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1. 发明专利

JP2011520454A Compositions for use in methods and such methods for evaluating the colorectal cancer 审中-公开
公开(公告)号：JP2011520454A
公开(公告)日：2011-07-21
申请号：JP2011509787
申请日：2009-05-18
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：アーント・グレッグ・エム , ドッシー・レズリー , ラポニ・ミッチ
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09 , C12Q1/02
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/158 , C12Q2600/178
摘要：本明細書において開示されるのは、選択されたｍｉＲＮＡ配列における制御変化を観察することにより、結腸直腸癌のステージを診断する方法である。これらの配列には、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４３、ｈｓａ−ｍｉＲ−１４５、これらのそれぞれの前駆体及びこれらの配列の組み合わせが含まれ得る。

2. 发明专利

JP2011509688A The discovery of gstp1 hypermethylation in prostate cancer 审中-公开
公开(公告)号：JP2011509688A
公开(公告)日：2011-03-31
申请号：JP2010544377
申请日：2009-01-19
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：バーゴ・ジャネット・エム , バーデ・ショバ・エイ , バーデン・ジョナサン・エフ , マズムダー・アビジット
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09 , G01N33/50
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/154 , C12Q2600/16
摘要：前立腺癌を発見するためのアッセイは、１つの遺伝子、例えばＧＳＴＰ１内からの、複数のメチル化マーカーを発見するための試薬を含む。

3. 发明专利

JP2009542216A Method of modifying a polymer without previously extracted from the sample 审中-公开
公开(公告)号：JP2009542216A
公开(公告)日：2009-12-03
申请号：JP2009518328
申请日：2007-06-29
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：オッペンハイマー・ダーリン , カオ・シーン・ウーション , グリーン・ジョージ , スティール・クリストファー , トラスト・キャリー , バーデ・ショバ , ベナー・タチアナ , マズムダー・アビジット , メフロトラ・ジョティ
IPC分类号： C12N15/09 , C07K1/14 , C12N5/06 , G01N30/88
CPC分类号： C12N15/1006 , C12N15/102
摘要：【課題】亜硫酸水素塩修飾したDNAを得るための、迅速で効率的な方法を提供する。
【解決手段】本発明は、サンプルから事前に抽出せずに高分子を修飾する方法であって、サンプル中の高分子を化学物質で変換し、必要に応じて化学中間体を除去するか、または、変換し、結果的に生じた修飾された高分子を精製することによる方法を含む。
【選択図】なし

4. 发明专利

JP2009192539A Method and apparatus for imaging target components in biological sample using permanent magnet 有权
标题翻译：使用永久磁铁在生物样品中成像目标组件的方法和装置
公开(公告)号：JP2009192539A
公开(公告)日：2009-08-27
申请号：JP2009032033
申请日：2009-02-13
申请人： Veridex Llc , ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人： TIBBE ARJAN G J , TERSTAPPEN LEON W M M
IPC分类号： G01N33/53 , G01N21/64 , G01N33/553
CPC分类号： G01N33/582 , G01N33/54326 , G01N33/56972 , G01N2333/70514 , G01N2446/00
摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a system for enumeration of cells in fluids by image cytometry for assessment of target populations such as leukocyte partial group in different bodily fluids, or bacterial contamination in environmental samples, food products and bodily fluids.
SOLUTION: Fluorescently labeled target cells are linked to magnetic particles or beads. In one embodiment, a small permanent magnet is inserted directly into the chamber containing the labeled cells. The magnets are coated with PDMS silicone rubber to provide a smooth and even surface which allows imaging on a single focal plane. The magnet is removed from the sample and illuminated with fluorescent light emitted by the target cells captured by a CCD camera. In another embodiment, a floater having a permanent magnet makes the target cells array along a single imaging plane within the sample solution. An image analysis can be performed with a novel algorithm for measuring cells on the surface reflecting the target cell concentration of the original sample.
COPYRIGHT: (C)2009,JPO&INPIT
摘要翻译：要解决的问题：提供一种用于通过图像细胞计数来计量流体中的细胞的系统，以评估靶群体，例如不同体液中的白细胞部分组，或环境样品，食品和体液中的细菌污染。荧光标记的靶细胞与磁性颗粒或珠子连接。在一个实施例中，将小永久磁铁直接插入含有标记细胞的腔室中。这些磁体用PDMS硅橡胶涂覆，以提供平滑和均匀的表面，允许在单个焦平面上进行成像。从样品中除去磁体，并用由CCD照相机俘获的靶细胞发射的荧光照射。在另一个实施例中，具有永磁体的浮子使得靶单元沿着样品溶液内的单个成像平面排列。可以使用用于测量反映原始样品的靶细胞浓度的表面上的细胞的新颖算法进行图像分析。版权所有（C）2009，JPO＆INPIT

