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158 , G06F19/325 , G16B20/00 , G16B30/00 , G16B50/00 , Y02A50/473 , Y02A50/478 , Y02A90/26
摘要： The present invention provides methods, systems, and kits for determining an appropriate therapeutic regimen for treating an infection caused by antibiotic resistant bacteria.
摘要翻译：本发明提供了用于确定治疗由抗生素抗性细菌引起的感染的适当治疗方案的方法，系统和试剂盒。

7. 发明申请

WO2018175435A2 SYSTEM AND METHOD FOR PROCESSING ELECTRONIC MEDICAL AND GENETIC/GENOMIC INFORMATION USING MACHINE LEARNING AND OTHER ADVANCED ANALYTICS TECHNIQUES 审中-公开
公开(公告)号：WO2018175435A2
公开(公告)日：2018-09-27
申请号：PCT/US2018/023355
申请日：2018-03-20
申请人： CELMATIX INC.
发明人： BEIM, Piraye, Yurttas , ADAMS, Mark , CLEMENT, Caterina , REHMAN, Anila , KIEL, Ryan, Mark
IPC分类号： G06F19/24 , G06F19/18
CPC分类号： G16H10/40 , G16B30/00 , G16B40/00 , G16B50/00 , G16B50/30 , G16H10/60 , G16H15/00 , G16H50/20 , G16H50/30 , G16H80/00
摘要： Embodiments of the present disclosure relate to a machine-learning system for processing medical information. The system comprises a communications interface configured to access electronic medical data. An automated retrieval processor is configured to analyze the electronic medical data to identify and retrieve relevant electronic data based on predefined search criteria. A learning processor is configured to update and optimize the automated retrieval processor based on received electronic metadata associated with the identified relevant electronic data. Other embodiments relate to a machine-learning method for processing electronic medical information. The method comprises accessing electronic medical data from a public database and/or a private database. In addition, the method comprises analyzing the electronic medical data to identify and retrieve relevant electronic data based on predefined search criteria. Also, the method includes performing adaptive learning based on received electronic metadata associated with the identified relevant electronic data.

8. 发明申请

WO2018093496A1 SYSTEMS AND METHODS FOR SECURE BIOMETRIC SAMPLE RAW DATA STORAGE 审中-公开
公开(公告)号：WO2018093496A1
公开(公告)日：2018-05-24
申请号：PCT/US2017/056459
申请日：2017-10-13
申请人： MASTERCARD INTERNATIONAL INCORPORATED
发明人： NOWAK, Dawid , DRUTA, Vladut
IPC分类号： G06K9/00 , G06K9/22
CPC分类号： G06K9/00926 , G06F16/162 , G06F16/90335 , G06F21/32 , G06F21/6227 , G06K9/00604 , G06K9/00986 , G06K9/22 , G16B50/00
摘要： A method for biometric template extraction and secure biometric sample raw data storage, the method comprising enrolling, at a terminal, at least one biometric sample of a user, storing, in a secure storage on the terminal, the raw data of the biometric sample, extracting, by an extraction application executed on the 5 terminal, a biometric template from the raw data of the sample, fragmenting, by a raw sample splitter executed on the terminal, the raw data of the biometric sample, distributing the fragments of the raw data of the biometric samples from the terminal to independent entities, preferably via a secure communication channel, and deleting the biometric sample raw data from the secure storage of 10 the terminal.

