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1. 发明申请

WO2016061517A2 CONTIGUITY PRESERVING TRANSPOSITION 审中-公开
标题翻译：对等保存转换
公开(公告)号：WO2016061517A2
公开(公告)日：2016-04-21
申请号：PCT/US2015/056040
申请日：2015-10-16
申请人： ILLUMINA CAMBRIDGE LIMITED , STEEMERS, Frank J. , GUNDERSON, Kevin L. , ZHANG, Fan , BETLEY, Jason Richard , GORMLEY, Niall Anthony , MEULEMAN, Wouter , WEIR, Jacqueline , IOANNOU, Avgousta , JENKINS, Gareth , JACKSON, Rosamond , MORRELL, Natalie , POKHOLOK, Dmitry K. , NORBERG, Steven J. , HE, Molly , KIA, Amirali , GORYSHIN, Igor , PANTOJA, Rigo
发明人： STEEMERS, Frank J. , GUNDERSON, Kevin L. , ZHANG, Fan , BETLEY, Jason Richard , GORMLEY, Niall Anthony , MEULEMAN, Wouter , WEIR, Jacqueline , IOANNOU, Avgousta , JENKINS, Gareth , JACKSON, Rosamond , MORRELL, Natalie , POKHOLOK, Dmitry K. , NORBERG, Steven J. , HE, Molly , KIA, Amirali , GORYSHIN, Igor , PANTOJA, Rigo
IPC分类号： C12N15/10
CPC分类号： C12N15/1093 , C12N15/1065 , C12Q2525/191 , C12Q2563/179 , C12Q2565/514
摘要： Embodiments provided herein relate to methods and compositions for preparing an immobilized library of barcoded DNA fragments of a target nucleic acid, identifying genomic variants, determining the contiguity information, phasing information, and methylation status of the target nucleic acid.
摘要翻译：本文提供的实施方案涉及用于制备靶核酸的条形码化DNA片段的固定文库，鉴定基因组变体，确定靶核酸的邻接信息，定相信息和甲基化状态的方法和组合物酸

2. 发明公开

EP3636757A1 CONTIGUITY PRESERVING TRANSPOSITION 审中-公开
公开(公告)号：EP3636757A1
公开(公告)日：2020-04-15
申请号：EP19183798.8
申请日：2015-10-16
申请人： Illumina Cambridge Limited
发明人： STEEMERS, Frank J. , GUNDERSON, Kevin L. , ZHANG, Fan , BETLEY, Jason Richard , GORMLEY, Niall Anthony , MEULEMAN, Wouter , WEIR, Jacqueline , IOANNOU, Avgousta , JENKINS, Gareth , JACKSON, Rosamond , MORRELL, Natalie , POKHOLOK, Dmitry K. , NORBERG, Steven J. , HE, Molly , KIA, Amirali , GORYSHIN, Igor , PANTOJA, Rigo
IPC分类号： C12N15/10
摘要： Embodiments provided herein relate to methods and compositions for preparing an immobilized library of barcoded DNA fragments of a target nucleic acid, identifying genomic variants, determining the contiguity information, phasing information, and methylation status of the target nucleic acid.

5. 发明公开

EP3218511A1 METHODS AND ARRAYS FOR PRODUCING AND SEQUENCING MONOCLONAL CLUSTERS OF NUCLEIC ACID 有权转让
标题翻译：产生和测序核酸单克隆聚类的方法和阵列
公开(公告)号：EP3218511A1
公开(公告)日：2017-09-20
申请号：EP15793823.4
申请日：2015-11-11
申请人： Illumina Cambridge Limited
发明人： GUNDERSON, Kevin L. , BAI, Jingwei , KELLINGER, Matthew William , BEIERLE, John M. , BOUTELL, Jonathan Mark , RIGATTI, Roberto , ROGERT BACIGALUPO, Maria Candelaria , BOYANOV, Boyan , MAISINGER, Klaus
IPC分类号： C12Q1/68 , B01J19/00 , C40B40/06 , C40B50/14
摘要： The present disclosure relates to the field of molecular biology and more specifically to microarrays and methods.
摘要翻译：用于在固体表面上，特别是在微阵列中的孔中捕获和扩增靶多核苷酸的方法，其中所述微阵列可以包含a）包含至少一个孔，围绕所述孔的表面和内井表面的基底; b）覆盖内井表面并包含至少一个第一捕获引物对的第一层; 和c）覆盖第一层和围绕井的表面的第二层。或者，微阵列可以包含a）包含至少一个孔，包围孔的表面和内部孔表面的基底; 和b）覆盖内井表面并包含至少一个第一捕获引物对和至少一个第二捕获引物对的层。具体地，动力排斥扩增用于在孔中产生核酸的单克隆群体。本申请还公开了修饰固定化捕获引物的方法，其包括：a）使包含多个固定化捕获引物的底物与多种模板核酸接触以产生一种或多种固定化模板核酸，其中所述多种固定化捕获引物包含包含3'末端通用捕获区域Y的第一多个引物，引物P5和包含3'末端通用捕获区域Z的第二多个引物，例如，引物P7; 并且其中每个模板核酸侧翼为5'-末端和3'-末端通用捕获区Y或Z并且包含一个或多个，例如， SapI，限制性位点和一个或多个限制性位点与3'-末端通用捕获区域之间的目标特异性捕获区域; 和b）延伸一种或多种固定的捕获引物。最后，本申请公开了用于修饰固定化捕获引物的方法，其包括：a）使包含多种固定化捕获引物的底物与多种不同种子核酸接触以产生多种不同的固定化种子核酸; b）延伸两种或更多种固定的捕获引物以产生与多种不同的固定化种子核酸中的两种或更多种互补的多种不同的固定延伸产物; 和c）活化所述多种不同的固定延伸产物中的一种固定延伸产物，以形成活化的捕获引物。

6. 发明公开

EP3207134A2 CONTIGUITY PRESERVING TRANSPOSITION 有权转让
标题翻译：对等保存转换
公开(公告)号：EP3207134A2
公开(公告)日：2017-08-23
申请号：EP15797490.8
申请日：2015-10-16
申请人： Illumina Cambridge Limited
发明人： STEEMERS, Frank J. , GUNDERSON, Kevin L. , ZHANG, Fan , BETLEY, Jason Richard , GORMLEY, Niall Anthony , MEULEMAN, Wouter , WEIR, Jacqueline , IOANNOU, Avgousta , JENKINS, Gareth , JACKSON, Rosamond , MORRELL, Natalie , POKHOLOK, Dmitry K. , NORBERG, Steven J. , HE, Molly , KIA, Amirali , GORYSHIN, Igor , PANTOJA, Rigo
IPC分类号： C12N15/10
CPC分类号： C12N15/1093 , C12N15/1065 , C12Q2525/191 , C12Q2563/179 , C12Q2565/514
摘要： Embodiments provided herein relate to methods and compositions for preparing an immobilized library of barcoded DNA fragments of a target nucleic acid, identifying genomic variants, determining the contiguity information, phasing information, and methylation status of the target nucleic acid.
摘要翻译：本文提供的实施方案涉及用于制备靶核酸的条形码化DNA片段的固定文库，鉴定基因组变体，确定靶核酸的邻接信息，定相信息和甲基化状态的方法和组合物。

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