基本信息:
- 专利标题： 一种基于多样性指标的群体蛋白质构象空间优化方法
- 申请号：CN201810438596.1 申请日：2018-05-09
- 公开(公告)号：CN108595910A 公开(公告)日：2018-09-28
- 发明人： 张贵军 , 彭春祥 , 刘俊 , 周晓根 , 王柳静
- 申请人： 浙江工业大学
- 申请人地址： 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号
- 专利权人： 浙江工业大学
- 当前专利权人： 浙江工业大学
- 当前专利权人地址： 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号
- 代理机构： 杭州斯可睿专利事务所有限公司
- 代理人： 王利强
- 主分类号： G06F19/16
- IPC分类号： G06F19/16
摘要：
一种基于多样性指标的群体蛋白质构象空间优化方法，首先，利用Rosetta第一阶段进行片段组装生成初始种群，并利用Rosetta第二阶段进行片段组装生成新种群；然后，针对随机选取的Loop区域，对构象进行Loop交换，从而实现种群重组；其次，基于Loop区域，对每个构象进行变异操作，并将变异生成的所有新个体与当前种群进行合并，并提取构象的USR特性信息建立多样性指标，基于该指标和能量对整个种群进行更新操作；最后，分别利用Rosetta第三和第四阶段对整个种群进行进一步优化，从而得到最终预测结果。本发明采样效率较高、多样性较好、复杂度较低及预测精度较高。
公开/授权文献:
- CN108595910B 一种基于多样性指标的群体蛋白质构象空间优化方法 公开/授权日：2021-08-03