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11. 发明专利

CA2742342A1 MSH3 EXPRESSION STATUS DETERMINES THE RESPONSIVENESS OF CANCER CELLS TO THE CHEMOTHERAPEUTIC TREATMENT WITH PARP INHIBITORS AND PLATINUM DRUGS 未知
公开(公告)号：CA2742342A1
公开(公告)日：2012-08-12
申请号：CA2742342
申请日：2011-06-07
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD , KOI MINORU , TAKAHASHI MASANOBU
IPC分类号： C12Q1/68 , C07K14/47 , G01N33/574
摘要： Methods for treating a patient at risk for or diagnosed with colorectal cancer are disclosed herein. The method of the present invention determines the overall expression of MSH3 in cells suspected of being colorectal cancer cells from the patient and predicting the efficacy of therapy with a genotoxic anti-neoplastic agent for treating the patient, wherein a decrease in the overall expression of MSH3 in the patient cells when compared to the expression of MSH3 in normal colorectal cells indicates a predisposition to responsiveness to genotoxic anti-neoplastic agent therapy, wherein the therapy comprises administering an effective amount of the genotoxic anti-neoplastic agent therapy to patients.

12. 发明专利

AR085440A1 BIOMARCADORES PARA PREDECIR LA RECURRENCIA DE METASTASIS DE CANCER COLORRECTAL 未知
公开(公告)号：AR085440A1
公开(公告)日：2013-10-02
申请号：ARP120100891
申请日：2012-03-16
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： KOI MINORU , BOLAND C RICHARD
IPC分类号： C12Q1/68 , C12N15/11
摘要： Biomarcadores y métodos para predecir la supervivencia sin recurrencia y determinar el riesgo de metástasis hepático (LM) colorrectal por determinación del nivel de inestabilidad de microsatélites en repeticiones de tetranucleótidos (EMAST) y en loci de repeticiones de mono- y un dinucleótido (MSI-L) o un SMARCA2R-LOH en pacientes con cáncer colorrectal (CRC). Los resultados obtenidos indican que los pacientes en etapa II y III con MSI-M tenían una supervivencia sin recurrencia más corto que el resto de los pacientes con niveles altos de MSI (MSI-H) o con microsatélites altamente estables, y que la MSI-M es un predictor independiente de la metástasis distante recurrente en el CRC en etapa II y III primario. Se observó que SMARCA2R-LOH y MSI-M están presentes en los tejidos de LM y CRC primario en etapa IV.

13. 发明专利

AR085439A1 LOS CAMBIOS EN LA EXPRESION DEL CONJUNTO DE microARN miR-200c/141 COMO BIOMARCADORES DE LA TRANSICION ENTRE EL EPITELIO Y EL MESENQUIMA EN LAS METASTASIS DEL CANCER COLORRECTAL HUMANO 未知
公开(公告)号：AR085439A1
公开(公告)日：2013-10-02
申请号：ARP120100890
申请日：2012-03-16
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD , HUR KEUN
IPC分类号： C12Q1/68 , A61P35/00 , C12N15/11 , G01N33/574
摘要： Métodos, conjuntos de elementos y biomarcadores para detectar y determinar el desarrollo de las metástasis del cáncer colorrectal (CRC) sobre la base de los cambios en el patrón de expresión de uno o más microARN (miR) o conjuntos de miR que incluyen la familia miR-200/141.Reivindicación 3: El método de la reivindicación 1, caracterizado porque los uno o más miR comprenden un microARN de la familia miR-200, donde la familia miR-200 comprende miR-200b, miR-200a, miR-200c, miR-141 y miR-429.

