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1. 发明申请

WO2006069638A1 NUKLEINSÄURE-BIDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON PHOSPHATMANGELZUSTÄNDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译：核酸BIDENDE芯片缺磷条件的生物工艺下的检测
公开(公告)号：WO2006069638A1
公开(公告)日：2006-07-06
申请号：PCT/EP2005/013499
申请日：2005-12-15
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN , ERNST-MORITZ-ARNDT-UNIVERSITÄT GREIFSWALD , SCHWEDER, Thomas , JÜRGEN, Britta , EVERS, Stefan , MAURER, Karl-Heinz , HOI, Le, Thi , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , FEESCHE, Jörg
发明人： SCHWEDER, Thomas , JÜRGEN, Britta , EVERS, Stefan , MAURER, Karl-Heinz , HOI, Le, Thi , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , FEESCHE, Jörg
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689
摘要： Gegenstand der vorliegenden Anmeldung sind Nukleinsäure-bindende Chips zur Überwachung von Bioprozessen unter spezieller Ausrichtung auf die Detektion von Phosphatmangelzuständen. Sie tragen Sonden für mindestens drei der folgenden 47 Gene: yhcR, tatCD, ctaC, Gen für eine vermutliche Acetoin-Reductase, spollGA, nasE, pstA, spollAA, Gen für ein hypothetisches Protein, yhbD, cotE, Gen für ein konserviertes hypothetisches Potein, yurl, spoVID, Gen für eine vermutliche Aromaten-spezifische Dioxygenase, yhbE, Gen für ein vermutliches Benzoat-Transportprotein, pstBB, spolliAH, Gen für ein hypothetisches Protein, spollQ, spollIAG,. yvmA, Gen für eine vermutliche Ribonuclease, dhaS, yrbE, Gen für eine vermutliche Decarboxylase/Dehydratase, htpG, yfkH, spollAB, spolllAF, alsD, gdh, yfkN, pstC, yfmQ, pstBA, Homolog zu dhaS, Gen für eine vermutliche Phosphatase, phy, cypX, aisS, phoD, pstS, phoB, yvnA, yvmC, wobei die Gesamtzahl aller Phosphatstoffwechsel-spezifischen unterschiedlichen Sonden auf den Nukleinsäure-bindenden Chips nicht über 100 liegt. Ferner betrifft diese Anmeldung die Verwendung entsprechender Gensonden, insbesondere auf solchen Chips, beziehungsweise entsprechende Verfahren und Verwendungsmöglichkeiten.
摘要翻译：本申请是用于监视所述检测磷酸盐缺乏尤其侧重生物过程核酸结合的芯片。他们携带探针至少三种以下47个基因：yhcR，TatCd，CTAC，基因推定的乙偶姻还原酶，spollGA，鼻子，PSTA，spollAA，基因的假定蛋白质，yhbD，科特迪瓦，基因保守假设Potein， yurl，spoVID，基因推定的芳香族特异性双加氧酶yhbE，基因推定的转运蛋白，苯甲酸pstBB，spolliAH，基因的假定蛋白质，spollQ，spollIAG。 yvmA，基因推定的核糖核酸酶，DHAS，Yrbe，基因推定的脱羧酶/脱水酶，HtpG，yfkH，spollAB，spolllAF，alsD，GDH，yfkN，PSTC，yfmQ，pstBA同源DHAS，基因推定的磷酸酶， PHY，cypX，AISS，phoD，PST的，phoB，yvnA，yvmC，其中磷酸酯特定代谢不同的探针的总数不是核酸结合芯片上通过第100 此外，本申请涉及使用适当的基因探针，尤其是这样的芯片，或对应的方法和用途。

