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11. 发明专利

TWI312809B 決定表皮生長因子受體及HER2-NEU基因表現及其與存活率相關程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL 失效
简体标题：决定表皮生长因子受体及HER2-NEU基因表现及其与存活率相关程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL
公开(公告)号：TWI312809B
公开(公告)日：2009-08-01
申请号：TW097112520
申请日：2001-11-30
申请人：雷斯邦司遺傳學公司 RESPONSE GENETICS, INC.
发明人：凱斯林D. 丹博格 KATHLEEN D. DANENBERG
IPC分类号： C12Q
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12Q2600/158
摘要：本發明係關於可用在醫學上,特別是用在癌症之化學治療上的預後方法。本發明之目標是提供在經過固定,或經過固定並以石蠟包埋的組織中,評估HER2-neu及/或EGFR表現程度,並預測患者腫瘤對利用瞄準受體酪胺酸激之化學治療的治療可能之敏感性的方法,該方法係藉著檢查在患者腫瘤細胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,並與那些基因之預定的閾表現程度相比較。更特定而言,本發明提供寡核酸引子對EGFR和HER2-neu,並包括分別用它們來檢測EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。
简体摘要：本发明系关于可用在医学上,特别是用在癌症之化学治疗上的预后方法。本发明之目标是提供在经过固定,或经过固定并以石蜡包埋的组织中,评估HER2-neu及/或EGFR表现程度,并预测患者肿瘤对利用瞄准受体酪胺酸激之化学治疗的治疗可能之敏感性的方法,该方法系借着检查在患者肿瘤细胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,并与那些基因之预定的阈表现程度相比较。更特定而言,本发明提供寡核酸引子对EGFR和HER2-neu,并包括分别用它们来检测EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。

12. 发明专利

TW200833847A 決定表皮生長因子受體及HER2-NEU基因表現及其與存活率相關程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL 失效
简体标题：决定表皮生长因子受体及HER2-NEU基因表现及其与存活率相关程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL
公开(公告)号：TW200833847A
公开(公告)日：2008-08-16
申请号：TW097112522
申请日：2001-11-30
申请人：雷斯邦司遺傳學公司 RESPONSE GENETICS, INC.
发明人：凱斯林D. 丹博格 KATHLEEN D. DANENBERG
IPC分类号： C12Q
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12Q2600/158
摘要：本發明係關於可用在醫學上,特別是用在癌症之化學治療上的預後方法。本發明之目標是提供在經過固定,或經過固定並以石蠟包埋的組織中,評估HER2-neu及/或EGFR表現程度,並預測患者腫瘤對利用瞄準受體酪胺酸激之化學治療的治療可能之敏感性的方法,該方法係藉著檢查在患者腫瘤細胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,並與那些基因之預定的閡表現程度相比較。更特定而言,本發明提供寡核酸引子對EGFR和HER2-neu,並包括分別用它們來檢測EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。
简体摘要：本发明系关于可用在医学上,特别是用在癌症之化学治疗上的预后方法。本发明之目标是提供在经过固定,或经过固定并以石蜡包埋的组织中,评估HER2-neu及/或EGFR表现程度,并预测患者肿瘤对利用瞄准受体酪胺酸激之化学治疗的治疗可能之敏感性的方法,该方法系借着检查在患者肿瘤细胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,并与那些基因之预定的阂表现程度相比较。更特定而言,本发明提供寡核酸引子对EGFR和HER2-neu,并包括分别用它们来检测EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。

