基本信息:
- 专利标题： 一种基于检测的细粒度蛋白酶功能预测方法
- 申请号：CN202510007356.6 申请日：2025-01-03
- 公开(公告)号：CN119943163A 公开(公告)日：2025-05-06
- 发明人： 苏冰 , 杨钊 , 陈嘉浩 , 文继荣
- 申请人： 中国人民大学
- 申请人地址： 北京市海淀区中关村大街59号
- 专利权人： 中国人民大学
- 当前专利权人： 中国人民大学
- 当前专利权人地址： 北京市海淀区中关村大街59号
- 代理机构： 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司
- 代理人： 尹振启
- 主分类号： G16B40/20
- IPC分类号： G16B40/20 ; G16B30/00 ; G06N3/0455 ; G06N3/0464 ; G06N3/08
摘要：
本公开提供一种基于检测的细粒度蛋白酶功能预测方法。首先，将初始输入蛋白质序列送入预训练好的ESM‑1b编码器得到通用初始嵌入式特征，构建基于编码器‑解码器结构的酶功能预测模型，包含蛋白质残基编码器和酶功能解码器；而后采用基于二分图匹配的模型训练方式对模型进行训练优化；之后构建基于注意力机制的功能特异性酶活性位点标注方法，在预测酶功能的同时定位出在酶促反应中重要的功能位点；模型最终实现对于单功能酶预测和多功能酶预测任务，并且根据预测结果进行有解释性的酶促反应活性位点标注。最终实现建立蛋白质结构与功能之间的联系。
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16B | 生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术 |
| ------G16B40/00 | 特别适用于生物统计学的ICT；特别适用于与生物信息学相关的机器学习或数据挖掘，例如知识发现或模式发现的ICT |
| --------G16B40/20 | .监督数据分析 |