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1. 发明申请

WO2009087318A3 PROCEDE ET DISPOSITIF DE RECONSTRUCTION DU VOLUME D'UN OBJET A PARTIR D'UNE SEQUENCE D'IMAGES DE COUPES DUDIT OBJET 审中-公开
公开(公告)号：WO2009087318A3
公开(公告)日：2009-07-16
申请号：PCT/FR2008/001483
申请日：2008-10-22
申请人： CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE , INSTITUT PASTEUR , CHALMOND, Bernard , TROUVE, Alain , YU, Yong , WANG, Jiaping , RENAUD, Olivier , SHORTE, Spencer
发明人： CHALMOND, Bernard , TROUVE, Alain , YU, Yong , WANG, Jiaping , RENAUD, Olivier , SHORTE, Spencer
IPC分类号： G02B21/00
摘要： Procédé de reconstruction du volume d'un objet à partir d'une séquence d'images de coupes, correspondant à différents positionnements et/ou orientations, soumis à des incertitudes, d'un plan d'acquisition, le procédé comportant : (a) le choix d'une base finie de fonctions sur laquelle le volume à reconstruire peut être décomposé; (b) le choix d'une première fonction de quantification de l'écart entre le positionnement et/ou l'orientation réels de chaque coupe et son positionnement et/ou orientation nominaux; (c) le choix d'une deuxième fonction de quantification de la cohérence spatiale du volume reconstruit; (d) le choix d'une troisième fonction de quantification de l'écart entre les images de coupes de l'objet et les coupes correspondantes du volume reconstruit; (e) le choix d'une fonction de coût global, dont la valeur dépend de celle desdites première, deuxième et troisième fonctions de quantification; et (f) l'estimation conjointe, par minimisation de ladite fonction de coût globale, des positionnements et/ou des orientations réels des coupes, ainsi que des coefficients de décomposition de l'image de l'objet sur ladite base de fonctions.

2. 发明申请

WO2007057787A2 TOOL FOR QUANTITATIVE REAL-TIME ANALYSIS OF VIRAL GENE EXPRESSION DYNAMICS IN SINGLE LIVING CELLS 审中-公开
标题翻译：用于定量实时分析单生动物细胞中病毒基因表达动力学的工具
公开(公告)号：WO2007057787A2
公开(公告)日：2007-05-24
申请号：PCT/IB2006/003966
申请日：2006-11-21
申请人： INSTITUT PASTEUR , INSTITUT NATIONAL DE LA SANTE ET DE LA RECHERCHE MEDICALE (INSERM) , SAEZ-CIRION, Asier , NICOLA, Marie-Anne , PANCINO, Gianfranco , SHORTE, Spencer
发明人： SAEZ-CIRION, Asier , NICOLA, Marie-Anne , PANCINO, Gianfranco , SHORTE, Spencer
CPC分类号： C12Q1/70 , C12Q1/6897 , C12Q1/701 , C12Q1/703 , C12Q2565/601 , C12Q2563/103 , C12Q2561/113
摘要： Tool for quantitative real-time analysis of viral gene expression dynamics in single living cells The invention provides a method allowing the detection and the quantitative real-time measurement, at the single living cell level, of viral replication using a bioluminescent reporter gene and a digital light detection device sensitive to detect single photons with high efficiency and assign them a lateral x,y coordinate and precise temporal incidence (i.e. a "time point"), wherein the spatial and temporal characteristics of bioluminescence is indicative at the single living cell level of viral replication.
摘要翻译：用于单个活细胞中病毒基因表达动力学的定量实时分析的工具本发明提供了一种允许在单个活细胞水平检测和定量实时测量病毒复制的方法，该方法使用生物发光报告基因和数字光检测装置对检测单个光子具有高效率敏感，并为它们分配横向x，y坐标和精确时间发生（即“时间点”），其中生物发光的空间和时间特征指示在单个活细胞水平病毒复制。

