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1. 发明申请

WO2021083700A1 A METHOD TO PREPARE PERSONALIZED TARGET-IRRELEVANT GUIDE RNA POOL FOR CRISPR 审中-公开
公开(公告)号：WO2021083700A1
公开(公告)日：2021-05-06
申请号：PCT/EP2020/079335
申请日：2020-10-19
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： HUANG, Yiwei
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/11
摘要： The present invention relates to a method of obtaining an enriched personalized population of a target polynucleotide using a synthetic single guide RNA (sgRNA) for an sgRNA- guided nucleic acid-binding protein, as well as to a method of obtaining a pool of personalized target-irrelevant synthetic single guide RNAs (sgRNAs) for a sgRNA-guided nucleic acid-binding protein. Also provided is a kit comprising a pool of sgRNAs obtainable by the methods of the invention, the use of a pool of sgRNAs obtainable by the methods of the invention and a method of monitoring a disease state.

2. 发明申请

WO2020094456A1 TARGET IRRELEVANT GUIDE RNA FOR CRISPR 审中-公开
公开(公告)号：WO2020094456A1
公开(公告)日：2020-05-14
申请号：PCT/EP2019/079478
申请日：2019-10-29
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： HUANG, Yiwei , MACH, Tivadar , PRAUSE, Stefan , WÜRSTLE, Maximilian
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/10
摘要： The present invention relates to a method of obtaining an enriched population of a target polynucleotide using a synthetic single guide RNA (sgRNA) for an sgRNA-guided nucleic acid-binding protein, as well as to a method of obtaining a pool of target-irrelevant synthetic single guide RNAs (sgRNAs) for a sgRNA-guided nucleic acid-binding protein. Also provided is a target polynucleotide and sgRNAs obtainable by the methods of the invention. Further envisaged is a kit comprising a pool of sgRNAs obtainable by the method of the invention, and the use of a pool of sgRNAs obtainable by the methods of the invention.

3. 发明申请

WO2020094457A1 LIQUID SAMPLE WORKFLOW FOR NANOPORE SEQUENCING 审中-公开
公开(公告)号：WO2020094457A1
公开(公告)日：2020-05-14
申请号：PCT/EP2019/079479
申请日：2019-10-29
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： HUANG, Yiwei , DIETRICH, Carsten , MACH, Tivadar , PRAUSE, Stefan , WÜRSTLE, Maximilian
IPC分类号： C12Q1/6827
摘要： The present invention relates to a method of characterizing a target DNA polynucleotide using rolling circle amplification (RCA) and a synthetic single guide RNA (sgRNA) to identify and cleave the WT version of the target DNA polynucleotide. Also provided are characterization steps based on the use of a transmembrane pore and a DNA translocase enzyme controlling the movement of the DNA polynucleotide through the transmembrane pore. Further envisaged is a kit comprising one or more oligonucleotides specific for at least a portion of the target DNA polynucleotide, an sgRNA specific for the WT version of the target DNA polynucleotide and an sgRNA-guided nucleic acid-binding protein.

4. 发明申请

WO2018114243A1 AMPLIFICATION-INTEGRATED GENETIC MATERIAL DEPLETION OF NON-TARGET ORGANISMS USING DIFFERENTIALLY ABUNDANT K-MERS 审中-公开
公开(公告)号：WO2018114243A1
公开(公告)日：2018-06-28
申请号：PCT/EP2017/080666
申请日：2017-11-28
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： DIETRICH, Carsten , HUANG, Yiwei , MATZAS, Mark , POSCH, Andreas Emanuel
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/70 , G06F19/22
摘要： The present invention relates to a method of selectively amplifying at least one nucleic acid sequence of at least one microorganism and/or virus in a sample of a subject, wherein k-mers (3) are applied that show a difference in frequency and/or context in the genome (2) of the at least one microorganism and/or virus compared to the genome of the subject (1).

