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51. 发明申请

WO2015035168A1 TUNING BACTERIOPHAGE HOST RANGE 审中-公开
标题翻译：调节细菌孵化器范围
公开(公告)号：WO2015035168A1
公开(公告)日：2015-03-12
申请号：PCT/US2014/054299
申请日：2014-09-05
申请人： MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLGY
发明人： LU, Timothy, Kuan-ta , ANDO, Hiroki , LEMIRE, Sebastien
IPC分类号： C12N7/00
CPC分类号： C12N7/00 , C12N7/02 , C12N15/81 , C12N2795/00011 , C12N2795/00021
摘要： Various aspects and embodiments of the invention are directed to high-throughput phage-engineering methods and recombinant bacteriophages with tunable host ranges for controlling phage specificity. The present disclosure provides, inter alia, recombinant bacteriophages with tunable host ranges for controlling phage host cell specificity and high-throughput bacteriophage engineering methods. This is achieved, in some embodiments, by altering host recognition elements such as, for example, tail fibers of a particular type of bacteriophage.
摘要翻译：本发明的各个方面和实施方案涉及高通量噬菌体工程方法和具有可控的宿主范围的用于控制噬菌体特异性的重组噬菌体。本公开尤其提供了具有可调节宿主范围的重组噬菌体，用于控制噬菌体宿主细胞特异性和高通量噬菌体工程方法。这在一些实施方案中通过改变宿主识别元件例如特定类型的噬菌体的尾纤维来实现。

52. 发明申请

WO2010007724A1 ＥｐＣＡＭに結合能を有するペプチド审中-公开
标题翻译：能够与EPCAM结合的肽
公开(公告)号：WO2010007724A1
公开(公告)日：2010-01-21
申请号：PCT/JP2009/002625
申请日：2009-06-10
申请人：財団法人癌研究会 , 株式会社村田製作所 , 柏木健司 , 芝清隆 , 河村秀樹
发明人：柏木健司 , 芝清隆 , 河村秀樹
IPC分类号： C12N15/09 , A61K38/00 , A61P35/00 , C07K7/06 , C07K7/08 , C07K14/82 , C07K16/44 , C07K19/00 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12N5/06 , C12N5/10 , C12N7/00 , G01N33/68
CPC分类号： C07K7/08 , C12N2795/00011 , C12N2795/00022
摘要：本発明の課題は、化学合成法や遺伝子工学的方法により簡単に作製が可能な、ＥｐＣＡＭに結合能を有する新規のペプチドを提供することにある。本発明者らは、上記課題を解決するため鋭意研究し、固相化したＥｐＣＡＭタンパク質に、多様なペプチド配列をファージ粒子上に提示するファージ集団を接触させ、ＥｐＣＡＭタンパク質に結合したファージ粒子を回収し、得られたファージ粒子を大腸菌中で増殖させた。次いで、この増殖させたファージ粒子を、再度ＥｐＣＡＭタンパク質に接触させるパニング操作を繰り返すことにより、ＥｐＣＡＭに特異的に結合するファージクローンを得ることに成功した。このファージクローンのＤＮＡ配列を解析し、ＥｐＣＡＭに特異的に結合するアミノ酸配列を特定し、本発明を完成するに至った。
摘要翻译：公开了能够与EpCAM结合的新型肽，其可以通过化学合成方法或遗传工程方法容易地制备。可以在噬菌体颗粒上显示各种肽序列的噬菌体群与固定在固体支持物上的EpCAM蛋白质接触。收集与EpCAM蛋白结合的噬菌体颗粒。收集的噬菌体颗粒在大肠杆菌中增殖。随后，重复将增殖的噬菌体颗粒与EpCAM蛋白质接触的淘选程序。以这种方式，能够成功地产生能够特异性结合EpCAM的噬菌体克隆。分析噬菌体克隆的DNA序列以指定能够特异性结合EpCAM的氨基酸序列。