3. 发明申请

WO2017218260A1 SYSTEM AND METHOD FOR MEANINGFUL RESEARCH INVESTMENT METROLOGY 审中-公开
标题翻译：用于研究投资计量的系统和方法
公开(公告)号：WO2017218260A1
公开(公告)日：2017-12-21
申请号：PCT/US2017/036360
申请日：2017-06-07
申请人： STRATOCORE S.A.S. , MARCHAND, Mathieu , SHORTE, Spencer
发明人： MARCHAND, Mathieu , SHORTE, Spencer
IPC分类号： G06Q10/06 , G06F17/30 , G06F19/28
CPC分类号： G06F16/2365 , G06F16/93 , G06Q10/06 , G06Q10/10
摘要： In a method for assessing instrument performance, a list of instrument user names of active users is queried (621) and active users are retrieved (622). The list of instrument user names for previous documents is queried (623) and a list of existing documents is retrieved (624). The content server is queried (625) with a list of active users and a list of documents that users published in a time period containing the past time period is retrieved (626). The list of documents that users published is compared with the list of existing documents (627). New documents are saved into a database (528). Emails are sent to web pages or mobile messaging tools including SMS to instrument users with a link to validate or not the documents (629). The database is updated according to reply emails returned from instrument users, validating the documents (722).
摘要翻译：在用于评估仪器性能的方法中，查询活动用户的仪器用户名称列表（621）并且检索活跃用户（622）。查询以前文档的工具用户名列表（623），并检索现有文档的列表（624）。用活动用户列表查询（625）内容服务器，并且检索用户在包含过去时间段的时间段内发布的文档列表（626）。将用户发布的文档列表与现有文档列表进行比较（627）。新文档被保存到数据库中（528）。电子邮件会发送到网页或手机短信工具，包括SMS，以便用户通过链接验证或不验证文档（629）。数据库根据从仪器用户返回的回复电子邮件进行更新，验证文档（722）。

4. 发明申请

WO2004038484A2 METHOD AND DEVICE FOR 3 DIMENSIONAL IMAGING OF SUSPENDED MICRO-OBJECTS PROVIDING HIGH-RESOLUTION MICROSCOPY 审中-公开
标题翻译：提供高分辨率显微镜的悬挂微型物体的三维成像方法和装置
公开(公告)号：WO2004038484A2
公开(公告)日：2004-05-06
申请号：PCT/EP2003/011818
申请日：2003-10-24
申请人： EVOTEC TECHNOLOGIES GMBH , INSTITUT PASTEUR , SHORTE, Spencer , MÜLLER, Torsten , SCHNELLE, Thomas
发明人： SHORTE, Spencer , MÜLLER, Torsten , SCHNELLE, Thomas
IPC分类号： G02B21/32
CPC分类号： G02B21/22 , G01N2015/144 , G01N2015/1445 , G01N2015/1452 , G02B21/367
摘要： A method for high-resolution image recording of at least one object with a microscope, comprises the steps of: positioning the object in a receptacle being arranged in the optical axis of the microscope, generating at least two first data sets per object which represent intermediate images of the object with at least two different orientations relative to the optical axis of the microscope, wherein the different orientations of the object are provided by moving the object relative to the receptacle, and evaluating the data sets for obtaining quantitative three dimensional information.
摘要翻译：一种利用显微镜对至少一个物体进行高分辨率图像记录的方法，包括以下步骤：将物体定位在布置在显微镜的光轴中的容器中，产生至少两个每个物体的第一数据组，其表示具有相对于显微镜的光轴的至少两个不同取向的物体的中间图像，其中物体的不同取向通过相对于容器移动物体来提供，并且评估数据组获得定量三维信息。

5. 发明申请

WO2011117847A9 METHOD TO INCREASE THE NUMBER OF DETECTABLE PHOTONS DURING THE IMAGING OF A BIOLOGICAL MARKER 审中-公开
标题翻译：在生物标记成像期间增加可检测光子数量的方法
公开(公告)号：WO2011117847A9
公开(公告)日：2011-12-15
申请号：PCT/IB2011051282
申请日：2011-03-25
申请人： PASTEUR INSTITUT , ROGERS KELLY , SHORTE SPENCER L , DRAGAVON JOSEPH , BLAZQUEZ SAMANTHA
发明人： ROGERS KELLY , SHORTE SPENCER L , DRAGAVON JOSEPH , BLAZQUEZ SAMANTHA
IPC分类号： G01N21/64 , B82Y15/00
CPC分类号： G01N21/6486 , B82Y15/00 , G01N21/6428 , G01N2201/06193
摘要： The present invention relates a method to determine the presence of a photon producing biological marker in a cell, tissue or organism of interest. The method is based on Fluorescence by Unbound Excitation from Luminescence (FUEL) and comprises the steps of a) providing conditions suitable for the biological marker to produce at least one first photon by luminescence; b) providing a FUEL probe pair-upper (FPP-U) disposed in proximity to the cell, tissue or organism, wherein the at least one first photon of step a) excites the FPP-U, which emits at least one second photon. The FPP-U may be selected from the group of quantum dots, carbon nanotubes, fluorescent proteins, diamond nanocrystals and metalloporphyrins. This method is charcterized in that said biological marker and said FPP-U are not bound and in that each of the at least one second photon (s) are of a longer wavelength than each of the at least one first photon (s).
摘要翻译：本发明涉及确定感兴趣的细胞，组织或生物体中产生光子的生物标志物的存在的方法。该方法基于通过未结合激发从荧光（FUEL）的荧光，并且包括以下步骤：a）提供适合于生物标记以通过发光产生至少一个第一光子的条件; b）提供设置在细胞，组织或生物体附近的FUEL探针对上（FPP-U），其中步骤a）的至少一个第一光子激发FPP-U，其发射至少一个第二光子。 FPP-U可以选自量子点组，碳纳米管，荧光蛋白，金刚石纳米晶体和金属卟啉。该方法的特征在于所述生物标记和所述FPP-U不结合，并且所述至少一个第二光子中的每一个具有比所述至少一个第一光子中的每一个更长的波长。

