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    • 44. 发明专利
      ES2712173T3 Análisis multiplexado de loci polimórficos mediante consulta simultánea y detección mediada por enzimas 未知
    • Análisis multiplexado de loci polimórficos mediante consulta simultánea y detección mediada por enzimas
    • ES2712173T3
    • 2019-05-09
    • ES13189483
    • 2002-10-15
    • BIOARRAY SOLUTIONS LTD
    • LI ALICE XIANG , HASHMI GHAZALA , SEUL MICHAEL
    • C12N15/09 , C12P19/34 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q1/68
    • Método (A) de determinación simultánea de la composición de nucleótidos en sitios polimórficos designados correlacionados ubicados dentro de una o más secuencias de nucleótidos diana, comprendiendo dicho método las etapas siguientes: (a) proporcionar uno o más conjuntos de sondas, siendo capaz cada sonda de aparearse con una subsecuencia de dichas una o más secuencias de nucleótidos diana ubicadas dentro de un intervalo de proximidad a un primer sitio polimórfico designado, en el que cada sonda comprende una región de iniciación de elongación terminal capaz de aparearse con el primer sitio polimórfico designado, comprendiendo dicha región de iniciación de elongación terminal los 3-4 nucleótidos terminales del extremo 3' terminal de la sonda, y una región de anclaje dúplex, y en el que el uno o más conjuntos de sondas se inmovilizan sobre micropartículas codificadas, ensamblándose las micropartículas codificadas en un alineamiento codificado al azar; (b) poner en contacto el conjunto de sondas con dichas una o más secuencias de nucleótidos diana para permitir la formación de complejos de hibridación colocando un sitio de consulta en la secuencia de iniciación de elongación terminal de una secuencia de sonda en alineación directa con el primer sitio polimórfico designado, en el que la región de iniciación de elongación terminal inicia una reacción de elongación catalizada por polimerasa para formar un producto de elongación si dicha secuencia de iniciación de elongación terminal coincide perfectamente con su sitio correspondiente en la secuencia de nucleótidos diana, comprendiendo dicho sitio correspondiente el primer sitio polimórfico designado, en el que la polimerasa carece de actividad exonucleasa 3' -> 5'; (c) poner en contacto el producto de elongación con una segunda sonda diseñada para hibridarse con un segundo sitio polimórfico designado; (d) para cada complejo de hibridación, determinar la presencia del producto de elongación para indicar una coincidencia o ausencia del producto de elongación para indicar una falta de coincidencia entre el sitio de consulta y el primer sitio polimórfico designado, y para cada producto de elongación, determinar la hibridación de la segunda sonda con el segundo sitio polimórfico designado; y (e) determinar la composición de los sitios polimórficos designados correlacionados primero y segundo, o (B) de determinación de la composición de sitios polimórficos en un ácido nucleico diana, comprendiendo dicho método: proporcionar un ácido nucleico, teniendo dicho ácido nucleico sitios polimórficos; elegir al menos dos sitios polimórficos como sitios designados; proporcionar dos o más sondas capaces de consultar los sitios designados; en el que dichas sondas comprenden una región de iniciación de elongación terminal ubicada en la posición terminal 3' de la secuencia de sonda; consultar los sitios designados de modo que se establezca la presencia de dos o más de tales sitios designados y se determinen las composiciones en dichos dos o más sitios, en el que la etapa de consultar los sitios designados comprende formar un complejo de hibridación entre una primera sonda y dicho ácido nucleico e iniciar una elongación catalizada por polimerasa de la sonda si dicha región de iniciación de elongación terminal coincide perfectamente con la porción correspondiente de la secuencia de ácido nucleico diana en el que la polimerasa carece de actividad exonucleasa 3' -> 5'; formar un producto de elongación sometiendo a elongación dicha primera sonda; y formar un complejo de hibridación apareando con el producto de elongación una segunda sonda diseñada para consultar un segundo sitio designado.
