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    • 1. 发明专利
    • Apparatus, program and method for predicting activated g protein
    • 装置,方案和预测激活的G蛋白的方法
    • JP2006127248A
    • 2006-05-18
    • JP2004316279
    • 2004-10-29
    • Mitsubishi Chemicals CorpNational Institute Of Advanced Industrial & Technology三菱化学株式会社独立行政法人産業技術総合研究所
    • SUWA MAKIKOHIROKAWA TAKATSUGUMUKAI HIDEHITO
    • G01N33/53G06F19/00G06F19/18G06F19/24
    • PROBLEM TO BE SOLVED: To provide technology for predicting a G protein type to be activated in inputting GPCR and ligand information. SOLUTION: A feature parameter extraction part 14 extracts a feature parameter which is a prescribed physical-chemical parameter related to G protein selectivity from the input information of the GPCR and ligand to be predicted. A feature vector data generation part 16 generates feature vector data to be predicted which includes the extracted feature parameter. A classification information storage part 20 stores known data classification information to classify the feature vector obtained from the GPCR and ligand information of which activated G protein is known in accordance with the activated G protein type. A prediction processing part 18 predicts the activated G protein based on the feature vector to be predicted by referring to the known data classification information. The known data classification information is super-plane information obtained by a support vector machine. COPYRIGHT: (C)2006,JPO&NCIPI
    • 要解决的问题:提供用于预测在输入GPCR和配体信息中被激活的G蛋白类型的技术。 解决方案:特征参数提取部分14从GPCR的输入信息和要预测的配体提取与G蛋白选择性相关的规定的物理化学参数的特征参数。 特征矢量数据生成部16生成包含提取的特征参数的要预测的特征矢量数据。 分类信息存储部分20存储已知的数据分类信息,以根据激活的G蛋白类型从GPCR获得的特征向量和其活化的G蛋白是已知的配体信息。 预测处理部18通过参照已知的数据分类信息来预测基于要预测的特征向量的激活的G蛋白。 已知的数据分类信息是由支持向量机获得的超平面信息。 版权所有(C)2006,JPO&NCIPI