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1. 发明公开

CN118711666A 一种油菜籽含油量与蛋白质含量全基因组选择方法审中-实审
公开(公告)号：CN118711666A
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202410878551.1
申请日：2024-07-02
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：刘佳 , 于文凯 , 胡琼 , 梅德圣 , 徐崟海 , 王会 , 汪文祥 , 成洪涛 , 李超
IPC分类号： G16B30/00 , G16B40/00 , G16B20/00 , G16B20/30 , G16B20/20 , G06N3/0985
摘要：本发明提供了一种油菜籽含油量与蛋白质含量全基因组选择方法，涉及油菜遗传育种技术领域，该方法包括：对油菜样本进行全基因组重测序操作，得到重测序数据；对重测序数据进行数据清洗，得到清洗数据；对清洗数据进行变异呼叫和过滤筛选，得到第一变异点位；对第一变异点位进行全基因组关联分析，得到第二变异点位；将第二变异点位输入至多个预设的学习模型中，得到多个预测结果，并通过对比多个预测结果，选取预测模型；对预测模型进行优化，得到优化模型；将第二变异点位输入至优化模型中，得到最终预测结果。该方法提升了对多基因控制复杂性状及低遗传力性状的选择效率和对油菜基因组预测的准确率。

2. 发明授权

CN116790628B 油菜BnLAZY1.A03基因及等位变异位点的应用有权
公开(公告)号：CN116790628B
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202310979228.9
申请日：2023-08-05
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：刘佳 , 徐崟海 , 胡琼 , 周日金 , 成洪涛 , 汪文祥 , 梅德圣 , 王会 , 李超
IPC分类号： C12N15/29 , C12N15/84 , A01H5/10 , A01H6/20 , C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , A01H1/04
摘要：本发明公开了油菜BnLAZY1.A03基因及等位变异位点的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明通过在油菜中过表达BnLAZY1.A03基因，得知其可调整油菜的多种农艺性状，包括分枝角、分枝数、主花序长度、角果数以及单株产量，本发明还利用特异性引物研究了BnLAZY1.A03基因的SNP突变位点在紧凑型和松散型油菜鉴定中的应用。本发明为开展油菜分子标记辅助选择，培育高密度栽培甘蓝型油菜高产紧凑型品种和明确油菜分枝角度的遗传机制奠定了基础。(56)对比文件汪文祥等.甘蓝型油菜分枝角度主基因+多基因混合遗传模型及遗传效应《.作物学报》.2016,第42卷(第8期),第1103-1111页.徐崟海.IGT基因家族调控作物株型研究进展《.生物技术进展》.2022,第12卷(第5期),第673-682页.Hui Wang等.Identification ofBnaYUCCA6 as a candidate gene for branchangle in Brassica napus by QTL-seq.《Scientific Reports》.2016,第6卷全文.Jiaowen Pan等.BSA-seq and geneticmapping identified candidate genes forbranching habit in peanut《.Theoreticaland Applied Genetics》.2022,第135卷第4457-4468页.张晓琼;王晓雯;田维江;张孝波;孙莹;李杨羊;谢佳;何光华;桑贤春.LAZY1通过油菜素内酯途径调控水稻叶夹角的发育.作物学报.2017,(第12期),全文.刘蒙蒙;谭彬;郑先波;叶霞;李继东;冯建灿.几个影响植物分枝角度的关键基因及其调控机制.分子植物育种.2017,(第07期),全文.汪文祥;胡琼;梅德圣;李云昌;周日金;王会;成洪涛;付丽;刘佳.甘蓝型油菜分枝角度主基因+多基因混合遗传模型及遗传效应.作物学报.2016,(第08期),全文.董云;王毅;靳丰蔚;吴旺泽;方彦;徐妙云;王磊.油菜Bna-miR1140基因的分离与转化及其过表达分析.西北植物学报.2018,(第04期),全文.

