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1. 发明申请

WO2016191344A1 BROAD-SPECTRUM SEROLOGICAL DIAGNOSTICS AND USES THEREOF 审中-公开
标题翻译：广谱光谱诊断及其用途
公开(公告)号：WO2016191344A1
公开(公告)日：2016-12-01
申请号：PCT/US2016/033722
申请日：2016-05-23
申请人： UNIVERSITY OF HOUSTON SYSTEM
发明人： VARADARAJAN, Navin , ADOLACION, Jay, R T. , WILLSON, Richard, C.
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/543 , G01N33/68 , C12N15/10 , C40B40/10
CPC分类号： C12N15/1062 , C12N15/10 , C12N15/1037 , C12Q1/68 , C40B40/10 , G01N33/543 , G01N33/68
摘要： In some embodiments, the present disclosure pertains to method of screening a biological sample for a plurality of diseases. In some embodiments, such a method comprises obtaining a biological sample from a subject in need thereof. In some embodiments, the biological sample comprises a plurality of biomarkers. In some embodiments, each of the plurality of biomarkers is specific for at least one disease. In some embodiments, the method comprises contacting the biological sample with a display library of peptides. In some embodiments, each peptide in the library may have a unique amino acid sequence. In some embodiments, each of the peptides is physically linked to a nucleic acid sequence that identifies of encodes the peptide. In some embodiments, at least one of the peptides is capable of binding to at least one of the biomarkers in the biological sample. In some embodiments, the method comprises separating the bound peptide particles from the unbound peptide particle. In some embodiments, the method comprises eluting the bound peptide particles from the bound state. In some embodiments, the method comprises determining the identity of the nucleic acid sequences physically linked to the bound peptide particles. In some embodiments, the method comprises comparing the sequences thus obtained to a database of sequences representing a plurality of biomarkers of diseases.
摘要翻译：在一些实施方案中，本公开涉及筛选多种疾病的生物样品的方法。在一些实施方案中，这种方法包括从有需要的受试者获得生物样品。在一些实施方案中，生物样品包含多个生物标志物。在一些实施方案中，多个生物标志物中的每一个对于至少一种疾病是特异性的。在一些实施方案中，该方法包括使生物样品与肽的展示文库接触。在一些实施方案中，文库中的每个肽可以具有唯一的氨基酸序列。在一些实施方案中，每个肽与识别编码肽的核酸序列物理连接。在一些实施方案中，至少一种肽能够结合生物样品中的至少一种生物标志物。在一些实施方案中，该方法包括从未结合的肽颗粒分离结合的肽颗粒。在一些实施方案中，该方法包括从结合状态洗脱结合的肽颗粒。在一些实施方案中，该方法包括确定与结合的肽颗粒物理连接的核酸序列的身份。在一些实施方案中，该方法包括将由此获得的序列与表示多种疾病生物标志物的序列的数据库进行比较。

2. 发明申请

WO2015175747A1 BARCODED PEPTIDES 审中-公开
公开(公告)号：WO2015175747A1
公开(公告)日：2015-11-19
申请号：PCT/US2015/030706
申请日：2015-05-14
申请人： EVORX TECHNOLOGIES, INC.
发明人： FIACCO, Stephen, V. , HARDY, Amanda, N. , TAKAHASHI, Terry, T.
IPC分类号： C07K19/00 , C12N15/11 , C12Q1/68
CPC分类号： C12N15/1062 , C07H21/02 , C07K19/00 , C12N15/11
摘要： Disclosed are peptide-mRNA fusion products, oligoribonucleotide structures, and methods of producing and using the same.
摘要翻译：公开了肽-MMI融合产物，寡核糖核苷酸结构，以及生产和使用它们的方法。

