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1. 发明申请

WO2014104202A1 組換え細胞、並びに、イソプレンの生産方法审中-公开
标题翻译：重组细胞和生产异丙酚的方法
公开(公告)号：WO2014104202A1
公开(公告)日：2014-07-03
申请号：PCT/JP2013/084915
申请日：2013-12-26
申请人：積水化学工業株式会社
发明人：古谷　昌弘 , 上西　章太 , 岩佐　航一郎
IPC分类号： C12N1/19 , C12N1/21 , C12N15/09 , C12P5/02
CPC分类号： C12P5/026 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12N15/52 , C12P5/007 , C12Y401/02043 , C12Y402/03027 , C12Y503/01027 , C12Y503/03002 , Y02E50/343
摘要：　メタノール等からイソプレンを生産するための一連の技術を提供することを課題とする。　メチロトローフである宿主細胞にイソプレン合成酵素をコードする遺伝子が導入されてなり、当該遺伝子が前記宿主細胞内で発現し、メタン、メタノール、メチルアミン、ギ酸、ホルムアルデヒド、及びホルムアミドからなる群より選ばれた少なくとも１つのＣ１化合物からイソプレンを生産可能である組換え細胞が提供される。ホルムアルデヒドの固定化経路として、セリン経路、リブロースモノリン酸経路、及びキシロースモノリン酸経路からなる群より選ばれた少なくとも１つのＣ１炭素同化経路を有することが好ましい。当該組換え細胞を用いたイソプレンの生産方法も提供される。
摘要翻译：本发明解决了提供从甲醇等制备异戊二烯的一系列技术的问题。提供了一种重组细胞，其中将编码异戊二烯合酶的基因转移到作为甲基营养素的宿主细胞中，其中所述基因可以在能够从至少一种选自甲烷，甲醇，甲胺，甲酸，甲醛和甲酰胺的C1化合物产生异戊二烯。重组细胞优选具有至少一种选自丝氨酸途径，核酮糖单磷酸途径和木糖单磷酸途径的C1碳同化途径作为甲醛固定途径。还提供了使用上述重组细胞来生产异戊二烯的方法。

2. 发明申请

WO2016137976A1 ELECTROCHEMICAL BIOREACTOR MODULE AND ENGINEERED METABOLIC PATHWAYS FOR 1- BUTANOL PRODUCTION WITH HIGH CARBON EFFICIENCY 审中-公开
标题翻译：电化学生物反应器模块和工程化代用路线，用于高碳效率的1-丁醇生产
公开(公告)号：WO2016137976A1
公开(公告)日：2016-09-01
申请号：PCT/US2016/019102
申请日：2016-02-23
申请人： BIOCHEMINSIGHTS, INC.
发明人： DODDS, David R. , ARMIGER, William B. , KOFFAS, Mattheos
IPC分类号： C12P1/00 , C12P7/16
CPC分类号： C12P7/16 , C12M45/07 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/001 , C12N9/1029 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12N15/52 , C12Y101/01001 , C12Y101/01027 , C12Y101/01157 , C12Y102/0101 , C12Y102/01046 , C12Y102/01057 , C12Y102/04001 , C12Y103/01006 , C12Y103/01038 , C12Y203/01008 , C12Y203/01009 , C12Y203/01054 , C12Y401/02043 , C12Y503/01027 , C25B3/04 , C25B9/08 , C25B15/02 , C25B15/08 , Y02E50/10
摘要： A combination of an electrochemical device for delivering reducing equivalents to a cell, and engineered metabolic pathways within the cell capable of utilizing the electrochemically provided reducing equivalents is disclosed. Such a combination allows the production of commodity chemicals by fermentation to proceed with increased carbon efficiency.
摘要翻译：公开了一种用于递送还原当量至细胞的电化学装置和能够利用电化学提供的还原当量的细胞内工程化代谢途径的组合。这种组合允许通过发酵生产商品化学品以提高碳效率。

