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    • 2. 发明申请
    • INTEGRATED DATABASE MANAGEMENT OF PROTEIN AND LIGAND STRUCTURES
    • 蛋白质和配体结构的整合数据库管理
    • WO2005055114A1
    • 2005-06-16
    • PCT/US2004/039449
    • 2004-11-24
    • ACCELRYS SOFTWARE INC.POTTS, Steven, J.SZALMA, SandorYU, YinKAHN, Scott, D.EDWARDS, David
    • POTTS, Steven, J.SZALMA, SandorYU, YinKAHN, Scott, D.EDWARDS, David
    • G06F19/00
    • G06F19/28G06F19/16
    • Systems and methods for storing protein structure information are provided. The system comprises a non-public database storing protein structure information, wherein the non-public database is coupled to a public database of non-proprietary protein structure information and to non-public sources of proprietary protein structure information. The non-public database may also be coupled to a database having protein structure information for substantially all the proteins of at least one organism genome. The method may comprise loading protein structure data from at least one public database and loading protein structure data from one or more proprietary sources of protein structure information. The public database may comprise the Protein Data Bank (PDB). Certain types of additional information are also advantageously loaded into the database. These may include classification data corresponding to at least one protein ontology. Mass spectroscopy data, NMR data and x-ray crystallography data may also be loaded into the database.
    • 提供了存储蛋白质结构信息的系统和方法。 该系统包括存储蛋白质结构信息的非公开数据库,其中非公开数据库耦合到非专有蛋白质结构信息的公共数据库和非公有资源的专有蛋白质结构信息。 非公开数据库还可以耦合到具有至少一个生物基因组的基本上所有蛋白质的蛋白质结构信息的数据库。 该方法可以包括从至少一个公共数据库加载蛋白质结构数据并从蛋白质结构信息的一个或多个专有来源加载蛋白质结构数据。 公共数据库可以包括蛋白质数据库(PDB)。 某些类型的附加信息也有利地被加载到数据库中。 这些可以包括对应于至少一个蛋白质本体的分类数据。 质谱数据,NMR数据和X射线晶体学数据也可以加载到数据库中。