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1. 发明授权

KR101131309B1 ＥＧＦＲ 경로를 표적화하는 약물로 치료하기 위한 두경부암 환자의 선별 有权
标题翻译：选择头部和鼻咽癌患者用药物治疗EGFR途径
公开(公告)号：KR101131309B1
公开(公告)日：2012-04-02
申请号：KR1020107019382
申请日：2009-11-20
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 뢰더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： G01N33/15 , H01J49/26 , G01N33/574 , G01N33/68
CPC分类号： G01N33/57488 , G01N33/6848 , G01N2800/52 , G06F19/707 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： 질량 분광 데이타 분석 및 분류 알고리듬을 이용한 방법은 두경부 편평세포 암종 (HNSCC) 환자가 소분자 표피 성장 인자 수용체 티로신 키나아제 억제제(EGFR-TKI) 및 모노클로날 항체 EGFR 억제제를 포함하는 표피 성장 인자 수용체 경로를 표적화하는 약물로부터 이익을 얻을 지를 결정하는 능력을 제공한다. 상기 방법은 a) 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 질량 스펙트럼을 수득하는 단계; b) 상기 단계 a)에서 수득된 질량 스펙트럼에 대한 하나 이상의 소정의 전-가공 단계들을 수행하는 단계; c) 상기 단계 b)에서 질량 스펙트럼에 대한 전-가공 단계들을 수행한 이후에 하나 이상의 소정의 m/z 범위에 있는 상기 스펙트럼의 선택된 피쳐(feature)들의 적분 강도 값을 수득하는 단계; 및 d) 다른 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 생성된 등급-라벨링된(class-labeled) 스펙트럼을 포함하는 트레이닝 세트(training set)를 이용한 분류 알고리듬에서 상기 단계 c)에서 수득된 값을 이용하여 환자가 상기 약물을 이용한 치료로부터 이익을 얻을 지 또는 얻지 못할 지를 확인하는 단계를 포함한다.

2. 发明公开

KR1020110047171A ＥＧＦＲ 경로를 표적화하는 약물로 치료하기 위한 두경부암 환자의 선별 有权
标题翻译：筛选头颈癌患者以治疗靶向药物的EGFR途径
公开(公告)号：KR1020110047171A
公开(公告)日：2011-05-06
申请号：KR1020107019382
申请日：2009-11-20
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 뢰더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： G01N33/15 , H01J49/26 , G01N33/574 , G01N33/68
CPC分类号： G01N33/57488 , G01N33/6848 , G01N2800/52 , G06F19/707 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： 질량 분광 데이타 분석 및 분류 알고리듬을 이용한 방법은 두경부 편평세포 암종 (HNSCC) 환자가 소분자 표피 성장 인자 수용체 티로신 키나아제 억제제(EGFR-TKI) 및 모노클로날 항체 EGFR 억제제를 포함하는 표피 성장 인자 수용체 경로를 표적화하는 약물로부터 이익을 얻을 지를 결정하는 능력을 제공한다. 상기 방법은 a) 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 질량 스펙트럼을 수득하는 단계; b) 상기 단계 a)에서 수득된 질량 스펙트럼에 대한 하나 이상의 소정의 전-가공 단계들을 수행하는 단계; c) 상기 단계 b)에서 질량 스펙트럼에 대한 전-가공 단계들을 수행한 이후에 하나 이상의 소정의 m/z 범위에 있는 상기 스펙트럼의 선택된 피쳐(feature)들의 적분 강도 값을 수득하는 단계; 및 d) 다른 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 생성된 등급-라벨링된(class-labeled) 스펙트럼을 포함하는 트레이닝 세트(training set)를 이용한 분류 알고리듬에서 상기 단계 c)에서 수득된 값을 이용하여 환자가 상기 약물을 이용한 치료로부터 이익을 얻을 지 또는 얻지 못할 지를 확인하는 단계를 포함한다.
摘要翻译：使用质谱分析数据和分类算法靶向包括头和颈部鳞状细胞癌的表皮生长因子受体路径方法（HNSCC）患者是小分子EGFR酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI）和单克隆抗体EGFR抑制剂的单克隆并有能力确定是否从该药物中受益。该方法包括：a）从来自患者的基于血液的样品获得质谱; b）对在步骤a）中获得的质谱执行至少一个预处理步骤; 以从一个或多个预先确定的m / z范围获得执行处理步骤之后的频谱的所选择的特征（功能）的积分强度值 - C）在上述步骤b的质谱）之前; 训练集包括一个标记（类标记）光谱（使用训练集在分类算法的步骤）c）该患者通过使用在所获得的值 - 并且从基板样品评分产生d）从其他患者血液有利于或不受益于药物治疗。