5. 发明专利

JP2008523822A Method for evaluating the acute myeloid leukemia patients 审中-公开
公开(公告)号：JP2008523822A
公开(公告)日：2008-07-10
申请号：JP2007547020
申请日：2005-12-19
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：ラポニ・ミッチ
IPC分类号： C12N15/09 , C12M1/00 , C12Q1/68 , G01N33/53 , G01N37/00
CPC分类号： C12Q1/6809 , C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/154 , C12Q2600/158 , C12Q2565/501
摘要：【課題】急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）を有する患者の予後を予測すること。
【解決手段】癌、好ましくは、造血系悪性腫瘍患者を治療する方法は、患者の遺伝子発現プロフィールおよび／または分子マーカーを分析して患者の状態および／または予後を決定することを含む。本発明はまた、非再発性または非難治性患者がファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤（ＦＴＩ）、および、場合によっては他の治療薬による治療に応答する可能性があるかどうか分析する方法も提供する。これらの方法はまた、患者の治療をモニタリングするため、かつ、治療過程を選択するためにも有用である。ＦＴＩ処置に応答して変調される遺伝子が提供され、プロフィールの作成に用いられる。
【選択図】図１３

6. 发明专利

JP2006014739A Method for assessing and treating cancer 审中-公开
标题翻译：癌症评估和治疗方法
公开(公告)号：JP2006014739A
公开(公告)日：2006-01-19
申请号：JP2005192550
申请日：2005-06-30
申请人： Veridex Llc , ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人： REPONI MITCH
IPC分类号： C12Q1/68 , A61K31/4709 , A61K45/00 , A61P35/00 , A61P43/00 , C07D401/06 , C07K16/32 , C12N15/09 , G01N33/50
CPC分类号： C07K16/32 , A61K31/47 , C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158 , G01N33/5011 , G01N2800/52
摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for treating a cancer patient in which the presence or absence of a molecular marker is determinative of whether the patient is likely to respond to the FTI. SOLUTION: This method for treating the cancer patient, preferably a malignant blood disorder patient involves a step of analyzing a gene expression profile of the patient and/or a molecular marker to determine whether or not the possibility that the patient will respond to treatment with a farnesyl transferase inhibitor (FTI) and optionally to the treatment with other medicaments is high. The method is useful for monitoring the treatment of the patient and for selecting a treating method for the patient. A gene regulated so as to correspond to the FTI treatment is provided, and the gene expression profile is produced by using the gene. COPYRIGHT: (C)2006,JPO&NCIPI
摘要翻译：待解决的问题：提供一种治疗癌症患者的方法，其中分子标志物的存在或不存在决定患者是否可能对FTI作出反应。解决方案：用于治疗癌症患者，优选恶性血液病症患者的方法涉及分析患者和/或分子标志物的基因表达谱的步骤，以确定患者是否可能响应用法呢基转移酶抑制剂（FTI）进行治疗，任选地用其他药物治疗是高的。该方法可用于监测患者的治疗和选择患者的治疗方法。提供了调节以对应于FTI处理的基因，并且通过使用该基因产生基因表达谱。版权所有（C）2006，JPO＆NCIPI

7. 发明专利

JP2005237381A Disruption of cell and tissue 审中-公开
标题翻译：细胞和组织的破坏
公开(公告)号：JP2005237381A
公开(公告)日：2005-09-08
申请号：JP2005040913
申请日：2005-02-17
申请人： Veridex Llc , ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人： BELLY ROBERT , HAYS DUSTIN
IPC分类号： C12N15/00 , B01L3/14 , C12M1/33 , C12M3/08 , C12N1/00 , C12N15/09 , G01N1/28
CPC分类号： G01N1/286 , B01L3/5082 , B01L2300/0609 , C12M47/06 , G01N2001/2866 , Y10T436/25375
摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for disruption of cells and tissues capable of carrying out extraction of RNA more rapidly, effectively and productively, and can be automated. SOLUTION: A method for disrupting cells and/or tissues, which employs a disrupter with a disruption element having an outer dimension that is slightly smaller than the inside dimension of a container in which a sample to be disrupted is placed. Devices for disrupting cells and/or tissues are also presented. The device and methods are used in processes such as the extraction of nucleic acids. COPYRIGHT: (C)2005,JPO&NCIPI
摘要翻译：要解决的问题：提供能够更快速，有效和高效地进行RNA提取的细胞和组织的破坏方法，并且可以自动化。解决方案：一种用于破坏细胞和/或组织的方法，其采用具有破坏元件的破坏器，所述破坏元件的外部尺寸略小于待放置样品的容器的内部尺寸。还介绍了破坏细胞和/或组织的装置。该装置和方法用于诸如提取核酸的过程中。版权所有（C）2005，JPO＆NCIPI

