基本信息:
- 专利标题： 基于蛋白质表面低熵水合层识别的蛋白质-蛋白质对接方法及装置
- 申请号：CN202210138581.X 申请日：2022-02-15
- 公开(公告)号：CN114512180B 公开(公告)日：2023-07-21
- 发明人： 杨霖 , 侯成宇 , 廖晨辰 , 赫晓东
- 申请人： 哈尔滨工业大学
- 申请人地址： 黑龙江省哈尔滨市南岗区西大直街92号
- 专利权人： 哈尔滨工业大学
- 当前专利权人： 深圳市观湛生物科技有限公司
- 当前专利权人地址： 518000 广东省深圳市南山区西丽街道松坪山社区朗山路13号南门西侧清华信息港科研楼309
- 代理机构： 哈尔滨市松花江联合专利商标代理有限公司
- 代理人： 时起磊
- 主分类号： G16B15/30
- IPC分类号： G16B15/30 ; G16B40/00
摘要：
基于蛋白质表面低熵水合层识别的蛋白质‑蛋白质对接方法及装置，涉及蛋白质‑蛋白质对接结构的预测方法及装置。为了解决目前的蛋白质结构预测方法存在蛋白质对接位点预测不准确的问题。本发明将蛋白质表面疏水基团和含少量氧原子、氮原子的疏水基团以及蛋白质表面形成分子内氢键的某些亲水基团识别为低熵区域。在计算机程序里根据蛋白质表面低熵水合层理论改变蛋白质某些氮、氧亲水原子为疏水碳原子，然后将蛋白质表面切割为多个平面，在每个平面内选出处于疏水连通区域的原子，分别计算每个疏水连通区域表面原子的面积和形状，选出疏水连通面积最大的平面，将该连通区域作为可能的对接位置，对蛋白质‑蛋白质对接位点进行预测。
公开/授权文献:
- CN114512180A 基于蛋白质表面低熵水合层识别的蛋白质-蛋白质对接方法及装置 公开/授权日：2022-05-17
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16B | 生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术 |
| ------G16B15/00 | 特别适用于分析二维或三维分子结构，例如结构或功能关系、结构排序的ICT |
| --------G16B15/30 | .利用结构数据进行药物靶向；对接或绑定预测 |