3. 发明公开

KR1020140007409A 호르몬 및 병용 요법을 위해 전이성 유방암 환자를 선택하기 위한 예측 시험 无效
标题翻译：用于选择异位乳腺癌患者的预防和联合治疗的预测性测试
公开(公告)号：KR1020140007409A
公开(公告)日：2014-01-17
申请号：KR1020137022660
申请日：2012-01-24
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 로더,조아나 , 그리고리에바,줄리아 , 로더,헤인리치
IPC分类号： G01N33/574 , G01N33/48 , G01N33/53
CPC分类号： A61B10/0041 , G01N33/57415 , G01N33/6848 , G01N33/6893 , G01N2333/485 , G01N2333/71 , G01N2800/52 , G06F19/24 , H01J49/00
摘要： 본 발명은 폐경후, HER2-음성 유방암 환자가 내분비 요법 약물 외에 표적화된 항암 약물을 투여하는 형태로 병용 치료를 투여함에 의해 이익을 얻을 지를 결정하는 질량-스펙트럼 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 환자로부터의 혈액-기반 샘플로부터 질량 스펙트럼을 수득한다. 하나 이상의 소정의 m/z 범위에서 스펙트럼에 있는 선택된 피쳐의 값들을 수득한다. 값들을 다른 암 환자로부터의 샘플로부터 생성된 등급-라벨링된 스펙트럼을 포함하는 트레이닝 세트를 이용하여 분류 알고리듬에 이용하고 샘플에 대한 등급 라벨을 수득한다. 등급 라벨이 "Poor"인 경우, 환자는 병용 치료로부터 이익을 얻을 것 같음으로 판단된다. "Poor" 등급 라벨은 유방암 환자가 환자의 HER2 상태에도 불구하고 내분비 요법 약물만으로는 이익을 얻지 못할 가능성을 예측하는데 이용된다.

4. 发明授权

KR101068732B1 약물이 질환에 걸린 환자에 효과적일지의 여부를 결정하기 위한 방법 및 시스템 有权
标题翻译：用于确定药物对患有疾病的患者有效的方法和系统
公开(公告)号：KR101068732B1
公开(公告)日：2011-09-28
申请号：KR1020087026830
申请日：2007-03-26
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 로더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： A61K49/00 , A61P35/00
CPC分类号： G06F19/24 , G06F19/18 , G06K9/6231 , G06K9/6276 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： 본 발명은 환자로부터 생성된 혈청으로부터 질량 분광기에 의해 생성된 시험 스펙트럼을 수득하는 것을 포함하여, 질환 또는 질병을 치료하는데 사용된 질환 또는 질병을 갖는 환자가 약물에 반응적일지의 여부를 결정하는 방법에 관한 것이다. 시험 스펙트럼은 동일하거나 유사한 임상 상태 질환 또는 질병을 가지며, 약물에 반응하거나 반응하지 않는 것으로 공지된 다른 환자로부터의 각 혈청으로부터 생성된 등급 라벨링된 스펙트럼 군에 대한 관계를 결정하기 위해 처리될 수 있다. 시험 스펙트럼의 등급 라벨링된 스펙트럼 군에 대한 관계에 기초하여, 환자가 약물에 반응적일지의 여부가 결정될 수 있다.

