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71. 发明申请

US20100015626A1 MULTIPLEX NUCLEIC ACID REACTIONS 审中-公开
标题翻译：多重核酸反应
公开(公告)号：US20100015626A1
公开(公告)日：2010-01-21
申请号：US12507022
申请日：2009-07-21
申请人： Arnold Oliphant , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Scott L. Butler , Jian-Bing Fan , Min-Jui Richard Shen
发明人： Arnold Oliphant , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Scott L. Butler , Jian-Bing Fan , Min-Jui Richard Shen
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6876 , C12Q1/6834 , C12Q1/6837 , C12Q2600/16 , Y10T436/143333 , C12Q2525/155 , C12Q2563/131 , C12Q2563/179
摘要： The invention is directed to a variety of multiplexing methods used to amplify and/or genotype a variety of samples simultaneously.
摘要翻译：本发明涉及用于同时扩增和/或基因型多种样品的多种多样化方法。

72. 发明申请

US20090215649A1 ARRAY KITS AND PROCESSING SYSTEMS 有权
标题翻译：阵列和加工系统
公开(公告)号：US20090215649A1
公开(公告)日：2009-08-27
申请号：US12405162
申请日：2009-03-16
申请人： John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Steven R. Auger , Gan G. Wang , Laura S. Casas , Shawn Christopher Baker , Robert C. Kain
发明人： John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Steven R. Auger , Gan G. Wang , Laura S. Casas , Shawn Christopher Baker , Robert C. Kain
IPC分类号： C40B40/08 , C40B60/12
CPC分类号： B01J19/0046 , B01J2219/00315 , B01J2219/00317 , B01J2219/00382 , B01J2219/005 , B01J2219/00511 , B01J2219/00524 , B01J2219/00585 , B01J2219/00596 , B01J2219/00605 , B01J2219/00612 , B01J2219/00621 , B01J2219/00626 , B01J2219/00637 , B01J2219/00648 , B01J2219/00659 , B01J2219/00704 , B01J2219/0072 , B01J2219/00722 , C40B40/06 , G01N33/54393
摘要： The invention relates to sensor compositions comprising a composite array of individual arrays, to allow for simultaneous processing of a number of samples. The invention further provides methods of making and using the composite arrays. The invention further provides a hybridization chamber for use with a composite array.
摘要翻译：本发明涉及包括单独阵列的复合阵列的传感器组合物，以允许同时处理多个样品。本发明还提供了制备和使用复合阵列的方法。本发明还提供了一种与复合阵列一起使用的杂交室。

73. 发明申请

US20080242555A1 MULTIPLEX NUCLEIC ACID REACTIONS 有权
标题翻译：多重核酸反应
公开(公告)号：US20080242555A1
公开(公告)日：2008-10-02
申请号：US12032581
申请日：2008-02-15
申请人： Min-Jui Richard Shen , Arnold Oliphant , Scott L. Butler , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Kenneth M. Kuhn , Jian-Bing Fan
发明人： Min-Jui Richard Shen , Arnold Oliphant , Scott L. Butler , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee , Kenneth M. Kuhn , Jian-Bing Fan
IPC分类号： C40B30/04
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q1/6858 , C12Q2535/125 , C12Q2537/143 , C12Q2561/125 , C12Q2565/515
摘要： The invention is directed to a variety of multiplexing methods used to amplify and/or genotype a variety of samples simultaneously.
摘要翻译：本发明涉及用于同时扩增和/或基因型多种样品的多种多样化方法。

74. 发明授权

US07252948B2 Chip-based speciation and phenotypic characterization of microorganisms 有权
标题翻译：基于芯片的形态和微生物的表型表征
公开(公告)号：US07252948B2
公开(公告)日：2007-08-07
申请号：US11050647
申请日：2005-02-04
申请人： Thomas R. Gingeras , David Mack , Mark S. Chee , Anthony J. Berno , Lubert Stryer , Ghassan Ghandour , Ching Wang
发明人： Thomas R. Gingeras , David Mack , Mark S. Chee , Anthony J. Berno , Lubert Stryer , Ghassan Ghandour , Ching Wang
IPC分类号： C12Q1/68 , C12P19/34
CPC分类号： C40B80/00 , B01J2219/00529 , B01J2219/00608 , B01J2219/00612 , C12Q1/6809 , C12Q1/6837 , C12Q1/6888 , C12Q1/689 , C12Q2600/156 , G01N33/54386 , G06F19/20 , C12Q2565/501
摘要： This invention provides oligonucleotide based arrays and methods for speciating and phenotyping organisms, for example, using oligonucleotide sequences based on the Mycobacterium tuberculosis rpoB gene. The groups or species to which an organism belongs may be determined by comparing hybridization patterns of target nucleic acid from the organism to hybridization patterns in a database.
摘要翻译：本发明提供了基于寡核苷酸的阵列和用于指定和表型生物的方法，例如使用基于结核分枝杆菌rpoB基因的寡核苷酸序列。可以通过将来自生物体的靶核酸的杂交模式与数据库中的杂交模式进行比较来确定生物体所属的组或物种。