53. 发明申请

WO2009005869A2 BIOLOGICAL DETECTION SYSTEM AND METHOD 审中-公开
标题翻译：生物检测系统和方法
公开(公告)号：WO2009005869A2
公开(公告)日：2009-01-08
申请号：PCT/US2008/059465
申请日：2008-04-04
申请人： GUILD ASSOCIATES, INC. , SCHOFIELD, David Alexander
发明人： SCHOFIELD, David Alexander
IPC分类号： C12Q1/04 , C12Q1/66 , G01N33/569
CPC分类号： C12Q1/04 , C12N15/1086 , C12N2795/00011 , C12N2795/10311 , C12N2795/14111 , C12Q1/66 , G01N33/569 , G01N33/56983 , G01N2333/32
摘要： The present disclosure, according to some embodiments, relates to phage-based biological detection systems, compositions, and methods. In some embodiments, it relates to a detection system and method using phage binding and bacterial infection to detect the presence of a target molecule (e.g., a toxin). One detection system may include a genetically engineered phage that expresses a surface molecule able to bind a target molecule and/or target microorganism; a bacterium susceptible to infection by the phage; and a detection component able to determine whether the bacterium has been infected by the phage. Infection of a bacterium by a phage may be indicative of phage binding to the target molecule and/or target microorganism. One method may include placing a sample suspected of containing the target molecule and/or target microorganism with a binder; adding a genetically engineered phage having reporter genetic material and able to bind the target molecule and/or target microorganism; washing away unbound phage; releasing phage bound to the target molecule and/or target microorganism; infecting a bacterium with the released phage; and detecting the presence of any reporter genetic material in the bacterium. Reporter material in the bacterium may correlate with target molecule and/or target microorganism in the sample. In some embodiments, the disclosure relates to a detection system and method using phage comprising a reporter to infect a microorganism (e.g., Bacillus anthracis), wherein the reporter is selectively (e.g., only) detectable upon phage infection.
摘要翻译：根据一些实施方案，本公开涉及基于噬菌体的生物检测系统，组合物和方法。在一些实施方案中，其涉及使用噬菌体结合和细菌感染来检测靶分子（例如毒素）的存在的检测系统和方法。一种检测系统可以包括表达能够结合靶分子和/或靶微生物的表面分子的基因工程噬菌体; 易受噬菌体感染的细菌; 以及能够确定细菌是否已被噬菌体感染的检测组分。通过噬菌体感染细菌可以指示噬菌体与靶分子和/或靶微生物的结合。一种方法可以包括将怀疑含有靶分子和/或靶微生物的样品与粘合剂一起放置; 添加具有报道基因材料并能够结合靶分子和/或靶微生物的基因工程噬菌体; 洗去未结合的噬菌体; 释放与靶分子和/或靶微生物结合的噬菌体; 用释放的噬菌体感染细菌; 并检测细菌中任何报道基因物质的存在。细菌中的报道物质可能与样品中的靶分子和/或靶微生物相关。在一些实施方案中，本公开涉及使用包含报道分子的噬菌体来感染微生物（例如炭疽芽孢杆菌）的检测系统和方法，其中报道分子在噬菌体感染后选择性地（例如，仅）可检测到。

54. 发明申请

WO2006050193A2 BACTERIOPHAGES AS SELECTIVE AGENTS 审中-公开
标题翻译：作为选择性代理的细菌
公开(公告)号：WO2006050193A2
公开(公告)日：2006-05-11
申请号：PCT/US2005039133
申请日：2005-10-31
申请人： STRATEGIC DIAGNOSTICS INC , STAVE JAMES W , TEANEY GEORGE B
发明人： STAVE JAMES W , TEANEY GEORGE B
IPC分类号： C12Q1/04 , C12N7/00
CPC分类号： C12Q1/04 , C12N7/00 , C12N2795/00011 , C12N2795/10045 , C12Q1/10 , G01N2333/005 , G01N2333/255
摘要： Compositions containing bacteriophages and methods of using bacteriophages in microorganism detection assays and microbial growth and plating media are disclosed. The lytic ability of these phages to control the growth of non-target populations provides superior sensitivity and specificity to detection assays and reduces false negative and false positive results. The removal of contaminating bacteria reduces the microbial competition for nutrients in the growth media thereby increasing the efficiency and productivity of the culture. The phage treatment of the sample increases the proportion of target microorganisms in the sample over contaminating bacteria thereby requiring less time for enrichment to obtain a significant signal improving overall signal to noise ratio in assays and providing for higher yield of end product in microbiological production systems.
摘要翻译：公开了包含噬菌体的组合物和在微生物检测测定和微生物生长和电镀培养基中使用噬菌体的方法。这些噬菌体控制非目标群体生长的溶解能力为检测测定提供了出色的灵敏度和特异性，并减少了假阴性和假阳性结果。污染细菌的去除减少了生长培养基中营养物的微生物竞争，从而提高了培养物的效率和生产力。样品的噬菌体处理增加了样品中目标微生物在污染细菌上的比例，从而需要更少的浓缩时间来获得显着的信号，从而提高了测定中的整体信噪比，并提供了微生物生产系统中最终产品的更高产量。

