专利快速检索-快速检索全球专利，免费商用专利数据库-IPRDB

41. 发明专利

JP4686188B2 Bioinformatics techniques and thereby resulting protein for identifying surface immobilized proteins from Gram-positive bacteria 有权
公开(公告)号：JP4686188B2
公开(公告)日：2011-05-18
申请号：JP2004536258
申请日：2003-09-15
申请人：インヒビテックス,インコーポレイテッド , ザテキサスエイアンドエムユニバースティシステム , ザユーエービーリサーチファンデイション
发明人：クー，イ , シュタナム，ナラヤナ , ヴイシランパ，ジユコ , エムパティ，ヨセフ , テイハトキンス，ジエフ , フック，マグナス , ホール，アンドレア , ポヌライ，カルテ , ヂー．ボーデンマリア
IPC分类号： C12N15/09 , G01N33/53 , A61K9/12 , A61K35/16 , A61K38/00 , A61K39/00 , A61K39/395 , A61P31/04 , C07K14/195 , C07K14/315 , C07K16/12 , C12P21/08 , G01N33/569 , G01N33/68 , G06F19/16 , G06F19/22
CPC分类号： G01N33/56916 , A61K38/00 , C07K14/315 , C07K16/1267 , G01N33/56911 , G06F19/16 , G06F19/22 , Y02A90/26 , Y10S435/975
摘要： A bioinformatic method for identifying and isolating proteins and peptides with MSCRAMM®-like characteristics from Gram positive bacteria, such as Enterococcus, Staphylococcus, Streptococcus and Bacillus bacteria, and proteins and peptides obtained thereby are provided which can be utilized in methods to prevent and treat infections caused by Gram-positive bacteria. The method involves identifying from sequence information those proteins with a putative C-terminal LPXTG (SEQ ID NO:1) cell wall sorting signal and other structural similarities to MSCRAMM® proteins having the LPXTG-anchored cell wall proteins. The MSCRAMM® proteins and immunogenic regions therein that are identified and isolated using the present invention may be useful in the diagnosis, treatment or prevention of Gram positive bacterial infections.

42. 发明专利

JP2011514509A Method for determining a correlation residues in proteins or other biopolymers using molecular dynamics 有权
公开(公告)号：JP2011514509A
公开(公告)日：2011-05-06
申请号：JP2010545577
申请日：2009-02-05
申请人：ザイムワークス,インコーポレイテッド
发明人：タン，パウウェル，パトリック，チェン , ディキシット，サージット，ビー． , ムレゲール，ヨハネス , ラリオ，ポーラ，アイ． , ロディンガー，トーマス
IPC分类号： G01N33/48 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12N5/10 , C12N9/58 , C12N15/09 , G01N33/68
CPC分类号： G01N33/68 , G06F19/12 , G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/26
摘要：【課題】バイオポリマー中の相関残基を決定するための方法を提供する。
【解決手段】本発明は、分子が利用可能な配座空間のサンプリングに基づいて、バイオポリマープロファイルとバイオポリマーの構造単位（残基）同士の相関とを決定する方法およびシステムを提供する。これら構造単位同士の相関は、タンパク質の結合残基ネットワークなど、バイオポリマー内のネットワークを見出すのにさらに使用することができる。本発明は、配座クラスタ化および本明細書に記載の方法から得られた情報を使用した、ポリペプチド、核酸、および炭水化物を含めたバイオポリマーの設計および設計操作も提供する。
【選択図】図１

43. 发明专利

JP4469833B2 Designed herbicide-resistant product based on the structure 有权
公开(公告)号：JP4469833B2
公开(公告)日：2010-06-02
申请号：JP2006328154
申请日：2006-12-05
申请人：アメリカンシアナミドコンパニー
发明人：オット，カール−ハインツ , カケフダ，ゲンイチ , クウァフ，ジェ−グ , ダブリュ．ストックトン，ジェラルド
IPC分类号： A01H5/00 , C12N15/09 , A01M21/00 , C07K14/415 , C12N1/15 , C12N1/21 , C12N5/10 , C12N9/88 , C12N15/82 , C12P21/02 , C12R1/19
CPC分类号： C12N9/88 , C12N15/8278 , G06F19/16
摘要： Disclosed herein are structure-based modelling methods for the preparation of acetohydroxy acid synthase (AHAS) variants, including those that exhibit selectively increased resistance to herbicides such as imidazoline herbicides and AHAS inhibiting herbicides. The invention encompasses isolated DNAs encoding such variants, vectors that include the DNAs, and methods for producing the variant polypeptides and herbicide resistant plants containing specific AHAS gene mutations. Methods for weed control in crops are also provided.