14. 发明专利

AR081874A1 METODO PARA PREDECIR EFICACIA A UN REGIMEN TERAPEUTICO EN UN PACIENTE CON ADENOCARCINOMAS MEDIANTE LA EXPRESION DE UN GEN REPARADOR DE ADN (MSH3) 未知
公开(公告)号：AR081874A1
公开(公告)日：2012-10-24
申请号：ARP110102043
申请日：2011-06-10
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： KOI MINORU , GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD , TAKAHASHI MASANOBU
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/574
摘要： Métodos para tratar un paciente que se halla en riesgo de contraer cáncer colorrectal o al que se le ha diagnosticado cáncer colorrectal. El método de la presente permite determinar la expresión general de MSH3 en células sospechadas de ser células de cáncer colorrectal del paciente y predecir la eficacia potencial de una terapia con un agente anti-neoplásico genotóxico en el tratamiento del paciente, donde una disminución en la expresión general de MSH3 en las células del paciente, en comparación con la expresión de MSH3 en las células colorrectales normales, es indicativa de una predisposición a la respuesta a la terapia con el agente antineoplásico genotóxico, donde la terapia comprende administrarles una cantidad eficaz del agente antineoplásico genotóxico a los pacientes, tal como inhibidores de la poli(adenosina-difosfato-ribosa)polimerasa o PARP y drogas de platino.

15. 发明专利

CA2905949A1 ULCERATIVE COLITIS (UC)-ASSOCIATED COLORECTAL NEOPLASIA MARKERS 未知
公开(公告)号：CA2905949A1
公开(公告)日：2014-09-25
申请号：CA2905949
申请日：2014-03-13
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： GOEL AJAY , TOIYAMA YUJI , BOLAND C RICHARD , OKUGAWA YOSHINAGA
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： Embodiments provide methods and compositions related to detecting neoplasia in ulcerative colitis patients by detection and analysis of the methylation state of miR-1, -9, -124, miR-137 and/or miR-34b/c in samples from UC patients.

16. 发明专利

AR086427A1 DETECCION DE LOS CANCERES COLORRECTALES CON DEFICIENCIAS EN LA REPARACION DE LAS FALTAS DE COINCIDENCIA EN EL ADN 未知
公开(公告)号：AR086427A1
公开(公告)日：2013-12-11
申请号：ARP120101742
申请日：2012-05-17
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： BOLAND C RICHARD , NAGASAKA TAKESHI , GOEL AJAY
IPC分类号： C12M1/40 , C12Q1/68
摘要： Uso del mononucleótido marcador CAT25 en un método basado en una PCR cuádruple con el que pueden detectarse los cánceres colorrectales (CRC) con deficiencias en MSH6. La PCR cuádruple de la presente solicitud es un ensayo sencillo, robusto, más económico (en comparación con la PCR quíntuple habitual), altamente sensible y específico con el que puede identificarse la inestabilidad a nivel de los microsatélites (MSI) en los CRC.Reivindicación 1: Un sistema para detectar la inestabilidad a nivel de los microsatélites (MSl) en una muestra biológica obtenida de un sujeto humano o de un animal, caracterizado porque comprende una cantidad de mononucleótidos marcadores que es suficiente para detectar un cambio en la expresión del gen MSH6, en la expresión de la proteína MSH6 o en ambas, donde los mononucleótidos marcadores comprenden CAT25, BAT25, BAT26, NR21, NR22, NR24, NR27 o cualquier combinación de éstos.

17. 发明专利

BRPI1103285A2 未知
公开(公告)号：BRPI1103285A2
公开(公告)日：2013-11-05
申请号：BRPI1103285
申请日：2011-07-28
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD , KOI MINORU , TAKAHASHI MASANOBU
IPC分类号： C07K14/82 , C07H21/04 , G01N33/574
摘要： Methods for treating a patient at risk for or diagnosed with colorectal cancer are disclosed herein. The method of the present invention determines the overall expression of MSH3 in cells suspected of being colorectal cancer cells from the patient and predicting the efficacy of therapy with a genotoxic anti-neoplastic agent for treating the patient, wherein a decrease in the overall expression of MSH3 in the patient cells when compared to the expression of MSH3 in normal colorectal cells indicates a predisposition to responsiveness to genotoxic anti-neoplastic agent therapy, wherein the therapy comprises administering an effective amount of the genotoxic anti-neoplastic agent therapy to patients.