2. 发明公开

EP1828416A1 NUKLEINS[URE-BIDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON PHOSPHATMANGELZUST[NDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译： NUKLEINS [URE-BIDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON PHOSPHATMANGELZUST [NDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE
公开(公告)号：EP1828416A1
公开(公告)日：2007-09-05
申请号：EP05822552.5
申请日：2005-12-15
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN , Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald
发明人： SCHWEDER, Thomas , JÜRGEN, Britta , EVERS, Stefan , MAURER, Karl-Heinz , HOI, Le, Thi , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , FEESCHE, Jörg
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689
摘要： The invention relates to nucleic acid-binding chips for monitoring bioprocesses, especially for detecting phosphate deficiency conditions. Said chips support probes for at least three of the following 47 genes: yhcR, tatCD, ctaC, gene for a putative acetoin reductase, spollGA, nasE, pstA, spollAA, gene for a hypothetical protein, yhbD, cotE, gene for a conserved hypothetical protein, yurl, spoVID, gene for a putative aromatics-specific dioxygenase, yhbE, gene for a putative benzoate transport protein, pstBB, spoIIIAH, gene for a hypothetical protein, spollQ, spollIAG, yvmA, gene for a putative ribonuclease, dhaS, yrbE, gene for a putative decarboxylase/dehydratase, htpG, yfkH, spollAB, spolllAF, alsD, gdh, yfkN, pstC, yfmQ, pstBA, dhaS homologue, gene for a putative phosphatase, phy, cypX, alsS, phoD, pstS, phoB, yvnA, yvmC, the total number of phosphate metabolism-specific different probes on the nucleic acid-binding chips not exceeding 100. The invention further relates to the use of corresponding gene probes, particularly on such chips, as well as corresponding methods and possible uses.
摘要翻译：本发明涉及用于监测生物过程特别是用于检测磷酸盐缺陷症状的核酸结合芯片。所述芯片支持针对以下47个基因中的至少三个的探针：用于假定的乙偶姻还原酶的基因yhcR，tatCD，ctaC，假想蛋白质的基因yspb，spollGA，假基因yhbD，cotE基因，用于保守假设的基因蛋白质，yurl，spoVID，推定的芳香族特异性双加氧酶基因，yhbE，推定的苯甲酸转运蛋白基因，pstBB，spoIIIAH，假定蛋白质的基因spollQ，spollIAG，yvmA，推定的核糖核酸酶基因dhaS，yrbE ，推定的磷酸酶基因，phy，cypX，alsS，phoD，pstS，phoB，htpG，yfkH，spollAB，spolIIAF，alsD，gdh，yfkN，pstC，yfmQ，pstBA，dhaS同源物， yvnA，yvmC，核酸结合片上磷酸代谢特异性不同探针的总数不超过100.本发明进一步涉及相应基因探针的用途，特别是在这种芯片上的用途，以及相应的方法和可能的用途。

3. 发明公开

EP1537245A2 DNA-CHIPS ZUR BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译： DNA芯片的生物处理
公开(公告)号：EP1537245A2
公开(公告)日：2005-06-08
申请号：EP03797287.4
申请日：2003-09-09
申请人： Henkel Kommanditgesellschaft auf Aktien , Ernst-Moritz-Arndt-Universität Greifswald
发明人： FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , BREVES, Roland , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , JÜRGEN, Britta , VOIGT, Birgit
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C07K14/32 , C12N15/52 , C12Q1/6837 , C12Q1/689 , C12Q2600/158
摘要： The invention relates to the following selection of process-critical genes, which are suitable for monitoring the course of bioprocesses: acoA, ahpC, ahpF, citB, clpC, clpP, codY, cspA, cspB, des, dnaK, eno, glnR, groEL, groL, gsiB, ibpA, ibpB, katA, katE, IctP, Idh, opuAB, phoA, phoD, pstS, purC, purN, pyrB, pyrP, sigB, tnrA, trxA and ydjF and to genes that are regulated in an identical manner in the relevant organism from the respective metabolic pathways that are characterised by said genes. The invention relates to chips, which are provided with corresponding nucleic-acid probes or nucleic-acid analog probes, in addition to corresponding methods and uses. Said chips enable, for example, the monitoring of fermentation for the industrial production of biological products, in particular of gram-negative bacteria such as E. coli or of gram-positive bacteria such as B. subtilis or B. licheniformis. In addition, the invention discloses the sequences of the corresponding genes and proteins from E. coli, B. subtilis and B. licheniformis, those from B. licheniformis being disclosed for the first time. Said genes and proteins from B. licheniformis are thus included in the scope of protection.

