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1. 发明申请

WO2010120121A3 표적 특이적 비항체 단백질 및 이의 제조 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2010120121A3
公开(公告)日：2010-10-21
申请号：PCT/KR2010/002318
申请日：2010-04-14
申请人： 포항공과대학교 산학협력단 , 최윤섭 , 정준호 , 유지호 , 조현수 , 윤수민 , 김경록 , 류성호 , 김상욱
发明人： 최윤섭 , 정준호 , 유지호 , 조현수 , 윤수민 , 김경록 , 류성호 , 김상욱
IPC分类号： C07K1/107 , C07K14/485 , G06Q50/00 , C12N15/12 , C12N15/63 , A61K38/18 , A61P35/00
摘要： 본 발명은 표적 특이적 비항체 단백질의 제조 방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로, 비항체 단백질의 라이브러리에서 표적 단백질의 표적 부위와 구조적 상보성을 가지는 비항체 단백질을 선별하고, 선별된 비항체 단백질과 표적 단백질의 결합에너지를 계산하여, 선별된 비항체 단백질 중에서 안정적인 결합에너지를 갖는 비항체 단백질을 선별하고, 선정된 비항체 단백질과 표적 단백질이 직접 접촉하는 아미노산 잔기 중 결합에너지가 높은 아미노산 잔기를 선택하여, 선택된 아미노산 잔기를 결합에너지가 낮은 아미노산 잔기로 치환하는 단계를 포함하는 표적 특이적 비항체 단백질의 제조 방법에 관한 것이다. 또한 본 발명은 상기 방법에 의해 제조된 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 도메인 2에 특이적으로 결합하는 표적 특이적 비항체 및 이를 포함하는 암치료용 조성물에 관한 것이다.

2. 发明申请

WO2023063605A1 네트워크에 기반한 머신러닝 기법을 활용하여 암 환자에 대한 ICI 치료 효과와 전체 생존률을 예측할 수 있는 바이오마커의 탐색 장치 및 방법 审中-公开
公开(公告)号：WO2023063605A1
公开(公告)日：2023-04-20
申请号：PCT/KR2022/014088
申请日：2022-09-21
申请人： 포항공과대학교 산학협력단 , 이뮤노바이옴 주식회사
发明人： 김상욱 , 공정호 , 김인해 , 박창욱
IPC分类号： G16B5/00 , G16B40/00 , G16C20/30
摘要： 본원은 ICI 치료에 있어, 해당 치료에 대한 반응과 해당 치료를 받은 환자의 전체 생존률을 예측할 수 있는 바이오마커의 탐색방법을 제공하고자 한다. 본원의 장치 및 방법을 활용하면 암 환자에 대한 ICI 치료의 효과와 환자의 생존률을 정확하게 예측할 수 있는 바이오마커를 찾아낼 수 있으며, 이에 따라 ICI 치료 효과를 극대화할 수 있다.

3. 发明授权

KR101797466B1 약물 표적 막 단백질의 안전성 테스트 방법 有权
公开(公告)号：KR101797466B1
公开(公告)日：2017-11-15
申请号：KR1020140020441
申请日：2014-02-21
申请人： 주식회사 케이티 , 포항공과대학교 산학협력단
发明人： 최윤섭 , 김상욱 , 황지혜
IPC分类号： G01N33/68 , G01N33/15 , G01N35/00
摘要： 본발명은약물표적이되는막 단백질에대한안전성을테스트하는방법에관한것으로, (a)테스트대상약물및 해당약물의부작용발생정보와상기테스트대상약물에대응하는타겟단백질정보에기초하여약물별타겟단백질과약물부작용현상과의연관관계를구축하는단계; (b)상기약물별타겟단백질에대한단백질속성정보를분석하여유전자재구성비율(gene rewiring rate) 정보를도출하는단계; 및 (c)상기유전자재구성비율정보에기초하여상기약물별타겟단백질과약물부작용현상과의연관관계를토대로상기테스트대상약물의표적이되는타겟단백질을선정하는단계를포함한다.