75. 发明授权

US07166431B2 Combinatorial decoding of random nucleic acid arrays 有权
标题翻译：随机核酸阵列的组合解码
公开(公告)号：US07166431B2
公开(公告)日：2007-01-23
申请号：US10648848
申请日：2003-08-21
申请人： Mark S. Chee , David R. Walt
发明人： Mark S. Chee , David R. Walt
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6874 , B01J2219/005 , B01J2219/00572 , B01J2219/00585 , B01J2219/00596 , B01J2219/00648 , B01J2219/00659 , B01J2219/00702 , B01J2219/00722 , C07B2200/11 , C07H21/00 , C12Q1/6837 , C40B20/04 , C40B40/06 , C40B70/00 , C12Q2563/161 , C12Q2563/185 , C12Q2525/179 , C12Q2563/155 , C12Q2565/514
摘要： The invention provides methods and compositions for combinatorially decoding arrays.
摘要翻译：本发明提供了组合解码阵列的方法和组合。

76. 发明授权

US07060431B2 Method of making and decoding of array sensors with microspheres 有权
标题翻译：使用微球制造和解码阵列传感器的方法
公开(公告)号：US07060431B2
公开(公告)日：2006-06-13
申请号：US09344526
申请日：1999-06-24
申请人： Mark S. Chee , John R. Stuelpnagel , Anthony W. Czarnik
发明人： Mark S. Chee , John R. Stuelpnagel , Anthony W. Czarnik
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/00 , G01N1/00 , G01N31/00
CPC分类号： C12Q1/6837 , B01J19/0046 , B01J2219/00317 , B01J2219/00459 , B01J2219/00466 , B01J2219/005 , B01J2219/00572 , B01J2219/00576 , B01J2219/00585 , B01J2219/00596 , B01J2219/00605 , B01J2219/0061 , B01J2219/00612 , B01J2219/00617 , B01J2219/00619 , B01J2219/00621 , B01J2219/00626 , B01J2219/0063 , B01J2219/00637 , B01J2219/00641 , B01J2219/00644 , B01J2219/00648 , B01J2219/00659 , B01J2219/00677 , B01J2219/00702 , B01J2219/00722 , B01L3/5085 , B82Y30/00 , C12Q1/6816 , C12Q1/6825 , C12Q1/6834 , C40B40/06 , C40B60/14 , C40B70/00 , G01N33/54313 , G06K9/6202 , Y10S977/924 , C12Q2563/155 , C12Q2563/179 , C12Q2563/107 , C12Q2527/137 , C12Q2521/313 , C12Q2537/143
摘要： The invention relates to compositions and methods for decoding microsphere array sensors.
摘要翻译：本发明涉及用于解码微球阵列传感器的组合物和方法。

77. 发明授权

US06998274B2 Composite arrays utilizing microspheres 有权
标题翻译：使用微球的复合阵列
公开(公告)号：US06998274B2
公开(公告)日：2006-02-14
申请号：US10194912
申请日：2002-07-12
申请人： Mark S. Chee , Steven R. Auger , John R. Stuelpnagel
发明人： Mark S. Chee , Steven R. Auger , John R. Stuelpnagel
IPC分类号： G01N33/543 , G01N33/53 , C12M1/34
CPC分类号： G01N33/543 , B01J2219/00315 , B01J2219/00317 , B01J2219/00382 , B01J2219/005 , B01J2219/00585 , B01J2219/00596 , B01J2219/00648 , B01J2219/00659 , C40B60/14 , G01N33/54313 , G01N33/54393 , Y10S977/924
摘要： The invention relates to compositions and methods for decoding microsphere array sensors.
摘要翻译：本发明涉及用于解码微球阵列传感器的组合物和方法。