13. 发明专利

TW200628614A 決定包括5-氟尿嘧啶、奧沙利鉑或其組合之化學治療療程在患者中用來治療腫瘤的方法 METHODS FOR DETERMINING A CHEMOTHERAPEUTIC REGIMEN COMPRISING 5-FLUOROURACIL, OXALIPLATIN, OR COMBINATION THEREOF FOR TREATING A TUMOR IN A PATIENT 失效
简体标题：决定包括5-氟尿嘧啶、奥沙利铂或其组合之化学治疗疗程在患者中用来治疗肿瘤的方法 METHODS FOR DETERMINING A CHEMOTHERAPEUTIC REGIMEN COMPRISING 5-FLUOROURACIL, OXALIPLATIN, OR COMBINATION THEREOF FOR TREATING A TUMOR IN A PATIENT
公开(公告)号：TW200628614A
公开(公告)日：2006-08-16
申请号：TW095115425
申请日：2001-11-30
申请人：雷斯邦司遺傳學公司 RESPONSE GENETICS, INC.
发明人：凱斯林D 丹博格 KATHLEEN D. DANENBERG
IPC分类号： C12Q , A61P
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158
摘要：本發明係關於可用在醫學上，特別是用在癌症之化學治療上的預後方法。本發明之目標是提供在經過固定，或經過固定並以石蠟包埋的組織中，評估TS及／或ERCC1表現程度，並預測患者腫瘤對利用5–FU和奧沙利鉑(oxaliplatin)為基礎之治療可能之抵抗力的方法，該方法係藉著在患者腫瘤細胞中檢查TS及／或ERCC1 mRNA的含量，並與那些基因之預定的閾表現程度相比較。更特定而言，本發明提供寡核酸引子對ERCC1和TS，並包括分別用它們來檢測ERCC1和TS mRNA之含量的方法。
简体摘要：本发明系关于可用在医学上，特别是用在癌症之化学治疗上的预后方法。本发明之目标是提供在经过固定，或经过固定并以石蜡包埋的组织中，评估TS及／或ERCC1表现程度，并预测患者肿瘤对利用5–FU和奥沙利铂(oxaliplatin)为基础之治疗可能之抵抗力的方法，该方法系借着在患者肿瘤细胞中检查TS及／或ERCC1 mRNA的含量，并与那些基因之预定的阈表现程度相比较。更特定而言，本发明提供寡核酸引子对ERCC1和TS，并包括分别用它们来检测ERCC1和TS mRNA之含量的方法。

14. 发明专利

TWI313711B 決定表皮生長因子受體及HER2-NEU基因表現及其與存活率相關程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL RATES 失效
简体标题：决定表皮生长因子受体及HER2-NEU基因表现及其与存活率相关程度之方法 METHOD OF DETERMINING EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR AND HER2-NEU GENE EXPRESSION AND CORRELATION OF LEVELS THEREOF WITH SURVIVAL RATES
公开(公告)号：TWI313711B
公开(公告)日：2009-08-21
申请号：TW090129662
申请日：2001-11-30
申请人：雷斯邦司遺傳學公司 RESPONSE GENETICS, INC.
发明人：凱斯林D. 丹博格 KATHLEEN D. DANENBERG
IPC分类号： C12Q
CPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6886 , C12Q2600/158
摘要：本發明係關於可用在醫學上,特別是用在癌症之化學治療上的預後方法。本發明之目標是提供在經過固定,或經過固定並以石蠟包埋的組織中,評估HER2-neu及/或EGFR表現程度,並預測患者腫瘤對利用瞄準受體酪胺酸激之化學治療的治療可能之敏感性的方法,該方法係藉著檢查在患者腫瘤細胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,並與那些基因之預定的閾表現程度相比較。更特定而言,本發明提供寡核酸引子對EGFR和HER2-neu,並包括分別用它們來檢測EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。
简体摘要：本发明系关于可用在医学上,特别是用在癌症之化学治疗上的预后方法。本发明之目标是提供在经过固定,或经过固定并以石蜡包埋的组织中,评估HER2-neu及/或EGFR表现程度,并预测患者肿瘤对利用瞄准受体酪胺酸激之化学治疗的治疗可能之敏感性的方法,该方法系借着检查在患者肿瘤细胞中之HER2-neu/EGFR mRNA的含量,并与那些基因之预定的阈表现程度相比较。更特定而言,本发明提供寡核酸引子对EGFR和HER2-neu,并包括分别用它们来检测EGFR和HER2-neu mRNA之含量的方法。