8. 发明专利

JP5405110B2 Methods and materials for identifying the primary tumor of unknown primary cancer 有权
公开(公告)号：JP5405110B2
公开(公告)日：2014-02-05
申请号：JP2008531421
申请日：2006-09-19
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：ワン・イーシン , マズムダー・アビジット , タラントフ・ドミトリー , ジャトコウ・ティモシー , バーデン・ジョナサン
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/00 , C12N15/09 , C12Q1/04 , G01N33/53 , G01N33/574 , G01N37/00
CPC分类号： G01N33/57484 , C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/158 , G01N33/5091 , G16H10/40 , Y02A90/26
摘要： The present invention provides a method of identifying origin of a metastasis of unknown origin by obtaining a sample containing metastatic cells; measuring Biomarkers associated with at least two different carcinomas; combining the data from the Biomarkers into an algorithm where the algorithm normalizes the Biomarkers against a reference; and imposes a cut-off which optimizes sensitivity and specificity of each Biomarker, weights the prevalence of the carcinomas and selects a tissue of origin determining origin based on highest probability determined by the algorithm or determining that the carcinoma is not derived from a particular set of carcinomas; and optionally measuring Biomarkers specific for one or more additional different carcinoma, and repeating the steps for additional Biomarkers.

9. 发明专利

JP2013533288A Method for determining the acute leukemia response to treatment with farnesyl transferase inhibitor 有权
公开(公告)号：JP2013533288A
公开(公告)日：2013-08-22
申请号：JP2013521970
申请日：2011-07-28
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：ベナー・タティアナ・アイ , デレーチョ・カルロ・シー , パルマ・ジョン・エフ , ラポニ・マイカル
IPC分类号： A61K31/4709 , A61P35/00 , A61P35/02 , A61P43/00 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/6809 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156 , C12Q2600/158 , C12Q2600/16
摘要：開示される方法は、ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤と、エトポシド、テニポシド、タモキシフェン、ソラフェニブ、パクリタキセル、テモゾロミド、トポテカン、トラスツズマブ、及びシスプラチナムのうちの１つ又は２つ以上との組み合わせによる治療に対して応答を示す確率が高い、高齢のＡＭＬ患者を含むＡＭＬ患者を所望の精度にて迅速に同定するものである。一実施形態では、改良点として、従来の骨髄試料に代わる全血の使用により、アッセイがより正確、迅速、低侵襲、低コストとなるだけでなく苦痛も少なくなることがある。本方法は２遺伝子発現比（ＲＡＳＧＲＰ１：ＡＰＴＸ）の評価を含み、この評価は、対応する閾値とともに、併用治療に対する応答を予測するための充分な精度をもたらすものである。好ましい実施形態では、併用治療は、チピファルニブ（Ｒ１１５７７７、ＺＡＲＮＥＳＴＲＡ（登録商標））をエトポシドと組み合わせたものである。更に、チピファルニブとエトポシドとの併用治療に応答する確率が高いものとして同定された高齢のＡＭＬ患者は、若年患者に対して使用可能な最良の治療に匹敵する完全回復率を有するものである。

10. 发明专利

JP2011501966A Process for colorectal cancer monitoring 审中-公开
公开(公告)号：JP2011501966A
公开(公告)日：2011-01-20
申请号：JP2010532248
申请日：2008-10-30
申请人：ベリデックス・エルエルシーVeridex,LLC
发明人：アーント・グレゴリー・エム , ラポニ・ミッチ
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/158 , C12Q2600/178 , C12Q1/6809 , C12Q2525/207
摘要：本明細書において開示されるのは、選択されたｍｉＲＮＡ配列におけるレギュレーション変化を観察することにより、結腸直腸癌のステージを判定する方法である。この配列には、ｈｓａ−ｍｉＲ−３１、ｈｓａ−ｍｉＲ−７、ｈｓａ−ｍｉＲ−９９ｂ、ｈｓａ−ｍｉＲ−３７８
＊、ｈｓａ−ｍｉＲ−１３３ａ、ｈｓａ−ｍｉＲ−１２５ａ及びこれら配列の組み合わせが含まれ得る。

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