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1. 发明申请

WO2007062039A2 CONFOCAL IMAGING METHODS AND APPARATUS 审中-公开
标题翻译：协同成像方法和装置
公开(公告)号：WO2007062039A2
公开(公告)日：2007-05-31
申请号：PCT/US2006045058
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC , FENG WENYI , KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
发明人： FENG WENYI , KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64
CPC分类号： G01N21/6456 , G01N21/6428 , G01N21/6452 , G01N21/6458 , G01N2021/6421 , G02B21/0032 , G02B21/004
摘要： The invention provides imaging apparatus and methods useful for obtaining a high resolution image of a sample at rapid scan rates. A rectangular detector array having a horizontal dimension that is longer than the vertical dimension can be used along with imaging optics positioned to direct a rectangular image of a portion of a sample to the rectangular detector array. A scanning device can be configured to scan the sample in a scan-axis dimension, wherein the vertical dimension for the rectangular detector array and the shorter of the two rectangular dimensions for the image are in the scan-axis dimension, and wherein the vertical dimension for the rectangular detector array is short enough to achieve confocality in a single axis.
摘要翻译：本发明提供了用于以快速扫描速率获得样品的高分辨率图像的成像装置和方法。具有比垂直尺寸长的水平尺寸的矩形检测器阵列可以与定位成将样本的一部分的矩形图像引导到矩形检测器阵列的成像光学元件一起使用。扫描装置可以被配置成以扫描轴尺寸扫描样本，其中矩形检测器阵列的垂直尺寸和图像的两个矩形尺寸中的较短的尺寸在扫描轴尺寸上，并且其中垂直尺寸因为矩形检测器阵列足够短以在单个轴上实现共焦。

2. 发明申请

WO2011082419A3 DNA SEQUENCING METHODS AND DETECTORS AND SYSTEMS FOR CARRYING OUT THE SAME 审中-公开
标题翻译： DNA序列方法和检测器及其执行系统
公开(公告)号：WO2011082419A3
公开(公告)日：2012-02-09
申请号：PCT/US2011020117
申请日：2011-01-04
申请人： LIFE TECHNOLOGIES CORP , SUN HONGYE , NORDMAN ERIC S , OLDHAM MARK F , O'NEILL JOHN R , CONNELL CHARLES , ULMANELLA UMBERTO , LAU ALDRICH N K , KOTSEROGLOU THEOFILOS , LIVAK KENNETH J
发明人： SUN HONGYE , NORDMAN ERIC S , OLDHAM MARK F , O'NEILL JOHN R , CONNELL CHARLES , ULMANELLA UMBERTO , LAU ALDRICH N K , KOTSEROGLOU THEOFILOS , LIVAK KENNETH J
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N27/414 , G01N33/50
CPC分类号： C12Q1/6869 , B01L3/502761 , G01N27/3278 , G01N27/414 , G01N27/4145 , G01N27/4146 , G01N33/5438 , Y10S977/924 , Y10T436/143333 , C12Q2565/631
摘要： In some embodiments, an analyte detection system is provided that includes a nanochannel, an electrode arrangement, and a plurality of nanoFET devices disposed in the nanochannel. A plurality of nucleic acid base detection components can be used that include a plurality of nanopores, a plurality of nanochannels, a plurality of hybridization probes, combinations thereof, and the like. According to other embodiments of the present teachings, different coded molecules are hybridized to a target DNA molecule and used to detect the presence of various sequences along the target molecule. A kit including mixtures of coded molecules is also provided. In some embodiments, devices including nanochannels, nanopores, and the like, are used for manipulating movement of DNA molecules, for example, in preparation for a DNA sequencing detection. Nanopore structures and methods of making the same are also provided as are methods of nucleic acid sequencing using the nanopore structures. Surface-modified nanopores are provided as are methods of making them. In some embodiments, surfaced-modified nanopores for slowing the translocation of single stranded DNA (ssDNA) through the nanopore are provided, as are nanopores configured to detect each of a plurality of different bases on an ssDNA strand.
摘要翻译：在一些实施例中，提供了分析物检测系统，其包括纳米通道，电极装置和设置在纳米通道中的多个纳米器件。可以使用多个核酸碱基检测组分，其包括多个纳米孔，多个纳米通道，多个杂交探针及其组合等。根据本教导的其他实施方案，将不同的编码分子与靶DNA分子杂交并用于检测沿着靶分子的各种序列的存在。还提供了包含编码分子混合物的试剂盒。在一些实施方案中，包括纳米通道，纳米孔等的装置用于操纵DNA分子的移动，例如用于DNA测序检测的准备。还提供了制备其的纳米孔结构及其制备方法，使用纳米孔结构的核酸测序方法也是如此。提供表面改性的纳米孔也是制备它们的方法。在一些实施方案中，提供用于减缓单链DNA（ssDNA）穿过纳米孔的易位的表面改性的纳米孔，以及配置成检测ssDNA链上的多个不同碱基中的每一个的纳米孔。