3. 发明申请

WO2015084861A1 DIRECTED EVOLUTION OF MULTIVALENT GLYCOPEPTIDES THAT TIGHTLY BIND TO TARGET PROTEINS 审中-公开
标题翻译：针对特定蛋白质的多种糖蛋白的指导性进展
公开(公告)号：WO2015084861A1
公开(公告)日：2015-06-11
申请号：PCT/US2014/068186
申请日：2014-12-02
申请人： BRANDEIS UNIVERSITY , THE GENERAL HOSPITAL CORPORATION
发明人： KRAUSS, Isaac, J. , HORIYA, Satoru , GUILLEN SCHLIPPE, Yollete, V.
IPC分类号： C12P21/04 , C12N15/62 , C07K9/00
CPC分类号： C12N15/1058 , A61K39/21 , A61K2039/575 , C07K16/1063 , C07K19/00 , C07K2317/76 , C07K2317/92 , C07K2319/91 , C12N15/1062 , C12N2740/16122 , C12N2740/16134 , G01N33/6845 , G01N2405/00 , Y02A50/53 , Y02A50/57 , Y02A50/60
摘要： The invention relates to a method for selecting a glycopolypeptide that binds to a target protein, the method including the steps of providing a pool of glycopolypeptides fused via puromycin linker to an encoding mRNA-cDNA duplex; combining the pool with a target protein to form a mixture; incubating the mixture for a period of time sufficient to allow any target protein to bind to one or more of the glycopolypeptides, thereby forming glycopolypeptide-target protein complexes; and isolating from the mixture the glycopolypeptide-target protein complexes, thereby identifying a plurality of selected glycopolypeptides.
摘要翻译：本发明涉及一种选择与靶蛋白结合的糖多肽的方法，所述方法包括以下步骤：通过嘌呤霉素接头融合到编码mRNA-cDNA双链体上的糖多肽池; 将池与目标蛋白结合形成混合物; 将混合物温育足以允许任何靶蛋白结合一种或多种糖多肽的时间，从而形成糖多肽 - 靶蛋白复合物; 并从混合物中分离出糖多肽 - 靶蛋白复合物，从而鉴定出多种选择的糖多肽。

4. 发明申请

WO2014200933A1 OBTAINING INFORMATION FROM SINGLE CELLS WITHIN POPULATIONS USING DNA ORIGAMI NANOSTRUCTURES 审中-公开
标题翻译：使用DNA ORIGAMI NANOSTRUCTURES从人群中获取单细胞信息
公开(公告)号：WO2014200933A1
公开(公告)日：2014-12-18
申请号：PCT/US2014/041581
申请日：2014-06-09
申请人： ARIZONA BOARD OF REGENTS ON BEHALF OF ARIZONA STATE UNIVERSITY , BLATTMAN, Joseph , YAN, Hao , SCHOETTLE, Louis , WEI, Xixi
发明人： BLATTMAN, Joseph , YAN, Hao , SCHOETTLE, Louis , WEI, Xixi
IPC分类号： C12N15/87 , C07H21/04 , B82Y5/00
CPC分类号： C12N15/1062 , B82Y5/00 , B82Y15/00 , C12Q1/6806 , C12Q1/6816 , C12Q1/6881 , C12Q2600/16 , C12Q2563/155
摘要： Methods for construction of DNA origami nanostructures, as well as for binding, isolation, linking, and deep sequencing information, such as both of TCR alpha and beta CDR3 mRNA, from individual cells within a mixed population of cells without the need for single cell sorting.
摘要翻译：用于构建DNA折纸纳米结构的方法，以及结合，分离，连接和深度测序信息（例如TCRα和βCD3mRNA两者），来自混合细胞群体内的各个细胞，而不需要单细胞分选。

5. 发明申请

WO2014119600A1 Ｆｌｅｘｉｂｌｅ　Ｄｉｓｐｌａｙ法审中-公开
标题翻译：灵活显示方法
公开(公告)号：WO2014119600A1
公开(公告)日：2014-08-07
申请号：PCT/JP2014/051907
申请日：2014-01-29
申请人：ペプチドリーム株式会社
发明人：リード　パトリック , 佐々木　亨 , 村上　裕
IPC分类号： C12N15/09 , C12P19/34 , C40B50/06
CPC分类号： C12N15/1062 , C12N15/1058
摘要：　進化分子工学により有用なタンパク質、ペプチド、ペプチドアナログを選択する際に用いられる改良された方法を提供する。　鋳型DNAライブラリーを加えることで、鋳型DNAライブラリーのmRNAへの転写、mRNAとリンカーとの結合、mRNAの翻訳、翻訳産物との結合を介して、翻訳産物／リンカー／mRNA複合体を形成させる工程を反応系中で自動的に行うことを可能にする、転写－リンカー結合－翻訳反応カップリング反応系であって、転写に必要な因子、翻訳に必要な因子、及びリンカーを含む、前記反応系。
摘要翻译：提供了一种改进的方法，用于使用分子进化工程技术选择有用的蛋白质，肽和肽类似物。由转录，接头结合和翻译反应组成的偶联反应体系，通过加入模板DNA文库，形成翻译产物/接头/ mRNA复合物的方法可以通过模板DNA的转录自动进行反应体系文库到mRNA，mRNA与接头的结合，mRNA的翻译和与翻译产物的结合，所述反应体系含有转录所需的因子，翻译所需的因子和连接体。