44. 发明专利

JP2010509206A Active thermal stability protein in the recombinant as well as the design and biosynthesis of the process that 有权
公开(公告)号：JP2010509206A
公开(公告)日：2010-03-25
申请号：JP2009535190
申请日：2007-11-06
申请人：カウンスィルオブサイエンティフィックアンドインダストリアルリサーチCouncil Of Scientific & Industrial Research
发明人：アハメド、シュビア , カプーア、ディヴィヤ , グプタサーマ、プルナナンダ , シャルマ、スワティ , シン、バルヴィンダー , スブラマニアン、カーティケヤン , ダット、マニッシュ , チャンドラヤン、サニーヴ、クマール
IPC分类号： C07K14/195 , C12N9/24 , C12N9/28 , C12N9/42 , C12N9/50 , C12N15/09
CPC分类号： C12N9/2437 , C12N9/96 , C12Y302/01004 , G06F19/16 , G06F19/22
摘要：本発明は、ベータシートに基づくタンパク質構造の表面の一部または全体の、とりわけ酵素に重点を置いた改変についての研究に関する。構造改変は、基質／リガンド結合および触媒作用に関与する表面の領域のみを改変するためにベータシートの構造的特徴を利用することによって１つのタンパク質の表面の一部または全部を、重ね合せ可能なポリペプチド主鎖の相同タンパク質の表面上に置き換えること（ｓｕｐｐｌａｎｔｉｎｇ）／移植することによって行われる。本発明はまた、最適機能ｐＨおよび温度の中活性機能特徴を備えた熱安定性タンパク質を生成するための、中温菌ホモログの活性表面が移植される好熱菌酵素の熱安定性足場の大半を保持する新規なタンパク質の生成などの、自然の進化によっては通常組み合わされない生物の異なるドメインからの酵素／タンパク質の特徴を選択的に組み合せるための本表面操作方法に関するものである。
【選択図】図１

45. 发明专利

JPWO2007139037A1 ケミカルゲノム情報に基づく、タンパク質−化合物相互作用の予測と化合物ライブラリーの合理的設計有权
公开(公告)号：JPWO2007139037A1
公开(公告)日：2009-11-19
申请号：JP2008517917
申请日：2007-05-25
申请人：国立大学法人京都大学
发明人：恭史奥野 , 恭史奥野 , 慶種石 , 慶種石 , 辻本　豪三 , 豪三辻本
IPC分类号： G06F19/16 , G06F19/24
CPC分类号： C40B50/02 , G06F19/16 , G06F19/24 , G06F19/706 , G06N99/005
摘要：本発明は、化合物のスクリーニングを合理的かつ効率的に行うことを目的とする。第1の化学物質群の空間座標を表す第1空間と第2の化学物質群の空間座標を表す第2空間とを定義し、第1の化学物質群は第1の特徴量により特徴付けられ、第2の化学物質群は第2の特徴量により特徴付けられ、前記第1空間と前記第2空間との相関が最大になるように、多変量解析手法、機械学習法およびそれらの等価方法からなる群より選択される手法によって、該第1空間の座標および該第2空間の座標を写像変換することによって解決した。具体的には、タンパク質群と化合物群の相互作用様式をタンパク質の特徴量(配列や発現情報などの生物学的情報)と化合物の特徴量(化学構造、物性などの化学物質情報)の統計的パターンとして機械学習し、それに基づく相互作用予測を実現したシステムであり、これにより上記の問題点が解決された。

46. 发明专利

JP2009538132A Systems and methods for analyzing the nanoreporter 有权
公开(公告)号：JP2009538132A
公开(公告)日：2009-11-05
申请号：JP2009512084
申请日：2007-05-21
申请人：ナノストリングテクノロジーズ, インコーポレイテッド
发明人：ジェンク−ネンホワン， , ジェフリーディー．ミットン，
IPC分类号： C12M1/34 , C12Q1/68 , G01N21/27 , G01N21/64 , G01N33/53 , G01N37/00 , G06F19/16 , G06F19/20
CPC分类号： B82Y30/00 , C40B20/04 , C40B70/00 , G06F19/16 , G06F19/20
摘要：基板上に置かれた試料内のプローブの存在を検出するための方法、コンピュータ、およびコンピュータプログラムの製品が提供される。該プローブは、複数の空間的に配置された標識を含む。データ記憶モジュールは複数の光イメージを記憶し、ここに、各光イメージは、複数の異なる波長範囲における対応する波長範囲において試料からの光を有する。標識同定モジュールは、基板上の相互に近接する複数の光イメージにおける複数の標識を同定する。複数の標識の空間的順序は、複数の標識のストリング配列を決定する。プローブ同定モジュールは、複数の標識のストリング配列が有効なレポーター配列を含むか否かを決定する。

47. 发明专利

JP4343222B2 Drug-metabolizing enzyme prediction apparatus 有权
公开(公告)号：JP4343222B2
公开(公告)日：2009-10-14
申请号：JP2006512181
申请日：2004-03-31
申请人：富士通株式会社 , 康山添
发明人：マルティンスィロイ，ホセ , 正人北島 , 康山添
IPC分类号： C40B30/02 , G01N33/48 , G06F19/00 , G06F19/16 , G06F19/18
CPC分类号： G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/706