18. 发明专利

CA2830416A1 BIOMARKERS FOR PREDICTING THE RECURRENCE OF COLORECTAL CANCER METASTASIS 未知
公开(公告)号：CA2830416A1
公开(公告)日：2012-09-27
申请号：CA2830416
申请日：2012-03-16
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： KOI MINORU , BOLAND C RICHARD
IPC分类号： C12Q1/68
摘要： The present invention includes biomarkers and methods for predicting recurrence-free survival and determination of risk for colorectal liver metastasis (LM) by determining a level of microsatellite instability at tetranucleotide repeats (EMAST) and at mono- and a dinucleotide repeat loci (MSI-L) or a SMARCA2R-LOH in colorectal cancer (CRC) patients. Results obtained indicate that stage II and III patients with MSI-M had a shorter recurrence-free survival than the rest of patients with high levels of MSI (MSI-H) or with highly stable microsatellites, and that MSI-M is an independent predictor for recurrent distant metastasis in primary stage II and III CRCs. It was found that SMARCA2R-LOR and MSI-M are found in stage IV primary CRC and LM tissues.

19. 发明专利

AR085818A1 HIPOMETILACION DE LINE-1 COMO BIOMARCADOR DEL COMIENZO TEMPRANO DE CANCER COLORRECTAL 未知
公开(公告)号：AR085818A1
公开(公告)日：2013-10-30
申请号：ARP120100844
申请日：2012-03-14
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD , BALAGUER FRANCESC
IPC分类号： G01N33/50 , C12Q1/68 , G01N33/574
摘要： Método para detectar el comienzo temprano de cáncer colorrectal en un sujeto humano. El método comprende los pasos de: (i) identificar el sujeto humano sospechado de sufrir de cáncer colorrectal; (ii) obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano; (iii) determinar el nivel de metilación de LINE-1 en una o más muestras biológicas; y (iv) comparar el nivel de metilación de LINE-1 con el nivel control de metilación de LINE-1, en donde un grado mayor de metilación de LINE-1 es indicativo del comienzo temprano de cáncer colorrectal.Reivindicación 2: El método de la reivindicación 1, caracterizado porque las muestras biológicas se seleccionan del grupo que consiste en una muestra de un tejido, una muestra de heces, un homogenato de células, una muestra de sangre, uno o más fluidos biológicos o cualquier combinación de los anteriores. Reivindicación 4: El método de la reivindicación 1, caracterizado porque el nivel de metilación de LINE-1 se determina mediante la amplificación de los sitios intermetilados, mediante la conversión de los bisulfitos, seguida por una captura y una secuenciación, a través de un análisis del perfil de metilación de los bisulfitos, a través de la secuenciación de los bisulfitos, con sondas que se unen a los bisulfitos, por medio de un análisis de alto desempeño de la metilación relativa, mediante un análisis de restricción de los bisulfitos, por medio de una hibridación diferencial en las metilaciones, con una PCR mediada por la unión a fragmentos cortos generados con HpalI, mediante la amplificación de los segmentos de CpG metilados, mediante una amplificación de los segmentos de CpG metilados combinada con una hibridación basada en microseries, por medio de la inmunoprecipitación del ADN metilado, mediante la inmunoprecipitación de los segmentos de CpG metilados, con un ensayo para recuperar los segmentos de CpG metilados, a través de una evaluación de la metilación basada en microseries, con una PCR con cebadores arbitrarios sensibles a la metilación, por medio de un conteo de los cortes sensible a la metilación, con una PCR con especificidad por la metilación, mediante la extensión de cebadores con nucleótidos individuales sensibles a la metilación, con una secuenciación de última generación, por medio de un análisis de las restricciones características del genoma, a través de una secuenciación basada en la representación reducida de los bisulfitos o a través de una secuenciación masiva de los bisulfitos en todo el genoma. Reivindicación 7: Un biomarcador para predecir, detectar, diagnosticar o monitorear un cáncer colorrectal de inicio temprano en un sujeto humano, caracterizado porque comprende un biomarcador con el que puede determinarse el nivel de metilación de LINE-1, donde un menor nivel de metilación de LINE-1 es indicativo de la presencia de un cáncer colorrectal de inicio temprano en el sujeto humano. Reivindicación 14: Un método para seleccionar la terapia apropiada para tratar un cáncer en un paciente al que se le ha diagnosticado un cáncer colorrectal de inicio temprano, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: determinar el nivel de metilación de LINE-1 en una muestra biológica obtenida del sujeto, donde el nivel de mutilación de LINE-1 es indicativo de un cáncer colorrectal de inicio temprano; y seleccionar la terapia para el cáncer sobre la base de la determinación de la presencia del cáncer colorrectal de inicio temprano en el sujeto. Reivindicación 22: Un método para detectar un pre-cáncer o un cáncer en un sujeto humano, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano, procesar las una o más muestras biológicas para determinar el nivel de metilación de LINE-1 y comparar el nivel de metilación de LINE-1 en las una o más muestras biológicas con el nivel de mutilación de LINE-1 en un tejido colorrectal normal, donde un menor nivel de mutilación de LINE-1 es indicativo de un cáncer colorrectal de inicio temprano.

