基本信息:
- 专利标题： 一种评估基因组重复区探针捕获安全性的方法及其装置
- 申请号：CN202211686367.4 申请日：2022-12-26
- 公开(公告)号：CN116206684B 公开(公告)日：2024-01-30
- 发明人： 蒋才 , 尹书剑 , 程陶然 , 朱文鑫
- 申请人： 纳昂达(南京)生物科技有限公司
- 申请人地址： 江苏省南京市江北新区华康路142号南京生物医药谷加速器三期A01栋南侧3-4层
- 专利权人： 纳昂达(南京)生物科技有限公司
- 当前专利权人： 纳昂达(南京)生物科技有限公司
- 当前专利权人地址： 江苏省南京市江北新区华康路142号南京生物医药谷加速器三期A01栋南侧3-4层
- 代理机构： 南京华讯知识产权代理事务所
- 代理人： 仝东凤
- 主分类号： G16B25/20
- IPC分类号： G16B25/20 ; G16B20/30 ; G16B40/00
摘要：
本发明公开了一种评估基因组重复区风险探针的方法及其装置。该方法包括下述步骤：构建重复区探针集R、中靶率高探针集A及混合探针集R+A，藉由探针集A和R+A对实验样本测序数据的差异构建风险探针影响力表格，分析高脱靶和低脱靶探针的序列差异并得到高危模体，最后利用高危模体集去筛选重复区探针集R或同重复类型的探针集R’，不含有高危模体即判定为安全探针，反之则为高危探针。本发明的方法及其装置可评估基因组重复区探针捕获安全性，被评估为安全探针的探针可用于后续捕获实验，安全探针即使属于重复区也不会在实际捕获过程中造成严重脱靶，有利于后续实验与分析，并降低实验成本。
公开/授权文献:
- CN116206684A 一种评估基因组重复区探针捕获安全性的方法及其装置 公开/授权日：2023-06-02
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16B | 生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术 |
| ------G16B25/00 | 特别适用于杂交的ICT；特别适用于基因或蛋白表达的ICT |
| --------G16B25/20 | .聚合酶链反应 |