9. 发明申请

WO2018021098A1 糖化アルブミンの測定方法审中-公开
标题翻译：测量糖化白蛋白的方法
公开(公告)号：WO2018021098A1
公开(公告)日：2018-02-01
申请号：PCT/JP2017/026014
申请日：2017-07-19
申请人：旭化成ファーマ株式会社
发明人：小熊　良裕
IPC分类号： G01N33/68 , C12M1/34 , G01N27/62 , G01N21/77
CPC分类号： G01N33/6842 , C12M1/34 , G01N21/77 , G01N27/62 , G01N33/6827 , G01N2333/765 , G01N2440/38 , G06F17/11 , G16B5/00 , G16B50/00
摘要：測定方法が異なることに起因して測定値が一致しない場合に測定値を一致させる方法を提供することを目的とする。また、糖化アルブミン（ＧＡ）認証値にトレーサブルなＧＡ値を、簡便且つ安価に、短時間で測定する方法を提供することを目的とする。　以下の工程を含む、糖化アルブミン（ＧＡ）認証値にトレーサブルなＧＡ値の測定方法：Ａ１）以下のｂ）、ｃ）及びｅ０）～ｈ）を含む工程により、回帰式IIIを決定する工程；ｂ）異なるＧＡ認証値を有する２種以上のＧＡ認証標準物質のＧＡ濃度 [L] （Ａ）を決定する工程；ｃ）２種以上のＧＡ認証標準物質におけるＧＡ由来の吸光度（Ｄ）を測定する工程；ｅ０）切片をゼロとする直線の式II ０を作成する工程；ｆ）式II ０を用いて、ＧＡ由来の吸光度（Ｄ）と比例するＧＡ濃度 [P] （Ｅ）を２種以上決定する工程；ｇ）ＧＡ値（Ｆ）を２種以上決定する工程；及びｈ）回帰式IIIを作成する工程。
摘要翻译：目的在于提供一种当测量值由于不同的测量方法而不匹配时匹配测量值的方法。本发明的另一个目的是提供一种方法，用于在短时间内简单且便宜地测量溯源至糖化白蛋白（GA）认证值的GA值。 C）和e _{0），其包括以下步骤：A 1用于测量可溯源为糖化白蛋白（GA）的GA值， B）确定具有不同GA认证值的两种或更多种GA认证参考物质的GA浓度[L]（A） E _{0 ）使截距为零的直线的公式_{0 （子）[P]（E）与来自GA的吸光度（D）成比例，使用公式II0 = G）确定两个或更多GA值（F）;和h）制备回归公式III。}}}

10. 发明申请

WO2018006022A1 BIOINFORMATICS SYSTEMS, APPARATUSES, AND METHODS EXECUTED ON AN INTEGRATED CIRCUIT PROCESSING PLATFORM 审中-公开
标题翻译：在集成电路处理平台上执行的生物信息系统，装置和方法
公开(公告)号：WO2018006022A1
公开(公告)日：2018-01-04
申请号：PCT/US2017/040385
申请日：2017-06-30
申请人： EDICO GENOME CORP.
发明人： VAN ROOYEN, Pieter , RUEHLE, Michael , MEHIO, Rami , HAHM, Mark
IPC分类号： G06F19/28 , G06F19/22
CPC分类号： G16B50/00 , G16B30/00
摘要： A system, method and apparatus for executing a bioinformatics analysis on genetic sequence data includes an integrated circuit formed of a set of hardwired digital logic circuits that are interconnected by physical electrical interconnects. One of the physical electrical interconnects forms an input to the integrated circuit that may be connected with an electronic data source for receiving reads of genomic data. The hardwired digital logic circuits may be arranged as a set of processing engines, each processing engine being formed of a subset of the hardwired digital logic circuits to perform one or more steps in the bioinformatics analysis on the reads of genomic data. Each subset of the hardwired digital logic circuits may be formed in a wired configuration to perform the one or more steps in the bioinformatics analysis.
摘要翻译：用于对遗传序列数据执行生物信息学分析的系统，方法和装置包括由通过物理电互连互连的一组硬线数字逻辑电路形成的集成电路。其中一个物理电互连形成集成电路的输入，其可以与电子数据源连接以接收基因组数据的读取。硬连线数字逻辑电路可以被布置为一组处理引擎，每个处理引擎由硬连线数字逻辑电路的子集形成，以在关于基因组数据的读取的生物信息学分析中执行一个或多个步骤。硬连线数字逻辑电路的每个子集可以以有线配置形成以执行生物信息学分析中的一个或多个步骤。

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