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    • 8. 发明授权
    • System and method for predicting chromosomal regions that control phenotypic traits
    • 用于预测控制表型性状的染色体区域的系统和方法
    • US07698117B2
    • 2010-04-13
    • US10015167
    • 2001-12-11
    • Jonathan A. UsukaAndrew GrupeGary Allen Peltz
    • Jonathan A. UsukaAndrew GrupeGary Allen Peltz
    • G06G7/48G06G7/58G01N33/48G01N31/00
    • G06F19/18C12Q1/6876
    • A method of associating a phenotype with one or more candidate chromosomal regions in a genome of an organism includes the step of deriving a phenotypic data structure that represents differences in phenotypes between different strains of the organism. Further, a genotypic data structure is established. The genotypic data structure corresponds to a locus selected from a plurality of loci in the genome of the organism. The genotypic data structure represents variations of at least one component of the locus between different strains of the organism. The phenotypic data structure is compared to the genotypic data structure to form a correlation value. The process of establishing a genotypic data structure and comparing it to the phenotypic data structure is repeated for each locus in the plurality of loci, thereby identifying one or more genotypic data structures that form a high correlation value relative to all other compared genotypic data structures. The loci that correspond to the one or more genotypic data structures having a high correlation value represent the one or more candidate chromosomal regions.
    • 将表型与生物体基因组中的一个或多个候选染色体区域相关联的方法包括产生表示生物体不同菌株之间的表型差异的表型数据结构的步骤。 此外,建立了基因型数据结构。 基因型数据结构对应于选自生物体基因组中多个基因座的位点。 基因型数据结构表示生物体的不同菌株之间的轨迹的至少一个成分的变化。 将表型数据结构与基因型数据结构进行比较,形成相关值。 针对多个基因座中的每个基因座重复建立基因型数据结构并将其与表型数据结构进行比较的过程,从而鉴定相对于所有其他比较的基因型数据结构形成高相关值的一个或多个基因型数据结构。 对应于具有高相关值的一个或多个基因型数据结构的基因座表示一个或多个候选染色体区域。