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1. 发明授权

US08148076B2 Gene expression profiling of EGFR positive cancer 失效
标题翻译： EGFR阳性癌基因表达谱
公开(公告)号：US08148076B2
公开(公告)日：2012-04-03
申请号：US13150799
申请日：2011-06-01
申请人： Joffre B. Baker , Maureen T. Cronin , Steven Shak , Jose Baselga
发明人： Joffre B. Baker , Maureen T. Cronin , Steven Shak , Jose Baselga
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/34 , C07H21/02 , C07H21/04
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158 , C12Q2600/16
摘要： The present invention concerns prognostic markers associated with EGFR positive cancer. In particular, the invention concerns prognostic methods based on the molecular characterization of gene expression in paraffin-embedded, fixed tissue samples of EGFR-expressing cancer, which allow a physician to predict whether a patient is likely to respond well to treatment with an EGFR inhibitor.
摘要翻译：本发明涉及与EGFR阳性癌症相关的预后标志物。特别地，本发明涉及基于在石蜡包埋的EGFR表达癌症的固定组织样品中的基因表达的分子表征的预后方法，其允许医师预测患者是否可能对EGFR抑制剂的治疗反应良好。

2. 发明申请

US20110287958A1 Method for Using Gene Expression to Determine Colorectal Tumor Stage 审中-公开
标题翻译：使用基因表达来确定结肠直肠肿瘤的方法
公开(公告)号：US20110287958A1
公开(公告)日：2011-11-24
申请号：US13111814
申请日：2011-05-19
申请人： Steven Shak , Margarita Lopatin , Mark Lee
发明人： Steven Shak , Margarita Lopatin , Mark Lee
IPC分类号： C40B30/04 , G01N33/574 , C12Q1/02 , C12Q1/68 , C12Q1/37
CPC分类号： G01N33/57419 , C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/156 , G01N2800/56
摘要： The invention relates to methods of determining a colorectal tumor stage in a patient by gene expression analysis. The method comprises assaying the level of at least one RNA transcript, or its expression product, which is correlated to colorectal tumor stage. The invention may be useful for determining whether a patient has stage II or stage III colorectal cancer.
摘要翻译：本发明涉及通过基因表达分析确定患者的结肠直肠肿瘤分期的方法。该方法包括测定与结肠直肠肿瘤阶段相关的至少一种RNA转录物或其表达产物的水平。本发明可用于确定患者是否具有II期或III期结肠直肠癌。

3. 发明申请

US20110171633A1 METHOD TO USE GENE EXPRESSION TO DETERMINE LIKELIHOOD OF CLINICAL OUTCOME OF RENAL CANCER 有权
标题翻译：使用基因表达测定肾癌临床观察结果的方法
公开(公告)号：US20110171633A1
公开(公告)日：2011-07-14
申请号：US12987023
申请日：2011-01-07
申请人： Wayne Cowens , Steven Shak , Audrey Goddard , Dejan Knezevic , Joffre B. Baker , Michael C. Kiefer , Tara Maddala , Frederick L. Baehner
发明人： Wayne Cowens , Steven Shak , Audrey Goddard , Dejan Knezevic , Joffre B. Baker , Michael C. Kiefer , Tara Maddala , Frederick L. Baehner
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/02 , G01N33/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/118 , C12Q2600/158 , G01N33/57438 , G06F19/00 , G06F19/10 , G06N7/005 , G16H50/20
摘要： The present disclosure provides gene and gene sets, the expression of which is important in the classification and/or prognosis of cancer, in particular of renal cell carcinoma.
摘要翻译：本公开提供了基因和基因组，其表达在癌症，特别是肾细胞癌的分类和/或预后中是重要的。

