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    • 7. 发明公开
      EP2767834A2 Quantitative standard for mass spectrometry of proteins 有权
    • Quantitative standard for mass spectrometry of proteins
    • Quantatativer Standardfürdie Massenspektrometrie von Proteinen
    • EP2767834A2
    • 2014-08-20
    • EP14157821.1
    • 2012-04-04
    • Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. , Atlas Antibodies AB
    • Mann, Matthias , Straube, Werner , Zeiler, Marlis , Uhlén, Mathias , Lundberg, Emma
    • G01N33/68 , C07K19/00
    • G01N33/6848 , C07B2200/05 , C07K19/00 , C07K2319/00 , C07K2319/23 , C07K2319/24 , C07K2319/50 , C07K2319/705
    • The present invention provides a method of determining the absolute amount of a target polypeptide in a sample, said method comprising the following steps: (a) adding (aa) a fusion polypeptide to said sample, said fusion polypeptide comprising (i) at least one tag sequence and (ii) a subsequence of the target polypeptide; and (ab) a known absolute amount of a tag polypeptide comprising or consisting of said tag sequence according to (aa) to said sample, wherein said fusion polypeptide on the one hand is mass-altered as compared to said target polypeptide and said tag polypeptide on the other hand, for example, said fusion polypeptide on the one hand and said target polypeptide and said tag polypeptide on the other hand are differently isotope labeled; (b) performing proteolytic digestion of the mixture obtained in step (a); (c) subjecting the result of proteolytic digestion of step (b), optionally after chromatography, to mass spectrometric analysis; and (d) determining the absolute amount of said target polypeptide from (i) the peak intensities in the mass spectrum acquired in step (c) of said fusion polypeptide, said tag polypeptide and said target polypeptide and (ii) said known absolute amount of said tag polypeptide.
      Furthermore provided is a fusion polypeptide for the quantification of a target polypeptide by mass spectroscopy, wherein: said fusion polypeptide consists of 35 to 455 amino acid residues and comprises (i) a target region, which is a fragment of the target polypeptide, and (ii) a tag region, which is not a fragment of the target polypeptide, said target region consists of 15 to 205 amino acid residues and comprises at least two signature regions; said tag region consists of 20 to 250 amino acid residues and comprises at least two signature regions; and each signature region has the structure Y-Z-X 4-28 -Y-Z, wherein all Y:s are selected from one of (i)-(iv), wherein (i) is R or K, (ii) is Y, F, W or L, (iii) is E and (iv) is D and each X and each Z are independently any amino acid residue, provided that the Z:s are not P if the Y:s are selected from (i)-(iii); and each signature region comprises at least one amino acid residue comprising a heavy isotope.
    • 本发明提供了确定样品中靶多肽绝对量的方法，所述方法包括以下步骤：（a）将融合多肽加入（aa）所述样品，所述融合多肽包含（i）至少一种 标签序列和（ii）靶多肽的亚序列; 和（ab）已知绝对量的标签多肽，其包含或由所述（aa）所述标签序列组成，所述标签多肽与所述靶多肽和所述标签多肽相比，其一方面被质量改变 另一方面，另一方面，另一方面，所述融合多肽和所述靶多肽和所述标签多肽是不同的同位素标记的; （b）进行步骤（a）中获得的混合物的蛋白水解消化; （c）步骤（b）的蛋白水解消化结果，任选地进行色谱分析之后进行质谱分析; （d）从（i）在所述融合多肽，所述标签多肽和所述靶多肽的步骤（c）中获得的质谱中的峰强度和（ii）所述已知绝对量的 所述标签多肽。 此外提供了用于通过质谱法定量目标多肽的融合多肽，其中：所述融合多肽由35至455个氨基酸残基组成，并且包含（i）靶区域，其是靶多肽的片段，和（ ii）标签区，其不是靶多肽的片段，所述靶区由15至205个氨基酸残基组成，并且包含至少两个标记区; 所述标签区由20至250个氨基酸残基组成并且包含至少两个签名区域; 并且每个签名区域具有结构YZX 4-28 -YZ，其中所有Y：s选自（i） - （iv）中的一个，其中（i）是R或K，（ii）是Y，F，W 或L，（iii）为E，（iv）为D，每个X和Z各自独立地为任何氨基酸残基，条件是如果Y：s选自（i） - （iii ）; 并且每个签名区域包含至少一个包含重同位素的氨基酸残基。
    • 基本信息 添加关注 加入工作空间 PDF全文 PDF下载 全文下载 相似专利 双屏查看 权利要求书 说明书全文 Global Dossier Espacenet 法律信息 同族专利 专利引用
    • 8. 发明公开
      EP2732038A1 METHODS OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR LIKE EFFECTOR ASSEMBLY 有权
    • METHODS OF TRANSCRIPTION ACTIVATOR LIKE EFFECTOR ASSEMBLY
    • VERFAHREN ZUR TRANSKRIPTION EINERAKTIVATORÄHNLICHENEFFEKTORANORDNUNG
    • EP2732038A1
    • 2014-05-21
    • EP12814750.1
    • 2012-07-12
    • The General Hospital Corporation
    • JOUNG, J., Keith , SANDER, Jeffry, D.
    • C12N15/66 , C12N15/62 , C12N15/31 , C12Q1/68 , C07K19/00 , C07K14/24 , C12N1/00 , C12N5/00 , C40B40/06
    • C07K14/195 , C07K2319/00 , C07K2319/24 , C07K2319/41 , C07K2319/43 , C07K2319/80 , C12N9/22 , C12N15/1093 , C12N15/66 , C12P19/34 , C12P21/02 , C12Q1/6806 , C12Y301/00 , C40B40/08 , C40B50/06 , C12Q2521/501 , C12Q2563/149
    • The disclosure describes methods that include providing a first nucleic acid having a sequence encoding a first set comprising one or more transcription activator-like effector (TALE) repeat domains and/or one or more portions of one or more TALE repeat domains; contacting the first nucleic acid with a first enzyme, wherein the first enzyme creates a first ligatable end; providing a second nucleic acid having a sequence encoding a second set comprising one or more TALE repeat domains and/or one or more portions of one or more TALE repeat domains; contacting the second nucleic acid with a second enzyme, wherein the second enzyme creates a second ligatable end, and wherein the first and second ligatable ends are compatible; and ligating the first and second nucleic acids through the first and second ligatable ends to produce a first ligated nucleic acid, wherein the first ligated nucleic acid is linked to a solid support, and wherein the first ligated nucleic acid encodes a polypeptide comprising said first and second sets.
    • 本公开描述了包括提供具有编码包含一个或多个转录激活子样效应子（TALE）重复结构域和/或一个或多个TALE重复结构域的一个或多个部分的第一组的序列的第一核酸的方法; 使第一核酸与第一酶接触，其中第一酶产生第一可结合末端; 提供具有编码包含一个或多个TALE重复结构域和/或一个或多个TALE重复结构域的一个或多个部分的第二组的序列的第二核酸; 使所述第二核酸与第二酶接触，其中所述第二酶产生第二可连接末端，并且其中所述第一和第二可连接末端是相容的; 以及通过所述第一和第二可连接末端连接所述第一和第二核酸以产生第一连接的核酸，其中所述第一连接的核酸与固体支持物连接，并且其中所述第一连接的核酸编码包含所述第一和第二核酸的多肽 第二套
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