55. 发明申请

WO2010064950A1 СПОСОБ НЕЙТРАЛИЗАЦИИ СПОР И ВЕГЕТАТИВНЫХ КЛЕТОК ВАСILLUS АΝTHRАСIS 审中-公开
标题翻译：用于中和黑曲霉ANTHRACIS SPORES和植物细胞的生物学
公开(公告)号：WO2010064950A1
公开(公告)日：2010-06-10
申请号：PCT/RU2008/000753
申请日：2008-12-05
申请人： ОТКРЫТОЕ АКЦИОНЕРНОЕ ОБЩЕСТВО "ИНСТИТУТ ИНЖЕНЕРНОЙ ИММУНОЛОГИ" , ПОПОВ, Виктор Григорьевич , ПЧЕЛИНЦЕВ, Сергей Юрьевич , ОЗЕРОВ, Михаил Юрьевич , ПОПОВ, Денис Викторович
发明人： ПОПОВ, Виктор Григорьевич , ПЧЕЛИНЦЕВ, Сергей Юрьевич , ОЗЕРОВ, Михаил Юрьевич , ПОПОВ, Денис Викторович
IPC分类号： C12N7/00 , C12Q1/70
CPC分类号： C12N7/00 , C12N2795/00011
摘要： Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к способам дезинфекции, используемым при заражении окружающей среды бациллами сибирской язвы. Предложен эффективный и экологически безопасный способ нейтрализации спор и вегетативных клеток Васillus аnthrасis, включающий обработку зараженной поверхности дезинфицирующим средством, представляющим собой водный раствор, содержащий смесь бактериофагов Васillus аnthrасis OZR-1, Васillus аnthrасis Ф-2, Васillus аnthrасis ФАУТ при соотношении активностей (БОЕ/см 3 ) Васillus аnthrасis OZR-1: Васillus аnthrасis Ф-2: Васillus аnthrасis ФАУТ = 1 :(0,2-1):(0,1-1) и активатор прорастания спор L-аланин Раствор для дезинфекции готовят смешением в растворе раздельно хранящихся L-аланина и комплекса бактериофагов, выращенных по отдельности и смешанных в заданных соотношениях. Предпочтительно, используется водный раствор, содержащий смесь бактериофагов в концентрации 10 10 - 10 12 БOE/л и активатор прорастания спор в концентрации 0.05 - 0.15 моль/л. Для достижения полного эффекта и закрепления результата обработка зараженной поверхности проводится дважды с интервалом 60-180 минут, а эффективной дезинфекции можно добиться, используя раствор из расчета 10 11 - 10 12 фаговых частиц на 10м 2 зараженной поверхности.
摘要翻译：本发明涉及生物技术，特别涉及用炭疽杆菌污染环境消毒的方法。中和的方法是孢子和营养细胞是有效和生态友好的，并且涉及用包含以下物质的混合物的水溶液形式的消毒剂处理污染的表面：为OZR-1，F为2，F为2，F为？thr thr ?? UT UT UT UT UT UT UT UT UT UT UT ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ??--OZR- 1，us thr thr thr ?? is is is is ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? ?? UT UT UT UT UT UT UT :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :( :(。。。。。。通过将分开存储的L-丙氨酸和噬菌体的复合物混合制备消毒溶液，所述噬菌体分别生长并以指定的比例混合。优选使用含有浓度为1010-1012PFU / l的噬菌体混合物和浓度为0.05-0.15mol / l的孢子萌发活化剂的水溶液。为了获得全面的效果并确定结果，污染的表面以60-180分钟的间隔进行两次处理，并且可以通过使用基于每10平方米污染的1011-1012个噬菌体颗粒的溶液来实现有效的消毒表面。