5. 发明授权

KR101556726B1 질량스펙트럼 분석을 이용한 치료제 투여를 위한 암 환자 선별 有权
标题翻译：使用质谱分析治疗药物的癌症患者选择
公开(公告)号：KR101556726B1
公开(公告)日：2015-10-02
申请号：KR1020127024976
申请日：2011-02-22
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 그리고리에바,줄리아 , 뢰더,하인리히 , 트시핀,맥심
IPC分类号： G01N30/72 , G01N33/49 , G01N33/574
CPC分类号： G01N33/6848 , G01N33/57415 , G01N2800/52 , G06F19/703 , G06F19/707 , G16H10/40 , H01J49/00 , H01J49/40 , Y02A90/22
摘要： 질량스펙트럼데이터분석및 분류알고리즘을이용한방법은고형상피성종양암 환자가수용체의아고니스트, Akt 또는 ERK/JNK/p38로부터의상류또는 Akt 또는 ERK/JNK/p38에서의 MAPK(mitogen-activated protein kinase), PI3K 또는 PKC(protein kinase C) 경로에관여하는수용체또는단백질, 또는 PKC를표적화하는, 예를들어 EGFR 및/또는 HER2를표적화하는, 치료제또는치료제의조합으로혜택을얻을수 있는지아닌지를확인하기위한능력을제공한다. 상기방법은또한암 환자가 EFGR를표적화하는치료제와 COX2를표적화하는치료제의조합으로혜택을얻을수 있는지아닌지를결정하고또는암 환자가 NF-κB 억제제로치료를통한혜택을얻을수 있는지아닌지를결정하기위한능력을제공한다.

6. 发明公开

KR1020130004309A 질량스펙트럼 분석을 이용한 치료제 투여를 위한 암 환자 선별 有权
标题翻译：癌症患者选择治疗药物使用质谱分析
公开(公告)号：KR1020130004309A
公开(公告)日：2013-01-09
申请号：KR1020127024976
申请日：2011-02-22
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 그리고리에바,줄리아 , 뢰더,하인리히 , 트시핀,맥심
IPC分类号： G01N30/72 , G01N33/49 , G01N33/574
CPC分类号： G01N33/6848 , G01N33/57415 , G01N2800/52 , G06F19/703 , G06F19/707 , G16H10/40 , H01J49/00 , H01J49/40 , Y02A90/22
摘要： 질량스펙트럼 데이터 분석 및 분류 알고리즘을 이용한 방법은 고형 상피성 종양 암 환자가 MAPK 경로, 또는 Akt 또는 ERK/JNK/p38로부터의 상류 또는 Akt 또는 ERK/JNK/p38에서의 PKC 경로에 관여하는 수용체의 아고니스트, 수용체 또는 단백질, 또는 PKC를 표적화하는, 예를 들어 EGFR 및/또는 HER2를 표적화하는, 치료제 또는 치료제의 조합으로 혜택을 얻을 수 있는지 아닌지를 확인하기 위한 능력을 제공한다. 상기 방법은 또한 암 환자가 EFGR를 표적화하는 치료제와 COX2를 표적화하는 치료제의 조합으로 혜택을 얻을 수 있는지 아닌지를 결정하고 또는 암 환자가 NF-κB 억제제로 치료를 통한 혜택을 얻을 수 있는지 아닌지를 결정하기 위한 능력을 제공한다.

7. 发明授权

KR101131231B1 ＥＧＦＲ 경로를 표적화하는 약물로 치료하기 위한 대장암 환자의 선별 有权
标题翻译：选择用于治疗EGFR途径的药物治疗癌症患者
公开(公告)号：KR101131231B1
公开(公告)日：2012-03-28
申请号：KR1020117007641
申请日：2009-11-20
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 뢰더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： G01N33/15 , G01N33/49 , G01N33/68 , G01N33/574
CPC分类号： G01N33/57446 , G01N33/6848 , G01N2800/52 , G06F19/707 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： 질량 분광 데이타 분석 및 분류 알고리즘을 이용한 방법은 대장암 (CRC) 환자가 모노클로날 항체 EGFR 억제제와 같은 표피 성장 인자 수용체 경로를 표적화하는 약물로부터 이익을 얻을 지를 결정하는 능력을 제공한다. 상기 방법은 a) 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 질량 스펙트럼을 수득하는 단계; b) 상기 단계 a)에서 수득된 질량 스펙트럼에 대한 하나 이상의 소정의 전처리 단계들을 수행하는 단계; c) 상기 단계 b)에서 질량 스펙트럼에 대한 전처리 단계들을 수행한 이후에 하나 이상의 소정의 m/z 범위에 있는 상기 스펙트럼내의 선택된 피쳐(feature)들의 적분 세기 값을 수득하는 단계; 및 d) 다른 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 생성된 등급-라벨링된(class-labeled) 스펙트럼을 포함하는 트레이닝 세트(training set)를 이용한 분류 알고리즘에서 상기 단계 c)에서 수득된 값을 이용하여 환자가 상기 약물을 이용한 치료로부터 이익을 얻을 지 또는 얻지 못할 지를 확인하는 단계를 포함한다.