4. 发明公开

KR1020150098998A 약물 표적 막 단백질의 안전성 테스트 방법 有权
标题翻译：测定药物胶囊蛋白质安全性的方法
公开(公告)号：KR1020150098998A
公开(公告)日：2015-08-31
申请号：KR1020140020441
申请日：2014-02-21
申请人： 주식회사 케이티 , 포항공과대학교 산학협력단
发明人： 최윤섭 , 김상욱 , 황지혜
IPC分类号： G01N33/68 , G01N33/15 , G01N35/00
CPC分类号： G01N33/6872 , G01N33/15 , G01N35/00722 , G01N35/00732
摘要： 본 발명은 약물 표적이 되는 막 단백질에 대한 안전성을 테스트하는 방법에 관한 것으로, (a)테스트 대상 약물 및 해당 약물의 부작용 발생정보와 상기 테스트 대상 약물에 대응하는 타겟 단백질 정보에 기초하여 약물별 타겟 단백질과 약물 부작용 현상과의 연관관계를 구축하는 단계; (b)상기 약물별 타겟 단백질에 대한 단백질 속성정보를 분석하여 유전자 재구성 비율(gene rewiring rate) 정보를 도출하는 단계; 및 (c)상기 유전자 재구성 비율 정보에 기초하여 상기 약물별 타겟 단백질과 약물 부작용 현상과의 연관관계를 토대로 상기 테스트 대상 약물의 표적이 되는 타겟 단백질을 선정하는 단계를 포함한다.
摘要翻译：本发明涉及一种药物靶膜蛋白质安全性检测方法，其特征在于，包括以下步骤：（a）根据检测药物设定每种药物的目标蛋白质与药物副作用引起的现象之间的关系副作用发生以及与试验药物相对应的目标蛋白质的信息; 通过分析每种药物的靶蛋白的性质来推导基因重新布线速率的信息的步骤（b）; 和（c）基于每种药物的靶蛋白与药物副作用引起的现象之间的关系，根据关于基因重新布线率的信息，选择作为试验药物靶标的靶蛋白。

5. 发明授权

KR101047192B1 표적 특이적 비항체 단백질 및 이의 제조 방법 失效
标题翻译：靶向特定的非抗体蛋白质及其制备方法
公开(公告)号：KR101047192B1
公开(公告)日：2011-07-06
申请号：KR1020100034505
申请日：2010-04-14
申请人： 포항공과대학교 산학협력단
发明人： 최윤섭 , 정준호 , 유지호 , 조현수 , 윤수민 , 김경록 , 류성호 , 김상욱
IPC分类号： C07K1/113 , G06F19/00 , C12N15/63 , A61K38/00
CPC分类号： C07K14/485 , A61K38/00 , C07K1/00 , C12N15/1089 , C40B30/02 , G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/22
摘要： 본 발명은 표적 특이적 비항체 단백질의 제조 방법에 관한 것으로, 보다 구체적으로, 비항체 단백질의 라이브러리에서 표적 단백질의 표적 부위와 구조적 상보성을 가지는 비항체 단백질을 선별하고, 선별된 비항체 단백질과 표적 단백질의 결합에너지를 계산하여, 선별된 비항체 단백질 중에서 안정적인 결합에너지를 갖는 비항체 단백질을 선별하고, 선정된 비항체 단백질과 표적 단백질이 직접 접촉하는 아미노산 잔기 중 결합에너지가 높은 아미노산 잔기를 선택하여, 선택된 아미노산 잔기를 결합에너지가 낮은 아미노산 잔기로 치환하는 단계를 포함하는 표적 특이적 비항체 단백질의 제조 방법에 관한 것이다. 또한 본 발명은 상기 방법에 의해 제조된 EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) 도메인 2에 특이적으로 결합하는 표적 특이적 비항체 및 이를 포함하는 암치료용 조성물에 관한 것이다.
摘要翻译：本发明特别针对于制造非抗体蛋白的方法，更具体地，非抗体从靶部位和所述目标蛋白的结构互补，和所选择的非抗体蛋白的蛋白质的文库与靶筛选非抗体蛋白计算的蛋白质的结合能，通过与靶蛋白中选择的非抗体蛋白与来自所选择的非抗体蛋白的能量的稳定的联接，并选择所选择的非抗体蛋白质是在氨基酸残基的结合能具有高的氨基酸残基直接接触并且用具有低结合能的氨基酸残基置换选择的氨基酸残基。本发明还涉及用于产生靶特异性非抗体蛋白质的方法。本发明还涉及一种组合物用于治疗癌症，包括非靶特异性抗体，并且该特异性结合由上述方法制备的EGFR（表皮生长因子受体）结构域2。