56. 发明申请

WO2009005869A3 BIOLOGICAL DETECTION SYSTEM AND METHOD 审中-公开
标题翻译：生物检测系统及方法
公开(公告)号：WO2009005869A3
公开(公告)日：2009-08-20
申请号：PCT/US2008059465
申请日：2008-04-04
申请人： GUILD ASS INC , SCHOFIELD DAVID ALEXANDER
发明人： SCHOFIELD DAVID ALEXANDER
IPC分类号： C12Q1/04 , C12Q1/66 , C12Q1/70 , G01N33/569
CPC分类号： C12Q1/04 , C12N15/1086 , C12N2795/00011 , C12N2795/10311 , C12N2795/14111 , C12Q1/66 , G01N33/569 , G01N33/56983 , G01N2333/32
摘要： The present disclosure, according to some embodiments, relates to phage-based biological detection systems, compositions, and methods. In some embodiments, it relates to a detection system and method using phage binding and bacterial infection to detect the presence of a target molecule (e.g., a toxin). One detection system may include a genetically engineered phage that expresses a surface molecule able to bind a target molecule and/or target microorganism; a bacterium susceptible to infection by the phage; and a detection component able to determine whether the bacterium has been infected by the phage. Infection of a bacterium by a phage may be indicative of phage binding to the target molecule and/or target microorganism. One method may include placing a sample suspected of containing the target molecule and/or target microorganism with a binder; adding a genetically engineered phage having reporter genetic material and able to bind the target molecule and/or target microorganism; washing away unbound phage; releasing phage bound to the target molecule and/or target microorganism; infecting a bacterium with the released phage; and detecting the presence of any reporter genetic material in the bacterium. Reporter material in the bacterium may correlate with target molecule and/or target microorganism in the sample. In some embodiments, the disclosure relates to a detection system and method using phage comprising a reporter to infect a microorganism (e.g., Bacillus anthracis), wherein the reporter is selectively (e.g., only) detectable upon phage infection.
摘要翻译：根据一些实施方案的本公开涉及基于噬菌体的生物检测系统，组合物和方法。在一些实施方案中，本发明涉及使用噬菌体结合和细菌感染来检测靶分子（例如毒素）的存在的检测系统和方法。一个检测系统可以包括表达能够结合靶分子和/或靶微生物的表面分子的遗传工程化噬菌体; 易受噬菌体感染的细菌; 以及能够确定细菌是否已经被噬菌体感染的检测组分。通过噬菌体感染细菌可以指示噬菌体与靶分子和/或靶微生物的结合。一种方法可以包括将疑似含有靶分子和/或靶微生物的样品置于粘合剂中; 添加具有报道基因材料并能够结合靶分子和/或靶微生物的遗传工程化噬菌体; 洗去未结合的噬菌体; 释放与靶分子和/或靶微生物结合的噬菌体; 用释放的噬菌体感染细菌; 并检测细菌中任何报道基因物质的存在。细菌中的记录物质可能与样品中的靶分子和/或靶微生物相关。在一些实施方案中，本公开涉及使用包含报告基因以感染微生物（例如炭疽芽孢杆菌）的噬菌体的检测系统和方法，其中所述报道分子在噬菌体感染时可选择性地（例如仅）可检测。

57. 发明申请

WO2008108989A2 CULTURES WITH IMPROVED PHAGE RESISTANCE 审中-公开
标题翻译：具有改善抗药性的文化
公开(公告)号：WO2008108989A2
公开(公告)日：2008-09-12
申请号：PCT/US2008/002714
申请日：2008-02-29
申请人： DANISCO A/S , BARRANGOU, Rodolphe , FREMAUX, Christophe , HORVATH, Philippe , ROMERO, Dennis , BOYAVAL, Patrick
发明人： BARRANGOU, Rodolphe , FREMAUX, Christophe , HORVATH, Philippe , ROMERO, Dennis , BOYAVAL, Patrick
IPC分类号： C12N7/00
CPC分类号： C12N15/746 , A23C9/123 , A23C9/1238 , A23C2220/202 , A23Y2240/75 , C12N1/20 , C12N2795/00011 , C12Q1/70 , C12Q2525/151
摘要： The present invention provides methods and compositions related to modulating the resistance of a cell against a target nucleic acid or a transcription product thereof. In some preferred embodiments, the present invention provides compositions and methods for the use of one or more cas genes or proteins for modulating the resistance of a cell against a target nucleic acid or a transcription product thereof. In some embodiments, the present invention provides methods and compositions that find use in the development and use of strain combinations and starter culture rotations. In additional embodiments, the present invention provides methods for labelling and/or identifying bacteria. In some preferred embodiments, the present invention provides methods for the use of CRISPR loci to determine the potential virulence of a phage against a cell and the use of CRISPR-cas to modulate the genetic sequence of a phage for increased virulence level. In still further embodiments, the present invention provides means and compositions for the development and use of phages as biocontrol agents.
摘要翻译：本发明提供了与调节细胞对靶核酸或其转录产物的抗性相关的方法和组合物。在一些优选实施方案中，本发明提供了使用一种或多种cas基因或蛋白质调节细胞对靶核酸或其转录产物的抗性的组合物和方法。在一些实施方案中，本发明提供了用于开发和使用菌株组合和起始培养旋转的方法和组合物。在另外的实施方案中，本发明提供用于标记和/或鉴定细菌的方法。在一些优选的实施方案中，本发明提供了使用CRISPR基因座确定噬菌体对细胞的潜在毒力的方法，以及使用CRISPR-cas调节噬菌体的遗传序列以增加毒力水平。在另外的实施方案中，本发明提供用于开发和使用噬菌体作为生物防治剂的方法和组合物。