15. 发明申请

US20150184250A1 KRAS PRIMERS AND PROBES 审中-公开
标题翻译： KRAS PRIMERS和PROBES
公开(公告)号：US20150184250A1
公开(公告)日：2015-07-02
申请号：US14570771
申请日：2014-12-15
申请人： RESPONSE GENETICS, INC.
发明人： Craig Stephens
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156
摘要： The present invention provides oligonucleotide primers or probes for the detection of a mutation of the KRAS gene. The invention also provides a method for detecting a mutation in the KRAS gene using the oligonucleotide primers or probes disclosed therein. Furthermore, the present invention encompasses a method for predicting the sensitivity of a tumor in a patient to epidermal growth factor receptor-directed chemotherapy, comprising obtaining DNA from the tumor; and determining whether there is a mutation in codon 12 and/or a mutation in codon 13 in exon 2 of the KRAS gene in the DNA using a method utilizing at least one of the oligonucleotide primers and/or probes of the present invention.
摘要翻译：本发明提供了用于检测KRAS基因突变的寡核苷酸引物或探针。本发明还提供了使用其中公开的寡核苷酸引物或探针检测KRAS基因突变的方法。此外，本发明包括用于预测患者中肿瘤对表皮生长因子受体指导化疗的敏感性的方法，包括从肿瘤获得DNA; 并使用利用至少一种本发明的寡核苷酸引物和/或探针的方法，确定DNA中的KRAS基因的外显子2的密码子12的突变和/或突变的密码子13是否突变。

16. 发明申请

US20150161327A1 SYSTEMS AND METHODS FOR DETECTING BIOLOGICAL FEATURES 审中-公开
标题翻译：用于检测生物特征的系统和方法
公开(公告)号：US20150161327A1
公开(公告)日：2015-06-11
申请号：US14624453
申请日：2015-02-17
申请人： Response Genetics, Inc.
发明人： Glenda G. Anderson
IPC分类号： G06F19/12 , G06N7/00
CPC分类号： G16B5/00 , G06N7/005 , G16B20/00 , G16B25/00 , G16B40/00
摘要： A computer having a memory stores instructions for receiving data. The data comprises one or more characteristics for each cellular constituent in a plurality of cellular constituents that have been measured in a test organism of a species or a test biological specimen from an organism of the species. The memory further stores instructions for computing a model in a plurality of models, wherein the model is characterized by a model score that represents the likelihood of a biological feature in the test organism or the test biological specimen. Computation of the model comprises determining the model score using one or more characteristics for one or more cellular constituents in the plurality of cellular constituents. The memory also stores instructions for repeating the instructions for computing one or more times, thereby computing the plurality of models. The memory also stores instructions for communicating computed model scores.
摘要翻译：具有存储器的计算机存储用于接收数据的指令。数据包括已经在物种的测试生物体中测量的多个细胞组分中的每个细胞成分的一个或多个特征或来自该物种的生物体的测试生物标本。存储器还存储用于计算多个模型中的模型的指令，其中模型的特征在于模型评分，其表示测试生物体或测试生物样本中生物特征的可能性。模型的计算包括使用针对多个细胞组分中的一个或多个细胞组分的一个或多个特征来确定模型得分。存储器还存储用于重复计算一次或多次的指令的指令，从而计算多个模型。存储器还存储用于传达计算的模型分数的指令。

17. 发明申请

WO2011130635A3 PRIMERS, PROBES, METHODS AND KITS FOR THE DETECTION OF EML4-ALK VARIANTS 审中-公开
标题翻译：用于检测EML4-ALK变体的引物，探针，方法和试剂盒
公开(公告)号：WO2011130635A3
公开(公告)日：2011-12-29
申请号：PCT/US2011032694
申请日：2011-04-15
申请人： RESPONSE GENETICS INC , CRAIG STEPHENS
发明人： CRAIG STEPHENS
IPC分类号： C12Q1/68
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156
摘要： The present invention relates primers, probes, and kits for the detection of EML4-ALK variant sequences in a sample. The present invention also relates methods of detection EML4-ALK variants using the primer, probes, and kits disclosed herein.
摘要翻译：本发明涉及用于检测样品中EML4-ALK变体序列的引物，探针和试剂盒。本发明还涉及使用本文公开的引物，探针和试剂盒检测EML4-ALK变体的方法。

18. 发明申请

WO2009002937A3 METHODS FOR ISOLATING LONG FRAGMENT RNA FROM FIXED SAMPLES 审中-公开
标题翻译：从固定样品中分离长片段RNA的方法
公开(公告)号：WO2009002937A3
公开(公告)日：2009-02-12
申请号：PCT/US2008067914
申请日：2008-06-23
申请人： RESPONSE GENETICS INC , DANENBERG KATHLEEN
发明人： DANENBERG KATHLEEN
IPC分类号： C12N15/10 , C12Q1/68
CPC分类号： C12N15/1003
摘要： The present invention relates to methods for the extraction of long fragment RNA from fixed tissue specimens. In particular, the present invention relates to methods for the extraction of RNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissue specimens for use in biologic applications, including assays based on oligonucleotide hybridization.
摘要翻译：本发明涉及从固定组织标本中提取长片段RNA的方法。特别地，本发明涉及从用于生物应用的福尔马林固定石蜡包埋的组织标本中提取RNA的方法，包括基于寡核苷酸杂交的测定法。