6. 发明申请

WO2013170000A1 METHODS AND COMPOSITIONS FOR ACTIVITY DEPENDENT TRANSCRIPTOME PROFILING 审中-公开
标题翻译：活动相关代码描述的方法和组合
公开(公告)号：WO2013170000A1
公开(公告)日：2013-11-14
申请号：PCT/US2013/040305
申请日：2013-05-09
申请人： THE ROCKFELLER UNIVERSITY
发明人： FRIEDMAN, Jeffrey, M. , KNIGHT, Zachary A. , TAN, Keith , BIRSOY, Kivan
IPC分类号： C12Q1/68 , C07H21/00 , C12P19/34
CPC分类号： C12N15/1041 , C07K14/001 , C12N15/1006 , C12N15/1062 , C12Q1/6809 , C12Q2537/159 , C12Q2563/131
摘要： Disclosed herein are methods, compositions, and kits for isolating actively translated mRNA from heterogeneous cell populations. Also disclosed herein are methods, compositions, and kits for identifying cell types that respond to stimuli in heterogeneous cell populations.
摘要翻译：本文公开了用于从异种细胞群体分离主动翻译的mRNA的方法，组合物和试剂盒。本文还公开了用于鉴定响应异种细胞群体中的刺激的细胞类型的方法，组合物和试剂盒。

7. 发明申请

WO2013155555A1 PEPTIDES FOR THE BINDING OF NUCLEOTIDE TARGETS 审中-公开
标题翻译：核心目标结合的肽
公开(公告)号：WO2013155555A1
公开(公告)日：2013-10-24
申请号：PCT/AU2013/000387
申请日：2013-04-16
申请人： THE UNIVERSITY OF WESTERN AUSTRALIA , THE STATE BOARD OF HIGHER EDUCATION ON BEHALF OF THE UNIVERSITY OF OREGON
发明人： BARKAN, Alice , SMALL, Ian , ROJAS, Margarita , BOND, Charles , FUJII, Sota , CHONG, Yee Seng
IPC分类号： C07K14/415 , C07K19/00 , A61K38/16 , C12N15/09
CPC分类号： C07K14/001 , A61K38/00 , C07K14/415 , C07K2319/24 , C07K2319/50 , C12N15/1062 , C12N15/67 , C12N15/8214 , C12N15/8216
摘要： A method of regulating expression of a gene in a cell is described, comprising the step of introducing into the cell a recombinant polypeptide comprising a PPR RNA-binding domain which itself comprises at least a pair of PPR RNA base-binding motifs. The PPR RNA base- binding motifs of the PPR RNA-binding domain are operably capable of binding the target RNA molecule with a target RNA sequence. Recombinant polypeptides comprising at least one PPR RNA-binding domain capable of binding to target RNA sequence are also described, together with fusion proteins comprising the recombinant PPR RNA-binding domains as well as isolated nucleic acids useful in preparing the recombinant polypeptides described. Recombinant vectors; compositions comprising the recombinant polypeptides; isolated nucleic acids; recombinant vectors; host cells comprising same; use of same in the manufacture of a medicament for regulating gene expression; as well as systems and kits for regulating gene expression are also described.
摘要翻译：描述了调节细胞中基因表达的方法，其包括将包含本身包含至少一对PPR RNA碱基结合基序的PPR RNA结合结构域的重组多肽引入细胞的步骤。 PPR RNA结合结构域的PPR RNA碱基结合基序可操作地能够将靶RNA分子与靶RNA序列结合。还描述了包含能够结合靶RNA序列的至少一个PPR RNA结合结构域的重组多肽，以及包含重组PPR RNA结合结构域的融合蛋白以及可用于制备所述重组多肽的分离的核酸。重组载体; 包含重组多肽的组合物; 分离核酸; 重组载体; 包含其的宿主细胞; 在制备用于调节基因表达的药物中的用途; 还描述了用于调节基因表达的系统和试剂盒。