4. 发明申请

US20090125247A1 GENE EXPRESSION MARKERS OF RECURRENCE RISK IN CANCER PATIENTS AFTER CHEMOTHERAPY 审中-公开
标题翻译：化疗后癌症患者遗传风险的基因表达标记
公开(公告)号：US20090125247A1
公开(公告)日：2009-05-14
申请号：US12192825
申请日：2008-08-15
申请人： JOFFRE BAKER , Robert Gray , Steven Shak , Joseph Sparano , Carl Yoshizawa
发明人： JOFFRE BAKER , Robert Gray , Steven Shak , Joseph Sparano , Carl Yoshizawa
IPC分类号： G01N33/48 , C12Q1/68 , G06F19/00
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156
摘要： The present invention relates to genes, the expression levels of which are correlated with likelihood of breast cancer recurrence in patients after tumor resection and chemotherapy.
摘要翻译：本发明涉及在肿瘤切除和化疗后患者的乳腺癌复发的可能性与其表达水平相关的基因。

5. 发明申请

US20080176229A1 Gene Expression Markers for Response to EGFR Inhibitor Drugs 审中-公开
标题翻译：用于EGFR抑制剂药物的基因表达标记物
公开(公告)号：US20080176229A1
公开(公告)日：2008-07-24
申请号：US11755697
申请日：2007-05-30
申请人： David Agus , Steven Shak , Maureen Cronin , Joffre Baker
发明人： David Agus , Steven Shak , Maureen Cronin , Joffre Baker
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/574 , C40B40/08 , C12P19/34
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158
摘要： The present invention concerns prognostic markers associated with cancer. In particular, the invention concerns prognostic methods based on the molecular characterization of gene expression in paraffin-embedded, fixed samples of cancer tissue, which allow a physician to predict whether a patient is likely to respond well to treatment with an EGFR inhibitor.
摘要翻译：本发明涉及与癌症相关的预后标志物。特别地，本发明涉及基于石蜡包埋的癌症组织固定样品中基因表达的分子表征的预后方法，其允许医师预测患者是否可能对EGFR抑制剂治疗反应良好。

6. 发明申请

US20080026426A1 ANTI-INFECTIVE THERAPY 审中-公开
标题翻译：抗感染治疗
公开(公告)号：US20080026426A1
公开(公告)日：2008-01-31
申请号：US11862934
申请日：2007-09-27
申请人： Steven Shak
发明人： Steven Shak
IPC分类号： C12P21/00 , C07H21/04 , C12N15/63 , C12N5/10
CPC分类号： C12Q1/6876 , A61K38/00 , C12N9/22 , C12N11/08 , C12N15/71 , C12N15/85 , C12N2800/108 , C12N2830/42 , C12N2840/44
摘要： DNA isolates coding for human DNase and methods of obtaining such DNA are provided, together with expression systems for recombinant production of human DNase useful in therapeutic or diagnostic compositions.
摘要翻译：提供了编码人DNase的DNA分离物和获得这样的DNA的方法，以及可用于治疗或诊断组合物的用于重组生产人类DNA的表达系统。

7. 发明申请

US20050164218A1 Gene expression markers for response to EGFR inhibitor drugs 审中-公开
标题翻译：用于EGFR抑制剂药物的基因表达标志物
公开(公告)号：US20050164218A1
公开(公告)日：2005-07-28
申请号：US10857715
申请日：2004-05-28
申请人： David Agus , Joffre Baker , Ron Natale , Steven Shak
发明人： David Agus , Joffre Baker , Ron Natale , Steven Shak
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158
摘要： The present invention concerns prognostic markers associated with cancer. In particular, the invention concerns prognostic methods based on the molecular characterization of gene expression in paraffin-embedded, fixed samples of cancer tissue, which allow a physician to predict whether a patient is likely to respond well to treatment with an EGFR inhibitor.
摘要翻译：本发明涉及与癌症相关的预后标志物。特别地，本发明涉及基于石蜡包埋的癌症组织固定样品中基因表达的分子表征的预后方法，其允许医师预测患者是否可能对EGFR抑制剂治疗反应良好。