19. 发明申请

WO2004075833A2 METHODS OF DETERMINING A CHEMOTHERAPEUTIC REGIMEN BASED ON LOSS OF HETEROZYGOSITY AT THE THYMIDYLATE SYNTHASE LOCUS 审中-公开
标题翻译：基于杂合性丢失的甲状腺素合成酶位置确定化疗方案的方法
公开(公告)号：WO2004075833A2
公开(公告)日：2004-09-10
申请号：PCT/US2004/004867
申请日：2004-02-20
申请人： RESPONSE GENETICS, INC. , DANENBERG, Kathleen, D.
发明人： DANENBERG, Kathleen, D.
IPC分类号： A61K
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158
摘要： The present invention is directed to a method of predicting a response to a chemotherapeutic regimen based on loss of heterozygosity at the thymidylate synthase locus in cancer tissue. This method comprises determining normal tissue genotype for thymidylate synthase of a patient; determining tumor tissue genotype for thymidylate synthase of said patient; comparing the normal tissue genotype with the tumor tissue genotype; determining whether a loss of heterozygosity at the thymidylate synthase locus has occurred in the tumor tissue based on the comparison of the genotypes; and predicting a response to the chemotherapeutic regimen based on the loss of heterozygosity in the tumor sample.
摘要翻译：本发明涉及基于癌组织中胸苷酸合酶基因座处杂合性丢失来预测对化疗方案的反应的方法。该方法包括确定患者的胸苷酸合酶的正常组织基因型; 确定所述患者的胸苷酸合酶的肿瘤组织基因型; 比较正常组织基因型与肿瘤组织基因型; 基于所述基因型的比较来确定所述肿瘤组织中是否已发生所述胸苷酸合酶基因座处杂合性的丢失; 并基于肿瘤样品中杂合性的丧失预测对化学治疗方案的响应。

20. 发明申请

WO02057489A3 METHOD OF DETERMINING A CHEMOTHERAPEUTIC REGIMEN BASED ON ERCC1 AND TS EXPRESSION 审中-公开
标题翻译：基于ERCC1和TS表达的确定化学疗法的方法
公开(公告)号：WO02057489A3
公开(公告)日：2003-11-06
申请号：PCT/US0143039
申请日：2001-11-09
申请人： RESPONSE GENETICS INC
发明人： DANENBERG KATHLEEN D
IPC分类号： C12N15/09 , A61K31/282 , A61K31/513 , A61P35/00 , A61P43/00 , C12P19/34 , C12Q20060101 , C12Q1/68 , G01N33/50 , G01N33/574
CPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q2600/106 , C12Q2600/158
摘要： The present invention relates to prognostic methods which are useful in medicine, particularly cancer chemotherapy. The object of the invention to provide a method for assessing TS and/or ERCC1 expression levels in fixed or fixed and paraffin embedded tissues and prognosticate the probable resistance of a patient's tumor to treatment with 5-FU and oxaliplatin-based therapies by examination of the amount of TS and/or ERCC1 mRNA in a patient's tumor cells and comparing it to a predetermined threshold expression level for those genes. More specifically, the invention provides to oligonucleotide primer pairs ERCC1 and TS and methods comprising their use for detecting levels of ERCC1 and TS mRNA, respectively.
摘要翻译：本发明涉及可用于医学，特别是癌症化学疗法的预后方法。本发明的目的是提供一种在固定或固定和石蜡包埋组织中评估TS和/或ERCC1表达水平的方法，并通过检查患者的肿瘤对5-FU和基于奥沙利铂的疗法进行治疗来预测患者肿瘤的可能抗性患者肿瘤细胞中TS和/或ERCC1 mRNA的量，并将其与这些基因的预定阈值表达水平进行比较。更具体地，本发明提供了寡核苷酸引物对ERCC1和TS以及分别用于检测ERCC1和TS mRNA水平的方法。

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