6. 发明申请

WO2011117847A1 METHOD TO INCREASE THE NUMBER OF DETECTABLE PHOTONS DURING THE IMAGING OF A BIOLOGICAL MARKER 审中-公开
标题翻译：提高生物标志物成像过程中检测到的光子数量的方法
公开(公告)号：WO2011117847A1
公开(公告)日：2011-09-29
申请号：PCT/IB2011/051282
申请日：2011-03-25
申请人： INSTITUT PASTEUR , ROGERS, Kelly , SHORTE, Spencer L. , DRAGAVON, Joseph , BLAZQUEZ, Samantha
发明人： ROGERS, Kelly , SHORTE, Spencer L. , DRAGAVON, Joseph , BLAZQUEZ, Samantha
IPC分类号： G01N21/64 , B82Y15/00
CPC分类号： G01N21/6486 , B82Y15/00 , G01N21/6428 , G01N2201/06193
摘要： The present invention relates a method to determine the presence of a photon producing biological marker in a cell, tissue or organism of interest. The method is based on Fluorescence by Unbound Excitation from Luminescence (FUEL) and comprises the steps of a) providing conditions suitable for the biological marker to produce at least one first photon by luminescence; b) providing a FUEL probe pair-upper (FPP-U) disposed in proximity to the cell, tissue or organism, wherein the at least one first photon of step a) excites the FPP-U, which emits at least one second photon. The FPP-U may be selected from the group of quantum dots, carbon nanotubes, fluorescent proteins, diamond nanocrystals and metalloporphyrins. This method is charcterized in that said biological marker and said FPP-U are not bound and in that each of the at least one second photon (s) are of a longer wavelength than each of the at least one first photon (s).
摘要翻译：本发明涉及确定感兴趣的细胞，组织或生物中产生光子的生物标志物的存在的方法。该方法基于来自发光的未结合激发的荧光（FUEL），并且包括以下步骤：a）提供适于生物标志物通过发光产生至少一个第一光子的条件; b）提供布置在细胞，组织或生物体附近的FUEL探针对（FPP-U），其中步骤a）的至少一个第一光子激发发射至少一个第二光子的FPP-U。 FPP-U可以选自量子点，碳纳米管，荧光蛋白，金刚石纳米晶体和金属卟啉。该方法的特征在于，所述生物学标记和所述FPP-U没有结合，并且至少一个第二光子中的每一个具有比所述至少一个第一光子中的每一个更长的波长。 / p>

7. 发明申请

WO2009087318A2 METHOD AND DEVICE FOR THE RECONSTRUCTION OF THE SHAPE OF AN OBJECT FROM A SEQUENCE OF SECTIONAL IMAGES OF SAID OBJECT 审中-公开
标题翻译：用于从对象的图像序列重建对象形状的方法和装置
公开(公告)号：WO2009087318A2
公开(公告)日：2009-07-16
申请号：PCT/FR2008001483
申请日：2008-10-22
申请人： CENTRE NAT RECH SCIENT , PASTEUR INSTITUT , CHALMOND BERNARD , TROUVE ALAIN , YU YONG , WANG JIAPING , RENAUD OLIVIER , SHORTE SPENCER
发明人： CHALMOND BERNARD , TROUVE ALAIN , YU YONG , WANG JIAPING , RENAUD OLIVIER , SHORTE SPENCER
IPC分类号： G06T17/00 , G01N21/00 , G02B21/18
CPC分类号： G02B21/008 , G06T7/571 , G06T7/70 , G06T15/00 , G06T2200/04 , G06T2207/10056 , G06T2207/30024
摘要： The invention relates to a method for the reconstruction of the shape of an object from a sequence of sectional images, corresponding to different positions and/or orientations, subject to uncertainties and an acquisition plan, the method comprises: (a) selection of a finite function base into which the shape for reconstruction can be broken down, (b) selection of a first quantification function of the range between the positioning and/or real orientation of each section and the positioning and/or orientation thereof, (c) selection of a second quantification function for the spatial coherence of the reconstructed shape, (d) selection of a third quantification function for the range between the sectional images and the corresponding sections of the reconstructed shape, (e) selection of a function for global cost, the value of which depends on said first, second and third quantification functions and (f) joint estimation, by minimisation of said global cost function, of the real positioning and/or orientation of the sections and the decomposition coefficients of the image object on said function base.
摘要翻译：本发明涉及一种用于根据对应于不同位置和/或取向的截面图像序列来重建物体形状的方法，其受到不确定性和采集计划的限制，所述方法包括：（a）选择有限（b）选择每个部分的定位和/或实际定向与其定位和/或定向之间的范围的第一定量函数，（c）选择用于重构形状的空间相干性的第二量化函数，（d）针对重建形状的截面图像和对应部分之间的范围选择第三量化函数，（e）选择用于全局成本的函数，其值取决于所述第一，第二和第三量化函数，以及（f）通过使所述全局成本函数最小化而对所述实际位置进行联合估计在所述功能库上的图像对象的分割和/或定向以及图像对象的分解系数。