4. 发明申请

WO2004027092A3 DNA-CHIPS ZUR BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
公开(公告)号：WO2004027092A3
公开(公告)日：2004-04-01
申请号：PCT/EP2003/009979
申请日：2003-09-09
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN , ERNST-MORITZ-ARNDT-UNI VERSITÄT GREIFSWALD , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , BREVES, Roland , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , JÜRGEN, Britta , VOIGT, Birgit
发明人： FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , BREVES, Roland , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , JÜRGEN, Britta , VOIGT, Birgit
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： Die vorliegende Anmeldung betrifft folgende Auswahl prozesskritischer Gene, die dazu geeignet sind, den Verlauf von Bioprozessen zu überwachen: acoA, ahpC, ahpF, citB, clpC , clpP, codY, cspA, cspB, des, dnaK, eno, glnR, groEL, groL, gsiB, ibpA, ibpB, katA, katE , IctP, Idh, opuAB, phoA, phoD, pstS, purC, purN, pyrB, pyrP, sigB, tnrA, trxA und ydjF , beziehungsweise für im betrachteten Organismus gleich regulierte Gene aus den jeweils durch diese Gene gekennzeichneten Stoffwechselwegen. Die Anmeldung betrifft Chips, die mit entsprechenden Nukleinsäure- oder Nukleinsäure-Analogon-Sonden dotiert sind, sowie entsprechende Verfahren und Verwendungen. So können beispielsweise Fermentationen zur industriellen Herstellung biologischer Produkte monitoriert werden, insbesondere von gramnegativen Bakterien wie E. coli oder von grampositiven Bakterien wie B. subtilis oder B. licheniformis . Zusätzlich werden die Sequenzen der zugehörigen Gene und Proteine aus E. coli , B. subtilis , und B . licheniformis offenbart, die aus B. licheniformis erstmals. Diese Gene und Proteine aus B. licheniformis werden somit in den Schutzbereich einbezogen.

5. 发明申请

WO2006122655A1 NUKLEINSÄURE-BINDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON GLUCOSEMANGELZUSTÄNDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译：核酸结合CHIPS葡萄糖缺乏状态的生物工艺下的检测
公开(公告)号：WO2006122655A1
公开(公告)日：2006-11-23
申请号：PCT/EP2006/004152
申请日：2006-05-04
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN , EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
发明人： EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689
摘要： Gegenstand der vorliegenden Anmeldung sind Nukleinsäure-bindende Chips zur Überwachung von Bioprozessen unter spezieller Ausrichtung auf die Detektion von Glucosemangelzuständen. Sie tragen Sonden für mindestens sechs der folgenden 85 Gene: yxe/, dppE, fruK, ybdN, yvdE, rbsK, hxIA, yvdH, ywfL, ispA, yvyD, licA, rocD, ycgO, yqiQ, sigX, iolC, LicH, iolE, rsiX, mmgE, iolD, yvql, glpF, ysbA, yvqH, bpr, acdA, yvoA, aprE, yusK, acuA, acsA, acoR, ysiA, pgcM, mmgB, mmgD, tdh, mmgC, malP, mmgA, yusJ, malA, glpD, etfB, etfA, ywjF, yvdG, yusL, yvdl, acoC, acoL, ycgM, mmsA, ycgN, yoeB, kbl, yvdJ, yvdK, yfiA, malL, acoA, acoB oder Homologen zu SEQ ID NO. 157, 39, 159, 103, 151 , 125, 123, 63, 9, 49, 93, 35, 13, 105, 17, 15, 95, 99, 101 , 107 oder 11; bei maximal 100 Glucosestoffwechsel-spezifischen unterschiedlichen Sonden. Ferner betrifft diese Anmeldung die Verwendung entsprechender Gensonden, insbesondere auf solchen Chips, beziehungsweise entsprechende Verfahren und Verwendungsmöglichkeiten.
摘要翻译：本申请是用于监测在检测葡萄糖缺乏的特别焦点生物过程核酸结合的芯片。他们携带探针以下85个基因的至少六个：YXE / DPPE，Fruk，ybdN，yvdE，RBSK，hxIA，yvdH，的ywfL，ISPA，yvyD，莉卡，ROCD，ycgO，yqiQ，SIGx，iolC，巫妖，约莱， RSiX，MMGE，IOLD，yvql，glpF中，ysbA，yvqH，BPR，ACDA，yvoA，aprE启动，Yusk，ACUA，ACSA，ACOR，ysia，pgcM，MMGB，MMGD，TDH，MMGC，MALP，MMGA，yusJ，麻辣烫 glpD，ETFB，ETFA，ywjF，yvdG，yusL，yvdl，ACOC，ACOL，ycgM，MMSA，ycgN，的YoeB，KBL，yvdJ，yvdK，yfiA，商场，ACOA，ACOB或同源于SEQ ID NO。 157，39，159，103，151，125，123，63，9，49，93，35，13，105，17，15，95，99，101，107或11; 在最高100葡萄糖特定代谢不同的探针。此外，本申请涉及使用适当的基因探针，尤其是这样的芯片，或对应的方法和用途。

