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1. 发明申请

WO2019121845A1 COMPOSITIONS AND METHODS FOR UNIDIRECTIONAL NUCLEIC ACID SEQUENCING 审中-公开
公开(公告)号：WO2019121845A1
公开(公告)日：2019-06-27
申请号：PCT/EP2018/085731
申请日：2018-12-19
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall , FULLER, Carl
IPC分类号： C12Q1/6869
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2525/313 , C12Q2537/143 , C12Q2565/631
摘要： This disclosure provides chips, systems and methods for sequencing a nucleic acid sample. Tagged nucleotides are provided into a reaction chamber comprising a nanopore in a membrane. An individual tagged nucleotide of the tagged nucleotides can contain a tag coupled to a nucleotide, which tag is detectable with the aid of the nanopore. Next, an individual tagged nucleotide of the tagged nucleotides can be incorporated into a growing strand complementary to a single stranded nucleic acid molecule derived from the nucleic acid sample. With the aid of the nanopore, a tag associated with the individual tagged nucleotide can be detected upon incorporation of the individual tagged nucleotide. The tag can be detected with the aid of the nanopore when the tag is released from the nucleotide.

2. 发明申请

WO2018069484A3 MOLECULAR DETECTION AND COUNTING USING NANOPORES 审中-公开
公开(公告)号：WO2018069484A3
公开(公告)日：2018-04-19
申请号：PCT/EP2017/076152
申请日：2017-10-13
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall
IPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/6851
摘要： Provided herein are methods and compositions for detecting and/or quantitating target analytes, including nucleic acids and polypeptides, using nanopore detectable barcodes.

3. 发明申请

WO2018069302A1 NANOPORE VOLTAGE METHODS 审中-公开
标题翻译： NANOPORE电压方法
公开(公告)号：WO2018069302A1
公开(公告)日：2018-04-19
申请号：PCT/EP2017/075782
申请日：2017-10-10
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall , WALLGREN, Markus
IPC分类号： G01N33/487
摘要： A method for sequencing a nucleic acid molecule includes providing a sequencing cell (200) having a nanopore (216) in a membrane (214) that resides over a well (205), a first electrode (202) at a bottom of the well, a second electrode (210) in a chamber (215) above the membrane, and an electrolyte (206, 208) in the well (205) and the chamber (215). The first electrode (202) is configured to facilitate non-Faradaic conduction of ionic current and forms a capacitance with ions in the electrolyte. A first voltage signal (1310) is applied across the first and second electrodes (202, 210), thereby creating a force that moves a nucleic acid molecule in the sequence cell through the nanopore (216). The first voltage signal (1310) increases to compensate for changes in the capacitance at the first electrode (202) during application of the first voltage signal. The method further includes determining signal values measured during the first voltage signal, which correspond to one or more nucleotides in the nucleic acid molecule.
摘要翻译：用于对核酸分子进行测序的方法包括：提供在位于孔（205）上方的膜（214）中具有纳米孔（216）的测序单元（200），第一电极（202）），在膜的上方的腔室（215）中的第二电极（210）以及在阱（205）和腔室（215）中的电解质（206,208）。第一电极（202）被配置为促进离子电流的非法拉第传导并且与电解质中的离子形成电容。跨第一和第二电极（202,210）施加第一电压信号（1310），由此产生移动序列细胞中的核酸分子通过纳米孔（216）的力。第一电压信号（1310）增加以补偿施加第一电压信号期间第一电极（202）处的电容变化。该方法还包括确定在第一电压信号期间测量的对应于核酸分子中的一个或多个核苷酸的信号值。

