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    • 3. 发明授权
    • T-RF 염기서열 분석 방법
    • 用于测序的经修改的T-RFLP方法
    • KR100730654B1
    • 2007-06-20
    • KR1020050011812
    • 2005-02-14
    • 이동훈이규호한국외국어대학교 연구산학협력단
    • 이현경김성민이규호이동훈
    • C12Q1/68
    • 본 발명은 기존의 T-RFLP 방법이 T-RF의 분리과정 중 3'의 primer 부위를 손실하기 때문에 세균 군집의 실질적인 정보를 제공해 주는 염기서열 분석이 불가능하다는 단점을 개선하여 염기서열 분석이 가능하도록 한 방법에 관한 것이다.
      상기와 같은 본 발명은 16S rDNA의 PCR 수행단계; 제한 효소처리 단계; 이중가닥 T-RF의 분리단계;
      Hha I-adapter의 연결(ligation) 단계; T-RF의 증폭단계; 단일가닥 T-RF의 분리단계; 전기영동 단계; gel에서 T-RF의 분리 및 증폭단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
      본 발명에 따르면 분리된 T-RF에 연결자(adapter)를 연결(ligation)하여 3'-말단의 염기서열 정보를 만들어 줌으로써 이전에 증폭이 불가능했던 단일가닥 T-RF의 증폭이 가능하고 염기서열 분석을 통해 더 많은 계통분류학적 정보를 얻을 수 있으므로, 자연생태계의 세균군집 구조 분석에 매우 유용하게 사용될 수 있다.
      T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism), adapter, PCR(효소중합연쇄반응, Polymerase Chain Reaction), 제한효소(Restriction enzyme), ligation, 군집분석(community analysis)
    • 8. 发明公开
    • T-RF 염기서열 분석 방법
    • 一种用于测序的改进型T-RFLP方法
    • KR1020060091333A
    • 2006-08-21
    • KR1020050011812
    • 2005-02-14
    • 이동훈이규호한국외국어대학교 연구산학협력단
    • 이현경김성민이규호이동훈
    • C12Q1/68
    • C12Q1/683C12Q1/6855C12Q1/6869
    • 본 발명은 기존의 T-RFLP 방법이 T-RF의 분리과정 중 3'의 primer 부위를 손실하기 때문에 세균 군집의 실질적인 정보를 제공해 주는 염기서열 분석이 불가능하다는 단점을 개선하여 염기서열 분석이 가능하도록 한 방법에 관한 것이다.
      상기와 같은 본 발명은 16S rDNA의 PCR 수행단계; 제한 효소처리 단계; 이중가닥 T-RF의 분리단계;
      Hha I-adapter의 연결(ligation) 단계; T-RF의 증폭단계; 단일가닥 T-RF의 분리단계; 전기영동 단계; gel에서 T-RF의 분리 및 증폭단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
      본 발명에 따르면 분리된 T-RF에 연결자(adapter)를 연결(ligation)하여 3'-말단의 염기서열 정보를 만들어 줌으로써 이전에 증폭이 불가능했던 단일가닥 T-RF의 증폭이 가능하고 염기서열 분석을 통해 더 많은 계통분류학적 정보를 얻을 수 있으므로, 자연생태계의 세균군집 구조 분석에 매우 유용하게 사용될 수 있다.
      T-RFLP(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism), adapter, PCR(효소중합연쇄반응, Polymerase Chain Reaction), 제한효소(Restriction enzyme), ligation, 군집분석(community analysis)