3. 发明申请

WO2017075208A1 METHANOL DEHYDROGENASE FUSION PROTEINS 审中-公开
标题翻译：甲醇脱氢酶融合蛋白
公开(公告)号：WO2017075208A1
公开(公告)日：2017-05-04
申请号：PCT/US2016/059096
申请日：2016-10-27
申请人： GENOMATICA, INC.
发明人： BARTON, Nelson R. , LI, Jingyi , WARNER, Joseph R. , PHARKYA, Priti
IPC分类号： C07K14/195 , C12N15/62 , C12N5/00
CPC分类号： C12Y503/01027 , C07K2319/00 , C12N9/0006 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12N15/52 , C12Y401/02043
摘要： Described herein are fusion proteins including methanol dehydrogenase (MeDH) and at least one other polypeptide such as 3-hexulose-6-phosphate dehydrogenase (HPS) or 6-phospho-3-hexuloisomerase (PHI), such as DHAS synthase or fructose-6-Phosphate aldolase or such as DHA synthase or DHA kinase. In a localized manner, the fusion protein can promote the conversion of methanol to formaldehyde and then to a ketose phosphate such as hexulose 6-phosphate or then to DHA and G3P. When expressed in cells, the fusion proteins can promote methanol uptake and rapid conversion to the ketose phosphate or to the DHA and D3P, which in turn can be used in a pathway for the production of a desired bioproduct. Beneficially, the rapid conversion to the ketose phosphate or to the DHA and G3P can avoid the undesirable accumulation of formaldehyde in the cell. Also described are engineered cells expressing the fusion protein, optionally include one or more additional metabolic pathway transgene(s), methanol metabolic pathway genes, target product pathway genes, cell culture compositions including the cells, methods for promoting production of the target product or intermediate thereof from the cells, compositions including the target product or intermediate, and products made from the target product or intermediate.
摘要翻译：本文描述了融合蛋白，其包括甲醇脱氢酶（MeDH）和至少一种其他多肽如3-己酮糖-6-磷酸脱氢酶（HPS）或6-磷酸-3-己酮糖异构酶（PHI），如DHAS合酶或果糖-6-磷酸醛缩酶或例如DHA合酶或DHA激酶。以局部方式，融合蛋白可以促进甲醇转化为甲醛，然后转化为磷酸酮糖如己酮糖6-磷酸，然后转化为DHA和G3P。当在细胞中表达时，融合蛋白可以促进甲醇吸收并快速转化为磷酸酮糖或DHA和D3P，其又可用于生产期望的生物产品的途径中。有利的是，快速转化为磷酸酮糖或DHA和G3P可以避免细胞中不希望的甲醛累积。还描述了表达融合蛋白的工程细胞，任选地包括一种或多种另外的代谢途径转基因，甲醇代谢途径基因，靶产物途径基因，包括细胞的细胞培养组合物，用于促进目标产物或中间产物生成的方法包括目标产物或中间体的组合物，以及由目标产物或中间体制备的产物。

4. 发明申请

WO2014100722A1 CELL-FREE SYSTEM FOR CONVERTING METHANE INTO FUEL, PYRUVATE OR ISOBUTANOL 审中-公开
标题翻译：将甲烷转化为燃料，吡咯或异丁醇的无细胞系统
公开(公告)号：WO2014100722A1
公开(公告)日：2014-06-26
申请号：PCT/US2013/077238
申请日：2013-12-20
申请人： GREENLIGHT BIOSCIENCES, INC.
发明人： BLAKE, William, Jeremy , SWARTZ, James, R.
IPC分类号： C12P7/16 , C12P7/40 , C12P7/64
CPC分类号： C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/0073 , C12N9/1022 , C12N9/1205 , C12N9/1217 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12N15/70 , C12P7/16 , C12P7/40 , C12P7/649 , C12Y101/01244 , C12Y102/01012 , C12Y114/13025 , C12Y202/01001 , C12Y207/01011 , C12Y207/0104 , C12Y207/02003 , C12Y401/02013 , C12Y401/02043 , C12Y402/01011 , C12Y501/03001 , C12Y503/01001 , C12Y503/01027 , Y02E50/10 , Y02E50/13
摘要： The present disclosure relates, in some aspects, to cell-free methods and systems for large-scale conversion of methane to isobutanol, comprising combining, in a bioreactor at elevated pressure, methane, oxygen, and cell lysates containing methane monooxygenase, methanol dehydrogenase, and enzymes that catalyze the conversion of formaldehyde to isobutanol, to form a cell-free reaction mixture, and incubating under suitable conditions the cell-free reaction to convert methane to isobutanol.
摘要翻译：在一些方面，本公开内容涉及用于将甲烷大规模转化为异丁醇的无细胞方法和系统，其包括在升高的压力下在生物反应器中组合甲烷，氧气和含有甲烷单加氧酶，甲醇脱氢酶，以及催化甲醛转化为异丁醇的酶，形成无细胞的反应混合物，并在合适的条件下孵育将甲烷转化为异丁醇的无细胞反应。

