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1. 发明公开

KR1020150061816A 혈액유래 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 有权
标题翻译：用于从血液样品获得的癌症诊断的多肽标记物和使用该方法诊断癌症的方法
公开(公告)号：KR1020150061816A
公开(公告)日：2015-06-05
申请号：KR1020130145999
申请日：2013-11-28
申请人： 한국기초과학지원연구원
发明人： 안영희 , 유종신 , 지은선 , 신박민 , 오나리
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/574 , G01N33/48
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6886 , G01N30/02 , G01N33/57423 , G01N33/6818 , G01N33/6848
摘要： 본발명은혈액유래암 진단용펩티드마커및 이를이용한암 진단방법에관한것으로, 구체적으로폐암환자의혈액에서암 발생및 진행에따른비정상적으로당쇄화된당단백질을렉틴(lectin)을이용하여분리하고, 렉틴에의하여분리된당단백질의가수분해로부터생성된펩티드를선별하여서열및 정량분석을통해마커단백질및 마커펩티드를선별함으로써, 상기마커펩티드를암 진단용마커및 진단방법으로유용하게사용할수 있다.
摘要翻译：本发明涉及用于诊断来自血液样品的癌症的多肽标记物，以及使用其的癌症诊断方法。更具体地，多肽标记被配置为使用凝集素从根据癌症发生和患有肺癌的患者的血液中分离出异常糖基化的糖蛋白，并通过顺序和定性分析选择标记蛋白和标记肽选择由凝集素分离的糖蛋白水解产生的肽。因此，标记肽可以有效地用作诊断癌症的标志物和癌症诊断方法。

2. 发明公开

KR1020100083072A 자유 라디칼 개시제 및 이를 이용한 펩타이드 서열의 동정방법 有权
标题翻译：免疫放射原理及其使用方法
公开(公告)号：KR1020100083072A
公开(公告)日：2010-07-21
申请号：KR1020090002440
申请日：2009-01-12
申请人： 서강대학교산학협력단
发明人： 오한빈 , 문봉진 , 강민혁 , 이민희
IPC分类号： C07D211/92
CPC分类号： C07K1/1077 , C07D401/12 , C07K1/128 , C07K1/13 , G01N33/6818 , G01N33/6848
摘要： PURPOSE: A novel free radical initiator and a method for identifying peptide sequence using the same are provided. CONSTITUTION: A compound of chemical formula 1, 2, or 3 is used as a free radical initiator for identifying peptide sequence. A method for identifying the peptide sequence comprises: a step of conjugating the compound with a peptide; a step of activating the conjugated peptide by primary collision to form molecular fragment; a dissociating by secondary collision of the molecular fragment to form ion fragment; and a step of analyzing mass of the ion fragment. The ion fragment is a, b, c, x, y or z. The method is performed on a gas phase.
摘要翻译：目的：提供一种新型的自由基引发剂和使用其的鉴定肽序列的方法。构成：使用化学式1,2或3的化合物作为鉴定肽序列的自由基引发剂。用于鉴定肽序列的方法包括：使化合物与肽缀合的步骤; 通过初次碰撞激活共轭肽以形成分子片段的步骤; 通过分子片段的二次碰撞解离形成离子片段; 以及分析离子片段的质量的步骤。离子片段是a，b，c，x，y或z。该方法在气相上进行。

3. 发明公开

KR1020070017676A 변형된 폴리펩티드(Ｍｏｄｉｆｉｅｄｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ)의 서열 및 변형 정보를 분석하는방법 失效
标题翻译：用于修饰多肽的加分评分方法
公开(公告)号：KR1020070017676A
公开(公告)日：2007-02-13
申请号：KR1020050072198
申请日：2005-08-08
申请人： 한국기초과학지원연구원
发明人： 안영희 , 권경훈 , 유종신
IPC分类号： G01N33/68 , G01N33/50
CPC分类号： C07K14/4732 , G01N33/6848 , G01N33/6818 , G01N2560/00 , G06F19/22 , G06F19/24
摘要： 본 발명은 질량 분석 데이터를 이용하여 변형된 폴리펩티드(modified polypeptide)의 서열 및 변형정보를 분석하는 방법에 관한 것으로서, 구체적으로 대상 펩티드 전구체로부터 탠덤 질량 분석 방법(tandom mass spectrometry)에 의하여 얻은 단편 이온 신호(fragment ion signal)들을 이용하여 가능한 모든 펩티드 단편화 패턴(peptide fragmentation pattern)을 구성하고, 이를 고려하여 각각의 후보 펩티드(candidate peptides)에 부합 수치(match score)를 부여한 후, 상기 수치를 통합하여 탠덤 질량 분석 과정에서 다양한 단편화 패턴을 생성하는 변형된 펩티드들을 검색하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 변형된 폴리펩티드(modified polypeptide) 분석 방법은 대상 펩티드의 질량 분석 데이타로부터 동일한 펩티드 서열로 구성되지만 서로 다른 펩티드 단편화 패턴에 의하여 생성될 수 있는 다양한 후보 펩티드의 경우를 모두 고려하여 수치화한 데이터를 통합함으로써 변형된 펩티드의 검색 효율 및 검색 결과의 신뢰도를 높이는 데에 보다 효과적으로 이용될 수 있다.