20. 发明专利

AR085438A1 LA HIPOMETILACION EN LOS ELEMENTOS NUCLEARES LARGOS INTERCALADOS (LINE-1) Y EN ALU COMO BIOMARCADOR PARA LAS METASTASIS DEL CANCER COLORRECTAL 未知
公开(公告)号：AR085438A1
公开(公告)日：2013-10-02
申请号：ARP120100889
申请日：2012-03-16
申请人： BAYLOR RES INST
发明人： HUR KEUN , GOEL AJAY , BOLAND C RICHARD
IPC分类号： C12Q1/68 , G01N33/48
摘要： Método para determinar las metástasis del cáncer colorrectal en un sujeto humano que padece un cáncer colorrectal (CRC) primario, que comprende los siguientes pasos: i) identificar un sujeto humano que padece un CRC primario; ii) obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano; iii) detectar el nivel de metilación de Alu, de LINE-1 o de ambos en las una o más muestras biológicas; y iv) diagnosticar una etapa más elevada para las metástasis del cáncer colorrectal en el sujeto humano si el nivel de metilación de Alu o de LINE-1 es menor que el nivel de metilación control correspondiente de Alu o de LINE-1.Reivindicación 7: Un biomarcador para detectar una metástasis del cáncer colorrectal en un sujeto humano que padece un cáncer colorrectal primario, caracterizado porque comprende determinar el nivel de metilación de Alu, de LINE-1 o de ambos y compararlo con el nivel de metilación control correspondiente de Alu o de LINE-1, donde un menor nivel de metilación de Alu, de LINE-1 o de ambos es indicativo de la presencia de metástasis del cáncer colorrectal de una etapa más avanzada en el sujeto humano. Reivindicación 14: Un método para seleccionar la terapia apropiada para tratar un cáncer en un paciente al que se le ha diagnosticado un cáncer colorrectal metastático, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: determinar el nivel de metilación general de Alu, de LINE-1 o de ambos en una o más células provenientes de una muestra biológica obtenida del sujeto, donde un menor nivel de metilación de Alu, de LINE-1 o de ambos, en comparación con el nivel de metilación control correspondiente de Alu o de LINE-1, es indicativo de un incremento en la etapa del cáncer colorrectal, es decir, del pasaje desde una etapa más baja hasta una etapa más alta; y seleccionar la terapia para tratar el cáncer sobre la base de la determinación del incremento en la etapa del cáncer colorrectal en el paciente. Reivindicación 21: Un método para determinar la etapa de las metástasis del cáncer colorrectal en un sujeto humano que padece un cáncer colorrectal (CRC) primario, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: identificar un sujeto humano que padece un CRC primario; obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano; detectar el nivel de metilación de Alu, de LINE-1 o de ambos en las una o más muestras biológicas; y diagnosticar una etapa más elevada para las metástasis del cáncer colorrectal en el sujeto humano si el nivel de metilación de Alu o de LINE-1 es menor que el nivel de metilación control correspondiente de Alu o de LINE-1.

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