6. 发明申请

WO2007028608A3 NUKLEINSÄURE-BINDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON STICKSTOFFMANGELZUSTÄNDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
公开(公告)号：WO2007028608A3
公开(公告)日：2007-03-15
申请号：PCT/EP2006/008726
申请日：2006-09-07
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN , EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
发明人： EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
IPC分类号： C12Q1/68 , C12P1/00
摘要： Gegenstand der vorliegenden Anmeldung sind Nukleinsäure-bindende Chips zur Überwachung von Bioprozessen unter spezieller Ausrichtung auf die Detektion von Stickstoffmangelzuständen. Sie tragen Sonden für mindestens drei der folgenden 50 Gene: kdgR, citA, htrA, ycnl, yppF, trpB, ggt, alsR, glnA, nrgA, yciC, yvtA, nrgB, ycnJ, glnR, yvIA, yncE, yvlB, trpF, ydfS, trpD, ycnK, trpB, trpC, nasD, ycdH, nasC, nasB, trpE, pckA, nasF, yrkC und tnrA oder Homologen zu SEQ ID NO. 91 , 41 , 53, 19, 55, 47, 21 , 17, 9, 85, 45, 49, 95, 63, 15, 93 oder 81 bei maximal 80 für den Stickstoff-Stoffwechsel spezifischen unterschiedlichen Sonden. Ferner betrifft diese Anmeldung die Verwendung entsprechender Gensonden, insbesondere auf solchen Chips, beziehungsweise entsprechende Verfahren und Verwendungsmöglichkeiten.

7. 发明公开

EP1880022A1 NUKLEINSÄURE-BINDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON GLUCOSEMANGELZUSTÄNDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译：核酸结合CHIPS葡萄糖缺乏状态的生物工艺下的检测
公开(公告)号：EP1880022A1
公开(公告)日：2008-01-23
申请号：EP06753481.8
申请日：2006-05-04
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN
发明人： EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/689
摘要： The invention relates to nucleic acid-binding chips for monitoring bioprocesses with special orientation toward the detection of glucose deficiency conditions. These chips support probes for at least six of the following 85 genes: yxe/, dppE, fruK, ybdN, yvdE, rbsK, hxIA, yvdH, ywfL, ispA, yvyD, licA, rocD, ycgO, yqiQ, sigX, iolC, licH, iolE, rsiX, mmgE, iolD, yvql, glpF, ysbA, yvqH, bpr, acdA, yvoA, aprE, yusK, acuA, acsA, acoR, ysiA, pgcM, mmgB, mmgD, tdh, mmgC, malP, mmgA, yusJ, malA, glpD, etfB, etfA, ywjF, yvdG, yusL, yvdl, acoC, acoL, ycgM, mmsA, ycgN, yoeB, kbl, yvdJ, yvdK, yfiA, malL, acoA, acoB or homologs to SEQ ID NO. 157, 39, 159, 103, 151, 125, 123, 63, 9, 49, 93, 35, 13, 105, 17, 15, 95, 99, 101, 107 or 11 with a maximum of 100 glucose metabolism-specific different probes. The invention also relates to the use of corresponding gene probes, particularly to chips of the aforementioned type, and to corresponding methods and possible uses.

8. 发明公开

EP1924711A2 NUKLEINSÄURE-BINDENDE CHIPS ZUR DETEKTION VON STICKSTOFFMANGELZUSTÄNDEN IM RAHMEN DER BIOPROZESSKONTROLLE 审中-公开
标题翻译：核酸结合CHIPS氮缺乏状态的生物工艺下的检测
公开(公告)号：EP1924711A2
公开(公告)日：2008-05-28
申请号：EP06791904.3
申请日：2006-09-07
申请人： HENKEL KOMMANDITGESELLSCHAFT AUF AKTIEN
发明人： EVERS, Stefan , FEESCHE, Jörg , MAURER, Karl-Heinz , SCHWEDER, Thomas , HECKER, Michael , VOIGT, Birgit , JÜRGEN, Britta , HOI, Le Thi
IPC分类号： C12Q1/68 , C12P1/00
CPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6837 , C12Q2600/158
摘要： The invention relates to nucleic acid-binding chips for monitoring bioprocesses, specifically for detecting nitrogen deficiencies. Said chips carry probes that are sensitive to at least three of the following 50 genes: kdgR, citA, htrA, ycnl, yppF, trpB, ggt, alsR, glnA, nrgA, yciC, yvtA, nrgB, ycnJ, glnR, yvIA, yncE, yvlB, trpF, ydfS, trpD, ycnK, trpB, trpC, nasD, ycdH, nasC, nasB, trpE, pckA, nasF, yrkC and tnrA or the homologs to SEQ ID NO. 91, 41, 53, 19, 55, 47, 21, 17, 9, 85, 45, 49, 95, 63, 15, 93 or 81 at a maximum of 80 different probes that are specific of nitrogen metabolism. The invention also relates to the use of corresponding gene probes, especially on the aforementioned chips, to corresponding methods and possible uses.

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