8. 发明申请

WO2006135654A2 POLYMER EVOLUTION VIA TEMPLATED SYNTHESIS RELATED APPLICATIONS 审中-公开
标题翻译：聚合物通过模拟合成方法进行相关应用
公开(公告)号：WO2006135654A2
公开(公告)日：2006-12-21
申请号：PCT/US2006/022207
申请日：2006-06-07
申请人： PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE , LIU, David, R. , ROSENBAUM, Daniel, M.
发明人： LIU, David, R. , ROSENBAUM, Daniel, M.
CPC分类号： C12N15/1068 , C12N15/1062
摘要： The invention provides a method for producing polymers having a desirable property, for example, catalytic activity or binding activity, via evolutionary nucleic acid-mediated chemistry.
摘要翻译：本发明提供了一种通过进化核酸介导化学制备具有所需性质，例如催化活性或结合活性的聚合物的方法。

9. 发明申请

WO2005072087A3 SYSTEM AND METHODS FOR NUCLEIC ACID AND POLYPEPTIDE SELECTION 审中-公开
标题翻译：用于核酸和多肽选择的系统和方法
公开(公告)号：WO2005072087A3
公开(公告)日：2005-11-03
申请号：PCT/US2004041380
申请日：2004-12-10
申请人： PROTEONOVA INC , WILLIAMS RICHARD B
发明人： WILLIAMS RICHARD B
IPC分类号： C07H21/04 , C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6811 , C12N15/1062
摘要： This invention relates generally to systems and methods for identifying and selecting, desired proteins or nucleic acid molecules by linking mRNA, with known or unknown sequences, to its translated protein to form a cognate pair. The cognate pair is selected based upon desired properties of the protein or the nucleic acid. This method also includes the evolution of a desired protein or nucleic acid molecule by amplifying the nucleic acid portion of the selected cognate pair, introducing variation into the nucleic acid, translating the nucleic acid, attaching the nucleic acid to its protein to form a second cognate pair, and re-selecting this cognate pair based upon desired properties. Modified mRNAs operable to crosslink to tRNAs are also provided. Methods of producing a psoralen monoadduct or a crosslink are also provided. Methods of producing mRNA libraries and vaccines are also provided.
摘要翻译：本发明一般涉及通过将mRNA与已知或未知序列连接到其翻译的蛋白质以形成同源对来鉴定和选择所需蛋白质或核酸分子的系统和方法。基于蛋白质或核酸的所需性质选择同源对。该方法还包括通过扩增所选择的同源对的核酸部分，引入核酸的变异，翻译核酸，将核酸连接到其蛋白质以形成第二个同源物，从而演化期望的蛋白质或核酸分子并且基于所需的属性重新选择该同源对。还提供了可操作以交联至tRNA的修饰的mRNA。还提供了补骨脂素单加成物或交联剂的制备方法。还提供了产生mRNA文库和疫苗的方法。

10. 发明申请

WO03089454A2 NUCLEIC ACID-PEPTIDE DISPLAY LIBRARIES CONTAINING PEPTIDES WITH UNNATURAL AMINO ACID RESIDUES, AND METHODS OF MAKING SAME 审中-公开
标题翻译：含有含有氨基酸残基的肽的核酸显示图谱及其制备方法
公开(公告)号：WO03089454A2
公开(公告)日：2003-10-30
申请号：PCT/US0312206
申请日：2003-04-18
申请人： CALIFORNIA INST OF TECHN , ROBERTS RICHARD W , FRANKEL ADAM , LI SHUWEI
发明人： ROBERTS RICHARD W , FRANKEL ADAM , LI SHUWEI
IPC分类号： C07K1/04 , C07K14/00 , C12N1/21 , C12N15/10 , C12P21/02 , C40B40/06 , C40B40/10 , C40B60/14 , C07K
CPC分类号： C40B40/06 , B01J2219/00358 , B01J2219/00722 , B01J2219/00725 , B01J2219/00729 , C07K1/047 , C07K14/003 , C12N15/1062 , C12N15/67 , C40B30/04 , C40B40/10 , C40B50/08 , C40B60/14
摘要： Libraries of nucleic acid-peptide fusion molecules are provided, wherein the peptide component of the fusion molecules contains one or more unnatural amino acid residues. Methods of making such libraries also are provided, as are methods of screening such libraries to identify peptides having desirable characteristics. Accordingly, isolated nucleic acid-peptide molecules also are provided, wherein the peptide component has a desirable characteristic, and is composed partially or entirely of unnatural amino acid residues.
摘要翻译：提供核酸 - 肽融合分子的文库，其中融合分子的肽组分含有一个或多个非天然氨基酸残基。还提供了制备此类文库的方法，以及筛选此类文库以鉴定具有所需特征的肽的方法。因此，还提供了分离的核酸 - 肽分子，其中肽组分具有所需的特征，并且部分或全部由非天然氨基酸残基构成。

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