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31. 发明专利

JPWO2012144528A1 標的粒子の定量方法、光分析装置及び光分析用コンピュータプログラム有权
公开(公告)号：JPWO2012144528A1
公开(公告)日：2014-07-28
申请号：JP2013511024
申请日：2012-04-18
申请人：オリンパス株式会社
发明人：秀孝中田 , 秀孝中田
IPC分类号： G01N21/64 , G01N15/06
CPC分类号： G01N21/76 , C12Q1/6818 , G01N21/6428 , G01N21/6458 , G01N2021/6419 , G01N2021/6421 , G01N2021/6432 , G01N2021/6441 , C12Q2537/157 , C12Q2545/114 , C12Q2565/601
摘要：この標的粒子の定量方法は、前記標的粒子と、前記標的粒子に結合する発光プローブとを含む試料溶液を調製し、前記試料溶液中で、前記標的粒子と前記発光プローブとを結合させる工程と;(b)共焦点顕微鏡又は多光子顕微鏡の光学系を用いて、前記試料溶液内において前記光学系の光検出領域の位置を移動する移動工程と、前記試料溶液内において前記光学系の前記光検出領域の前記位置を移動させながら、前記光検出領域中の前記発光プローブから放出される光信号を検出して、直接的または間接的に前記標的粒子を個別に検出する検出工程と、(c)前記検出工程において検出された、前記標的粒子の数を計数する計数工程及び前記試料溶液中の前記標的粒子の濃度又は量と前記標的粒子の前記数との相関関係を近似する検量線に基づいて、前記工程(b)において計数された前記標的粒子の前記数から、前記試料溶液中の前記標的粒子の濃度を算出する算出工程とを有する。

32. 发明专利

JP2014506485A Rotation dependent transcription sequencing system and method of use 有权
标题翻译：空值
公开(公告)号：JP2014506485A
公开(公告)日：2014-03-17
申请号：JP2013555562
申请日：2012-02-23
申请人：イブバイオメディカルインコーポレイテッド
发明人：テオフィロスコツェログロー
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/00
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6874 , C12Q2521/119 , C12Q2521/543 , C12Q2523/303 , C12Q2563/143 , C12Q2565/601
摘要：本願で提供されるのは、回転依存転写配列決定法およびシステムである。
摘要翻译：本文提供了旋转依赖性转录测序方法和系统。

33. 发明专利

JP2013507125A How to characterize the small nucleic acid molecule 审中-公开
公开(公告)号：JP2013507125A
公开(公告)日：2013-03-04
申请号：JP2012533147
申请日：2010-07-30
申请人：オプジェン, インコーポレイテッド
发明人：ロナルドダブリュー．レノックス， , コリンダブリュー．ダイクス，
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09
CPC分类号： C12Q1/6853 , C12Q1/6844 , C12Q2531/125 , C12Q2525/307 , C12Q2525/131 , C12Q2565/601 , C12Q2565/518 , C12Q2563/173 , C12Q2521/301
摘要：本発明は、一般に、小さな核酸分子（例えば、プラスミドまたはウイルスから得られる核酸分子）を特徴付ける方法に関する。特定の実施形態において、本発明は、小さな環状核酸分子を特徴付ける方法を提供し、この方法は、小さな環状核酸分子においてローリングサークル増幅を行い、それにより、コンカテマーを生成する工程、およびコンカテマーのオプティカルマップを作製し、それにより、小さな環状核酸分子を特徴付ける工程を含む。

34. 发明专利

JP2012196201A Dna sequencing method 审中-公开
标题翻译： DNA序列方法
公开(公告)号：JP2012196201A
公开(公告)日：2012-10-18
申请号：JP2011264043
申请日：2011-12-01
申请人： Gen Probe Inc , ジェン−プローブ・インコーポレーテッド
发明人： DENSHAM DANIEL HENRY
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N21/64 , C12N11/18 , C12N15/09 , C12Q1/25 , G01N33/50
CPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q2565/601 , C12Q2521/543
摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an improved method for determining the sequence of a polynucleotide on a single strand fragment level.SOLUTION: The method for determining the sequence of a polynucleotide contributes to the detection of a conformational change in an enzyme that interacts with and processes along the polynucleotide. The detection of the conformational change is carried out by measuring changes in a fluorophore bound to the enzyme. In one embodiment, the method for determining the sequence of the polynucleotide includes a reaction of the target polynucleotide with the enzyme interacting with and processing along the polynucleotide under sufficient requirements for inducing enzymatic activity, and detection of the conformational change in the enzyme in the course of processing the enzyme along the polynucleotide.
摘要翻译：待解决的问题：提供确定单链片段水平上多核苷酸序列的改进方法。解决方案：用于确定多核苷酸序列的方法有助于检测与多核苷酸相互作用和进程的酶中的构象变化。通过测量与酶结合的荧光团的变化来进行构象变化的检测。在一个实施方案中，用于确定多核苷酸序列的方法包括：目标多核苷酸与在多个核酸酶的相互作用和加工过程中对于诱导酶活性的足够要求的酶的反应，以及在该过程中酶的构象变化的检测沿着多核苷酸处理酶。版权所有（C）2013，JPO＆INPIT