6. 发明公开

KR1020100114478A 표적 특이적 비항체 단백질 및 이의 제조 방법 失效
标题翻译：目标特异性非抗体蛋白质组合物及其生产方法
公开(公告)号：KR1020100114478A
公开(公告)日：2010-10-25
申请号：KR1020100034505
申请日：2010-04-14
申请人： 포항공과대학교 산학협력단
发明人： 최윤섭 , 정준호 , 유지호 , 조현수 , 윤수민 , 김경록 , 류성호 , 김상욱
IPC分类号： C07K1/113 , G06F19/00 , C12N15/63 , A61K38/00
CPC分类号： C07K14/485 , A61K38/00 , C07K1/00 , C12N15/1089 , C40B30/02 , G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/22
摘要： PURPOSE: A method for preparing target-specific non-antibody protein which suppresses EGFR(epidermal growth factor receptor) domain 2 is provided to efficiently treat cancer cells. CONSTITUTION: A method for preparing target-specific non-antibody protein comprises: a step of selecting a non-antibody protein having structural complementarity with target site of the target protein; a step of calculating binding energy of the selected non-antibody protein and target; a step of selecting amino acid residue having highest binding energy; and a step of substituting the selected amino acid residue to amino acid residue of low binding energy. The target protein is EGFR domain 2.
摘要翻译：目的：提供抑制EGFR（表皮生长因子受体）结构域2的靶特异性非抗体蛋白的制备方法，以有效治疗癌细胞。构成：制备靶特异性非抗体蛋白质的方法包括：选择与靶蛋白的靶位点具有结构互补性的非抗体蛋白质的步骤; 计算所选择的非抗体蛋白质和靶标的结合能的步骤; 选择具有最高结合能的氨基酸残基的步骤; 以及将选择的氨基酸残基取代为低结合能的氨基酸残基的步骤。靶蛋白是EGFR结构域2。

7. 发明授权

KR101020933B1 전자 라이브러리로부터 시뮬레이션을 통해 표적 분자 저해를 위한 최적의 단백질 구조를 검색하는 방법 失效
标题翻译：搜索用于从电子图书馆模拟的目标分子抑制的理想蛋白质结构的方法
公开(公告)号：KR101020933B1
公开(公告)日：2011-03-09
申请号：KR1020100015396
申请日：2010-02-19
申请人： 포항공과대학교 산학협력단
发明人： 최윤섭 , 서판길 , 정준호 , 유지호 , 조현수 , 윤수민 , 김경록 , 류성호 , 김상욱
IPC分类号： G01N33/68 , G06F17/30
摘要： PURPOSE: A method for searching for a non-antibody protein that is specific to a target through simulation from an electronic library is provided to remarkably improve speed and to save costs. CONSTITUTION: A method for searching for a non-antibody protein that is specific to a target from an electronic library comprises: a step of performing a docking simulation using a non-antibody protein and target to select a non-antibody protein that is bound in more than a number of predetermined target residues; a step of calculating the binding energy of the non-antibody protein and target and arranging a non-antibody protein according the predetermined number; and a step of removing a non-antibody protein which has a level less than the predetermined level. The electronic library comprises a non-antibody protein forming a monomer, homodimer, or homotrimer.
摘要翻译：目的：提供一种通过电子图书馆模拟搜索特异于靶标的非抗体蛋白质的方法，显着提高速度并节约成本。构成：从电子文库搜索靶标特异性的非抗体蛋白质的方法包括：使用非抗体蛋白质和靶标进行对接模拟的步骤，以选择结合于非抗体蛋白质的非抗体蛋白质超过一定数量的预定目标残留物; 计算非抗体蛋白质和靶标的结合能量并按照预定数量排列非抗体蛋白质的步骤; 以及去除具有低于预定水平的水平的非抗体蛋白质的步骤。电子文库包含形成单体，同二聚体或同三聚物的非抗体蛋白质。

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