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2. 发明申请

WO2007015459A1 大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための遺伝子セット审中-公开
标题翻译：用于预测淋巴结转移灶的基因组预测
公开(公告)号：WO2007015459A1
公开(公告)日：2007-02-08
申请号：PCT/JP2006/315143
申请日：2006-07-31
申请人：国立大学法人大阪大学 , 竹政伊知朗 , 田崎武信 , 園田光 , 樋口浩文 , 松原謙一
发明人：竹政伊知朗 , 田崎武信 , 園田光 , 樋口浩文 , 松原謙一
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/09
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/112 , C12Q2600/158
摘要：　大腸癌のリンパ節転移の有無を予測するための方法及び当該方法に利用できる遺伝子セットを提供する。下記（１）～（４）の工程を含む、大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための遺伝子セットの選択方法：（１）組織病理学的判定によりリンパ節転移の有無が明らかにされた患者の大腸癌原発巣組織における遺伝子発現情報を、教師あり学習解析方法を少なくとも一つ含む、４以上の解析方法で解析することにより、リンパ節転移の有無を正分類率７５％以上で分類できる遺伝子群をそれぞれの解析方法において選定する工程、（２）（１）で用いたそれぞれの解析方法で選定された遺伝子群から、何れの解析方法でも共通して選定された共通遺伝子を選択する工程、（３）前記遺伝子発現情報を解析することにより、任意の２以上の遺伝子の組合せの中から、リンパ節転移の有無の分類を指示し、交互作用を示す遺伝子の組合わせを選択する工程、及び（４）前記共通遺伝子及び前記遺伝子の組合わせを説明変数として、リンパ節転移の有無を応答としたロジスティック回帰モデルにおける変数選択を行う工程；該選択方法により選択される、大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための遺伝子セット；及び該遺伝子セットを用いることを特徴とする大腸癌リンパ節転移の有無を予測するための方法。
摘要翻译：公开了一种预测结肠直肠癌淋巴结转移的存在或不存在的方法。还公开了可用于该方法的一组基因。一种选择用于预测结肠直肠癌淋巴结转移存在或不存在的一组基因的方法，所述方法包括以下步骤（1）至（4）：（1）分析基因表达的信息通过至少一种涉及至少一种监督学习分析方法的至少四种分析方法，通过组织病理学测试确定已经确定具有结肠直肠癌淋巴结转移的患者的结肠直肠癌的原发性病变，从而选择一组用于确定每种分析方法的正确分类率为75％以上的淋巴结转移的存在或不存在; （2）在步骤（1）的所有分析方法中选择选自基因群的共同基因; （3）分析上述基因表达信息，将两种或多种基因的任意组合分配淋巴结转移的存在或不存在，然后从组合中选择显示相互作用的基因组合; （4）在逻辑回归模型中进行变量选择，使用共同基因和基因组合作为解释变量给出有关淋巴结转移存在或不存在的答案; 通过该方法选择的一组用于预测结肠直肠癌淋巴结转移的存在或不存在的基因; 以及通过使用该组基因来预测结肠直肠癌淋巴结转移的存在或不存在的方法。

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