5. 发明申请

WO2015077752A1 METHODS FOR ENHANCING MICROBIAL PRODUCTION OF SPECIFIC LENGTH FATTY ALCOHOLS IN THE PRESENCE OF METHANOL 审中-公开
标题翻译：在甲醇存在下增强特定长度脂肪醇的微生物生产方法
公开(公告)号：WO2015077752A1
公开(公告)日：2015-05-28
申请号：PCT/US2014/067282
申请日：2014-11-25
申请人： GENOMATICA, INC.
发明人： OSTERHOUT, Robin, E. , BURGARD, Anthony, P. , PHARKYA, Priti , ANDRAE, Stefan
IPC分类号： C12N1/19 , C12N1/15 , C12N1/13 , C12N1/11
CPC分类号： C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/1022 , C12N9/88 , C12N9/90 , C12P7/04 , C12Y101/01244 , C12Y202/01003 , C12Y401/02043 , C12Y503/01027
摘要： The invention provides non-naturally occurring microbial organisms having a formaldehyde fixation pathway, a formate assimilation pathway, and/or a methanol metabolic pathway in combination with a fatty alcohol, fatty aldehyde, fatty acid or isopropanol pathway, wherein the microbial organisms selectively produce a fatty alcohol, fatty aldehyde or fatty acid of a specified length or isopropanol. The microbial organisms provided advantageously enhance the production of substrates and/or pathway intermediates for the production of chain length specific fatty alcohols, fatty aldehydes, fatty acids or isopropanol. In some aspects, the microbial organisms of the invention have select gene disruptions or enzyme attenuations that increase production of fatty alcohols, fatty aldehydes or fatty acids. The invention additionally provides methods of using the above microbial organisms to produce a fatty alcohol, a fatty aldehyde, a fatty acid or isopropanol.
摘要翻译：本发明提供具有甲醛固定通道，甲酸同化途径和/或与脂肪醇，脂肪醛，脂肪酸或异丙醇途径组合的甲醇代谢途径的非天然存在的微生物生物，其中所述微生物有选择地产生脂肪醇，脂肪醛或指定长度的脂肪酸或异丙醇。提供的微生物有利地增强了用于生产链长特异性脂肪醇，脂肪醛，脂肪酸或异丙醇的底物和/或途径中间体的生产。在一些方面，本发明的微生物有选择性的基因破坏或酶衰减，其增加脂肪醇，脂肪醛或脂肪酸的产生。本发明还提供了使用上述微生物生产脂肪醇，脂肪醛，脂肪酸或异丙醇的方法。

6. 发明申请

WO2014112627A1 組換え細胞、並びに、１，４－ブタンジオールの生産方法审中-公开
标题翻译：重组细胞和生产1,4-丁二醇的方法
公开(公告)号：WO2014112627A1
公开(公告)日：2014-07-24
申请号：PCT/JP2014/050998
申请日：2014-01-20
申请人：積水化学工業株式会社
发明人：古谷　昌弘 , 上西　章太 , 岩佐　航一郎
IPC分类号： C12N1/21 , C12N1/19 , C12N15/09 , C12P7/18
CPC分类号： C12P7/18 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/10 , C12N9/88 , C12N9/93 , C12Y101/01244 , C12Y401/02043 , C12Y402/03027
摘要：　メタノール等から１，４－ブタンジオールを生産するための一連の技術を提供することを課題とする。　メチロトローフである宿主細胞に、コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素、スクシニルＣｏＡ合成酵素、ＣｏＡ依存型コハク酸セミアルデヒド脱水素酵素、４－ヒドロキシ酪酸脱水素酵素、４－ヒドロキシ酪酸ＣｏＡ転移酵素、４－ヒドロキシ酪酸ＣｏＡ還元酵素、４－ヒドロキシブチルアルデヒド脱水素酵素、及びアルコールデヒドロゲナーゼからなる群より選ばれた少なくとも１つの酵素をコードする遺伝子が導入されてなり、当該遺伝子が前記宿主細胞内で発現し、メタン、メタノール、メチルアミン、ギ酸、ホルムアルデヒド、及びホルムアミドからなる群より選ばれた少なくとも１つのＣ１化合物から１，４－ブタンジオールを生産可能である組換え細胞。
摘要翻译：本发明解决了提供一系列用于从甲醇等生产1,4-丁二醇的技术的问题。通过引入编码选自琥珀酸半醛脱氢酶，琥珀酰辅酶A合成酶，辅酶A依赖性琥珀酸半醛脱氢酶，4-羟基丁酸脱氢酶，4-羟基丁酰-CoA转移酶，4 - 羟基丁酰辅酶A还原酶，4-羟基丁醛脱氢酶和醇脱氢酶转化为宿主细胞，其是甲基营养素，其中所述基因可以在宿主细胞中表达，所述重组细胞能够从至少一个C1产生1,4-丁二醇选自甲烷，甲醇，甲胺，甲酸，甲醛和甲酰胺的化合物。

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