78. 发明授权

US06890741B2 Multiplexed detection of analytes 有权
标题翻译：分析物的多重检测
公开(公告)号：US06890741B2
公开(公告)日：2005-05-10
申请号：US09915231
申请日：2001-07-24
申请人： Jian-Bing Fan , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee
发明人： Jian-Bing Fan , John R. Stuelpnagel , Mark S. Chee
IPC分类号： G01N33/53 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12N15/09 , C12P19/34 , C12Q1/68 , G01N33/00 , G01N33/566
CPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q1/6809 , C12Q1/682 , C12Q1/6834 , C12Q1/6837 , C12Q1/6853 , C12Q1/6858 , C12Q1/6862 , Y10T436/143333 , C12Q2563/179 , C12Q2533/107 , C12Q2525/173 , C12Q2565/519 , C12Q2525/161 , C12Q2565/501 , C12Q2531/125 , C12Q2563/131 , C12Q2525/155
摘要： The present invention is directed to sensitive and accurate multiplexed assays for target analyte detection.
摘要翻译：本发明涉及用于靶分析物检测的灵敏且准确的多重测定。

79. 发明授权

US06410229B1 Expression monitoring by hybridization to high density nucleic acid arrays 有权
标题翻译：通过与高密度核酸阵列杂交进行表达监测
公开(公告)号：US06410229B1
公开(公告)日：2002-06-25
申请号：US09212004
申请日：1998-12-14
申请人： David J. Lockhart , Eugene L. Brown , Gordon G. Wong , Mark S. Chee , Thomas R. Gingeras
发明人： David J. Lockhart , Eugene L. Brown , Gordon G. Wong , Mark S. Chee , Thomas R. Gingeras
IPC分类号： C12Q168
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q1/6837 , G01N15/1475 , C12Q2565/507
摘要： This invention provides methods of monitoring the expression levels of a multiplicity of genes. The methods involve hybridizing a nucleic acid sample to a high density array of oligonucleotide probes where the high density array contains oligonucleotide probes complementary to subsequences of target nucleic acids in the nucleic acid sample. In one embodiment, the method involves providing a pool of target nucleic acids comprising RNA transcripts of one or more target genes, or nucleic acids derived from the RNA transcripts, hybridizing said pool of nucleic acids to an array of oligonucleotide probes immobilized on surface, where the array comprising more than 100 different oligonucleotides and each different oligonucleotide is localized in a predetermined region of the surface, the density of the different oligonucleotides is greater than about 60 different oligonucleotides per 1 cm2, and the olignucleotide probes are complementary to the RNA transcripts or nucleic acids derived from the RNA transcripts; and quantifying the hybridized nucleic acids in the array.
摘要翻译：本发明提供监测多种基因的表达水平的方法。所述方法包括将核酸样品与寡核苷酸探针的高密度阵列杂交，其中高密度阵列含有与核酸样品中靶核酸的子序列互补的寡核苷酸探针。在一个实施方案中，所述方法包括提供包含一个或多个靶基因的RNA转录物或衍生自RNA转录物的核酸的靶核酸库，将所述核酸库与固定在表面上的寡核苷酸探针阵列杂交，其中包含超过100种不同寡核苷酸的阵列和每种不同的寡核苷酸被定位在表面的预定区域中，不同寡核苷酸的密度大于每1cm 2大约60个不同的寡核苷酸，并且寡核苷酸探针与RNA转录物互补衍生自RNA转录物的核酸; 并定量阵列中的杂交核酸。

80. 发明授权

US06355431B1 Detection of nucleic acid amplification reactions using bead arrays 有权
标题翻译：使用珠阵列检测核酸扩增反应
公开(公告)号：US06355431B1
公开(公告)日：2002-03-12
申请号：US09517945
申请日：2000-03-03
申请人： Mark S. Chee , Kevin Gunderson
发明人： Mark S. Chee , Kevin Gunderson
IPC分类号： C12Q168
CPC分类号： C12Q1/6874 , B01J2219/005 , B01J2219/00596 , B01J2219/00648 , B01J2219/00659 , B01J2219/00707 , B01J2219/00722 , C12Q1/6813 , C40B40/06 , Y10S977/924
摘要： The invention relates to compositions and methods for detecting and quantifying a target nucleic acid using a variety of both signal amplification and target amplification techniques.
摘要翻译：本发明涉及使用各种信号放大和靶扩增技术检测和定量靶核酸的组合物和方法。

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