4. 发明公开

KR1020120125889A 이중 질량 분석기를 통한 고속 다중―무제한 변이 탐색 방법 및 장치 有权
标题翻译：通过串联质谱快速多盲修改检索方法和装置
公开(公告)号：KR1020120125889A
公开(公告)日：2012-11-19
申请号：KR1020110043616
申请日：2011-05-09
申请人： 서울시립대학교 산학협력단
发明人： 백은옥 , 나승진 , 누노반데이라
IPC分类号： G06F19/10
CPC分类号： G06F19/22 , G01N33/6818 , G01N33/6848
摘要： PURPOSE: A high speed multiple-unrestricted modification searching method through a mass spectrometry and a device thereof are provided to use dynamic programming algorithm based on a multi sequence tag from each a mass spectrometry spectrum according to modification alignment, thereby determining modifications about a database peptide. CONSTITUTION: MS/MS spectrum information is inputted from a mass spectrometry. A plurality of amino acid ranking tags is induced. Each of ranking tags is arranged about candidate peptides including the corresponding ranking tags in a database. Modification within the candidate peptide is identified without a limit of the number of modifications by every peptide through dynamic programming limiting a moving route according to location information of tags in a matrix. Each of the ranking tags are arranged for arrangement between ranking of the spectrum information and the candidate peptides in the matrix.
摘要翻译：目的：提供通过质谱法及其装置的高速多重无限制修改搜索方法，以根据修改对齐方式使用基于每个质谱图谱的多序列标签的动态规划算法，从而确定关于数据库肽的修饰。构成：通过质谱仪输入MS / MS谱信息。诱导多个氨基酸排名标签。排列标签中的每个排列关于候选肽，包括数据库中相应的排名标签。通过根据矩阵中的标签的位置信息通过动态规划限制移动路线来确定候选肽中的修饰，而不限制每个肽的修饰数量。排列标签中的每一个排列用于在矩阵中的频谱信息和候选肽的排序之间进行排列。

5. 发明公开

KR1020060036322A 아미노산 서열 분석 장치 및 방법 失效
标题翻译：氨基酸序列分析装置及方法
公开(公告)号：KR1020060036322A
公开(公告)日：2006-04-28
申请号：KR1020040085496
申请日：2004-10-25
申请人： 김상태 , 이공주 , 박희진 , 백은옥
发明人： 김상태 , 박희진 , 이공주 , 백은옥
IPC分类号： C12Q1/68 , G06F19/20
CPC分类号： G01N33/6818 , G06F19/20
摘要： 단백질에 포함된 아미노산 서열을 분석하기 위한 장치 및 방법을 제시한다.
본 발명은 분석 대상 펩타이드에 포함된 서열 태그 리스트를 추출하고 이를 포함하는 후보 펩타이드를 결정한 후, 서열 태그 간의 결합을 통해 공백을 포함하는 펩타이드 리스트를 생성한 다음, 공백 부분의 질량 변이와 후보 펩타이드에 포함된 공백 부분의 아미노산 서열 정보를 이용하여 해당 공백 부분의 아미노산 서열 또는 번역 후 변형을 탐색함으로써, 단백질에 포함된 아미노산 서열 및 번역 후 변형의 탐색 절차를 최소화할 수 있다.
단백질, 아미노산 서열, 번역 후 변형

