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    • 3. 发明专利
    • System and method for detecting gene mutation
    • 用于检测基因突变的系统和方法
    • JP2009278876A
    • 2009-12-03
    • JP2008131243
    • 2008-05-19
    • Shimadzu Corp株式会社島津製作所
    • KATO SHINGOSUDO KOJI
    • C12Q1/68C12N15/09G01N27/62
    • C12Q1/6827C12Q2565/627C12Q2525/131C12Q2521/301
    • PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a system for detecting a gene mutation by which a quantitative change can accurately be detected.
      SOLUTION: The system for detecting the gene mutation encompasses: a spectrum generation mechanism 301 configured to acquire a first amplified product containing a specific site so that the specific site is amplified by a first PCR by using a specific site-oriented primer, and a second amplified product containing the specific site sandwiched by recognition sites of a restriction enzyme so that the first amplified product is amplified by a second PCR by using a recognition site introduction-oriented primer containing the recognition sites of the restriction enzyme, and to generate a mass spectrum of an oligonucleotide fragment containing the specific site, the oligonucleotide fragment being cut out from the second amplified product by using the restriction enzyme; an area ratio calculation mechanism 302 configured to calculate a calculated value of an area ratio of a peak of a wild-type sequence of the specific site and a peak of a mutation-type sequence of the specific site in the mass spectrum; and an abundance ratio calculation mechanism 303 configured to obtain a measured value of an abundance ratio of the wild-type sequence and the mutation-type sequence from the calculated value of the area ratio based on a relationship between a previously acquired area ratio and the abundance ratio of the wild-type sequence and the mutation-type sequence.
      COPYRIGHT: (C)2010,JPO&INPIT
    • 要解决的问题:提供一种用于检测可以准确检测定量变化的基因突变的系统。 解决方案:用于检测基因突变的系统包括:光谱产生机制301,被配置为获得含有特定位点的第一扩增产物,使得通过使用特异性位点取向引物通过第一PCR扩增特异性位点, 以及第二扩增产物,其含有夹在限制性内切酶的识别位点的特异位点,使得通过使用含有限制酶的识别位点的识别位点引入取向引物,通过第二PCR扩增第一扩增产物,并产生 含有特异性位点的寡核苷酸片段的质谱图,通过使用限制酶从第二扩增产物切出的寡核苷酸片段; 面积比计算机构302,用于计算特定部位的野生型序列的峰的面积比和质谱中特定部位的突变型序列的峰的计算值; 以及丰度比计算机构303,其基于前述获取的面积比与丰度之间的关系,从计算出的面积比的值中求出野生型序列和突变型序列的丰度比的测定值 野生型序列和突变型序列的比例。 版权所有(C)2010,JPO&INPIT
    • 8. 发明专利
    • 糖ペプチド解析装置
    • 糖肽分析仪
    • JP2015102475A
    • 2015-06-04
    • JP2013244499
    • 2013-11-27
    • 株式会社島津製作所
    • 村瀬 雅樹
    • G01N27/64H01J49/40H01J49/42H01J49/10G01N27/62
    • H01J49/009G01N33/6842G01N33/6851H01J49/40H01J49/42C12Q1/6872C12Q2565/627C40B20/08Y10T436/24
    • 【課題】糖ペプチドのグリコフォームの定量及び構造解析を、面倒な試料前処理を行うことなく効率良く行う。 【解決手段】イオントラップにイオンを捕捉して質量分析するイオントラップ型質量分析部11と、試料から生成されたイオンをそのまま質量分析する飛行時間型質量分析部12とで同じ試料Sを分析し、マススペクトル作成部21はその結果からITマススペクトル、TOFマススペクトルを作成する。糖ペプチド検出部23はITマススペクトルから糖のニュートラルロスに関連したピークを検出する一方、TOFマススペクトルから分子のインタクトイオンに対応するピークを検出し、両スペクトルに共通のピークを糖ペプチドイオンとして検出する。定量解析部24はTOFマススペクトルに基づき糖ペプチドのグリコフォームの相対定量を行う。構造解析部25は試料Sに対するMS n 分析の結果を利用して、糖ペプチドの構造解析を行う。 【選択図】図1
    • 要解决的问题:有效地进行糖肽糖型的定量分析和结构分析,而不会进行麻烦的样品预处理。解决方案:通过离子阱型质谱部分11分析相同的样品S,其将离子捕获到离子阱中, 执行质谱分析和飞行时间质谱部分12,其直接对从样品中产生的离子进行质谱分析,质谱产生部分21从它们的结果产生IT质谱和TOF质谱。 糖肽检测部23从IT质谱检测与中性的糖损失相关的峰值,同时检测与TOF质谱对应的分子的完整离子的峰,并且检测作为糖肽离子的两个谱共同的峰。 定量分析部分24基于TOF质谱对糖肽的糖型进行相对定量测定。 结构分析部25通过对样品S进行MS分析的结果,对糖肽进行结构分析。