3. 发明专利

CA3015204A1 METHODS AND SYSTEMS FOR DETECTING TARGET NUCLEIC ACIDS 未知
公开(公告)号：CA3015204A1
公开(公告)日：2017-08-24
申请号：CA3015204
申请日：2017-02-20
申请人： BASHKIROV VLADIMIR I , KOTSEROGLOU THEOFILOS
发明人： BASHKIROV VLADIMIR I , KOTSEROGLOU THEOFILOS
IPC分类号： C12N15/09 , C12P19/34 , C12Q1/68
摘要： The present invention provides methods and systems for nucleic acid detection and identification.

4. 发明专利

AU2017221492A1 Methods and systems for detecting target nucleic acids 未知
公开(公告)号：AU2017221492A1
公开(公告)日：2018-09-06
申请号：AU2017221492
申请日：2017-02-20
申请人： BASHKIROV VLADIMIR I , KOTSEROGLOU THEOFILOS
发明人： BASHKIROV VLADIMIR I , KOTSEROGLOU THEOFILOS
IPC分类号： C12N15/09 , C12P19/34 , C12Q1/68
摘要： The present invention provides methods and systems for nucleic acid detection and identification.

5. 发明专利

ES2635094T3 Procedimientos y aparatos para la formación confocal de imágenes 未知
公开(公告)号：ES2635094T3
公开(公告)日：2017-10-02
申请号：ES13155085
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC , ILLUMINA INC , ILLUMINA INC
发明人： KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64
摘要： Un aparato de formación de imágenes, que comprende: (a) una fuente de radiación (120), (122) situada para enviar radiación de excitación a al menos una porción (14) de una región de muestra; (b) un conjunto de detectores rectangular (164), (166) que tiene elementos que convierten la energía de los fotones en contacto en una respuesta eléctrica, estando dichos elementos en una disposición ortogonal bidimensional en la que una primera dimensión es más larga que una segunda dimensión; (c) un generador de línea (94) colocado para recibir radiación de excitación procedente de dicha fuente de radiación y para enviar una línea de radiación a dicha región de muestra; (d) una óptica de formación de imágenes (160) colocada para dirigir una imagen rectangular de dicha porción a dicho conjunto de detectores rectangulares; y (e) un dispositivo de exploración (140), (142), (144) configurado para explorar dicha región de muestra en una dimensión de eje de exploración, por lo que la porción de dicha región de muestra que forma una imagen rectangular en dicho conjunto de detectores rectangular se cambia, en el que la menor de las dos dimensiones rectangulares para dicho conjunto de detectores rectangular y la menor de las dos dimensiones rectangulares para dicha imagen están en dicha dimensión del eje de exploración, en el que dicha menor de las dos dimensiones rectangulares para dicho conjunto rectangular de detectores es lo suficientemente corta para conseguir confocalidad en un solo eje de dicho conjunto de detectores rectangulares, en el que dicho eje único es dicha menor de las dos dimensiones rectangulares para dicho conjunto de detectores rectangular y en el que la relación de las dos dimensiones rectangulares menores para dicha línea de radiación a la resolución de Rayleigh de la óptica de formación de imágenes está en el intervalo de 0,1 a 10.

