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1. 发明申请

US20110040545A1 METHOD TO CHARACTERIZE A PROTEIN AS RNA BINDING PROTEIN 审中-公开
标题翻译：鉴定蛋白质作为RNA结合蛋白的方法
公开(公告)号：US20110040545A1
公开(公告)日：2011-02-17
申请号：US12863302
申请日：2009-01-19
申请人： Naveen Kulkarni , Vidya Niranjan
发明人： Naveen Kulkarni , Vidya Niranjan
IPC分类号： G06G7/58 , G06G7/60
CPC分类号： G01N33/574
摘要： The invention relates to a method to characterize a protein as RNA-binding protein, said method comprising steps of: a) modeling the protein using a template structure; b) analyzing the modeled protein for RNA-binding site(s); and c) docking the analyzed modeled protein with polyadenylated RNA using co-ordinates of RNA complexed with polyadenide binding for said chacterisation. The invention especially relates to a method to characterize Gamma-glutamyl transpeptidase (GGT) as RNA-binding protein, said method comprising steps of: a) modeling the GGT using a template structure; b) analyzing the modeled GGT for RNA-binding site(s); and c) docking the analyzed modeled GGT with polyadenylated RNA using coordinates of RNA complexed with polyadenide protein for said characterisation.
摘要翻译：本发明涉及一种将蛋白质表征为RNA结合蛋白的方法，所述方法包括以下步骤：a）使用模板结构对蛋白质进行建模; b）分析模拟蛋白质的RNA结合位点; 并且c）使用与聚腺苷酸结合的RNA的坐标用聚合腺苷酸化的RNA对接所分析的模拟蛋白质用于所述细胞化。本发明特别涉及一种表征γ-谷氨酰转肽酶（GGT）作为RNA结合蛋白的方法，所述方法包括以下步骤：a）使用模板结构对GGT进行建模; b）分析模拟的GGT的RNA结合位点; 并且c）使用与聚腺苷酸蛋白质复合的RNA座标，将分析的建模的GGT与多聚腺苷酸化RNA对接，用于表征。

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