58. 发明申请

WO2008097115A1 PURIFIED BACTERIOPHAGE, ITS PREPARATION AND APPLICATION 审中-公开
标题翻译：纯化细菌，其制备和应用
公开(公告)号：WO2008097115A1
公开(公告)日：2008-08-14
申请号：PCT/PL2008/000013
申请日：2008-02-08
申请人： INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOSWIADCZALNEJ PAN , LIPINSKI, Tomasz , GAMIAN, Andrzej , ZUZIAK, Ewa , KORZENIOWSKA-KOWAL, Agnieszka , GORSKI, Andrzej
发明人： LIPINSKI, Tomasz , GAMIAN, Andrzej , ZUZIAK, Ewa , KORZENIOWSKA-KOWAL, Agnieszka , GORSKI, Andrzej
IPC分类号： A61K35/76 , C12N7/02
CPC分类号： C12N7/00 , A61K35/76 , C12N7/02 , C12N2795/00011 , C12N2795/00051 , C12N2795/10132 , C12N2795/10151
摘要： A method of preparation of purified bacteriophage preparations with increased antibacterial activity, in which from bacterial lysate of phages is obtained, advantageously in the presence of lysozyme, chelating factor and detergent, in a continuous manner with ultrafiltration on membranes, the phage containing high molecular mass preparation, devoid of bacterial cell wall and other contaminants, free of toxins and endotoxins, active in tests of bacterial lysis, which is characterized by chromatography HPLC, In SDS-PAGE electrophoresis, immunoblotting, biological tests of bacterial lysis, and is dedicated for phage therapy of bacterial infections and tumors and for production of phage deriving pharmaceutical preparations.
摘要翻译：一种制备具有增加的抗菌活性的纯化噬菌体制剂的方法，其中从噬菌体的细菌裂解物获得有利地在溶菌酶，螯合因子和洗涤剂的存在下以连续方式在膜上进行超滤，所述噬菌体含有高分子量制备，没有细菌细胞壁和其他污染物，没有毒素和内毒素，在细菌裂解试验中有活性，其特征为色谱HPLC，SDS-PAGE电泳，免疫印迹，细菌裂解生物试验，专用于噬菌体治疗细菌感染和肿瘤以及用于生产噬菌体衍生的药物制剂。

59. 发明申请

WO2016055586A1 MODIFYING BACTERIOPHAGE 审中-公开
标题翻译：修饰细菌
公开(公告)号：WO2016055586A1
公开(公告)日：2016-04-14
申请号：PCT/EP2015/073296
申请日：2015-10-08
申请人： PHICO THERAPEUTICS LTD
发明人： FAIRHEAD, Heather , WILKINSON, Adam , BARNARD, Anne , SEVERI, Emmanuele , ANDERSON, Neil , PITTS, Katy
IPC分类号： C12N7/00 , A61K35/76
CPC分类号： A61K35/76 , A61K35/00 , C12N7/00 , C12N2795/00011 , C12N2795/10121 , C12N2795/10144
摘要： A method for modifying the genome of a lytic target phage, uses of the method and products thereof are described. Compositions comprising such phage are also described. The compositions may be formulated as a medicament, which are useful for human treatment and may treat various conditions, including bacterial infections.
摘要翻译：描述了用于修饰裂解靶噬菌体的基因组的方法，其方法及其产物的用途。还描述了包含这种噬菌体的组合物。组合物可以配制成药物，其可用于人类治疗，并且可以治疗各种病症，包括细菌感染。

60. 发明申请

WO2016055584A1 MULTIPLE HOST RANGE BACTERIOPHAGE WITH DIFFERENT TAIL FIBRES 审中-公开
标题翻译：多个主动范围细菌与不同的尾纤纤维
公开(公告)号：WO2016055584A1
公开(公告)日：2016-04-14
申请号：PCT/EP2015/073293
申请日：2015-10-08
申请人： PHICO THERAPEUTICS LTD
发明人： FAIRHEAD, Heather , WILKINSON, Adam , SEVERI, Emmanuele , ANDERSON, Neil , PITTS, Katy , BARNARD, Anne
IPC分类号： C12N7/00
CPC分类号： C12N7/00 , A61K35/74 , A61K35/76 , C12N2795/00011 , C12N2795/00032 , C12N2795/00043 , C12N2795/00045
摘要： Modified bacteriophage, uses thereof, and compositions containing the modified bacteriophage are described. The compositions are useful for human treatment and may treat various conditions, including bacterial infections.
摘要翻译：描述了改良的噬菌体，其用途和含有改性噬菌体的组合物。该组合物可用于人类治疗，并可治疗各种病症，包括细菌感染。

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