6. 发明专利

DK2594981T3 Fremgangsmåder og indretning til konfokal billedbehandling 未知
公开(公告)号：DK2594981T3
公开(公告)日：2017-08-21
申请号：DK13155085
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC
发明人： KOTSEROGLOU THEOFILOS , KAIN ROBERT , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64

7. 发明专利

ES2407968T3 Procedimientos y aparatos para la formación confocal de imágenes 未知
公开(公告)号：ES2407968T3
公开(公告)日：2013-06-17
申请号：ES06838184
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC
发明人： KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64
摘要： Aparato para la formación de imágenes que comprende: (a) una fuente de radiación dispuesta para enviar radiación de excitación, como mínimo, a una parte de una regiónde muestra; (b) un conjunto detector rectangular que tiene elementos que convierten la energía de los fotones contactados enuna repuesta eléctrica, encontrándose dichos elementos en una disposición bidimensional, ortogonal, en la queuna primera dimensión es más larga que una segunda dimensión; (c) una óptica de formación de imágenes dispuesta para dirigir una imagen rectangular de dicha parte a dichoconjunto detector rectangular; y (d) un dispositivo de escaneado configurado para escanear dicha región de muestra en una dimensión de eje deescaneado, de manera que la parte de dicha región de muestra que forma una imagen rectangular en dichoconjunto detector rectangular, es cambiada, en el que la más corta de las dos dimensiones rectangulares para dicho conjunto detector rectangular y la más cortade las dos dimensiones rectangulares para dicha imagen se encuentran en dicha dimensión del eje de escaneado, yen el que dicha dimensión más corta de las dos dimensiones rectangulares para dicho conjunto de detectorrectangular es suficientemente corta para conseguir confocalidad en un eje único de dicho conjunto detectorrectangular, de manera que dicho eje único es dicha dimensión más corta de las dos dimensiones rectangularespara dicho conjunto detector rectangular.

8. 发明专利

DK1955102T3 Fremgangsmåde og indretning til konfokal billedbehandling 未知
公开(公告)号：DK1955102T3
公开(公告)日：2013-05-13
申请号：DK06838184
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC
发明人： KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64

9. 发明专利

CA2632221A1 CONFOCAL IMAGING METHODS AND APPARATUS 未知
公开(公告)号：CA2632221A1
公开(公告)日：2007-05-31
申请号：CA2632221
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC
发明人： CHE DIPING , TRIENER ALEXANDER , KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , FENG WENYI , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64
摘要： The invention provides imaging apparatus and methods useful for obtaining a high resolution image of a sample at rapid scan rates. A rectangular detector array having a horizontal dimension that is longer than the vertical dimension can be used along with imaging optics positioned to direct a rectangular image of a portion of a sample to the rectangular detector array. A scanning device can be configured to scan the sample in a scan-axis dimension, wherein the vertical dimension for the rectangular detector array and the shorter of the two rectangular dimensions for the image are in the scan-axis dimension, and wherein the vertical dimension for the rectangular detector array is short enough to achieve confocality in a single axis.

10. 发明专利

CA2632221C CONFOCAL IMAGING METHODS AND APPARATUS 未知
公开(公告)号：CA2632221C
公开(公告)日：2013-08-27
申请号：CA2632221
申请日：2006-11-21
申请人： ILLUMINA INC
发明人： FENG WENYI , KOTSEROGLOU THEOFILOS , WANG MARK , TRIENER ALEXANDER , CHE DIPING , KAIN ROBERT
IPC分类号： G02B21/00 , G01N21/64
摘要： The invention provides imaging apparatus and methods useful for obtaining a high resolution image of a sample at rapid scan rates. A rectangular detector array having a horizontal dimension that is longer than the vertical dimension can be used along with imaging optics positioned to direct a rectangular image of a portion of a sample to the rectangular detector array. A scanning device can be configured to scan the sample in a scan-axis dimension, wherein the vertical dimension for the rectangular detector array and the shorter of the two rectangular dimensions for the image are in the scan-axis dimension, and wherein the vertical dimension for the rectangular detector array is short enough to achieve confocality in a single axis.

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