4. 发明申请

WO2018069484A2 MOLECULAR DETECTION AND COUNTING USING NANOPORES 审中-公开
标题翻译：用纳米孔分子检测和计数
公开(公告)号：WO2018069484A2
公开(公告)日：2018-04-19
申请号：PCT/EP2017/076152
申请日：2017-10-13
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall
IPC分类号： C12Q1/6851
CPC分类号： G01N33/48721 , C12Q1/6806 , C12Q1/6813 , C12Q1/6844 , C12Q1/6851 , C12Q1/686 , C12Q2600/16 , C12Q2533/101 , C12Q2563/179 , C12Q2565/631
摘要： Provided herein are methods and compositions for detecting and/or quantitating target analytes, including nucleic acids and polypeptides, using nanopore detectable barcodes.
摘要翻译：本文提供了使用纳米孔可检测条形码来检测和/或定量目标分析物（包括核酸和多肽）的方法和组合物。

5. 发明申请

WO2017174572A1 NUCLEIC ACID SAMPLE PREPARATION METHODS 审中-公开
标题翻译：核酸样品制备方法
公开(公告)号：WO2017174572A1
公开(公告)日：2017-10-12
申请号：PCT/EP2017/057974
申请日：2017-04-04
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall , DORWART, Michael , MOK, Janine
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： Provided are methods of nucleic acid sample preparation for analysis, including analysis using nanopore sequencing applications. In particular provided are methods that allow for the creation of circular and linear DNA samples that contain asymmetric ends to ligate different and desired adaptors to the end of the sample, methods to create single nucleic acid molecules that automatically form concatemers for higher sequencing throughput; methods to create multiple copies (temperature dependent, multi-primed, open-fold replication) of one original nucleic acid sample, or to create single nucleic acid molecules containing multiple copies of more than one original nucleic acid sample (concatemerized samples) for improved accuracy and throughput are described; and methods for improved modified base calling.
摘要翻译：提供用于分析的核酸样品制备方法，包括使用纳米孔测序应用的分析。特别提供了允许产生含有不对称末端以将不同和所需衔接子连接到样品末端的环状和线性DNA样品的方法，产生单一核酸分子的方法，所述单个核酸分子自动形成用于更高测序通量的串联体; 方法来创建一个原始核酸样品的多个拷贝（温度依赖的，多引发的，开放倍数复制），或产生含有多个原始核酸样品的多个拷贝的单个核酸分子（串联样品）以提高精度并描述吞吐量; 以及改进修饰碱基调用的方法。

6. 发明公开

EP3526349A2 MOLECULAR DETECTION AND COUNTING USING NANOPORES 有权
公开(公告)号：EP3526349A2
公开(公告)日：2019-08-21
申请号：EP17791978.4
申请日：2017-10-13
申请人： F. Hoffmann-La Roche AG , Roche Diagnostics GmbH
发明人： DAVIS, Randall
IPC分类号： C12Q1/6844 , C12Q1/6851

7. 发明公开

EP3728635A1 COMPOSITIONS AND METHODS FOR UNIDIRECTIONAL NUCLEIC ACID SEQUENCING 无效
公开(公告)号：EP3728635A1
公开(公告)日：2020-10-28
申请号：EP18825680.4
申请日：2018-12-19
申请人： F. Hoffmann-La Roche AG , Roche Diagnostics GmbH
发明人： DAVIS, Randall , FULLER, Carl
IPC分类号： C12Q1/6869

8. 发明公开

EP3440222A1 NUCLEIC ACID SAMPLE PREPARATION METHODS 审中-公开
公开(公告)号：EP3440222A1
公开(公告)日：2019-02-13
申请号：EP17718843.0
申请日：2017-04-04
申请人： F. Hoffmann-La Roche AG , Roche Diagnostics GmbH
发明人： DAVIS, Randall , DORWART, Michael , MOK, Janine
IPC分类号： C12Q1/68

9. 发明公开

EP3526603A1 NANOPORE VOLTAGE METHODS 有权
公开(公告)号：EP3526603A1
公开(公告)日：2019-08-21
申请号：EP17790980.1
申请日：2017-10-10
申请人： F. Hoffmann-La Roche AG , Roche Diagnostics GmbH
发明人： DAVIS, Randall , WALLGREN, Markus
IPC分类号： G01N33/487

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