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1. 发明申请

WO2018108328A1 METHOD FOR INCREASING THROUGHPUT OF SINGLE MOLECULE SEQUENCING BY CONCATENATING SHORT DNA FRAGMENTS 审中-公开
公开(公告)号：WO2018108328A1
公开(公告)日：2018-06-21
申请号：PCT/EP2017/057975
申请日：2017-04-04
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： SCHLECHT, Ulrich , MOK, Janine , SO, Austin
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： The invention comprises a novel method and compositions for sequencing library preparation, which increases the throughput of single-molecule sequencing (SMS) platforms by generating long concatenated templates from pools of short DNA molecules.

2. 发明申请

WO2017174572A1 NUCLEIC ACID SAMPLE PREPARATION METHODS 审中-公开
标题翻译：核酸样品制备方法
公开(公告)号：WO2017174572A1
公开(公告)日：2017-10-12
申请号：PCT/EP2017/057974
申请日：2017-04-04
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： DAVIS, Randall , DORWART, Michael , MOK, Janine
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： Provided are methods of nucleic acid sample preparation for analysis, including analysis using nanopore sequencing applications. In particular provided are methods that allow for the creation of circular and linear DNA samples that contain asymmetric ends to ligate different and desired adaptors to the end of the sample, methods to create single nucleic acid molecules that automatically form concatemers for higher sequencing throughput; methods to create multiple copies (temperature dependent, multi-primed, open-fold replication) of one original nucleic acid sample, or to create single nucleic acid molecules containing multiple copies of more than one original nucleic acid sample (concatemerized samples) for improved accuracy and throughput are described; and methods for improved modified base calling.
摘要翻译：提供用于分析的核酸样品制备方法，包括使用纳米孔测序应用的分析。特别提供了允许产生含有不对称末端以将不同和所需衔接子连接到样品末端的环状和线性DNA样品的方法，产生单一核酸分子的方法，所述单个核酸分子自动形成用于更高测序通量的串联体; 方法来创建一个原始核酸样品的多个拷贝（温度依赖的，多引发的，开放倍数复制），或产生含有多个原始核酸样品的多个拷贝的单个核酸分子（串联样品）以提高精度并描述吞吐量; 以及改进修饰碱基调用的方法。

3. 发明申请

WO2017201315A1 QUANTITATIVE REAL TIME PCR AMPLIFICATION USING AN ELECTROWETTING-BASED DEVICE 审中-公开
标题翻译：使用基于电化学装置的定量实时PCR扩增
公开(公告)号：WO2017201315A1
公开(公告)日：2017-11-23
申请号：PCT/US2017/033374
申请日：2017-05-18
申请人： ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC. , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , F. HOFFMANN-LA ROCHE AG
发明人： YANG, Jaeyoung , ASTIER, Yann , MOK, Janine , SCHLECHT, Ulrich
IPC分类号： C12P19/34 , C12M1/00 , C12N9/12
摘要： The present invention generally relates to a method which makes use of electrowetting to automate PCR amplification wherein the PCR reagents are contained in droplets, and further wherein the quantity of PCR product is monitored in real time thus enabling stopping amplification once a desired quantity of PCR product has been generated.
摘要翻译：本发明总体上涉及一种利用电润湿来使PCR扩增自动化的方法，其中PCR试剂包含在液滴中，并且此外其中实时监测PCR产物的量，从而能够停止一旦产生了所需量的PCR产物，就进行扩增。

4. 发明申请

WO2018015318A1 METHOD FOR GENERATING SINGLE-STRANDED CIRCULAR DNA LIBRARIES FOR SINGLE MOLECULE SEQUENCING 审中-公开
标题翻译：生成单分子循环DNA文库用于单分子测序的方法
公开(公告)号：WO2018015318A1
公开(公告)日：2018-01-25
申请号：PCT/EP2017/067940
申请日：2017-07-14
申请人： F. HOFFMANN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： MOK, Janine , SCHLECHT, Ulrich
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： The invention comprises circular single-stranded templates for nucleic acid sequencing, methods of making and using the same.
摘要翻译：本发明包括用于核酸测序的环状单链模板，制备和使用它们的方法。

5. 发明申请

WO2018013710A1 PRIMER EXTENSION TARGET ENRICHMENT 审中-公开
标题翻译：主要扩展目标富集
公开(公告)号：WO2018013710A1
公开(公告)日：2018-01-18
申请号：PCT/US2017/041748
申请日：2017-07-12
申请人： F. HOFFMAN-LA ROCHE AG , ROCHE DIAGNOSTICS GMBH , ROCHE SEQUENCING SOLUTIONS, INC.
发明人： GODWIN, Brian C. , PLATZER, Joseph , MOK, Janine , PENKLER, Jo-Anne , MILLER, Bronwen
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12Q1/6853 , C12Q2525/191 , C12Q2531/119 , C12Q2533/101 , C12Q2535/122 , C12Q2565/514
摘要： Improved methods and compositions are provided herein for primer extension target enrichment of target polynucleotides and affinity capture. The first extension product is enriched by affinity capture using a primer or nucleotides labelled with an affinity ligant, e.g. biotin. The first extension product is displaced or degraded when a second extension primer is extended along the target strand. The second extension primer comprises a barcode region.
摘要翻译：本文提供了用于靶多核苷酸的引物延伸靶富集和亲和捕获的改进的方法和组合物。第一延伸产物通过使用用亲和配体标记的引物或核苷酸进行亲和捕获来富集，例如，生物素。当第二延伸引物沿着目标链延伸时，第一延伸产物被置换或降解。第二个延伸引物包含条形码区域。

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