3. 发明公开

CN117106780A 利用CRISPR-Cas9系统敲除甘蓝型油菜BnaTTG1基因的方法及应用审中-实审
公开(公告)号：CN117106780A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311248605.8
申请日：2023-09-26
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：成洪涛 , 胡琼 , 郝梦宇 , 梅德圣 , 白泽涛 , 王会 , 汪文祥 , 付丽 , 刘佳 , 李超
IPC分类号： C12N15/113 , C12N9/22 , C12N15/82 , A01H4/00 , A01H5/10 , A01H6/20
摘要：本发明属于植物基因工程领域，具体涉及利用CRISPR‑Cas9系统敲除甘蓝型油菜BnaTTG1基因的方法及应用，实现甘蓝型油菜的高效准确的靶向基因修饰。以BnaTTG1基因为目标设计特异性靶向sgRNA并构建编辑载体，通过农杆菌介导的转化方法将编辑载体导入甘蓝型油菜下胚轴，诱导愈伤并再生成苗。Cas9核酸酶在sgRNA的引导下通过两个不同的核酸酶结构域在PAM上游剪切目标序列，每条sgRNA都能通过CRISPR/Cas9系统介导，同时在A和C基因组上实现BnaTTG1基因的敲除，产生基因组定点编辑。经表型鉴定发现BnaTTG1基因敲除后纯合突变体种子含油量以及低温和盐胁迫下的发芽率有明显提高。

4. 发明公开

CN114196775A 提高油菜油酸含量的分子标记引物、引物组及其在育种中的应用有权
公开(公告)号：CN114196775A
公开(公告)日：2022-03-18
申请号：CN202111497490.7
申请日：2021-12-09
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：刘佳 , 胡琼 , 杨雨婷 , 于文凯 , 梅德圣 , 徐崟海 , 李超 , 王会 , 汪文祥 , 成洪涛
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要：本发明属于分子遗传育种领域，公开了提高油菜油酸含量的分子标记引物、引物组及其在育种中的应用。本发明和油菜油酸含量显著相关的SNP6355位于A08染色体BnFAE1.A08基因翻译起始位置（ATG）后的6355bp的位置，另一个显著位点小片段插入InDel6位于C03染色体BnFAE1.C03基因翻译起始位置（ATG）后的6bp的位置，另外1个较小效应显著位点O9.A05，位于A05染色体的23102798bp，利用该三个分子标记联合对289份油菜资源进行高油酸筛选，最终筛选出的样本的油酸平均含量达到71.87%。开发与利用油菜油酸含量显著相关的变异位点KASP标记，对于加快高油酸油菜育种提供了一种新的方法，在实际育种过程中具有重要的理论意义和实践指导意义。

5. 发明公开

CN113151352A 一种八倍体油菜转基因方法以及在基因编辑中的应用有权
公开(公告)号：CN113151352A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110496645.9
申请日：2021-05-07
申请人：中国农业科学院油料作物研究所 , 成都市农林科学院 , 武汉中油大地希望种业有限公司
发明人：李超 , 付绍红 , 梅德圣 , 王会 , 杨进 , 胡琼 , 李云 , 汪文祥 , 成洪涛 , 刘佳 , 孙梦丹 , 桑世飞 , 石育钦 , 胡学志 , 郝梦宇
IPC分类号： C12N15/84 , C12N15/53 , C12N15/55 , A01H4/00 , A01H5/00 , A01H5/10 , A01H6/20 , A01H1/04 , A01H1/02 , C12Q1/6895
摘要：本发明公开了一种八倍体油菜转基因方法以及在基因编辑中的应用，属于遗传育种技术领域。本发明首次建立八倍体油菜农杆菌介导的转基因方法，将基因编辑载体成功的转化到具有诱导能力的八倍体油菜中，并将具有基因编辑元件活性的花粉直接对母本授粉，进而直接对其进行基因编辑，克服了基因编辑对于遗传转化的依赖性，直接通过授粉的方式对难于进行遗传转化的育种材料进行基因编辑，获得染色体倍性和母本一致双单倍体材料，且获得突变体材料不含有转基因元件，突变效率高达100％。

6. 发明公开

CN113025743A 油菜高抗裂角位点qSRIchrC9及其分子标记和应用有权
公开(公告)号：CN113025743A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN202110369405.2
申请日：2021-04-06
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：储文 , 胡琼 , 成洪涛 , 付丽 , 刘佳 , 王会 , 汪文祥 , 李超 , 梅德圣 , 郝梦宇
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要：本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及油菜高抗裂角位点qSRIchrC9及其分子标记和应用。该位点位于油菜C9染色体上，高抗裂角性状受一对隐性单基因控制。本发明公开三个与该高抗位点紧密连锁的分子标记S10、S13和S15，由SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的DNA分子组成。本发明中的位点和标记可应用于油菜育种中抗裂角品种的选育。