35. 发明专利

JP2011512141A How to determine the antibiotic resistance 审中-公开
公开(公告)号：JP2011512141A
公开(公告)日：2011-04-21
申请号：JP2010546963
申请日：2009-02-19
申请人：オプジェン, インコーポレイテッド
发明人：アダムブリスカ，
IPC分类号： C12Q1/68 , C12Q1/02
CPC分类号： C12Q1/683 , G06F19/22 , G06F19/28 , Y02A90/26 , C12Q2565/601 , C12Q2565/518 , C12Q2563/107
摘要：本開示は、細菌の抗生物質耐性プロフィールを決定する方法、および治療上有効な抗生物質で患者を処置する方法に関する。上記方法は、上記核酸の制限マップと、制限マップデータベースとを比較する工程、および上記核酸の領域を、上記データベースにおける対応する領域にマッチさせることによって、上記細菌の抗生物質耐性を決定する工程を包含する。詳細な制限マップデータベースを使用すると、上記生物は、属レベルおよび種レベルでのみならず、亜種レベル（株、亜株、および／もしくは単離物レベル）でも、同定かつ分類され得る。

36. 发明专利

JPWO2007013370A1 核酸の塩基配列を決定する方法及び装置有权
公开(公告)号：JPWO2007013370A1
公开(公告)日：2009-02-05
申请号：JP2007528438
申请日：2006-07-21
申请人：株式会社島津製作所 , 国立大学法人大阪大学
发明人：川合　知二 , 知二川合 , 裕行田中 , 裕行田中
IPC分类号： G01N13/12 , C12M1/00 , C12N15/09 , C12Q1/68 , G01N13/10 , G01N13/20
CPC分类号： C12Q1/6869 , B82Y35/00 , G01Q60/12 , C12Q2565/601
摘要：好ましい形態では、核酸6の塩基位置にプローブ2の探針が位置決めされ、トンネル電流値が設定され、バイアス電圧を基板に対して−6Vから4Vまで段階的に変化させることにより、観察される塩基像の高さにより電子状態分布パターンが測定される。測定対象となる核酸の各塩基より得られる電子状態分布パターンをデータベース内のものとを照合し、パターンマッチングにより最も類似度の大きいものがその塩基種であると同定され、塩基配列が決定される。

37. 发明专利

JP4183256B2 The method of strand separation nucleic acid amplification reaction products, detection methods of nucleic acid amplification reaction product 有权
公开(公告)号：JP4183256B2
公开(公告)日：2008-11-19
申请号：JP2004228344
申请日：2004-08-04
申请人：キヤノン株式会社
发明人：尚志岡本 , 育正池田
IPC分类号： C12N15/09 , C12Q1/68 , G01N21/78 , G01N33/53 , G01N33/543 , G01N33/566 , G01Q60/50 , G01Q60/52 , G01Q80/00
CPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q2565/601 , C12Q2563/149 , C12Q2563/143
摘要： Provided is a strand separation method of a double strand DNA as an amplification product, which facilitates the strand separation of each strand composing a double strand DNA after nucleic acid amplification reaction and allows the acquisition and detection of a target nucleic acid with higher efficiency through the use of PCR. A primer bound with a fine particle for capture is used to perform PCR, and each strand forming a double strand DNA as a resulting amplification product is separated and collected using the fine particle bound with the primer.

38. 发明专利

JP2007522799A Methods and compositions for detecting nucleic acids using a scanning probe microscope and nanocode 审中-公开
公开(公告)号：JP2007522799A
公开(公告)日：2007-08-16
申请号：JP2006547471
申请日：2004-12-28
申请人：インテル・コーポレーション
发明人：アンドリューバーリン , 峯尾山川
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09 , G01Q60/10 , G01Q60/50
CPC分类号： C12Q1/6874 , B82Y5/00 , B82Y10/00 , C12Q2565/601 , C12Q2563/155 , C12Q2525/179
摘要：核酸のヌクレオチド配列を決定するための方法であって、核酸を、核酸と結合させるための一連の標識オリゴヌクレオチドと接触させる段階を含み、それぞれの標識オリゴヌクレオチドが既知のヌクレオチド配列および分子ナノコードを含むような方法が提供される。続いて、核酸と結合する単離された標識オリゴヌクレオチドのナノコードを、SPMを用いて検出する。いくつかの特定の局面における本発明のナノコードは、バーコードが付された対象物に関する情報をコードするタグの配列の範囲を超えて検出可能な特徴を含み、これはバーコードが付された対象物に関する情報をコードするタグを検出するのを助ける。検出可能な特徴には、エラーチェック／エラー訂正、暗号化およびデータ縮小／圧縮のための、本明細書において検出可能な特徴タグと呼ばれる、ナノコードの構造、またはナノコードが付随した構造が含まれる。