8. 发明申请

US20050048542A1 Expression profile algorithm and test for cancer prognosis 有权
标题翻译：表达谱算法和癌症预后检测
公开(公告)号：US20050048542A1
公开(公告)日：2005-03-03
申请号：US10883303
申请日：2004-06-30
申请人： Joffre Baker , John Bryant , Soonmyung Paik , Steven Shak
发明人： Joffre Baker , John Bryant , Soonmyung Paik , Steven Shak
IPC分类号： G01N33/48 , G01N33/50 , G01N33/574 , G06F19/20 , G06F19/24 , C12Q1/68 , G06F19/00
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/118 , C12Q2600/158 , G01N33/57415 , G01N33/57484 , G01N33/57492 , G06F19/20 , G06F19/24
摘要： The present invention provides a noninvasive, quantitative test for prognosis determination in cancer patients. The test relies on measurements of the tumor levels of certain messenger RNAs (mRNAs). These mRNA levels are inserted into a polynomial formula (algorithm) that yields a numerical recurrence score, which indicates recurrence risk.
摘要翻译：本发明提供了癌症患者预后测定的无创定量试验。测试依赖于某些信使RNA（mRNA）的肿瘤水平的测量。将这些mRNA水平插入到产生数字复发评分的多项式公式（算法）中，其表示复发风险。

9. 发明授权

US06627196B1 Dosages for treatment with anti-ErbB2 antibodies 有权
标题翻译：用抗ErbB2抗体治疗的剂量
公开(公告)号：US06627196B1
公开(公告)日：2003-09-30
申请号：US09648067
申请日：2000-08-25
申请人： Sharon A. Baughman , Steven Shak
发明人： Sharon A. Baughman , Steven Shak
IPC分类号： A61K39395
CPC分类号： C07K16/30 , A61K31/337 , A61K38/00 , A61K39/395 , A61K39/39558 , A61K45/06 , A61K2039/505 , A61K2039/54 , A61K2039/545 , C07K16/32 , A61K2300/00
摘要： The present invention concerns the treatment of disorders characterized by the overexpression of ErbB2. More specifically, the invention concerns the treatment of human patients susceptible to or diagnosed with cancer overexpressing ErbB2 with anti-ErbB2 antibody.
摘要翻译：本发明涉及以ErbB2的过度表达为特征的疾病的治疗。更具体地，本发明涉及用抗ErbB2抗体治疗易患或被诊断患有过度表达ErbB2的癌细胞的人类患者。

10. 发明授权

US08868352B2 Predicting response to chemotherapy using gene expression markers 有权
标题翻译：使用基因表达标志物预测化疗反应
公开(公告)号：US08868352B2
公开(公告)日：2014-10-21
申请号：US13049568
申请日：2011-03-16
申请人： Joffre B. Baker , John L. Bryant , Soonmyung Paik , Steven Shak
发明人： Joffre B. Baker , John L. Bryant , Soonmyung Paik , Steven Shak
IPC分类号： G06F19/24 , C12Q1/68 , G06F19/18 , G06F19/20
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158 , G06F19/18 , G06F19/20
摘要： The present invention provides gene expression information useful for predicting whether a cancer patient is likely to have a beneficial response to treatment with chemotherapy, comprising measuring, in a biological sample comprising a breast tumor sample obtained from the patient, the expression levels of gene subsets to obtain a risk score associated with a likelihood of a beneficial response to chemotherapy, wherein the score comprises at least one of the following variables: (i) Recurrence Score, (ii) ESRI Group Score; (iii) Invasion Group Score; (iv) Proliferation Group Score; and (v) the expression level of the RNA transcript of at least one of MYBL2 and SCUBE2, or the corresponding expression product. The invention further comprises a molecular assay-based algorithm to calculate the likelihood that the patient will have a beneficial response to chemotherapy based on the risk score.
摘要翻译：本发明提供了可用于预测癌症患者是否可能对化疗治疗具有有益反应的基因表达信息，包括在包含从患者获得的乳腺肿瘤样品的生物样品中测量基因亚群的表达水平获得与化疗有益反应的可能性相关的风险评分，其中所述评分包括以下变量中的至少一个：（i）复发评分，（ii）ESRI组评分; （iii）入侵小组得分; （iv）增殖组得分; 和（v）MYBL2和SCUBE2中的至少一种的RNA转录物的表达水平或相应的表达产物。本发明还包括基于分子测定的算法来计算患者将基于风险评分对化学疗法有益的反应的可能性。

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