8. 发明申请

WO2007057787A3 TOOL FOR QUANTITATIVE REAL-TIME ANALYSIS OF VIRAL GENE EXPRESSION DYNAMICS IN SINGLE LIVING CELLS 审中-公开
标题翻译：工具用于单人病毒基因表达动力学定量实时分析
公开(公告)号：WO2007057787A3
公开(公告)日：2007-10-04
申请号：PCT/IB2006003966
申请日：2006-11-21
申请人： PASTEUR INSTITUT , INST NAT SANTE RECH MED , SAEZ-CIRION ASIER , NICOLA MARIE-ANNE , PANCINO GIANFRANCO , SHORTE SPENCER
发明人： SAEZ-CIRION ASIER , NICOLA MARIE-ANNE , PANCINO GIANFRANCO , SHORTE SPENCER
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/70
CPC分类号： C12Q1/70 , C12Q1/6897 , C12Q1/701 , C12Q1/703 , C12Q2565/601 , C12Q2563/103 , C12Q2561/113
摘要： Tool for quantitative real-time analysis of viral gene expression dynamics in single living cells The invention provides a method allowing the detection and the quantitative real-time measurement, at the single living cell level, of viral replication using a bioluminescent reporter gene and a digital light detection device sensitive to detect single photons with high efficiency and assign them a lateral x,y coordinate and precise temporal incidence (i.e. a "time point"), wherein the spatial and temporal characteristics of bioluminescence is indicative at the single living cell level of viral replication.
摘要翻译：用于单个活细胞中病毒基因表达动态的定量实时分析的工具本发明提供了一种方法，该方法允许使用生物发光报道基因和数字在单细胞活细胞水平上检测和定量实时测量病毒复制光检测装置对高灵敏度检测单光子敏感，并为其分配横向的x，y坐标和精确的时间入射（即“时间点”），其中生物发光的空间和时间特征指示单个活细胞水平的病毒复制。

9. 发明申请

WO2004038484A3 METHOD AND DEVICE FOR 3 DIMENSIONAL IMAGING OF SUSPENDED MICRO-OBJECTS PROVIDING HIGH-RESOLUTION MICROSCOPY 审中-公开
标题翻译：用于三维成像提供高分辨率显微镜的悬挂微型物体的方法和装置
公开(公告)号：WO2004038484A3
公开(公告)日：2004-05-27
申请号：PCT/EP0311818
申请日：2003-10-24
申请人： EVOTEC TECHNOLOGIES GMBH , PASTEUR INSTITUT , SHORTE SPENCER , MUELLER TORSTEN , SCHNELLE THOMAS
发明人： SHORTE SPENCER , MUELLER TORSTEN , SCHNELLE THOMAS
IPC分类号： G01N15/14 , G02B21/22 , G02B21/36 , G02B21/32 , G03B35/00 , H04N13/00
CPC分类号： G02B21/22 , G01N2015/144 , G01N2015/1445 , G01N2015/1452 , G02B21/367
摘要： A method for high-resolution image recording of at least one object with a microscope, comprises the steps of: positioning the object in a receptacle being arranged in the optical axis of the microscope, generating at least two first data sets per object which represent intermediate images of the object with at least two different orientations relative to the optical axis of the microscope, wherein the different orientations of the object are provided by moving the object relative to the receptacle, and evaluating the data sets for obtaining quantitative three dimensional information.
摘要翻译：用显微镜对至少一个物体进行高分辨率图像记录的方法包括以下步骤：将物体放置在显微镜的光轴上布置的容器中，每个物体生成至少两个表示中间体的第一数据集具有相对于显微镜的光轴具有至少两个不同取向的物体的图像，其中物体的不同取向通过相对于容器移动物体并且评估用于获得定量三维信息的数据集来提供。

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