48. 发明专利

JP2009531028A Stabilized polypeptide compound 有权
公开(公告)号：JP2009531028A
公开(公告)日：2009-09-03
申请号：JP2009500530
申请日：2007-03-19
申请人：バイオジェン・アイデック・エムエイ・インコーポレイテッド
发明人：シウフェンウー， , スコットグレイザー， , リサジェイ．クローナー， , ウィリアムビー．スナイダー， , スティーブンデマレスト， , ブライアンロバートミラー， , アレクセイアレクサンドロビッチルゴフスコイ， , ノーマンワン，
IPC分类号： C12N15/09 , C07K16/00 , C07K16/46 , C12N1/15 , C12N1/19 , C12N1/21 , C12N5/10 , C12P21/02 , C40B30/10 , G01N33/15 , G01N33/50
CPC分类号： G06F19/16 , A61K39/395 , A61K2039/505 , A61K2039/507 , C07K16/00 , C07K16/2851 , C07K16/2878 , C07K16/30 , C07K2317/21 , C07K2317/24 , C07K2317/31 , C07K2317/34 , C07K2317/55 , C07K2317/622 , C07K2317/624 , C07K2317/73 , C07K2317/92 , C07K2319/30 , G06F19/18 , G06F19/22 , Y02A90/26
摘要：本発明は、少なくとも部分的に、安定化されたｓｃＦｖ分子よりなる安定化された結合分子の開発およびそのような安定化された分子の作製方法に基づく。加えて、本発明は、抗体分子のような安定な蛋白質を設計するための方法を提供する。一つの実施形態において、本発明の安定化されたｓｃＦｖ分子は、安定な多特異的、例えば、二特異的分子を生産するのに特に有用である。本発明の安定化された結合分子、例えば、多特異的結合分子は培養において安定に発現させることができ、大規模生産に適しており、かつイン・ビボで安定である。

49. 发明专利

JPWO2007116787A1 ＲＮＡの二次構造予測方法、予測装置及び予測プログラム有权
公开(公告)号：JPWO2007116787A1
公开(公告)日：2009-08-20
申请号：JP2008509798
申请日：2007-03-28
申请人： Necソフト株式会社
发明人：穣秋冨 , 穣秋冨
IPC分类号： G06F17/30 , G06F19/16 , G06F19/22
CPC分类号： G06F19/16 , G06F19/22
摘要：シュードノット構造など二次構造の予測が困難であった二次構造の予測を行い得るRNAの二次構造予測方法及びこの予測方法を用いたRNAの二次構造予測装置を提供する。本発明によるRNAの二次構造予測方法は、対象となるRNA配列のうちステム構造を形成し得る塩基を探索する工程と、前記ステム構造を構成する各塩基の自由エネルギーに基づいて、ステム構造候補を設定する工程と、前記ステム構造候補から確定ステム構造を設定する工程と、前記確定ステム構造の塩基情報に基づいて、前記RNA配列の配列構造状態を調査する工程と、前記配列構造状態に基づいて、前記RNA配列を構成する各塩基の配列エネルギー状態を計算する工程と、前記確定ステム構造を反映した前記RNA配列の二次構造の配列エネルギー状態と、前記ステム構造候補から選択した追加ステム構造候補を該二次構造に反映した新たな二次構造の配列エネルギー状態とに基づいて、該追加ステム構造候補を新たな確定ステム構造と設定する工程と、を有することを特徴とする。

50. 发明专利

JP2008283943A Method for predicting secondary structure of nucleic acid sequence, prediction apparatus for the secondary structure of nucleic acid sequence and prediction program for the secondary structure of nucleic acid sequence 有权
标题翻译：核酸序列二级结构预测方法，核酸序列二级结构预测装置及核酸序列二级结构预测方案
公开(公告)号：JP2008283943A
公开(公告)日：2008-11-27
申请号：JP2007134529
申请日：2007-05-21
申请人： Nec Soft Ltd , Necソフト株式会社
发明人： AKITOMI MINORU
IPC分类号： C12Q1/68 , C12M1/00 , C12N15/09 , G06F19/00 , G06F19/16
CPC分类号： G06F19/16
摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for predicting the secondary structure of a nucleic acid sequence predicting, not only the overall similarity but also local similarity of the secondary structure of a nucleic acid sequence, and to provide a prediction apparatus and a prediction program for the secondary structure of a nucleic acid sequence by performing the method. SOLUTION: The prediction method has a step of extracting the structural element of the secondary structure of a nucleic acid sequence, and a step of evaluating the similarity of the structural elements of the nucleic acid sequence to be evaluated, based on the characteristic vector of the structural element. COPYRIGHT: (C)2009,JPO&INPIT

你已经成功收藏专利！

检索式保存成功!

IPRDB

热门服务

关于我们

友情链接

联系方式