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    • 46. 发明专利
      ES2661167T3 Análisis multiplexado de loci polimórficos mediante consulta simultánea y detección mediada por enzimas 未知
    • Análisis multiplexado de loci polimórficos mediante consulta simultánea y detección mediada por enzimas
    • ES2661167T3
    • 2018-03-27
    • ES02801745
    • 2002-10-15
    • BIOARRAY SOLUTIONS LTD
    • LI ALICE , HASHMI GHAZALA , SEUL MICHAEL
    • C12N15/09 , C12P19/34 , C07H21/02 , C07H21/04 , C12Q1/68
    • Método de determinación simultánea de la composición de nucleótidos en sitios polimórficos designados ubicados dentro de una o más secuencias de nucleótidos diana, comprendiendo dichas secuencias de nucleótidos diana un polimorfismo no designado, comprendiendo dicho método las etapas siguientes: (a) proporcionar un conjunto de pares de cebadores oligonucleotídicos, siendo capaz cada par de aparearse con cadenas de polinucleótidos complementarias para delinear una región de la diana correspondiente que incluye al menos un sitio polimórfico designado; (b) poner en contacto dicho conjunto de cebadores oligonucleotídicos con dichas dianas en condiciones que permiten la formación de amplicones con sitios polimórficos designados correspondientes a los sitios polimórficos designados en dianas correspondientes, comprendiendo cada amplicón una cadena sentido de amplicón correspondiente a una cadena sentido diana y una cadena antisentido de amplicón correspondiente a una cadena antisentido diana; (c) proporcionar uno o más conjuntos de sondas degeneradas, en el que el conjunto contiene sondas degeneradas capaces de aparearse con una subsecuencia de dicha una o más secuencias de cadena sentido y cadena antisentido de amplicón ubicadas dentro de un intervalo de proximidad a un sitio polimórfico designado en la cadena sentido o antisentido; (d) poner en contacto el conjunto de sondas con dicha una o más secuencias de nucleótidos de amplicón para permitir la formación de complejos de hibridación colocando un sitio de consulta dentro de una secuencia de sonda en alineación directa con el sitio polimórfico designado en la cadena sentido y antisentido; (e) incubar cada complejo de hibridación con un ADN polimerasa capaz de extender las sondas dentro del complejo: (i) determinar la presencia de una coincidencia entre el sitio de consulta y un sitio polimórfico designado mediante elongación de sonda; y (ii) determinar la presencia de una falta de coincidencia entre el sitio de consulta y un sitio polimórfico designado por la falta de elongación de sonda; determinando de ese modo la composición del sitio polimórfico designado; en el que el uno o más conjuntos de sondas se inmovilizan sobre micropartículas codificadas, ensamblándose las micropartículas codificadas en un alineamiento codificado al azar.
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    • 49. 发明专利
      ES2532842T3 Método de tipado de ácido nucleico para seleccionar donantes registrados para determinar la compatibilidad cruzada con receptores de transfusión 未知
    • Método de tipado de ácido nucleico para seleccionar donantes registrados para determinar la compatibilidad cruzada con receptores de transfusión
    • ES2532842T3
    • 2015-04-01
    • ES05816073
    • 2005-10-24
    • BIOARRAY SOLUTIONS LTD , REID MARION E
    • SEUL MICHAEL , HASHMI GHAZALA , PIERCE MICHAEL , REID MARION E
    • C12Q1/68 , C12N15/12
    • Método de selección de un donante de transfusión mediante la determinación de la compatibilidad con un receptor comparando combinaciones de marcadores polimórficos en un conjunto de tales marcadores, de donantes candidatos y un receptor en el que dicha determinación se realiza tras someter material genómico/ADN de donantes candidatos y el receptor a amplificación para generar de ese modo productos amplificados, en el que los productos amplificados se someten a un ensayo de hibridación o a un ensayo de elongación mediado por captura o a ambos, en el que se genera una señal de ensayo por los eventos de hibridación o elongación individuales, según sea aplicable, mediante pares de sondas en las que los miembros del par son complementarios, en su totalidad o en parte, a las subsecuencias de los productos amplificados que son los mismos que y/o que son complementarios a los marcadores polimórficos en el conjunto; en el que se genera un patrón de intensidad de señal de ensayo a partir de eventos de hibridación o elongación, de modo que cada marcador en el conjunto está representado por un par de intensidades de señal de ensayo particulares, comprendiendo el método: determinar el patrón de intensidad de señal de ensayo generado a partir de dicho ensayo de hibridación o elongación y formar, para cada par de sondas, una combinación de intensidades de señal asociadas con los miembros del par; generar a partir de dichas combinaciones de intensidades de señal una serie de valores, cada valor en la serie seleccionado de uno de tres posibles valores, que indican respectivamente un estado homocigótico normal, heterocigótico u homocigótico variante para formar de ese modo un patrón de reacción; determinar las combinaciones de marcadores polimórficos representadas por dichos patrones de reacción; y seleccionar de los donantes candidatos un donante que tiene dicha combinación de marcadores polimórficos idéntica a la del receptor, en el que la combinación de intensidades de señal de miembros se representa de modo que una intensidad de este tipo, iN, se correlaciona con la cantidad de marcador normal en la muestra, y la otra intensidad de este tipo, iV, se correlaciona con la cantidad de marcador variante en la muestra, y dichas intensidades se combinan para formar un parámetro de discriminación Δ >= (iN-iV)/(iN+iV) que varía entre -1 y 1.
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