基本信息:
- 专利标题： 增强采样方法及计算复合物的结合自由能的方法
- 申请号：CN202111669883.1 申请日：2021-12-31
- 公开(公告)号：CN114446411A 公开(公告)日：2022-05-06
- 发明人： 李治鹏 , 杨明俊 , 邹俊杰 , 林泓叡 , 彭春望 , 方栋 , 林志雄 , 万晓
- 申请人： 深圳晶泰科技有限公司
- 申请人地址： 广东省深圳市福田区福保街道福保社区红柳道2号顺丰工业厂房3层
- 专利权人： 深圳晶泰科技有限公司
- 当前专利权人： 深圳晶泰科技有限公司
- 当前专利权人地址： 广东省深圳市福田区福保街道福保社区红柳道2号顺丰工业厂房3层
- 主分类号： G16C20/50
- IPC分类号： G16C20/50
摘要：
本发明涉及药物研发技术领域，特别是涉及一种增强采样方法及计算复合物的结合自由能的方法。该增强采样方法包括：确定目标分子‑蛋白质复合物的升温区域；对应升温区域修改初始输入文件中目标分子‑蛋白质复合物体系的力场参数，得到基于修改后的目标分子‑蛋白质复合物体系的力场参数，然后进一步生成FEP/REST2模拟所需的参数文件；将参数文件作为势函数的输入进行FEP/REST2模拟以生成轨迹文件。本申请通过对应所确定的升温区域修改初始输入文件中目标分子‑蛋白质复合物体系的力场参数，以尽量少修改代码的方式快速便捷地实现REST2方法的流程，操作简单，提高后续FEP的计算效率及预测精度。
IPC结构图谱:
| G | 物理 |
| --G16 | 特别适用于特定应用领域的信息通信技术 |
| ----G16C | 计算化学；化学信息学；计算材料科学 |
| ------G16C20/00 | 化学信息学，例如特别适用于处理化学粒子、元素、化合物或混合物的物理化学或化合物结构数据的ICT |
| --------G16C20/50 | .分子设计，例如药物 |