7. 发明公开

CN107304425A 油菜裂角相关基因及分子标记及应用有权
公开(公告)号：CN107304425A
公开(公告)日：2017-10-31
申请号：CN201610257664.5
申请日：2016-04-23
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：胡琼 , 刘佳 , 周日金 , 汪文祥 , 王会 , 李云昌 , 梅德圣 , 付丽
IPC分类号： C12N15/29 , C12N15/11 , C12Q1/68
摘要：本发明提供了油菜裂角相关基因及分子标记及应用，申请人首次在油菜A09上定位了控制抗裂角的负向效应QTL位点，可解释11.26%~12.07%的表型方差,进一步利用R1和R2基因组上的差异开发一对InDel标记（IF4/IR4），通过基因功能标记检测角果抗裂角不同QTL位点，可以在苗期进行淘汰，不仅节约生产成本而且大大提高选择效率。本发明中抗裂角负效QTL点功能基因位置明确，检测方法方便快速，不受环境影响。通过检测抗裂角性状功能分子标记，即可预测育种材料的抗裂角性，进而准确快速筛选抗裂角油菜株系。

8. 发明公开

CN105969852A 一种与油菜分枝角度性状QTL位点紧密连锁的分子标记及应用有权
公开(公告)号：CN105969852A
公开(公告)日：2016-09-28
申请号：CN201610316603.1
申请日：2016-05-13
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：胡琼 , 成洪涛 , 王会 , 汪文祥 , 刘佳 , 梅德圣 , 郝梦宇 , 付丽 , 周日金
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11
CPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
摘要：本发明公开了一种与油菜分枝角度性状QTL位点紧密连锁的分子标记及应用，本发明以甘蓝型油菜品种沪油19为母本与Purler为父本杂交，杂种F1自交构建F2分离群体进行分析，获得分枝角度位点qBA1.A06；利用与该位点边界的Indel标记设计引物检测两亲本及F2群体，获得与分枝角度位点紧密连锁的分子标记BAIndel76和BAIdenl79；利用该标记引物可对两亲本杂交后的油菜基因型鉴定，利用该标记进行辅助选择可以大大提高选择效率，本发明为油菜株型的分子育种提供了一种新的遗传标记，也为甘蓝型油菜的分枝角度性状位点的精细定位和相关基因的图位克隆提供了有用信息。

9. 发明公开

CN116024369A 一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子标记组合及其应用有权
公开(公告)号：CN116024369A
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202211348860.5
申请日：2022-10-31
申请人：中国农业科学院油料作物研究所
发明人：刘佳 , 杨雨婷 , 胡琼 , 汪文祥 , 徐崟海 , 梅德圣 , 王会 , 成洪涛 , 李超
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要：本发明提供了一种与油菜秸秆半纤维素含量关联的SNP分子记及其应用，属于植物遗传育种技术领域。本发明提供的SNP分子标记分别位于油菜的C2、C5和C8染色体上，且Bn‑scaff_22144_1‑p207843A/A基因型、Bn‑scaff_16197_1‑p2621761A/A基因型以及Bn‑scaff_16045_1‑p235411G/G基因型的秸秆半纤维素含量明显高于其他基因型。通过对该三个SNP位点的基因型鉴定，即可预测油菜秸秆半纤维素水平。因此，利用该标志物可在油菜生育早期鉴定出符合育种目标的油菜种质，对油菜秸秆半纤维素含量的早期预测和筛选具有重要意义，利于提高育种的效率，加快育种进程。

10. 发明授权

CN113151352B 一种八倍体油菜转基因方法以及在基因编辑中的应用有权
公开(公告)号：CN113151352B
公开(公告)日：2022-09-27
申请号：CN202110496645.9
申请日：2021-05-07
申请人：中国农业科学院油料作物研究所 , 成都市农林科学院 , 武汉中油大地希望种业有限公司
发明人：李超 , 付绍红 , 梅德圣 , 王会 , 杨进 , 胡琼 , 李云 , 汪文祥 , 成洪涛 , 刘佳 , 孙梦丹 , 桑世飞 , 石育钦 , 胡学志 , 郝梦宇
IPC分类号： C12N15/84 , C12N15/53 , C12N15/55 , A01H4/00 , A01H5/00 , A01H5/10 , A01H6/20 , A01H1/04 , A01H1/02 , C12Q1/6895
摘要：本发明公开了一种八倍体油菜转基因方法以及在基因编辑中的应用，属于遗传育种技术领域。本发明首次建立八倍体油菜农杆菌介导的转基因方法，将基因编辑载体成功的转化到具有诱导能力的八倍体油菜中，并将具有基因编辑元件活性的花粉直接对母本授粉，进而直接对其进行基因编辑，克服了基因编辑对于遗传转化的依赖性，直接通过授粉的方式对难于进行遗传转化的育种材料进行基因编辑，获得染色体倍性和母本一致双单倍体材料，且获得突变体材料不含有转基因元件，突变效率高达100％。

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