6. 发明公开

KR1020030094404A 프로테옴 칩을 사용한 단백질 활성의 포괄적인 분석 无效
标题翻译：使用蛋白质芯片对蛋白质活性进行综合分析
公开(公告)号：KR1020030094404A
公开(公告)日：2003-12-11
申请号：KR1020037014678
申请日：2002-05-13
申请人： 예일 유니버시티
发明人： 스니더,마이클 , 주헹 , 벨톤,폴 , 비드링마이어,스콧,엠. , 빌긴,메틴 , 카사마이어,안토니오,제이. , 게스테인,마크 , 젠슨,로날드 , 란닝
IPC分类号： G01N33/68
CPC分类号： C40B30/04 , C07K1/047 , C07K1/1077 , C07K14/47 , G01N33/6818 , G01N33/6842 , G01N33/6845 , G01N33/92
摘要： 본 발명은 단일 종에서 발현되는 모든 단백질의 대부분을 갖는 배열을 포함하는 프로테옴 칩에 관한 것이다. 본 발명은 또한 프로테옴 칩의 제조 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 프로테옴 칩을 사용하여 고도의 자료 처리 방식으로 종들 중의 모든 단백질 상호작용을 체계적으로 분석하는 방법에 관한 것이다.
본 발명은 또한 고 밀도 배열 포맷으로 진핵 단백질을 제조 및 정제하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 이중 표시된 융합 단백질을 고체 지지체에 부착시킴으로써 단백질 배열을 제조하는 방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한 신호의 양성 여부를 식별하는 방법에 관한 것이다.

7. 发明公开

KR1020160079780A 생체분자를 서열화하는 디바이스들, 시스템들 및 방법들 审中-实审
标题翻译：生物分子测序设备，系统和方法
公开(公告)号：KR1020160079780A
公开(公告)日：2016-07-06
申请号：KR1020167009999
申请日：2014-09-17
申请人： 퀀텀 바이오시스템즈 가부시키가이샤
发明人： 카와이,토모지 , 타니구치,마사테루 , 오시로,타카히토 , 올덤,마크 , 노드먼,에릭,에스.
IPC分类号： G01N33/487 , G01N33/68 , G06F19/22 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , G01N27/04 , G01N33/48721 , G06F19/22 , C12Q2563/116 , C12Q2565/631 , G01N33/48792 , G01N33/6818
摘要： 단백질샘플들을서열화하기위한디바이스들, 시스템들및 방법들이제공된다. 일부예들에서, 단량체가나노갭전극쌍의전극들사이를통과할때 발생되는전류들은몇 개의상이한거리들각각에대해측정되며, 이로써, 복수의종류들의단량체들이동정될수 있고미리결정된정확도로순서화되는유사한전극간거리(들)을이용하여측정되는전류로부터획득되며하나또는그 초과의기준물질들의사용에의해추가로정규화되는터닐링전류로부터획득되는검출된물리량에기초하는인지된단량체의기준물리량에비교할때, 단체들이동정된다.

8. 发明公开

KR1020090115930A 혈청 단백질체학 시스템 및 관련 방법 无效
标题翻译：血清保护系统及相关方法
公开(公告)号：KR1020090115930A
公开(公告)日：2009-11-10
申请号：KR1020097015592
申请日：2007-12-26
申请人： 브라이엄 영 유니버시티 , 아이에이치씨 헬쓰 서비스즈, 인크. , 더 유니버시티 오브 유타 리서치 파운데이션
发明人： 그레이브스,스티븐,윌리암 , 툴린,크래이그,댄 , 에스플린,마이클,션
IPC分类号： G01N33/48 , B01D59/44 , G01N1/20
CPC分类号： G01N33/6848 , G01N33/6818
摘要： Methods for proteomic analysis are provided. For example, in one aspect a method for identifying and sequencing a peptide may include fractionating a biological sample containing a peptide of interest to at least partially isolate the peptide, obtaining mass spectra of the peptide, and accelerating the peptide into a collision chamber at a plurality of discrete collision energies for a discrete period of time to form a plurality of peptide fragments for each of the plurality of discrete collision energies. The method may further include obtaining a plurality of fragmentation mass spectra from the plurality of peptide fragments for each of the plurality of discrete collision energies, summing the plurality of fragmentation mass spectra from each of the plurality of discrete collision energies to form a plurality of discrete collision energy mass spectra, one discrete collision energy mass spectra from each discrete collision energy, summing the plurality of discrete collision energy mass spectra to form a final mass spectrum for the peptide fragments, and identifying a sequence of amino acids corresponding to the peptide from the final mass spectrum.
摘要翻译：提供蛋白质组学分析方法。例如，在一个方面，用于鉴定和测序肽的方法可以包括将含有目的肽的生物样品分级至少部分分离肽，获得肽的质谱图，并将肽加速到碰撞室中多个离散碰撞能量在离散的时间段内形成用于多个离散碰撞能量中的每一个的多个肽片段。该方法还可以包括从多个肽片段获得多个离散碰撞能量中的每一个离散碰撞能量的多个碎裂质谱，将来自多个离散碰撞能量中的每一个的多个分裂质谱相加，以形成多个离散碰撞能量碰撞能量质谱，来自每个离散碰撞能量的一个离散碰撞能量质谱，对多个离散的碰撞能量质谱进行求和，以形成肽片段的最终质谱，并鉴定与肽片段相对应的氨基酸序列最终质谱。