39. 发明专利

JPWO2005001125A1 核酸の変異及び多型の判定方法审中-公开
公开(公告)号：JPWO2005001125A1
公开(公告)日：2006-08-10
申请号：JP2005511102
申请日：2004-06-24
申请人：オリンパス株式会社
发明人：長岡　智紀 , 智紀長岡
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/00 , C12N15/09 , G01N33/53 , G01N33/566 , G01N37/00
CPC分类号： C12Q1/6827 , C12Q2535/131 , C12Q2565/601
摘要：本発明は、DNAマイクロアレイを利用して変異又は多型の解析を行う場合に試料となる核酸分子が、配列に関してヘテロ中(heterozygous/heterogeneous)である場合であっても、DNAマイクロアレイ上の各スポットからのシグナルがプローブと標的核酸との間の完全にマッチしたものなのか、又は不完全にマッチしたものなのかを同定する手段を提供することを課題とする。本発明は、完全マッチプローブの候補と、完全にマッチする核酸のみからなる試料を用いて得られたシグナル値を、生データより差し引くことにより非特異的ハイブリダイゼーションに起因するシグナル分の補正を行い、その補正シグナル値が一定値以上である場合に、完全マッチに由来するシグナルと同定することを特徴とする。

40. 发明专利

JP2006500026A Controlled alignment of nano barcodes to encode specific information scanning probe microscopy (spm) for reading 有权
标题翻译：空值
公开(公告)号：JP2006500026A
公开(公告)日：2006-01-05
申请号：JP2004537739
申请日：2003-09-05
申请人：インテル・コーポレーション
发明人：シングス , セレナチャン , ミネオヤマカワ
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/34 , C12N15/09 , G01N33/48 , G01N33/50 , G01N33/53 , G01N33/543 , G01N33/573 , G01N37/00 , G01Q60/00 , G01Q70/12 , G01Q70/18 , G01Q80/00 , G06F19/00
CPC分类号： C12Q1/6816 , B82Y5/00 , B82Y10/00 , B82Y30/00 , Y10S977/702 , Y10S977/704 , Y10S977/705 , Y10S977/728 , Y10S977/729 , Y10S977/734 , Y10S977/742 , Y10S977/773 , Y10S977/774 , Y10S977/924 , C12Q2565/601 , C12Q2563/185
摘要：本明細書に開示された方法、装置および組成物は、生体分子、例えば核酸またはタンパク質の検出、同定および／または配列決定に関する。本発明の一定の態様において、1つ以上のナノバーコードに接着したプローブ分子を含むコード化プローブを1つ以上のターゲット分子に結合させることができる。結合していないコード化プローブに結合し分離した後に、結合したコード化プローブを表面に整列し、走査型プローブ顕微鏡検査によって分析することができる。ナノバーコードは、SPMによって弁別可能ないかなる分子または複合体であってもよく、例えば、カーボンナノチューブ、フラーレン、マイクロメートル以下の金属バーコード、ナノ粒子、または量子ドットであってもよい。プローブがオリゴヌクレオチドである場合、ターゲット核酸にハイブリッド形成された隣接するコード化プローブを、整列およびSPM分析の前に、一緒にライゲートさせてもよい。また、コード化プローブを含む組成物が本明細書において開示される。生体分子分析用のシステムは、SPM機器および表面に接着した少なくとも1つのコード化プローブを含んでもよい。
摘要翻译：本文公开的方法，装置和组合物涉及生物分子如核酸或蛋白质的检测，鉴定和/或测序。在本发明的某些实施方案中，包含连接至一个或多个纳米糖基的探针分子的编码探针可以被允许与一个或多个靶分子结合。在结合和分离未结合的编码探针之后，结合编码的探针可以在表面上排列并通过扫描探针显微镜进行分析。纳米线可以是通过SPM可区分的任何分子或复合物，例如碳纳米管，富勒烯，亚微米金属条形码，纳米颗粒或量子点。当探针为寡核苷酸时，与靶核酸杂交的相邻编码探针可在对准和扫描探针显微镜（SPM）分析之前连接在一起。包含编码探针的组合物也在本文中公开。用于生物分子分析的系统可以包括SPM仪器和附接到表面的至少一个编码探针。

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