5. 发明申请

WO2016074910A1 THERMOZYKLER UND VERFAHREN ZUM BETRIEB EINES THERMOZYKLERS 审中-公开
标题翻译：热循环仪及其操作方法使用热循环仪
公开(公告)号：WO2016074910A1
公开(公告)日：2016-05-19
申请号：PCT/EP2015/074643
申请日：2015-10-23
申请人： SIEMENS HEALTHCARE GMBH
发明人： GUMBRECHT, Walter , HUANG, Yiwei , PAULICKA, Peter
IPC分类号： B01J19/00 , B01L7/00 , C12Q1/68
CPC分类号： B01L7/525 , B01L3/50273 , B01L2200/04 , B01L2300/123 , B01L2300/1822 , B01L2400/0481 , C12Q1/6834 , C12Q1/686 , C12Q2565/519 , C12Q2565/537 , C12Q2531/113
摘要： Die Erfindung betrifft einen Thermozykler und ein Verfahren zum Betrieb eines Thermozyklers. Das Verfahren zum Betrieb des Thermozyklers umfasst die Schritte: - Einstellen einer ersten Temperatur in einem ersten Temperaturbereich des Probenraums mittels eines ersten Mittels zum Denaturieren der Nukleinsäurestränge, - Einstellen einer zweiten Temperatur in einem zweiten Temperaturbereich des Probenraums mittels eines zweiten Mittels zum Hybridisieren eines Primers an die Nukleinsäuren, - Zugeben einer nukleinsäurehaltigen Probe in den ersten Temperaturbereich des Probenraums des Thermozyklers, - Denaturieren der Nukleinsäuren, - Bewegen eines beweglichen Abschnitts der ersten Außenwand derart, dass der Abschnitt auf die gegenüberliegende zweite Außenwand zu bewegt wird und sich die Probe von dem ersten zum zweiten Temperaturbereich bewegt, - Hybridisieren der Primer-Nukleinsäuremoleküle an die Nukleinsäurestränge, - Bewegen des beweglichen Abschnitts der ersten Außenwand derart, dass der Abschnitt von der gegenüberliegenden zweiten Außenwand weg bewegt wird und sich die Probe vom zweiten zum ersten Temperaturbereich bewegt, - Elongieren der Nukleinsäurestränge.
摘要翻译：本发明涉及一种热循环仪和用于操作的热循环仪的方法。热循环仪的操作方法包括以下步骤： - 通过的第1装置设置在一第一温度范围内的样品腔室的第一温度用于变性的核酸链， - 用于引物杂交到设置在第二温度范围内的样品腔室的第二温度通过的第二装置的装置的核酸， - 将热循环仪的样本空间的第一温度区域中的含核酸样本， - 变性核酸， - 移动所述第一外壁的可动部，使得该部分被朝向相对的第二外壁并从所述第一样品移动移动到第二温度范围内， - 杂交引物的核酸分子与核酸链， - 移动，使得该部分被从相对的第二外壁和s移开所述第一外壁的可动部余移动离开所述第二样品到第一温度范围， - 所述核酸链的伸长率。

6. 发明公开

EP3529375A1 AMPLIFICATION-INTEGRATED GENETIC MATERIAL DEPLETION OF NON-TARGET ORGANISMS USING DIFFERENTIALLY ABUNDANT K-MERS 审中-公开
公开(公告)号：EP3529375A1
公开(公告)日：2019-08-28
申请号：EP17816540.3
申请日：2017-11-28
申请人： Siemens Healthcare GmbH
发明人： DIETRICH, Carsten , HUANG, Yiwei , MATZAS, Mark , POSCH, Andreas Emanuel
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/70 , G06F19/22

7. 发明公开

EP3877544A1 LIQUID SAMPLE WORKFLOW FOR NANOPORE SEQUENCING 审中-公开
公开(公告)号：EP3877544A1
公开(公告)日：2021-09-15
申请号：EP19801711.3
申请日：2019-10-29
申请人： Siemens Healthcare GmbH
发明人： HUANG, Yiwei , DIETRICH, Carsten , MACH, Tivadar , PRAUSE, Stefan , WÜRSTLE, Maximilian
IPC分类号： C12Q1/6827

8. 发明公开

EP3877543A1 TARGET IRRELEVANT GUIDE RNA FOR CRISPR 审中-公开
公开(公告)号：EP3877543A1
公开(公告)日：2021-09-15
申请号：EP19801710.5
申请日：2019-10-29
申请人： Siemens Healthcare GmbH
发明人： HUANG, Yiwei , MACH, Tivadar , PRAUSE, Stefan , WÜRSTLE, Maximilian
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/10

9. 发明公开

EP3935163A1 PREPARATION METHODS AND APPARATUS ADAPTED TO FILTER SMALL NUCLEIC ACIDS FROM BIOLOGICAL SAMPLES 审中-公开
公开(公告)号：EP3935163A1
公开(公告)日：2022-01-12
申请号：EP20765661.2
申请日：2020-03-03
申请人： Siemens Healthcare GmbH
发明人： HUANG, Yiwei , HENNIG, Guido
IPC分类号： C12N15/10 , C12N9/58 , C12Q1/68

10. 发明公开

EP3877541A1 METHOD FOR DETECTION OF SPECIFIC NUCLEIC ACIDS 审中-公开
公开(公告)号：EP3877541A1
公开(公告)日：2021-09-15
申请号：EP19801709.7
申请日：2019-10-29
申请人： Siemens Healthcare GmbH
发明人： HUANG, Yiwei , MACH, Tivadar , PRAUSE, Stefan , WÜRSTLE, Maximilian
IPC分类号： C12Q1/6804 , C12Q1/6827

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