9. 发明公开

KR1020070029126A 단백질 해석 방법 无效
标题翻译：蛋白质分析方法
公开(公告)号：KR1020070029126A
公开(公告)日：2007-03-13
申请号：KR1020067014203
申请日：2004-12-17
申请人： 야마우치 요시오 , 신카와 다카시 , 이소베 도시아키
发明人： 야마우치요시오 , 신카와다카시 , 이소베도시아키
IPC分类号： G01N33/68 , G01N33/48 , C12Q1/37 , G06F19/18
CPC分类号： G01N33/6848 , G01N33/6818
摘要： It is intended to provide a protein analysis method whereby proteins can be identified and the quantification data can be obtained by a convenient procedure. Namely, a protein analysis method characterized by comprising: the step of cleaving two protein-containing samples individually with restriction enzymes at specific amino acid sites to give peptide chain-containing samples; the step of modifying peptide chains contained in the peptide chain- containing samples with labeling compounds having different masses due to isotopes so as to impart different masses to the peptide chains; the step of mixing the isotope-labeled peptide chain-containing samples and fractionally quantifying the sample mixture for individual peptide chains so as to determine a content ratio; the step of selecting peptide chains to be subjected to amino acid sequence identification from the peptide chains and identifying the amino acid sequences of the peptide chains; the step of specifying proteins corresponding to the peptide chains; and the step of determining the content ratio of the thus specified proteins based on the fractional quantification data of the peptide chains. ® KIPO & WIPO 2007
摘要翻译：旨在提供蛋白质分析方法，其中可以鉴定蛋白质，并且可以通过方便的方法获得定量数据。即，蛋白质分析方法，其特征在于，包括：在特定氨基酸位点用限制性内切酶单独裂解两个含蛋白质的样品，得到含有肽链的样品的步骤; 利用由于同位素而具有不同质量的标记化合物来修饰含有肽链的样品中含有肽链的步骤，以赋予肽链不同的质量; 混合同位素标记的含有肽链的样品并对各个肽链的样品混合物进行分数定量以确定含量比的步骤; 从肽链中选择要进行氨基酸序列鉴定的肽链并鉴定肽链的氨基酸序列的步骤; 指定对应于肽链的蛋白质的步骤; 以及基于肽链的分数定量数据确定如此指定的蛋白质的含量比的步骤。 ®KIPO＆WIPO 2007

10. 发明授权

KR101219516B1 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 有权
标题翻译：用于诊断癌症的多肽标记物及使用其诊断癌症的方法
公开(公告)号：KR101219516B1
公开(公告)日：2013-01-11
申请号：KR1020120031257
申请日：2012-03-27
申请人： 한국기초과학지원연구원
发明人： 안영희 , 유종신 , 신박민
IPC分类号： G01N33/68 , G01N33/574 , G01N30/02 , C12Q1/68
CPC分类号： G01N33/6893 , G01N33/57438 , C12Q1/6837 , C12Q1/6886 , G01N33/6818 , G01N2030/027
摘要： PURPOSE: A method for diagnosing cancer using information on aberrant glycosylation is provided to quantitatively analyze glycoprotein isoform and to effectively distinguish a normal group and a cancer patient group. CONSTITUTION: A method for analyzing a polypeptide sequence and quantity for providing information for diagnosing liver cancer comprises: a step of treating a test sample with lectin, and isolating and concentrating glycoprotein; a step of hydrolyzing the glycoprotein and preparing polypeptides; a step of analyzing the sequence and quantity of the polypeptide; and a step of determining the test sample as an individual with a risk of developing liver cancer or having liver cancer when the polypeptide has an amino acid among sequence numbers 1-27.
摘要翻译：目的：提供使用异常糖基化信息诊断癌症的方法，定量分析糖蛋白同种型，有效区分正常组和癌症患者组。构成：用于分析提供用于诊断肝癌的信息的多肽序列和数量的方法包括：用凝集素处理测试样品并分离和浓缩糖蛋白的步骤; 水解糖蛋白并制备多肽的步骤; 分析多肽的序列和数量的步骤; 以及当所述多肽在序列号1-27中具有氨基酸时，将测试样品确定为具有发生肝癌或具有肝癌风险的个体的步骤。

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