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    • 1. 发明专利
    • DNA 5-甲基胞嘧啶與5-羥甲基胞嘧啶基因圖譜定序方法
    • DNA 5-甲基胞嘧啶与5-羟甲基胞嘧啶基因图谱定序方法
    • TW201732044A
    • 2017-09-16
    • TW106102252
    • 2017-01-20
    • 上海易華恩基因科技有限公司SHANGHAI EPICAN GENETECH CO. LTD.
    • 陸星宇LU, XING-YU宋豔群SONG, YAN-QUN
    • C12Q1/68
    • C12N15/10C12Q1/68C40B50/06
    • 本發明提供一種DNA 5-甲基胞嘧啶與5-羥甲基胞嘧啶基因圖譜定序方法,包括(1)DNA的純化與片段化預處理:將標的DNA提取後將其打斷至平均50個核苷酸長度到10000個核苷酸長度的DNA片段;(2)微量DNA的修復與接頭引子連接:將預處理的DNA片段修復並與二代定序需要的定序接頭引子連接;(3)共價標記5-甲基胞嘧啶與5-羥甲基胞嘧啶;(4)固相收集濃化含有標記的5位修飾胞嘧啶的DNA片段,在固相上用對應接頭引子的PCR擴增引子進行擴增。取得的PCR產物,經純化後即得到二代定序所需的基因組5位修飾胞嘧啶的分佈圖譜。本發明增強固相表面與DNA修飾鹼基結合的選擇性和效率。
    • 本发明提供一种DNA 5-甲基胞嘧啶与5-羟甲基胞嘧啶基因图谱定序方法,包括(1)DNA的纯化与片段化预处理:将标的DNA提取后将其打断至平均50个核苷酸长度到10000个核苷酸长度的DNA片段;(2)微量DNA的修复与接头引子连接:将预处理的DNA片段修复并与二代定序需要的定序接头引子连接;(3)共价标记5-甲基胞嘧啶与5-羟甲基胞嘧啶;(4)固相收集浓化含有标记的5位修饰胞嘧啶的DNA片段,在固相上用对应接头引子的PCR扩增引子进行扩增。取得的PCR产物,经纯化后即得到二代定序所需的基因组5位修饰胞嘧啶的分布图谱。本发明增强固相表面与DNA修饰碱基结合的选择性和效率。