8. 发明公开

KR1020110061605A ＥＧＦＲ 경로를 표적화하는 약물로 치료하기 위한 대장암 환자의 선별 有权
标题翻译：选择用于治疗EGFR途径的药物治疗癌症患者
公开(公告)号：KR1020110061605A
公开(公告)日：2011-06-09
申请号：KR1020117007641
申请日：2009-11-20
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 뢰더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： G01N33/15 , G01N33/49 , G01N33/68 , G01N33/574
CPC分类号： G01N33/57446 , G01N33/6848 , G01N2800/52 , G06F19/707 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： 질량 분광 데이타 분석 및 분류 알고리즘을 이용한 방법은 대장암 (CRC) 환자가 모노클로날 항체 EGFR 억제제와 같은 표피 성장 인자 수용체 경로를 표적화하는 약물로부터 이익을 얻을 지를 결정하는 능력을 제공한다. 상기 방법은 a) 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 질량 스펙트럼을 수득하는 단계; b) 상기 단계 a)에서 수득된 질량 스펙트럼에 대한 하나 이상의 소정의 전처리 단계들을 수행하는 단계; c) 상기 단계 b)에서 질량 스펙트럼에 대한 전처리 단계들을 수행한 이후에 하나 이상의 소정의 m/z 범위에 있는 상기 스펙트럼내의 선택된 피쳐(feature)들의 적분 세기 값을 수득하는 단계; 및 d) 다른 환자로부터의 혈액-기재 샘플로부터 생성된 등급-라벨링된(class-labeled) 스펙트럼을 포함하는 트레이닝 세트(training set)를 이용한 분류 알고리즘에서 상기 단계 c)에서 수득된 값을 이용하여 환자가 상기 약물을 이용한 치료로부터 이익을 얻을 지 또는 얻지 못할 지를 확인하는 단계를 포함한다.

9. 发明公开

KR1020080108599A 약물이 질환에 걸린 환자에 효과적일지의 여부를 결정하기 위한 방법 및 시스템 有权
标题翻译：用于确定药物对患有疾病的患者有效的方法和系统
公开(公告)号：KR1020080108599A
公开(公告)日：2008-12-15
申请号：KR1020087026830
申请日：2007-03-26
申请人： 바이오디식스, 인크.
发明人： 로더,하인리히 , 차이핀,맥심 , 그리고리에바,줄리아
IPC分类号： A61K49/00 , A61P35/00
CPC分类号： G06F19/24 , G06F19/18 , G06K9/6231 , G06K9/6276 , Y02A90/26 , Y10T436/24
摘要： A process of determining whether a patient with a disease or disorder will be responsive to a drug, used to treat the disease or disorder, including obtaining a test spectrum produced by a mass spectrometer from a serum produced from the patient. The test spectrum may be processed to determine a relation to a group of class labeled spectra produced from respective serum from other patients having the or similar clinical stage same disease or disorder and known to have responded or not responded to the drug. Based on the relation of the test spectrum to the group of class labeled spectra, a determination may be made as to whether the patient will be responsive to the drug. ® KIPO & WIPO 2009
摘要翻译：确定患有疾病或病症的患者是否对用于治疗疾病或病症的药物有反应的过程，包括从患者产生的血清中获得由质谱仪产生的测试光谱。可以处理测试光谱以确定与来自具有或类似临床阶段的相同疾病或病症的已知具有对该药物的反应或不反应的其他患者的各自血清产生的一组类别标记光谱的关系。基于测试光谱与类别标记光谱组的关系，可以确定患者是否对药物有反应。 ®KIPO＆WIPO 2009

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